Date: Contacts: le29mars2017 L3/Master:GhislaineHernandez +33(0)472728819 Programmedel'épreuveoraledeBiologiedescandidatsaudoubleparcours"médecine/sciences" Programmeindicatif1pourlesétudiantsen2èmeannéedemédecineoude pharmacie,candidatsaudoubleparcoursmédecineoupharmacie/science proposéparl'ENSdeLyonetl'UniversitéLyon1 Préliminaire Ceprogrammeestindicatif,ilestlàpourlimiter(unpeu)lechampdesconnaissancesexigibles,mais aussipourmontrerl'espritdanslequelcesconnaissancessontproposées.Ils'agiteneffetd'insister surlacompréhensiondufonctionnementduvivantetlacapacitéàorganisersesconnaissancesen plusieurschampsrecouvrantdesproblématiquesdifférentes. Ceciétant,lejuryd'admissionseréserveaussiledroitdeposer,trèsmarginalement,desquestions quipourraientreleverdeconnaissancesantérieures(programmedebiologiedelycée)oudeculture générale. 2 Organisation I–DESMOLECULESDUVIVANTALACELLULE:ORGANISATIONFONCTIONNELLE I-AORGANISATIONFONCTIONNELLEDESMOLECULESDUVIVANT I-A-1L’eau,lespetitesmoléculesorganiques I-A-2Lesmacromoléculesbiologiques I-BMEMBRANEETECHANGESMEMBRANAIRES I-B-1Organisationetpropriétésdesmembranescellulaires I-B-2Membranesetinterrelationsstructurales I-B-3Membranesetéchanges I-B-4Membraneetdifférencedepotentielélectrique:potentielderepos,d’actionettransmission synaptique I-C.METABOLISMECELLULAIRE I-C-1.Lesréactionschimiquesduvivant I-C-2.Biosynthèsescaractéristiques I-C-3Aspectsénergétiquesdumétabolisme–liensaveclessynthèses I-DORGANISATIONFONCTIONNELLEDEQUELQUESCELLULES TRAVAUXPRATIQUESDEPREMIEREANNEEBCPST Organisationfonctionnelledelacellule Nature,propriétésettechniquesd’étudesdesbiomolécules Cinétiqueenzymatiqueetsoncontrôle 1 leprogrammedeBiologieest,commeannoncé,essentiellement"bâtiàpartirduprogrammedebiologiedesCPGE BCPST,duquelserontexpurgéeslespartiestropéloignéesdesmatièresbiomédicales(écologie,biologiedesplantes,…)." 2 Lanumérotationcorrespondàcelleduprogrammed'originetellequ'elleapparaîtsurlesiteduministère. 2 II–L’ORGANISME:UNSYSTEMEENINTERACTIONAVECSONENVIRONNEMENT UNIQUEMENT: II-B II-FDIVERSITEMORPHO-FONCTIONNELLEDESORGANISMES II-F-1Organismespluricellulaires(restreintàl'Homme) II-F-2Organismesunicellulaires III–POPULATIONS,ECOSYSTEMES,BIOSPHERE rien IV–LABIODIVERSITEETSADYNAMIQUE IV-AGENOMIQUESTRUCTURALEETFONCTIONNELLE IV-A-1Génomedeseubactéries–génomedesEucaryotes IV-A-2L’expressiondugénome:latranscriptionetsoncontrôle IV-BREPLICATIONDEL’INFORMATIONGENETIQUEETMITOSE IV-B.1Duplicationdel’informationgénétique:conservationetvariation IV-B.2Cyclecellulaire,mitoseetrépartitiondumatérielgénétique IV-CLADIVERSIFICATIONDESGENOMES IV-C.1Diversitédesmutationsetdiversificationdesgénomes IV-C.2Brassagegénétiqueetdiversificationdesgénomes Transfertshorizontauxd'informationgénétique Quelquesoutilspourl’étudedesgénomes IV-DLESMECANISMESDEL’EVOLUTION horsprogramme 3 I–Desmoléculesduvivantàlacellule:organisationfonctionnelle I-AOrganisationfonctionnelledesmoléculesduvivant I-A-1L’eau,lespetitesmoléculesorganiques Élémentsdephysico-chimienécessaires Lesatomesdecarbonedesmoléculesbiologiquesportentdesfonctionsvariéesquidéterminent leurspropriétésphysico-chimiques(dimension,solubilité,polarité,ionisation). Lerôlebiologiquedesmoléculesorganiquesdépenddeleurspropriétésphysico-chimiquesetdeleur réactivité. Desréactionsd’oxydoréductionmodifientetdiversifientlesfonctionschimiquesdespetites