Métabolisme des acides aminés - Serveur UNT-ORI

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Métabolisme des acides aminés
Plan du cours
Origine des amino-acides :
Alimentation
Transamination
Conversion
Catabolisme des amino-acides : réactions générales
Décarboxylation
Désamination, Transamination
Cycle de l'urée, Ammoniogenèse
AAs cétogènes et glucoformateurs
Transformations des amino-acides en produits spécialisés :
Neuromédiateurs et autres amines biogènes
Bases puriques et pyrimidiques, hème
(métabolismes vus ultérieurement)
Glutathion
Synthèse de la créatine
Métabolisme et dérivés particuliers de certains AAs :
Glycine
Arginine
Met et Cys
Phe et Tyr
Alimentation
50-100 g
Secrétion
50g
Protéines : env 10 kg
(principalement muscles)
Protéolyse
Synthèse 300-400 g
protéique
Intestin
Absorption
(jusqu’à 150g)
AAs libres
100 g
Sang
10 g
Catabolisme
Acides
Urée
cétoniques (20-35 g)
Glucose
Corps cétoniques, lipides
Biosynthèse des AAs
Transamination
Conversion
réversible : Glycine ↔ Sérine
non réversibles :
Méthionine -> Cystéine par transsulfuration d’homocystéine
Phénylalanine -> Tyrosine par hydroxylation
Aspartate -> Alanine par décarboxylation
Glutamate -> Proline par cyclisation
Autres :
Arginine : produite au cours du cycle de l’urée
Décarboxylation
Catabolisme
des amino-acides
COOH
R-CH
NH2
Transamination
Désamination
MÉTABOLISME DE LA
CHAINE CARBONÉE :
AA Glucoformateurs
AA Cétogènes
Ammoniogenèse
Glutaminogenèse
Cycle de l’urée
Décarboxylation des AAs
Réaction irréversible
R-CH (NH2) - COOH
→
Amino-acide
O
OH
O
- CO2
O
N
OH
GABA
NH2
(Ac γ- aminobutyrique)
Glutamate
- CO2
O
OH
NH2
R- CH2- NH2 + CO2
Amine
O
N
OH
NH2
N
Histidine
- CO 2
N
NH2
Histamine
OH
OH
N
NH 2
Tryptophane
Oxydase
5-OHTryptophane
N
Sérotonine
(5-OH-Tryptamine)
NH 2
AA
AMINE
FONCTION
Trp
Sérotonine
Neuromédiateur
Glu
γ-amino butyrate
Neuromédiateur
His
Histamine
Neuromédiateur, médiateur immunitaire
Dopamine,
Noradrénaline,
Neuromédiateurs,
Adrénaline
hormone
Asp
ß-alanine
Composant du coenzyme A
Cys
Cystéamine
Composant du coenzyme A
Ser
Ethanolamine
Composant des phospholipides
Thr
Amino-propanol
Composant de la vitamine B12
Tyr
Désamination oxydative
R-CH - NH
FAD
R-C=NH
COOH
COOH
+ H2O
R-C=O +
COOH
2 H+
Ac Glutamique + NH3 + ATP
→

Glutamine
+ ADP + Pi
NH3
La transamination
AA + ac α-cétoglutarique <--------> α-cétoacide + Ac Glutamique
Apoenzyme
Amino-acide
+
R-CH -NH 2
2- O3 POH 2C
NH - (CH2)4 - Lys
CH
COOH
N
H
+
α-cétoacide
COOH
Ac α-céto
glutarique
(CH2)2-C =O
2- O3 POH 2C
CH
N
H
+
COOH
COOH
Ac glutamique
COOH
NH2 - (CH2)4 - Lys
O-
Phosphate de
pyridoxamine
CH3
+ NH - (CH ) - Lys
24
2- O3 POH 2C
(CH 2)2-C H -NH2
CH3
NH2
R-C=O
COOH
Phosphate de pyridoxal
O-
CH
N
H
+
OCH3
NH3
α-céto
glutarate
Acide aminé
Transaminase
Acide
α-cétonique
NADH, H+
L-glutamate
deshydrogénase
Ac
glutamique
NAD+
H2O
Réoxydation
(chaines
transport d’e-)
Le cycle de l'urée
Mitochondrie
Désamination
NH3 intestinal
H2N-CH-COOH
Ornithine
(CH2 ) 3
NH2
