14/10/2015 Histoire de la pensée évolutionniste Anaximandre de Milet (610 à 547 av. JC) Fossiles marins = vie apparue dans les océans (les humains sont sortis de la bouche de poissons) Empédocle (490 à 435 av. JC) 1ères formes de vie: sorties de terre Accouplements entre ces formes (toutes sortes d’hybrides, hermaphrodites, créatures à deux têtes) Les créatures aberrantes ne survivent pas ou ne peuvent se reproduire. Seules les créatures harmonieuses se reproduisent et fondent de nouvelles créatures Evol d’Evol (2) 1 14/10/2015 Aristote (284-322 av. JC) Puisqu'en effet parmi les êtres les uns sont éternels et divins tandis que les autres peuvent aussi bien exister ou non et participent au pire comme du meilleur; comme l'âme est meilleure que le corps matériel, l'animé meilleur que l'inanimé parce qu'il a une âme, comme être est meilleur que ne pas être et vivre que ne pas vivre, pour toutes ces raisons il y a génération des animaux. Puisqu'il est impossible que la nature de ce genre d'être soit éternelle, c'est seulement dans une certaine mesure que ce qui naît est éternel. Individuellement, il ne le peut pas. Mais il peut l'être du point de vue de l'espèce. Voilà pourquoi il existe perpétuellement un genre des hommes, des animaux, des végétaux." (Génération des animaux II,1,731b)) Propose une classification hiérarchisée linéaire (Scala Natura) Scala Natura: I. les êtres humains, II. les Quadrupèdes vivipares, III. les Cétacés, IV. les Animaux sanguins ovipares, V. lesCéphalopodes, VI. les Crustacés, VII. les Animaux segmentés, VIII. les Mollusques à coquilles, IX. les Zoophytes(entre animaux et végétaux), X. les Plantes supérieures, XI. les Plantes inférieures, XII. les êtres inanimés Evol d’Evol (3) Théophrate (322 à 288 av. JC) Elève d’Aristote, il distingue le monde Animal / Végétal Propose une classification « utilitaire » des Végétaux (Historia planturum) Pline l’Ancien (-23 à 79) : Historia naturalis Classification animaux & Végétaux selon leur propriétés, leurs utilisations etc.. Classification « utilitaire » Evol d’Evol (4) 2 14/10/2015 Tchouang Tseu (IV s. av. JC, Chine) Père du Taoïsme qui rejette la fixité des espèces, celles-ci développent différemment des attributs en réponse aux divers environnements Al-Jahiz (776-868, Perse) « Les Animaux » Evolution selon: Lutte pour l’existence, Transformation et Influence de l’Environnement Nasir Ad-Din at Tuni (1201-1274, Perse) Précise que c’est la sélection des meilleurs et l’adaptation, moteur du « takâmul » (perfectionnement) Idées très «(pré)-darwiniennes » F. Alakkarov, 2001 the evolutionary niew by Nasiraddin Tusi http://azer.com/aiweb/categories/magazine/92_folder/92_articles/92_tusi.h tml Evol d’Evol (5) Augustin d’Hippone (354-430) (« Saint Augustin ») Des créatures nouvelles peuvent apparaître à partir de la décomposition de formes plus anciennes -> relation de parenté Pierre Belon (1517-1564) « La comparaison du susdit portraict des os humains monstre combien cestuy cy qui est d’un oiseau, en est prochain » Evol d’Evol (6) 3 14/10/2015 Bernard Palissy (1510-1590) « Comment (les) ignorants affirment que la nature ou le ciel ont créé (les fossiles) par des influences célestes ; comme si l'on n'y trouvait pas les coquilles qui se sont accrues par la longueur du temps, comme si dans l'écorce des coquilles et des colimaçons on ne pouvait pas compter les années ou les mois de leur vie... Nous ne voyons en eux aucun instrument capable de creuser la terre ou les pierres où on les trouve maintenant reclus.... Pourquoi trouve-t-on tant de fragments de coquilles entre deux couches de pierres, sinon parce