moléculesbiologiques.Unemêmemoléculebiologiquepeutapparteniràplusieursfamilles. Lafamilledesglucidesestcomposéedesosesetdesosides. Lesosesouglucidessimplessontdesmoléculeschiralesréductricesquidériventduglycéraldéhyde oududihydroxyacétoneetquiportentplusieursfonctionshydroxyle.Lesdi-osidessontdesdimères d'osesassociésparliaisonosidique. Leslipides Leslipidessontdesmoléculesorganiqueshydrophobesdefaiblemassemolaire.Ilspeuvent posséderdesgroupementshydrophilesquipermettentlaformationdemicellesetdebicouches. Lesglycolipidessontdesmoléculesmixtesassociantunlipideàunouplusieursradicauxglucidiques. Lesacidesalpha-aminés Lesacidesalpha-aminésontunétatd’ionisationquidépenddupH.Leurdiversitéreposesurles caractéristiquesdeleursradicaux. Laliaisonpeptidiqueunitdeuxacidesaminésselonunegéométriequiconditionnelesstructures d’ordresupérieur. Lesnucléotides Lesnucléotidessontdesmoléculesorganiquescomposéesd'unebaseazotéepuriqueoupyrimidique etd'unpentosephosphorylé. Leurdiversitéestdueàlanaturedelabaseazotée. Ilsformentdesmoléculesdepetitetaillesolublesetmobilesoususceptiblesdes’associerà desprotéines Lesconversionsd’unefamilleàl’autresontpossibles. Oses,acidesaminésetnucléotidessontégalementlesmonomèresd’édificesmacromoléculaires. I-A-2Lesmacromoléculesbiologiques Lesmacromoléculessontdespolymèresdefortemassemolaire(globalementsupérieureà 5000Daltons).Cesontdesglucides,desacidesnucléiques,desprotéinesoudes polyphénols(lignine). Lesmacromoléculesglucidiques,nonréductrices,sontdespolymèresleplussouventmonotones d’oses.Selonleurtaille,leursolubilité,leuractivitéosmotiqueouleurstructuretridimensionnelle,ils formentdegrandsédificesauxfonctionsdiversesIlspeuvents'associeràd'autres moléculesorganiques. Lesacidesnucléiquessontdespolymèresséquencésdenucléotides.Vecteursd’information,ils peuventinteragiravecdesprotéines. Lesprotéinessontdespolymèresd'acidesaminés.Lespropriétésphysico-chimiquesdelaliaison peptidiqueetdesradicauxdesacidesaminéspermettentauxprotéinesdes'organiserenstructures tridimensionnellessecondaires,tertiairesetquaternaires.Lafonctiondesprotéinesdépenddes propriétéschimiquesetmécaniquesdesesdifférentsdomainesfonctionnels. Lesmacromoléculesprotéiquessontdesstructuresdynamiques,dontlesradicauxsonten permanenteagitation.Leurfonctiondépenddeleurorganisationtridimensionnellequireposesur desliaisonsdefaibleénergiequicontribuentàcontenirl’agitationthermiquedesradicaux.Elles 4 peuvents’associerdefaçonspécifiqueàd’autresmoléculesauniveaudesites.Lespropriétésdeces relationsprotéines-ligandssontsemblables;lesconséquencesfonctionnellesqu’entrainelafixation dépendentdelaprotéine. Certainesprotéinessontglycosylées. Leslipoprotéinessontdesédificescomplexesdeprotéinesetdelipides. I-BMembraneetéchangesmembranaires I-B-1Organisationetpropriétésdesmembranescellulaires Lesmembranescellulairessontdesassociationsnoncovalentesdeprotéinesetdelipidesassemblés enbicouchesasymétriques.Lespropriétésdefluidité,deperméabilitésélective,despécificitéetde communicationdelamembranedépendentdecetteorganisation. I-B-2Membranesetinterrelationsstructurales Desinteractionsentremembranes,matricesextracellulairesetcytosquelettesconditionnent lespropriétésmécaniquesdescellulesetlesrelationsmécaniquesentrecellulesauseindes