MN Adam, CH Orsay B Pangon, Versailles C Eloy, Troyes Evaluer les pratiques lors d’endocardites, myocardites, péricardites dans nos laboratoires d’après le référentiel de microbiologie de la Société Française de Microbiologie (REMIC). Un questionnaires a été adressé aux membres du collège de bactériologie, virologie hygiène au mois de mars 2011 sur les pratiques de diagnostic direct et indirect de microbiologie y compris la biologie moléculaire. Établissement Phase préananalytique Méthodes diagnostiques: ◦ Culture ◦ Biologie moléculaire ◦ Recherche d’antigènes ou d’anticorps 66 laboratoires ont répondu sur les 210 établissements représentant le collège (310 membres). 1 questionnaire non rempli car absence de ces pathologies dans l’établissement 25 é t 20 20 a b l 15 15 i N s b s 11 10 8 e m e n 5 1 t s 5 0 <100 100- 199 200-299 300-399 400-499 Nb de lits > 500 25 23 é t a 20 b l i N s b s e 15 11 10 m e n 5 5 10 7 6 t s 0 < 10 10 à 19 20 à 29 30 à 39 40 à 49 Nb de lits > 50 40 é t a b l N b i s s e m e n t 37 35 30 25 20 15 15 8 10 5 1 0 0 < 10 10 à 19 Nb de lits > 20 Toujours Jamais Parfois Endocardites 8 7 50 Péricardites 3 19 41 Myocardites 3 26 34 Renseignement ATB 5 5 55 Appel biologiste (endo) 2 4 57 ENDOCARDITES Automates : - 43 Bac Alert de Biomérieux - 22 Bactec de Becton Dickinson Flacons avec résine ou charbon (absorption des antibiotiques) : 8 sans / 56 avec Suspicion du diagnostic d’endocardite : - 31 toujours - 2 jamais - 27 parfois Nbre d’Hémocultures 3/24H 12 3/24h 3h/24 Renou- H pdt velmt 3J 72H si neg 43 8 Durée d’incubation si endocardite 10 jours 11-15 jours 21 jours 28-30 jours 12 8 33 6 Repiquage des hémocultures : - oui : 6 - non : 53 Utilisation des tubes Isolator : - oui : 3 - non : 62 CMI CMB PBS Associa- Conserva tion AB -tion souche Toujours 37 0 0 0 57 Jamais 2 62 58 55 1 Parfois 25 2 6 9 6 Intérêt de conservation de la souche et réalisation de la CMI (ex Streptocoque et Pénicilline G et Pénicilline A) : durée de traitement et posologie en fonction de la CMI. Réalisations de la CMB, de l’association des AB et du PBS non marquées dans le REMIC. 3 Hémocultures prélevées (inhibiteur si possible) Qualité de flacons permet la croissance de bactérie à croissance difficile (durée recommandé par le fabricant). Durée d’incubation conseillée de 15 à 30 J (3 semaines). Prélèvement sur Isolator possible (concentration des bactéries intracellulaires) Si Hémocultures négative, il est conseillé de reprélever des Hc 3J plus tard Tube hépariné pour culture cellulaire : C burnetti, Bartonella spp , T. Whipplei Sérologie : C. burnetti , Bartonella spp , Brucella spp, Chlamydiae spp, Legionella spp, Mycoplasma spp, Aspergillus spp et Candida spp (gras : conférence consensus 2009) Biologie moléculaire : prélèvement peropératoire-conférence consensus 2009 PCR valve : C. burnetti , Brucella spp, Whipple Legionella spp, Mycoplasma spp PERICARDITES 52/65 établissements reçoivent des liquides péricardiques < 10 liquides : 41 Entre 10 et 50 : 10 NSP : 1 Deux établissements font de la culture cellulaire pour une recherche virale. Cyto-bactériologie conventionnelle des liquides péricardiques Cytologie Quantitative Gram Giemsa