que ces coquilles déjà déposées sur la plage y furent recouvertes d'une terre rejetée par la mer, laquelle terre est venue ensuite à se pétrifier ? " « Recepte véritable » 1563 Incrustation de coquille de bivalve = fossiles Evol d’Evol (7) Francesco Redi (1626-1697) Esperienze intorno alla generazione degl'insetti (1668) Pas de génération spontanée pour les macro-organismes Anton van Leeuwenhoek (1632-1723) « Perfectionneur » du microscope, il observe la présence d’ « Animalcules » (Org. microscopiques) •… on continue à croire à la génération spontanée pour les micro-organismes Evol d’Evol (8) 4 14/10/2015 Benoît de Maillet (1656-1738) Consul de France en Egypte Observe des sites fossilifères Ouvrage clandestin, publié après sa mort : « Telliamed ou Entretiens d'un philosophe indien avec un missionnaire français sur la diminution de la mer, la formation de la terre, l'origine de l'homme. » (1748) Terre vieille de plusieurs millions d’années avec assèchement progressif Ressemblances entre animaux terrestres et animaux marins Pressent que les animaux terrestres descendent de poissons par une adaptation progressive des organismes Considéré comme précurseur du transformisme Evol d’Evol (9) Carl von Linné (1707-1778) -Fixiste, il cherche a démontrer l’ordre divin dans la nature Classification hiérarchique non linéaire et nomenclature (« la connaissance des choses périt par l'ignorance du nom ») 1758 Systema Naturae système binominal (= 2 noms : Genre espèce) Bufo bufo (Linnaeus, 1758) an zéro de la taxonomie Classification arbitraire 6 races d’ Homo sapiens : Africanus, Americanus, Asiaticus, Europeanus et Monstrosus (e.g. nains des Alpes, géants de Patagonie) Evol d’Evol (10) 5 14/10/2015 Bernard de Jussieu (1699-1777) - docteur en médecine à Montpellier, puis Prof. de Botanique au Jardin du Roi (Paris) Ne suit pas la classification de Linné et développe la 1ere Classification des végétaux suivant un système basé sur la morphologie des plantes (principe de subordination des caractères) Classification naturelle Antoine-Laurent de Jussieu (1748-1836) Directeur du MNHN, il finalise le travail de son oncle et publie un système de classification basé sur des caractères communs. « Exposition d'un nouvel ordre des plantes, adopté dans les démonstrations du Jardin royal » 1774 et « Genera plantarum secundum ordines naturales disposita » 1789 Evol d’Evol (11) Georges Louis Leclerc, comte de Buffon (1707-1788) « Théorie de la Terre, Histoire générale des animaux et Histoire de l’Homme » 1749 - estime l'âge de la Terre (→ > 75 000 ans) -Concept d’ « Espèces perdues » -La diversité humaine suit les même lois que pour les animaux -Précurseur du transformisme (transformisme des espèces nobles et dégénération des autres) Evol d’Evol (12) 6 14/10/2015 Jean-Baptiste de Monet, chevalier de Lamarck (1744-1829) Elève de Buffon Militaire et botaniste, chaire des « Mollusques, vers et zoophytes » Fondateur de la Biologie Réconcilie les courants mécaniste et vitaliste Théorie du transformisme (1809) « Dans tout animal qui n’a point dépassé le terme de ses développements, l’emploi plus fréquent et soutenu d’un organe quelconque fortifie peu à peu cet organe, le développe, l’agrandit et lui donne une puissance proportionnée à la durée de cet emploi, tandis que le défaut constant d’usage de tel organe l’affaiblit insensiblement, le détériore, diminue progressivement ses facultés et finit par le faire disparaître. » Evol d’Evol (13) La fonction crée l’organe « Relativement aux habitudes, il est curieux d'en observer le produit dans la forme particulière et la taille de la girafe (camelo-pardalis) : on