tissus.Lesmatricesextracellulairesformentuneinterfacefonctionnelleentrelacelluleetsonmilieu. I-B-3Membranesetéchanges Destransfertsdematièresontréalisésentrecompartimentspardesphénomènes debourgeonnementoudefusiondevésicules(dontlesphénomènesd’endocytoseetd’exocytose). Lesmécanismesreposentsurlespropriétésdesmembranesetl’implicationdeprotéines. L’eauetlessolutéspeuventtraverserunemembranepartransfertspassifs,partransportactif primaireousecondaire.Cestransfertssontrégispardesloisthermodynamiques (gradientschimiquesouélectrochimiques,sensdetransfert). Desmodèlesdemécanismesmoléculairespermettentderendrecomptedecesdifférentstypesde flux.Ceséchangesontdesfonctionsdiversesenliaisonentreautres,aveclanutritiondescellules, leurmétabolismemaisaussiavecdesfonctionsinformationnellesàl’échelledelacelluleoude l’organisme. Plusprécisément: -lacinétiquedesfluxtransmembranairespeutêtrelinéaire(diffusionsimpleautraversdelaphase lipidique),ouhyperbolique(ladiffusionfacilitéeparlestransporteursoulescanauxlacinétique decesderniersétantcependantlinéairesdanslesconditionscellulaires); -ungradienttransmembranaire(chimiqueouélectrochimique)estuneformed’énergieque l’onpeutévaluersousformed’unevariationmolaired’enthalpielibre. Exercicesetcompétrencesexigibles: -évaluerlaliposolubilitéd’uneespècechimiqueparsoncoefficientdepartitionhuile/eau; -relierunecinétiquedepassageàunemodalitédepassage; -évaluerunedifférencedepotentielélectrochimique; -exprimerunedifférencedepotentielélectrochimiquesousformed’une tensiontransmembranaire(«forceion-motrice»); -relierl’existenced’ungradientauxaspectsénergétiquesdestransferts; -relierlescaractéristiquesdesprotéines,leurlocalisationetleurfonctiondansleséchanges; I-B-4Membraneetdifférencedepotentielélectrique:potentielderepos,d’actionettransmission synaptique Potentieldemembrane–potentield’action Lesmembranesétablissentetentretiennentdesgradientschimiquesetélectriques.Lesfluxioniques transmembranairesinstaurentunpotentielélectriqueappelépotentieldemembrane. 5 Lepotentield’équilibre Lepotentield’équilibred’unionestlepotentieldemembranepourlequellefluxnetdel’ionest nul.Laprésencedecanauxioniquessensiblesàlatensionélectriquerendcertainescellules excitables. Potentield'action Lepotentield’actionneuronals’expliqueparlesvariationsdeconductancedecescanaux. Danslesneurones,lepotentield’actionsepropagedefaçonrégénérativelelongdel'axone. Lediamètredesfibresaffecteleurconductivitéetdonclavitessedepropagationdes potentielsd’action,demêmequelagainedemyéline. Lessynapses Lasynapsepermetlatransmissiond’informationd’unecelluleexcitableàuneautreen provoquantunevariationdepotentieltransmembranaire. L'étudiantdoitêtrecapablede: -expliquer,dansunfonctionnementsynaptique,letrajetdel’informationsupportéeparles signauxsuccessifs:naturedusignal,natureducodage,extinctiondusignal; -reliercesétapesauxmodèlesdemécanismesmoléculairesquilessous-tendent; -reliersurunexemplelefonctionnementdesrécepteursligands-dépendantsauxcaractéristiques fonctionnellesdesprotéines(site,allostérie,hydropathieetlocalisation...); Onselimiteàunexemplequipeutêtreceluidelasynapseneuromusculaireoud’unesynapse neuro-neuronique.Onlimitelesprécisionssurlesmécanismesmoléculairesàcequieststrictement nécessaireàlacompréhensiondumodèle. L'étudiantdoitêtrecapablede: -définirlanotiondepotentielélectrochimiqued’unionetexpliciterlecalculdeson