NH3 + CO 2 + 2 ATP + H 2O
Carbamyl-phosphate
synthétase
Carbamyl
phosphate
H2 N-COO- P
OCT
(ornithinecarbamyl
transférase)
Pi
H2N-CH-COOH
(CH2)3
NH
Arginosuccinate
C
NH2
H2N-CH-COOH
Citrulline
O
(CH2)3
NH
Arginosuccinate
synthétase
C
NH
NH-CH-COOH
CH2
COOH
ATP
-> AMP + PP
Citrulline
+
Aspartate
Cycle de l'urée (suite)
H2N-CH-COOH
H2N-CH-COOH
(CH2) 3
(CH2) 3
NH
Arginosuccinase
C
NH
NH-CH-COOH
CH2
NH
C
NH
Ac fumarique
NH2
Arginine
COOH
Arginosuccinate
Arginase
H2N-CH-COOH
(CH2) 3
O
NH2
C
Ornithine
Urée
NH2
Urée
NH2
Ammoniogenèse
O
O
O
HO
NH 2
O
OH
OH
NH 2
NH 2
Ac Glutamique
Glutamine
Tubule
rénal
NH3
H+ + NH3
NH4+
Urine
Elimination du groupement aminé : bilan
Catabolisme de la
chaine carbonée
R-CH - NH2
COOH
Désamination
-1 ATP
Glutamine
Glutaminase
AMMONIOGENESE
(rein)
Urine
Transamination
Ac glutamique
Glutamate
Déshydrogénase
UREOGENESE
(foie)
- 3 ATP
Sang puis urine
AAs cétogènes et AAs glucoformateurs
AAs à
2 OU 3C
ALA
CYS
GLY
SER
TRP
AAs à 5C
LEU
LYS
ARG
HIS
PRO
GLN
THR
Acétoacétate
Pyruvate
GLU
Isocitrate
AAs à 4C
α-cétoglutarate
MET
VAL
Citrate
Succinyl-CoA
Oxaloacétate
Malate
ASP
ASN
AAs à 4C
Succinate
Fumarate
PHE
TYR
ILE
Acétyl CoA
Dérivés biologiquement actifs des AAs
Aspartate
Fumarate
Bases puriques
Glycine, Glutamine, Aspartate
NH3
N
Gln
N
Glu
HCO3-
Gln
N
NH3
Glu
NH3
Aspartate
N
N
N
Bases pyrimidiques
Glutamine et Aspartate
Glycine
Le glutathion
Synthèse du glutathion : Glu + Cys + Gly + 2 ATP ---> Glutathion + 2 (ADP+Pi):
γ
COOH
CO
NH CH
NH CH2
CH2 CO
CH2
CH2
SH
CH
COOH
Cystéine
+
ATP
Glutamate
NH2
ADP
+
Pi
γ-glutamylcystéine synthétase
γ-Glu
Thiol
Cys
Glycine
+
ATP
ADP
+
Pi
Glutathion
synthétase
γ-Glu
Cys
Glutathion
Réactions impliquant la fonction thiol :
Détoxification des peroxydes par le glutathion :
2 GSH + R
O
OH
GSSG + H2O + ROH
Glutathion-peroxydase
Sélénium
Régénération du glutathion réduit par la glutathion-réductase :
GSSG + NADPH, H+ ---> 2 GSH + NADP+
Glutathion-réductase
Conjugaison du glutathion aux xénobiotiques électrophiles :
GSH + R -----> G-S-R
Gly
Glutathion-transférase
Catabolisme hépatique de l’insuline (réduction des ponts S-S)
Le glutathion
Réactions impliquant le résidu γ-glutamyl :
Cys-Glu
AA
GSH
γ-Glu-AA
Gamma-glutamyl-transférase
γ-Glu-AA
GSH
Glu
La créatine
HN = C- NH - (CH2)3- CH - COOH
NH2
NH2
NH2 - CH2 - COOH
Transamidination
HN = C - NH2 - CH2 - COOH
NH2
Ac guanidino-acétique
NH2 - (CH2)3- CH - COOH
NH2
Ornithine
S-adénosyl méthionine
Méthylation
S-adénosyl homocystéine
CH3
HN = C - N - CH2 - COOH
NH2
Créatine
CH3
CH3
ADP
HN = C -N - CH2 - COOH
ATP
HN = C -N - CH2 - COOH
NH2
Créatine
- H2O
Créatine
kinase
CH3
HN = C - N - CH2
NH
CO
NH - P
Créatine-phosphate
- PO4
- H2O
Créatinine
Arginine : synthèse de NO
Cycle des méthyle activés
Tétrahydro
folate
(THF)
N5,N10
méthylène
THF
Méthylène
Tétrahydrofolate
Réductase (MTHFR)
Méthionine
Synthase
Vit B12
N5 méthyl
THF
Acide folique
Méthionine
Glycine
S-Adénosylméthionine
Bétaïne Homocystéine
méthyltransférase
Bétaïne
