cours 6 la systématique et phylogenèse

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La phylogenèse
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• Définition :
= généalogie d’une espèce ou d’un groupe
d’espèces apparentées.
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La phylogénie
• Définition :
= La phylogénie est l'étude des relations de
parentés entre différents êtres vivants en vue
de comprendre l'évolution des organismes
vivants
Reconstruction des relations évolutives et
leur représentation dans des «arbres».
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La phylogénie
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• La vie a une histoire, elle a changé au cours
du temps et différentes espèces partagent un
ancêtre commun.
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La systématique
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• Définition :
= étude de la diversité biologique
→ reconstituer la phylogenèse des espèces.
Ϲ taxonomie = science qui nomme et classifie
les espèces
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La taxonomie
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• XVIIIème, Linné
- Nomenclature binomiale (genre – espèce)
- Classification → hiérarchie de catégories
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La phylogénie
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• Un arbre est une hypothèse au sujet des
relations entre organismes.
3 domaines (= clades)
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La phylogénie
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• Un arbre est une hypothèse au sujet des
relations entre organismes.
3 clades = domaines
Les archées forment un
groupe de micro-organismes
unicellulaires
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La phylogénie
Page 53
• Un arbre est une hypothèse au sujet des
relations entre organismes.
3 clades = domaines
Les bactéries sont des
organismes
vivants
unicellulaires
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La phylogénie
• Un arbre est une hypothèse au sujet des
relations entre organismes.
3 clades = domaines
Procaryotes
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La phylogénie
• Un arbre est une hypothèse au sujet des
relations entre organismes.
3 clades = domaines
Les eucaryotes
Animaux
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Les Animaux
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Les Vertébrés
Page 54
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La taxonomie
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Taxonomie du chat domestique
Règne
Animal
Embranchement
Cordés
Sous-Embranchement
Vertébrés
Classe
Mammifères
Ordre
Carnivores
Famille
Félidés
Genre
Felis
Espèce
domestica
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La taxonomie
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• Taxon
= un rang taxonomique identifié (quelque
soit le niveau)
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Comprendre la phylogénie
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• ≠ lecture d’un arbre généalogique
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Comprendre la phylogénie
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• Spéciation = branche
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Comprendre la phylogénie
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• Les phylogénies tracent des dessins d’ancêtres
partagés entre les lignées
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Comprendre la phylogénie
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• Chaque lignée a des ancêtres qui sont uniques
à cette lignée et des ancêtres qu’elle partage
avec d’autres lignées, des ancêtres communs.
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Un clade
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• Définition :
= Un clade est un groupe monophylétique
d'organismes vivants ou éteints comprenant un
organisme particulier (ancêtre commun) et
tous ses descendants.
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Monophylétique
• Définition :
= Un clade est un groupe monophylétique
d'organismes vivants ou ayant vécu
comprenant un organisme particulier et tous
ses descendants.
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Un clade
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Les clades
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• Imbriqués les uns dans les autres (hiérarchie)
• Un clade peut inclure plusieurs milliers
d’espèces ou seulement quelques-unes.
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Phylogénie
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• Echelle ou branches
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Phylogénie
• Echelle ou branches
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Phylogénie (lecture)
FOUGERES PIN
ROSE
évolution
≠ plantes primitives
Lignée n°1
MOUSSES
≠ ancêtres des autres plantes
Lignée n°2
• Interprétation:
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Evénement de spéciation
Nbres caractéristiques partagées
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Phylogénie (lecture)
Page 57
• 3 éléments importants:
– Eléments n°1:
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Phylogénie (lecture)
Page 57
• 3 éléments importants:
– Eléments n°2:
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Phylogénie (lecture)
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• 3 éléments importants:
– Eléments n°3:
MOUSSES FOUGERES PIN
ROSE
FOUGERES PIN
ROSE
MOUSSES
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Phylogénie des vertébrés
Page 58
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Construire les arbres
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• Les arbres phylogénétiques représentent des
généalogies.
– On recueille des caractères:
= Traits héritables qu’il est possible de comparer
entre les organismes.
- caractères physiques (morphologique)
- séquences génétiques
- traits comportementaux
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Phylogénie des vertébrés
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• Procédure:
– Examiner des représentants de chaque lignée
→ infos sur leur morphologie
- Vertébrés ou non
- Squelette osseux ou non
- Quatre membres ou non
- Œuf amniotique
-…
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Construire les arbres
Page 59
• Utiliser les caractères dérivés partagés
→ trouver des preuves
→ grouper des organismes dans des clades
monophylétiques.
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Construire les arbres
Page 59
• Utiliser les caractères dérivés partagés
– Exemple:
Comment
déterminer
les
relations à l’intérieur de ce
clade ?
Examiner d’autres caractères
qui
varient
dans
les
différentes lignées du clade
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Homologie
Pages 59-60
• Caractères homologues
= caractères similaires chez plusieurs
organismes qui révèlent un héritage d’un
ancêtre commun qui avait aussi ce caractère.
= indicateur fiable
de l’existence d’un ancêtre commun
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Homologie
Page 60
• Caractères homologues
– Exemple:
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Homologie
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• Tous les caractères ne sont pas des homologies
• Exemple:
– Les oiseaux et les chauves-souris ont des ailes, alors
que les souris et les crocodiles n’en ont pas
– Cela veut-il dire que les chauves-souris ont une
parenté plus proche avec les oiseaux qu’avec les
souris et les crocodiles?
NON
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Analogie
Page 60
• Examinons les ailes des chauves-souris et des
oiseaux
Chauve-souris
Oiseau
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Analogie
Page 60
• Représentation phylogéniques
Chauve-souris
Souris
Oiseau
Crocodile
Membres antérieurs
ont évolué en ailes
Evolution de
quatre membres
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Analogie
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• Représentation phylogéniques
Chauve-souris
Souris
Oiseau
Crocodile
Membres antérieurs
ont évolué en ailes
Evolution de
quatre membres
= origine évolutive différente, mais ressemblance.
= évolution convergente
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Synapomorphie
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= Caractère dérivé qui a évolué dans une lignée
→ clade monophylétique et qui sépare ses
membres d’autres individus
Exemple:
– Les plumes des oiseaux
Une synapomorphie est une homologie
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Autapomorphie
Page 60
= Caractère dérivé propre à un taxon
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Caractère ancestral
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= Caractère qui n’a pas subi de modification au
cours de l’évolution.
= une symplésiomorphie
Ce caractère homologue a été conservé depuis le
premier ancêtre du groupe le présentant, mais pas
nécessairement présent dans toutes les espèces qui en
descendent.
Exemple: la pentadactylie
→groupe paraphylétique
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