potentield’équilibre(loideNernst); -relierlavariationdupotentielmembranaireauxmodificationsdeconductances; -analyserdesenregistrementsdepatch-clamppourargumenterunmodèlemoléculaire defonctionnementd’uncanalvoltage-dépendant; -expliquerlapropagationaxoniqueparrégénérationd’unpotentield’action; L’explicationdesmontagespermettantdemesurerlescourantsioniquestransmembranaires n’estpasexigible. I-C.Métabolismecellulaire I-C-1.Lesréactionschimiquesduvivant Lestransformationschimiquesquiconstituentlemétabolismeobéissentauxloisde lathermodynamiqueetdelacinétiquechimique.Ellessontaccéléréespardesbiocatalyseurs, lesenzymes,quipermettentàcesréactionsdeseproduireàdesvitessesimportantesdans lesconditionsduvivant(température,pH,etc.).Certainestransformationsdonnentlieuà uncouplageénergétique. Lesenzymessontlesfacteursdecouplage. Lecontrôledelaréalisationdestransformationsdépend: -delaprésencedesenzymes,liéeauniveaud’expressiondesgènes; -deschangementsconformationnelsintervenantàtouslesniveauxstructuraux;cesmodifications sontinduitesparl’association,covalenteounon,àunouplusieursligands. Lanaturedesenzymesprésentesdanslescellulesoulescompartimentsainsiquelaspécificitédes associationsentrecesenzymesetleursligandssontdesélémentsdelaspécialisationdescellules. 6 I-C-2.Biosynthèsescaractéristiques Lestransformationschimiquescellulairespermettentlaréalisationdebiosynthèsesnécessairesau fonctionnementcellulaireetàlamultiplicationcellulaire. Desinterconversionssontpossiblesentrelesdifférentesfamillesdemolécules;ellesaboutissentàla synthèsedesprincipalesmoléculesàrôlesstructural,métaboliqueouinformationnelquipermettent lefonctionnementdescellulesetleursinteractionsaveclemilieu.Cessynthèses,localiséesdansles cellules,sontassociéesàdesvoiesd’acheminementdesmoléculesversleurlocalisation fonctionnelleintraouextracellulaire Unexempledebiosynthèse:labiosynthèsedesprotéines Les mécanismes de la traduction des ARNmessagers Lasynthèsedesprotéinesestunprocessusdepolymérisationd’acidesaminés,réversible parhydrolyse.L’ARNrdelagrandesous-unitéduribosomeassurelacatalyselorsdelaformationde laliaisonpeptidique(ribozyme),réactionconsommatriced’énergie. Deplus,cettepolymérisations’accompagned’untransfertd’informationetd’undécodageréalisé grâceàlacoopérationfonctionnellededifférentsARNauseindesribosomes. Les maturations post traductionnelles des protéines Laprotéinesynthétiséesubitensuitedesmodificationsdestructureetdelocalisationavantde devenirfonctionnelle.Elleacquiertsastructuretridimensionnelle,processusfacilitépar l’interventiondeprotéineschaperonnes.Salocalisationcellulaireestdéterminéeparlaprésence d’uneinformationdeposition.Lecontrôledelabiosynthèseestundesélémentsd’ajustementdu protéomecellulaire,quidépendaussideleurrenouvellementetdeleurrecyclage. I-C-3Aspectsénergétiquesdumétabolisme–liensaveclessynthèses Lemétabolismepeutselireselondeuxgrilles: -entermesdetransformationdematière; -entermesénergétiques. Cesdeuxapprochesdoiventévidemmentêtrereliéesl’uneàl’autre. Lesinterrelationsentrevoiesmétaboliquesetleurscontrôlesauseindessystèmescellulaires introduisentunetroisièmegrilledelecture:l’information. I-C-3-aMétabolismeetformesd’énergiedelacellule Troisformesd’énergiesontprivilégiéesdanslacellule:l’énergied’hydrolysedel’ATP,l’énergiedes