Xylella fastidiosa Le centre Inra Angers
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42 rue Georges Morel 49071 Beaucouzé Cedex - France Tél. : + 33 1 (0)2 41 22 56 00 Fax : + 33 1 (0)2 41 22 56 05 www.angers-nantes.inra.fr COMMUNIQUE DE PRESSE Angers, le 22 septembre 2015 Xylella fastidiosa Le centre Inra Angers-Nantes Pays de la Loire mobilisé sur la recherche menée sur cette bactérie Xylella fastidiosa, a été détectée fin juillet en Corse du Sud sur des arbustes d’ornement. Les ravages connus de cette bactérie sur différentes cultures aux USA (vigne), en Amérique du Sud et Centrale (caféiers et agrumes) et en Italie (oliviers) inquiètent les agriculteurs français. Inra Angers-Nantes « Afin de rapidement proposer des méthodes de lutte efficace, nous avons besoin d’élargir nos connaissances scientifiques sur la bactérie, sa diversité génétique, les spectres d’hôtes des différentes souches isolées en Europe, d’analyser les génomes des souches pour, par exemple, mieux comprendre comment la bactérie interagit avec ses hôtes, insectes vecteurs ou plantes. » Marie-Agnès Jacques, Directrice de recherche Inra, référente scientifique nationale Inra sur Xylella Description Xylella fastidiosa est une bactérie phytopathogène transmise par des insectes vecteurs à ses plantes hôtes. Dans celles-ci, elle se limite aux vaisseaux conducteurs de la sève brute. Les symptômes sont essentiellement liés à l’invasion du xylème. Les bactéries obstruent les vaisseaux du xylème, limitant la circulation de la sève. Les symptômes sont ainsi similaires à ceux consécutifs à une sècheresse. Cette bactérie est connue pour infecter plus de 309 espèces végétales, dont la vigne (mais aussi les amandiers, les caféiers, les pêchers, les lauriers roses, les orangers, les abricotiers…). [1] Un peu d’histoire 1888 : description d’une maladie sur vigne en Californie, par Pierce. 1978 : la bactérie est isolée sur milieu de culture. 1987 : description de la bactérie. Le nom « fastidiosa » vient du caractère ‘fastidieux’ de cette bactérie, c’est-à-dire de la difficulté à la cultiver in vitro sur milieu. Dans les années 1990, une collaboration entre l’Inra de Bordeaux et un consortium brésilien autour de l’Institut de Biologie de São Paulo a donné lieu au séquençage d’une souche de Xylella fastidiosa, première bactérie phytopathogène à avoir été séquencée. En 2013, l’Inra a redémarré les recherches sur cette bactérie dans le cadre de l’interception de plants de café contaminés par Xylella fastidiosa et des travaux préliminaires à la mise en place du plan de surveillance du ministère de l’Agriculture. A Angers, l’équipe de bactériologie de l’UMR IRHS collabore avec l’ANSES pour l’identification et le typage des souches isolées en Corse. 22 juillet 2015 : 1er cas détecté en Corse Les travaux de l’Inra Actuellement, les travaux à l’Inra s’organisent autour de trois grands axes : (1) mieux connaitre les épidémies causées par Xylella fastidiosa, (2) développer les connaissances en bactériologie sur les interactions entre la bactérie et les plantes hôtes, (3) identifier les insectes vecteurs pour anticiper les risques. A l’Inra, les recherches font appel aux experts de nombreuses disciplines : épidémiologie, phytopathologie (Inra site d’Angers), bactériologie (Inra site d’Angers), entomologie (Inra Montpellier), génomique moléculaire (Inra site d’Angers), génétique des populations (Inra site d’Angers et Montpellier), etc. Les ressources du site Inra d’Angers L’équipe de recherche EmerSys de l’UMR IRHS (Inra-Agrocampus Ouest – Université d’Angers), dirigée par MarieAgnès Jacques, a participé à l’identification de la bactérie Xylella fastidiosa, qui s’attaque à différentes espèces végétales et qui a été détectée en juillet en Corse sur des arbustes d’ornement. En interaction avec l’ANSES, l’équipe de MarieAgnès Jacques est chargée de l’analyse phylogénique et de l’analyse du génome de cette bactérie. Les compétences mises en œuvre à Angers pour