S-Adénosylhomocystéine
Homocystéine
Métabolisme de Phe et Tyr
(BH4)
Fe++
Hormones
thyroïdiennes
Tyr
DOPA
4-hydroxyphenyl pyruvase
Dopamine
Alcaptone
Dopaquinone
Noradrénaline
Mélanines
Métabolites
Adrénaline
Synthèse des catécholamines
COMT
MAO
Hormones thyroïdiennes
Phe
Phenylcétonurie
Tyrosinémie
Type II
Tyr
DOPA
4-hydroxyphenyl pyruvase
Tyrosinémie
Type III
Alcaptone
Dopaquinone
Alcaptonurie
Maléyl acétoacétate
Mélanines
Albinismes
Métabolisme des porphyrines
1) Synthèse des porphyrines : hème
2) Dégradation et métabolisme de la bilirubine
Protoporphyrine
Hème
Catabolisme de l'hème
Bilirubine
conjuguée
Synthèse des purines : schéma général
Ribose-5-P
1)
Synthèse du Phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP)
2)
Assemblage du noyau purine sur le ribose phosphate (IMP)
Synthèse de l'adénylate
Synthèse du guanylate
(AMP)
(GMP)
O
O
O
P O CH2 O
H
O
H
H
OH
H
OH
OH
ATP
AMP
O
P O CH2
O
O
H
H
H
OH
OH
O
H
PRPP synthホtase
PRPP synthétase
O
O
P O
P
O
O
OH
PRPP
Ribose-5-P
6
1
2
N
C
C
N
3
5
7
C
N
C
C8
4
N
9
Glycine
ATP
O
H
C
ADP
+ Pi
NH
CH
2
C
O
THF
+
N H3
N10-formyl
CH
2
C O
THF
NH
NH
R ib o s e -P
R ib o s e -P
Formylglycinamide ribonucléotide
Glycinamide ribonucléotide
Gln
ATP
ADP
+ Pi
Glu
H
O
C
HC
H2O
N
CH
NH
C
CH
HN
C
2
ATP
NH
R ib o s e -P
Formylglycinamidine ribonucléotide
ADP
+ Pi
H N
2
N
R ib o s e -P
5-Aminoimidazole
ribonucléotide
O
Aspartate
C
O
N
C
NH
CH
C
+
HOOC
CH
2
HOOC
2
CH
COOH
ATP
N
H N
2
O
ADP
+ Pi
C
CH HN
2
CH
HOOC
HN
2
N
C
CH
C
N
Ribose-P
5-Aminoimidazole
4-N-succinocarboxamide
Ribonucléotide
R ib o s e -P
5-Aminoimidazole 4-carboxylate
ribonucléotide
O
O
H2O
C
HN
C
H N
2
C
N
N
C
N
Inositate (IMP)
CH
C
N
H N
2
N
COOH
5-Aminoimidazole
4-carboxamide
Ribonucléotide
R ibose-P
CH
+
CH
CH
HC
COOH
C
Ribose-P
Fumarate
Régulation
Synthèse de l’IMP : bilan
Ribose-5-P
+ 2 Gln
+ 1 Gly
+ 1 Asp
+ 2 N10 formyl THF
+ 5 ATP
Ribose 5-P
IMP
+ 2 Glu
+ 1 fumarate
+ 2 THF
+ 5 ADP
ADP
GDP
PRPP
AMP
GMP
IMP
Phosphoribosylamine
Antifolates
IMP
Synthèse de l'AMP
Synthèse du GMP
Synthèse du GMP
Dégradation des purines : formation d'ac urique ; la goutte
OH
C
N
N
N
N
Allopurinol
Allantoïne
Métabolisme des bases pyrimidiques
4
3
Carbamoyl phosphate
2
N
C
C
C
5
Aspartate
C6
N
1
O
O
C
NH2
P
O
O
+ HOOC
COOH
Aspartate
N-Carbamoylaspartate
O
O
O
+
NH2
CH2
C
COOH
N
H
HN
O
H
C
HNN
H
C
O
PRPP
PPi
O
Orotate
O
O
O
CC
CC
Orotate
phosphoribosyl
transfホrase
OH
OH
OH OH
O
C
CH
C
UTP
Glutamine
+
ATP + H2O
CH
N
Ribose triphosphate
NH2
Glutamate
+
ADP + Pi + 2H+
C
N
O
CH
C
CTP
CH
N
Ribose triphosphate
C
CH
CH
HN
OO
CC CC
NN
O PO
O CH
CH22 O
O
O
O
HH
H
H
HH
H
H
C
N
H
O
OO
C
O
H
Dihydro-orotate
O
CH
COOH
C
N
H
N-Carbamoylaspartate
HN
CH2
C
Dihydroorotase
C
O
C
H2O
H
C
O
H2N
Aspartate
transcarbamoylase
COOH
Carbamoyl Phosphate
HN
H
N C COOH
H
CH2
C
CH2 CH
O
H2N
O
Pi
OO
Orotidylate
Orotidylate
+
H
O
CO2
Orotidylate
dホcarboxylase
O
C
O
P O CH2
O
CH
CH
N
O
H
H
OH
OH
H
H
Uridylate
(UMP)
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