Ziehl/ Auramine Hemoc BK Toujours 42 49 27 5 16 8 Jamais 6 0 6 37 3 2 Parfois 4 3 19 10 33 42 (36 > 10GB : 9 >50 GB : 5 >100GB :2 sur prescription) Les pratiques d’ensemencement sont très variables suivant l’établissement . La recherche mycologique n’est pas faite systématiquement Les durées d’incubation vont de 48 H à 30 jours essentiellement pour la mycologie avec une moyenne de 5 jours. SEROLOGIES ENDOCARDITESPERICARDITESMYOCARDITES Endocardites Péricardites Myocardites Coxiella burnetti 25 7 5 Bartonella spp 21 4 4 Chlamydiae spp 15 6 5 Rickettsies : 11 4 5 Brucella 18 4 2 Legionella spp 7 2 2 Mycoplasma spp 9 7 6 Candida spp 4 1 1 Aspergillus spp 3 1 1 Toxoplasmose 4 4 4 Endocardites Péricardites Enterovirus (coxsackie, Echovirus) Myocardites 4 12 11 5 12 11 3 4 7 3 1 1 6 6 4 4 9 5 2 5 3 4 8 5 2 6 4 3 3 1 1 3 2 CMV Myxovirus Arbovirus VHC VIH Parvovirus B19 EBV Adenovirus HSV Virus de la rougeole Autres sérologies réalisées : Whipple, VZV,HBV, Trypanosome, rubéole, toxocarose Entre 21 (endocardite)-33 (myocardite) réponses NSP BIOLOGIE MOLECULAIRE ENDOCARDITESPERICARDITESMYOCARDITES Endocardites Péricardites Myocardites ARN 16S Groupe herpès Mycobactéries Parvovirus B19 Entérovirus Grippe-Chlamydiaefièvre Q-Whipple 1 1 0 2 2 1 3 1 1 0 4 0 1 3 3 1 1 0 Autres PCR réalisées : légionelle, Adénovirus, ARN 18S fongique Entre 13 (endocardite)-23 (myocardite) réponses NSP 26 établissements ne font jamais de biologie moléculaire Pratiques très variées suivant les établissements Manque de renseignements cliniques Intérêt d’harmonisation des pratiques Importance du dialogue entre clinicienbiologiste pour une meilleure prise en charge du patient (protocoles écrits en commun). Alba Sauviat C. Chaumont, Belmonte O. Réunion, Bensedik Z. Chartres, Blanc V. Antibes, Boucaud Maitre Y Lyon, Breuil J. Ouanich J. Villeneuve St Georges, Cattier C. Amboise, Cattoen C. Valenciennes, Chardon H. Aix, Danjoux M. F. Tarbes, Danquigny A.L. Vienne, Decousser J.W. Béclère Clamart, Delesalle S. Mendes Martins L. Charleville , Deligne D. Remiremont, Demachy M.C. Meaux, Deregnaucourt J. Bellan, Doat V. Bourgoin –Jallieu, Dubourdieu B. Rodez, Elharrif Z. Libourne, Eloy C. Troyes, Evers A. Annonay, Fasquelle D. Thonon, Fevre C. Montbéliard, Fiette H. Melun, Hombrouck-Alet C. Blois, Geffroy F. Quimper, Gravet A. Delarbre J.M. Mulhouse, Goursaud R. Nouméa-IP Nouvelle Calédonie, Grise G. Elbeuf, Guiet P. sens, Jensen C. Avignon, Julienne G. Laurens E. Belfort, Laluque S. Montluçon , Lamarca R. Narbonne, Lambert C. Longjumeau, Lebrun C. Cholet, Lecaillon E. Perpignan, Lemenando Saint Nazaire, Leturdu F. Argenteuil, Lureau P. Niort, Machuca S.Langres, Mandjee A. Drome, Noulard M.N. Arras, Ogier Desserrey A Chalons sur Saône, Palette X. Dourdan, Pangon B. Versailles, Paul J.G. Boulogne sur Mer, Petitboulanger N. Dole, Pocheret H. Aulnay, A.S. Poirier La Roche/Yon, Rey H. St Cloud, Richardin F. Mantes la Jolie, Sanchez R. Périgueux, Stolidi P. Aubagne, Thellier J. P. Château Thierry, Vachée A. Roubaix, Varache C. Le Mans, Vaucel J. Saint Brieuc, Verdier I. Bourg en Bresse, Verhaeghe A. Dunkerque, Villemain M. Aurillac, Vrillon H. Saint Maurice, Wilhem N. Cahors.