sait que cet animal, le plus grand des mammifères, habite l'intérieur de l'Afrique, et qu'il vit dans des lieux où la terre, presque toujours aride et sans herbage, l'oblige de brouter le feuillage des arbres, et de s'efforcer continuellement d'y atteindre. Il est résulté de cette habitude soutenue depuis longtemps, dans tous les individus de sa race, que ses jambes de devant sont devenues plus longues que celles de derrière, et que son col s'est tellement allongé, que la girafe, sans se dresser sur ses jambes de derrière, élève sa tête et atteint à six mètres de hauteur (près de vingt pieds) ( ... ). Les efforts dans un sens quelconque, longtemps soutenus ou habituellement faits par certaines parties d'un corps vivant, pour satisfaire des besoins exigés par la nature ou par les circonstances, étendent ces parties, et leur font acquérir des dimensions et une forme qu'elles n'eussent jamais obtenues, si ces efforts ne fussent point devenus l'action habituelle des animaux qui les ont exercés. « Cette transformation est transmissible (hérédité des caractères acquis … admise par tous à cette époque) D’où l’hypothèse d’une transformation (non perceptible par l’Homme) des espèces par complexification croissante (Comment expliquer la présence de forme simple de nos jours?) Evol d’Evol (14) 7 14/10/2015 Temps Complexification Evol d’Evol (15) Apparition spontanée Temps Complexification Evol d’Evol (16) 8 14/10/2015 Décrit des fossiles (malacofaune du Bassin Parisien) Définit les fossiles comme « des dépouilles des corps vivants altérés par leur long séjour dans la terre ou sous les eaux, mais dont la forme et l'organisation sont encore reconnaissables". Contrairement à Cuvier, Lamarck souligne les analogies qui existaient entre les espèces fossiles et les espèces actuelles. Développe la classification de Jussieu et introduit les 1ères clés de détermination dichotomiques (Philosophie Zoologique, 1809) Evol d’Evol (17) Augustin Pyrane de Candolle (1778-1841) « Théorie élémentaire de la Botanique 1813 » Botaniste suisse, il donne une série de règles création de la Taxinomie Editées et divulguées par son fils Alphonse « Lois de nomenclatures » 1867 A l’origine des 1er codes de Nomenclature Botanique et Zoologique (1892-1905) Code international de nomenclature zoologique (CINZ) http://iczn.org Code international de nomenclature botanique (CINB) http://www.iapt-taxon.org Evol d’Evol (18) 9 14/10/2015 Georges Cuvier (1769-1832) Père de l’anatomie comparée et de la Paléontologie des vertébrés (sarrigue des gypse de Montmartre) Remarques les changements fauniques au cours du temps mais l’absence de forme intermédiaire entre les espèces « perdues » et les espèces vivantes ne plaide pas pour une évolution « progressiste » fixiste NB: Structuration de l’enseignement primaire et supérieur (+ agreg) sous Napoléon 1er Evol d’Evol (19) Alcide d’Orbigny (1802-1857) -Inventeur de la micropaléontologie -Echelle biostratigraphique (27 étages) -Catastrophiste et fixiste (27 extinctions et 28 créations) Richard Owen (1804-1892) - « Cuvier » anglais - Taxonomique des vertébrés (marsupiaux) - Distingue les caractères analogues/homologues - Concepteur des « Dinosaures » - Fixiste/Evolutionniste? Evol d’Evol (20) 10 14/10/2015 Geoffroy st Hilaire (1722-1844) -Adopte les principes d’anatomie comparée de Cuvier (définit la notion d’homologie et d’unité de composition organique) -Adopte le transformisme de Lamarck... forte opposition au fixisme de Cuvier - Pont entre embryologie et anatomie comparée Evol d’Evol (21) Edward D. Cope (1840-1897) - Paléontologue et herpétologue à l’Académie - Grand récolteur de dinosaures fossiles (avec Marsh) - Concept de « lignée fossiles »: participe au début du mouvement « Neo-Lamarckiste » américain Charles Lyell (1797-1875) Echelle stratigraphique (Cénozoïque) Concept d’Uniformitarisme Evol d’Evol (22) 11 14/10/2015 Alfred Russel Wallace (1823-1913) « …chaque espèce est apparue tant dans l'espace que dans le temps avec une espèce apparentée proche… » « On the Law that has regulated the Introduction of New Species » 1855 « …divergence évolutionniste d'espèces par rapport à d'autres semblables suite à des pressions environnementales… » = sélection naturelle « On the Tendency of Species to form Varieties » 1858 « Mêmes conclusions » que Darwin mais avec statut social moindre. Evol d’Evol (23) Charles Darwin (1809-1882) Expédition du Beagle (1831-1836) -Récolte et publie des fossiles d’Amérique du Sud (1837) Erreurs (plaques de Glyptodon attribuées à tort à megatherium) Restauration de Glyptodon par Owen ?Espèces disparues/espèces nouvelles Evol d’Evol (24) 12 14/10/2015 Charles Darwin (1809-1882) Toujours à partir des observations faites durant l’expédition du Beagle (1836), il finalise le modèle d’évolution des récifs passés (1842) http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosdarwin/darwin.html (modèle de Darwin) Evol d’Evol (25) Charles Darwin (1809-1882) « Enfin un rayon de lumière m’est venu et je suis presque convaincu que les espèces ne sont pas (c’est comme si j’avouais un crime) immuables. Je pense que j’ai découvert (c’est une présomption) le moyen simple par lequel les espèces deviennent remarquablement adaptées à des fins variées. » (1844) Les pinsons des Galápagos Evol d’Evol (26) 13 14/10/2015 Charles Darwin (1809-1882) « De l’origine des espèces » (1859) « Les espèces qui survivent ne sont pas les espèces les plus fortes, ni les plus intelligentes, mais celles qui s’adaptent le mieux au changement. » Charles Darwin Evol d’Evol (27) Charles Darwin (1809-1882) Variations entre individus « Filtre environnemental » Survie des plus « aptes », à l’origine des générations suivantes = sélection naturelle Evol d’Evol (28) 14 14/10/2015 Critiques philosophiques et religieuses Transmission des caractères? Qu'est ce qui est transmis et comment ? NB : on croit toujours à l'hérédité des caractères acquis (mais la théorie de Darwin fonctionne sans ça !) Comment générer de la variabilité ? Evol d’Evol (29) Critiques/versions du Darwinisme: - Le Créationnisme - L’orthogenèse (« la vie possède une tendance innée au chgt vers une plus grande perfection », Osborn) - Le Néo-Lamarkisme (Transformation >> SN, Haeckel; Cope etc..) - Le Saltanionisme (Les « Mutationnistes », De Vries, Johanssen, Bateson, Morgan, Muller) - Intelligent design Evol d’Evol (30) 15 14/10/2015 Ernst Haeckel (1834-1919) - Illustre et vulgarise le Darwinisme et le principe de « Triple parallélisme » - Anatomiste, il présente les premières études de Développement Triple parallélisme: ordre d’apparition des fossiles = relation de parenté = ordre d’apparition ontogénétique Evol d’Evol (31) Louis Pasteur (1822-1895) Travaille sur les microbes En 1864 (deux siècles après Redi !), démontre définitivement que les microorganismes n'apparaissent pas non plus par génération spontanée ! 