COURS ÉLÈVES 01/10/14 2 EXPRESSION DU PATRIMOINE GÉNÉTIQUE, STABILITÉ ET VARIATION DE L'ADN Le fonctionnement d'un être vivant est sous le contrôle de son ADN en interaction avec son environnement. Nous nous intéresserons: aux modalités de sa transmission de l'ADN de cellule en cellule à la manière dont l'ADN contrôle le fonctionnement des cellules. à l'origine de la variabilité de la molécule d'ADN Dans le noyau, l'ADN est associé à des protéines formant ainsi un ensemble facilement colorable, la chromatine. Lors des divisions cellulaires, la chromatine (état non condensé de l’ADN) s'enroule, se condense en structures visibles au microscope ordinaire, les chromosomes , structures constantes des cellules à noyau (eucaryotes). Les chromosomes sont donc dans des états de condensation variables au cours du cycle cellulaire. 2.1 Transmission de la molécule d'ADN de cellule en cellule: la reproduction conforme de la cellule 2.1.1 Les étapes de la mitose au niveau cellulaire (cytologique) En général la division cellulaire est une reproduction conforme qui conserve toutes les caractéristiques du caryotype (nombre et morphologie des chromosomes = 23 paires de chromosomes dans l'espèce humaine). Le cycle cellulaire se déroule en 2 grandes étapes: l'interphase, étape du travail normal de la cellule, puis mitose, étape de division de la cellule . Ces 2 étapes comportent des phases dont les caractéristiques expliquent cette reproduction conforme . L' interphase comporte une phase où les chromosomes sont à l'état standard (2 brins complémentaires de nucléotides au niveau de l'ADN), la phase G1, une phase de synthèse d'ADN, la phase S et une phase de préparation de la division, phase G2. La mitose comporte 4 phases principales décrites sur le schéma ci-dessous (étapes 2 à 7 du schéma) . les chromosomes se déplacent le long de protéines tubulaires constituant une structure appelée fuseau. Les étapes de la mitose, observation cytologique 2.1.2 La mitose au niveau moléculaire Comme vu en seconde, l'ADN est le support de l'information génétique. L'ADN est formé d'une chaîne composée de deux brins complémentaires de nucléotides. Chaque nucléotide est formé par l'association d'un phosphate, d'un sucre (le désoxyribose) et d'une base azotée. Il y a 4 bases azotées différentes (adénine, guanine, cytosine, thymine) dans l'ADN donc 4 types de nucléotides. la séquence nucléotidique de l'ADN détermine les caractéristiques de l'individu. Chaque chromatide contient une molécule d’ADN. Au cours de la phase S, l’ADN subit la réplication semi-conservative . En l'absence d’erreur, ce phénomène préserve, par copie conforme, la séquence des nucléotides. Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 1 Sur 7 COURS ÉLÈVES 01/10/14 Réplication de l'ADN L'enzyme (= catalyseur biologique = accélérateur de réaction) est indispensable au bon déroulement de la réplication. Évolution du taux d'ADN au cours du cycle cellulaire Schéma récapitulatif du cycle cellulaire Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 2 Sur 7 COURS ÉLÈVES 2.2 01/10/14 Détermination du phénotype, rôles des protéines et de l'ADN: 2.2.1 Les molécules responsables du phénotype : La drépanocytose est une maladie provoquée par la mutation du gène codant pour la hémoglobine (gène porté par le chromosome 11). Le phénotype malade comporte des aspects macroscopiques qui s’expliquent par la modification d’une protéine. Ces protéines, en régissant la structure et les activités cellulaires, contribuent à l'établissement du phénotype. Protéine particulière propriétés particulières phénotype particulier Les propriétés des protéines dépendent de leur séquence en acides aminés (structure primaire). La structure primaire (20 acides aminés différents) détermine par repliements successifs la structure spatiale de la protéine (forme) celle ci déterminant à son tour les propriétés de la protéine. Finalement, les phénotypes alternatifs sont dus à des différences dans les protéines concernées . Séquence en acides aminés forme de la protéine propriétés phénotype Influence de la séquence en acides aminés sur la forme de la protéine La valine en position 6 sur l'hémoglobine S permet la création de liaisons entre les molécules d'hémoglobine S lorsque le globule rouge est peu oxygéné ceq ui rigidifie les globules rouges Le phénotype macroscopique dépend du phénotype cellulaire, lui-même induit par le phénotype moléculaire. Au niveau moléculaire, ce sont les protéines qui sont responsables du phénotype. Les protéines sont les molécules réalisant l'essentiel du travail dans les cellules (les « ouvriers » de la cellule). Nous avons ainsi parlé des récepteurs de neuromédiateurs ou de l'ADN polymérase qui réalisent chacune un travail particulier fondamental pour l'organisme. En conséquence se pose la question de ce qui détermine les caractéristiques des protéines. Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 3 Sur 7 COURS ÉLÈVES 01/10/14 2.2.2 De l'ADN à la protéine: le codage de l'information Chaque acide aminé de la protéine est codé par 3 nucléotides successifs au niveau de l'ADN. Ce triplet est appelé un codon. 64 codons codent pour 20 acides aminés (code redondant) . La séquence des acides aminés d'une protéine dépend de la portion codante de la molécule d'ADN. Un gène est une séquence de nucléotides, une série de codons, déterminant la séquence d'une protéine donnée. La molécule d'ADN d'un chromosome est le support de très nombreux gènes (23000 gènes pour l'espèce humaine). Il se trouve à un endroit déterminé sur un chromosome (son locus) ADN codon ATG TTT CAT AGT Acide aminé Mét Phe His Ser Protéine Séquence ADN Séquence en AA forme protéine propriétés phénotype Rappel: Un gène donné peut présenter différentes séquences de nucléotides, chaque séquence particulière est appelée un allèle. L'ensemble des allèles constituent le génotype. Chaque chromosome comporte de nombreux gènes. Pour un gène donné, il existe généralement dans une population de nombreuses versions différentes du gène: ce sont ses allèles. Lorsqu’un chromosome est en 2 exemplaires dans la cellule (cas général sauf XY chez l’homme), la cellule comporte 2 allèles pour le même gène. Ces 2 allèles peuvent être différents (individu hétérozygote) ou identiques (individu homozygote). Un allèle confronté à un autre s'exprimer alors que l'autre ne s'exprime pas, celui qui s'exprime est qualifié de dominant, celui qui ne s'exprime pas est qualifié de récessif . 2.2.3 Le rôle du milieu dans la détermination du phénotype Les allèles fournissent un potentiel à l’organisme mais l’influence du milieu est déterminante dans la détermination du phénotype de l'individu, dans la détermination de ses caractéristiques réelles. Les effets du milieu peuvent être réversible ou irréversibles. Ainsi en est il de l'influence du soleil sur la couleur de la peau des personnes à peau claire, de l'influence de l'alimentation sur la masse corporelle, de l'influence de la cigarette sur les capacités respiratoires … . Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 4 Sur 7 COURS ÉLÈVES 2.3 01/10/14 Les étapes de la synthèse des protéines à partir du message codé au niveau de l'ADN 2.3.1 De l'ADN a l'ARN messager: la transcription La synthèse des protéines se fait dans le cytoplasme alors que l'information génétique est dans le noyau. Une molécule assure le transfert de l'information du noyau vers le cytoplasme. Dans le noyau (cellules à noyau = eucaryotes), un des brins de l'ADN est transcrit en une autre molécule, l'ARN prémessager, ce brin d'ADN est qualifié de brin transcrit (l'autre brin est le brin codant) . L'ARN prémessager est modifié en ARN messager (maturation) dans le noyau. Cette étape de maturation va enlever des parties de l'ARN prémessager et recoller les morceaux restants pour former l'ARN messager. Le découpage pouvant se produire de différentes manières, cela peut permettre de fabriquer plusieurs ARN messagers à partir d'un même gène. L'ARN messager est ensuite chargé de transporter l'information du noyau vers le cytoplasme . L'ARN messager est constitué de 4 types de nucléotides correspondant à 4 bases azotées, adénine, guanine, cytosine et uracile. La synthèse de l'ARN messager est catalysée (accélérée) par une ARN polymérase (enzyme). Séquence ADN (brin transcrit) Séquence ARN 2.3.2 De l'ARN messager à la protéine: la traduction La traduction est la synthèse cytoplasmique de chaînes protéiques . Elle est réalisée par les ribosomes. La séquence des acides aminés dépend de celle des nucléotides de l'ARN messager suivant un système de correspondance, le code génétique (commun à la plupart des êtres vivants). La traduction débute au codon d'initiation AUG qui oriente la lecture du message au niveau de l'ARN messager et s'arrête à un codon stop UAG … . En présence d'un codon donné, un ARN de transfert (transporteur d'acide aminé) apporte un acide aminé précis. Exemple si le codon est AUG, l'acide aminé est la méthionine. Séquence ADN Séquence ARN Séquence en AA forme protéine propriétés phénotype L’ensemble des protéines qui se trouvent dans une cellule (phénotype moléculaire) dépend : - du patrimoine génétique de la cellule (une mutation allélique peut être à l’origine d’une protéine différente ou de l’absence d’une protéine) ; - de la nature des gènes qui s’expriment sous l’effet de l’influence de facteurs internes et externes variés (localisation des cellules par exemple). Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 5 Sur 7 COURS ÉLÈVES 01/10/14 2.4 La variabilité génétique et ses conséquences L’ADN peut présenter des erreurs spontanées, rares et aléatoires, les mutations (addition délétion substitution) . Elles apparaissent en particulier lors de la réplication de l'ADN et leur fréquence est augmentée par l’action d’agents mutagènes (UV dont soleil, benzopyrène dont fumée de cigarette, chaleur, virus ...) . Le plus souvent l’erreur est réparée par des systèmes enzymatiques . Quand elle ne l’est pas, si les modifications n’empêchent pas la survie de la cellule, elle pourra être transmise si la cellule se divise (voir mécanisme de la mitose). 2.4.1 Conséquences d'une mutation en fonction du type de cellule touchée Si une mutation affecte une cellule germinale du parent (cellule intervenant lors de la reproduction), en raison du mécanisme des mitoses, toutes les cellules de l'organisme sont touchées. Elle est donc héréditaire. Si une mutation affecte une cellule somatique du parent (cellule non germinale), en raison du mécanisme des mitoses, seules les cellules descendant de la cellule touchée sont affectées. Elle n'est donc pas héréditaire. Cellule germinale Œuf affectée Cellule somatique mitoses affectée 2.4.2 Mutations et biodiversité Une mutation peut conduire à un nouvel allèle fonctionnel et n'affectant pas de manière notable le fonctionnement de l'organisme. Elle devient alors source de la diversité des allèles, fondement de la biodiversité. Ainsi le gène MC1-R (porté par le chromosome 16) code pour une protéine contrôlant la formation de pigments bruns au niveau de la peau et des poils. Si la mutation de ce gène inactive le récepteur MC1R, il n'y a pas de fabrication de pigment brun, donc les individus ou animaux auront une couleur claire. Ces variations peuvent présenter des implications en matière de santé : Biodiversité humaine constituant une protection de la population contre les changements de milieu. Exemple des contrôleurs pour le SIDA L’enzyme apobec3 est capable de provoquer des mutations inactivant l‘ADN viral Le virus du SIDA est généralement insensible à cette enzyme Une mutation de l’enzyme apobec3 (sur le chromosome 22) peut rétablir sa capacité à inactiver l’ADN du VIH La personne est ainsi protégée contre le développement du VIH Biodiversité microbienne expliquant la résistance des populations de microbes aux médicaments Exemple de la résistance de certaines bactéries contre les antibiotiques. Le médicament tue toutes les bactéries sauf celles ayant muté, résistantes. Si les antibiotiques sont trop utilisés, les bactéries résistantes, n’ayant plus de concurrentes, se multiplient. Il y a eu sélection « naturelle » des bactéries résistantes Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 6 Sur 7 COURS ÉLÈVES 01/10/14 2.4.3 Mutations et maladies Une mutation peut conduire à un nouvel allèle non fonctionnel ou à un allèle fonctionnel mais dont le nouveau fonctionnement altère le fonctionnement de l'organisme. Elle devient alors source de maladie. Le cancer est ainsi une maladie issue d'une mutation d'un gène contrôlant la division cellulaire . Les divisions cellulaires deviennent incontrôlées ce qui perturbe le fonctionnement de l'organisme. La présence d'une mutation peut augmenter le risque de maladie sans la déclencher de manière systématique (le mode d'action de la mucoviscidose n'est donc pas le cas le plus général). En général les modes de vie et le milieu interviennent également, et le développement d’une maladie dépend alors de l’interaction complexe entre facteurs du milieu et génome. Un exemple de maladie (maladie cardiovasculaire, diabète de type II) permet d’illustrer le type d’études envisageables gènes protéines phénotype environnement La connaissance de la nature des perturbations du génome responsable d’un cancer permet d’envisager des mesures de protection (évitement des agents mutagènes, surveillance, vaccination). Par des actions sur l'environnement par des actions sur les gènes Dans le cas de la mucoviscidose, on limite les effets de la maladie en agissant sur des paramètres du milieu. La thérapie génétique (ajout d'un allèle fonctionnel dans les cellules malades) constitue un espoir de correction de la maladie dans les cellules pulmonaires atteintes. Daniel Devallois 74160 St Julien en genevois 7 Sur 7