cette recherche : • L’équipe s’appuie notamment sur des compétences en bactériologie, en typage moléculaire, en phytopathologie, en culture, en analyse des génomes… • La Collection Française de Bactéries Phytopathogène, localisée sur le site Inra d’Angers, rassemble aujourd’hui 20 souches de Xylella, ce qui en fait la plus grande collection publique de cet agent pathogène. • Les installations expérimentales (inaugurées en novembre dernier) permettent de travailler sur Xylella fastidiosa en chambre de culture confinée (S3), mesure indispensable pour l’étude de Xylella. Quelques acteurs du centre Inra Angers-Nantes Pays de la Loire • Marie-Agnès JACQUES, Directrice de recherche à l’Inra, est aussi référente scientifique nationale Inra sur Xylella. Avec des compétences en bactériologie et phytopathologie, elle est responsable de l’équipe EmerSys (Emergence, systématique et écologie des bactéries phytopathogènes) à l’unité mixte de recherche IRHS, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (Inra-Agrocampus Ouest–Université d’Angers). Cette équipe a pour objectif d'améliorer les connaissances sur les bactéries phytopathogènes associées aux parties aériennes des plantes en travaillant sur plusieurs thématiques complémentaires centrées autour de l'écologie de ces bactéries. • Nicolas DENANCE est post-doctorant (janvier 2015 – janvier 2017) dans l’équipe EmerSys de l’UMR IRHS. Avec des compétences en microbiologie, phytopathologie et génomique bactérienne, Nicolas travaille dans le cadre d’un projet collaboratif entre l’UMR IRHS et le laboratoire de la santé des végétaux de l’Anses, projet financé par la région Pays de la Loire, à [2] travers un programme de soutien à la recherche ‘objectif végétal’. Le projet, intitulé ‘Sap Alien’ (un étranger dans la sève), vise à mieux comprendre l’histoire évolutive et les mécanismes gouvernant le pouvoir pathogène de Xylella fastidiosa. A propos du centre INRA Angers-Nantes Pays de la Loire Le Centre INRA Angers-Nantes conduit des recherches tournées vers la connaissance, l’expertise et l’innovation sur un champ thématique relatif à la gestion durable et la qualité des productions végétales et animales ainsi qu’à la construction et la qualité des aliments et matériaux biosourcés. Les 21 unités du Centre sont implantées en Loire-Atlantique et Maine-et-Loire. Elles regroupent environ 1000 personnes : 500 agents permanents INRA, 250 agents permanents relevant des établissements partenaires des unités communes et 250 non titulaires, parmi lesquels 115 doctorants et 35 post-doctorants et jeunes scientifiques contractuels. Les unités des sites angevins sont positionnées sur le domaine thématique du « Végétal spécialisé », principalement l’horticulture et les semences. Les unités des sites nantais le sont sur le domaine thématique « Agroalimentaire », avec des spécialisations sur la biologie/biochimie structurale et la physicochimie des biopolymères, la santé animale et la sécurité des aliments, la nutrition humaine périnatale, ainsi que les sciences sociales appliquées aux politiques agricoles. www.angers-nantes.inra.fr A propos de l’unité mixte de recherche IRHS L’Institut de Recherche en Horticulture et Semences (UMR-IRHS), est une unité mixte de recherche sous les tutelles de l’INRA, d’AGROCAMPUS OUEST et de l’Université d’Angers. Elle conduit des recherches en biologie végétale à Angers. Ce laboratoire, d’un effectif de 237 personnes est conçu pour mettre en œuvre des approches de biologie intégrative en coordonnant les expertises de généticiens, sélectionneurs, phytopathologistes, physiologistes, biochimistes et bioinformaticiens sur les espèces horticoles et la production de semences. www.angers-nantes.inra.fr/irhs Contact scientifique Contacts presse Marie-Agnès JACQUES Directrice de Recherche INRA [email protected] Sylvia MARION Chargée de communication INRA Angers-Nantes [email protected] http://www.angers-nantes.inra.fr/irhs http://www.angers-nantes.inra.fr [3]