16 14/10/2015 August Weismann (1834-1814) -Opposant au créationnisme et Darwiniste convaincu - Considéré comme un précurseur du néodarwinisme - Théorie du plasma germinatif Approche expérimentale sur l'hérédité Coupe la queue de souris (22 générations) … les descendants ont toujours une queue ! → met à mal l'hérédité des caractères acquis (mais critiquable : il s'agit de mutilations, pas de caractères acquis naturellement) Sans génération spontanée ni hérédité des caractères acquis, la théorie de Lamarck ne tient plus ! Grégor Mendel (1822-1884) Mathématicien, Contemporain de Darwin (qui n'a pas perçu l'intérêt de ses travaux) -Contrairement à Darwin (approche empirique), Mendel développe des approches expérimentales et des analyses mathématiques Approche expérimentale: 7 caractères croisements contrôlés 28000 individus Analyse mathématique Sur 15 espèces en tout ! Evol d’Evol (34) 17 14/10/2015 Les proportions de plantes ayant 1 caractère donné sont constantes au cours de génération La graine hérite de chaque parent un « élément déterminant » du caractère transmissible et inaltérable = Transmission héréditaire des caractères (Loi de Mendel, 1866) AA aa Uniformité des hybrides F1 Aa AA Aa Aa Aa aa Disjonction des caractères en F2 Ségrégation indépendante des caractères Variabilité expliquée Evol d’Evol (36) 18 14/10/2015 Hugo de Vries (1848-1935) botaniste Carl Correns (1864-1933) botaniste Erich von TschermakSeysenegg (1871-1932) botaniste Redécouverte des lois de Mendel (1900) Evol d’Evol (37) Hugo de Vries (1848-1935) -Transmission des caractères par l’intermédiaire de « Pangènes » - Caractères originaux pouvant surgir alors qu’aucun des parents ne les portent = « mutation » (« Théorie des mutations », 1901) Les « pangènes » deviennent des « gènes », génotypes et phénotypes (1913) Wilhelm Johanssen (1857-1927) Étude des gènes = Génétique William Bateson (1861-1926) Evol d’Evol (38) 19 14/10/2015 Thomas Morgan (1866-1945) Théorie chromosomique de l’hérédité (« the mechanism of mendelian heredity », 1915) Génétique généalogique (« the theory of the gene », 1926) - des traits phénotypiques sont liés au sexe, le trait "couleur de l'œil" est probablement porté par le chromosome sexuel et que d'autres gènes sont probablement portés par d'autres chromosomes = localisation des gènes sur le chromosomes, carte génétique Evol d’Evol (39) Les mendéliens « Mutationnistes » (« les généticiens ») De Vries, Johanssen, Bateson, Morgan, Muller « La mutation à l’origine des innovations » Les mendéliens « Sélectionnistes » (« les statisticiens et biométriciens») « La sélection explique l’innovation » Galton (Galtoniens, évolution discontinue) Pearson (Darwiniens, évolution continue) Evol d’Evol (40) 20 14/10/2015 Vers la synthèse « néodarwinienne » Transmission du matériel héréditaire Modélisation mathématique Sewal Wright (1889-1988) Ronald Fisher (1890-1962) Evolution des populations Génétique formelle génétique des populations Evol d’Evol (41) Vers la synthèse « néodarwinienne » T. Dobzhansky (1900-1975) généticien Genetics and the Origin of Species, 1937 E. Mayr (1904-2005) systématicien Systematic and the Origin of Species, 1942 G.G. Simpson (1902-1984) paléontologue Tempo and Mode in Evolution, 1944 J. Huxley (1887-1975) biologiste Evolution: the modern synthesis, 1942 G.L. Stebbins (1906-2000) botaniste Variation and Evolution in Plants 1950 « Théorie synthétique de l’évolution » Evol d’Evol (42) 21 14/10/2015 La synthèse « néodarwinienne » -l'évolution est graduelle et se produit par variations continues -c'est la sélection naturelle qui est le moteur principal de l'évolution, en privilégiant les espèces les mieux adaptées à leur environnement. - le changement évolutif par mutation peut se faire de deux façons : l'anagenèse (une lignée descendante remplace une lignée ancestrale dans la continuité) et la cladogenèse (une lignée ancestrale se scinde en deux lignées descendantes). = Mécanisme de « spéciation » Evol d’Evol (43) A. Wegener (1880-1930) Dérive des continents (1915) explique les distributions fauniques et floristiques actuelles, et implique de travailler à la fois dans le temps et l’espace pour la définition des espèces (Mayr, 1982) Evol d’Evol (44) 22 14/10/2015 - Révolution phylogénétique - Développement / redécouverte de l’Evo-Devo (gènes du Développement) - Développement des théories néodarwiniennes (Gènes égoïste, Reine rouge, théorie du handicap…etc Hamilton, Price, Maynard Smith…) - (re)découverte de l’Epigénétique Evol d’Evol (45) Emil Hans Willi Hennig (1913-1976) - Distingue « ce qui est plus proche de qui » (phyloG) de « ce qui descend de qui » (généalogie) - fondements de la classification phylogénétique reposant sur le concept de Clade Monophylétique (cladism) / phénétique (1950) Basic outline of a theory of phylogenetic systematics (1966) Phylogenetic Systematics (University of Illinois Press) Père de la “cladistique” (E. Mayr) Travaux surtout développés dans les années 70 par J, S. Farris, W, Fitchand, and H, Wagner, Evol d’Evol (46) 23 14/10/2015 G.H.F. Nuttall (1904) Utilise pour la première fois les incompatibilités immunologiques entre primates pour estimer leur distance évolutive relative Linus Pauling & Emile Zuckerkandl (1965) « Horloge Biologique » = mutation génétique s’accumule à un rythme constant 1984 PCR 1986 Woese & Olsen (Endosymbiose Mito/Chloro révélées par 16s) 1990 GenBank Evol d’Evol (47) Motoo Kimura (1924-1994) Théorie neutraliste de l’évolution (1980) (théorie de la mutation et de la dérive aléatoire) « les mutations sont à la fois l’aliment de la sélection naturelle – puisque sans elle la sélection est insuffisante à enchaîner sur de nouveaux génotypes – et suivent des régularités qui ne sont pas celles de la sélection naturelle. » « Là où il y a sélection, il y a des contraintes sur la fixation des mutations ; lorsqu’il n’y a pas sélection, la plupart des mutations sont neutres et donc il y a évolution rapide au niveau moléculaire » réservoir de mutations qui deviennent avantageuses par suite de changements d’environnements. « longue phase faite surtout d’évolution moléculaire, avec une « sélection stabilisatrice » qui essentiellement supprime les allèles délétères, et phase de « sélection directionnelle », c’est-à-dire sélection changeant la valeur adaptive de traits phénotypiques en réponse à un changement environnemental » (pp.418-421). Evol d’Evol (48) 24 14/10/2015 Avec l’avènement des données moléculaires, Méthode Phénétique (classification basée sur la ressemblance globale = distances) Développée par Sneath (1923-2011) et Sokal (1926-2012) en phylogénie Méthode Probabiliste (classification basée sur le maximum de vraisemblance = probabilité conditionnelle) Méthode de Fisher (1922), application en phylogénie suggérée par Edwards et Cavalli-Sforza (1964) puis appliquée par Neyman (1971) et Felsenstein (1981) Evol d’Evol (49) S. J. Gould, (1941-2002) N Eldredge & S. J. Gould (1972) Equilibres Ponctués : « stase et spéciation » (Ponctualisme) Replace le débat de l’évolution sur le plan du processus général. Réintroduit la notion de hasard et de contingence Evol d’Evol (50) 25 14/10/2015 Hétérochronies du développement (Gould, 1977) Réactualise Goldsmith (1930 « Monstres prometteurs ») Ouvre la voie de la Génétique du Développement (gènes du dev) Evol d’Evol (51) L. Thaler (1930-2002) Paléontologue, il rapporte la vision de G.G. Simpson en France Fédère la Paléontologie, la Génétique et l’Ecologie = Création de l’ISEM (1980) Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier http://www.isem.univ-montp2.fr Evol d’Evol (52) 26