réactionsd’oxydo-réductionetl’énergiedegradienttransmembranaire. Laphosphorylationd’ADPenATPestréaliséesoitpartransphosphorylation(synonyme dephosphorylationsursubstrat)soitauniveaudesmembranesparconversiond’uneforce protonmotrice. Organisationetfonctionnementdesmitochondriesdanslemétabolismeénergétique. Ladiversitédesmodesd’établissementdecetteénergiepotentielle(enparticulierdela forceproton-motrice)permetdedistinguerdifférentstypestrophiques(chimioorganotrophieet chimiolithotrophie). I-C-3-bMétabolismeettransfertsdematière Danslacellulehétérotrophepourl’azoteetlecarbone,cesélémentsentrentsousforme demoléculesorganiquesquipeuventêtreanaboliséesoucataboliséescommesourced’énergie. 7 Laglycolyseestunevoiemétaboliquepermettantlaformationd’ATP,decoenzymesréduitsetde pyruvateparunechainederéactionspartantduglucose.L’oxydationduglycéraldéhyde3-Pdansle cytosolestuneréactionclé. Lefluxglycolytiqueestl’objetd’uncontrôlecellulaire.Ilparticipeàl’ajustementdelaproduction d’ATPauxbesoinsdelacellule.Lepyruvateetlesacidesgrassontimportésetutilisésdanslamatrice mitochondrialepourproduiredel’acétyl-coenzymeA,substratducycledeKrebs. LecycledeKrebsestunevoiedeconvergenceducatabolisme.Laproductiond’ATPestdoncpossible àpartirdedifférentsmétabolitesinitiaux. Chaînerespiratoiremitochondrienne Latransformationdesmoléculesazotées,excrétionazotée. Fondementsmétaboliquesdel’autotrophie L’approvisionnementdescellulesenélémentschimiquesfondamentaux(carboneetazote)peutêtre assuréparautotrophie. Unexempledecellulebactériennechimiolithotrophe Lespartiessurl'énergielumineuse,laRubisco,lecycledeCalvin,l'amidonoulefonctionnementdu chloroplastessontenlevées. I-DOrganisationfonctionnelledequelquescellules Comparaisoncelluleeucaryote/celluleeubactérienne. Quelquescelluleseucaryotesàconnaître(organisationducytosquelette,métabolismeénergétique, couplageexitation-contraction): - Lacellulemusculairestriéesquelettique - Lacellulemusculairecardiaque Autrescellules(aspectsmétaboliques): - Entérocyte - Adipocyte - hépatocyte Autre(fonctionnementflagelle): - Spermatozoïde TravauxPratiquesdepremièreannéeBCPST Organisationfonctionnelledelacellule -remiseencohérencedesacquisdesclassesantérieures -aufuretàmesuredescellulesrencontrées,organisationfonctionnellededifférentescellules d'organismesunietpluricellulaires -miseenoeuvredetechniquesd'étudessimplesdelacellule -observationetidentificationdesélémentsd'organisationdelacellule(microscopiephotonique- électronique)avecmiseenrelationdesreprésentations2D-3D Nature,propriétésettechniquesd’étudesdesbiomolécules Cinétiqueenzymatiqueetsoncontrôle -approcheexpérimentale,interprétationentermesmoléculaires -réalisationd’uneélectrophorèsedeprotéinesenconditionsnativeetdénaturante -miseenévidencedel’existencededifférentsniveauxstructuraux 8 -analysed’unrésultatdeblot(Westernblot) -suiviexpérimentaldelacinétiqued'uneréactionenzymatique,déterminationdevitessesinitiales danslecasd’unecinétiquemichaélienne -déterminationdeKMetVmax -analyseetinterprétationdedonnéesportantsurdescinétiquesmichaéliennesenprésenceounon dedifférentstypesd'inhibiteurs(compétitifs–noncompétitifsseulement) -interprétationentermesdestructuredesprotéinesavecutilisationd'imageriemoléculaire(site, spécificité,changementdeconformation) II–L’organisme:unsystèmeeninteractionavecsonenvironnement II-B Uniquement: L’hémoglobinehumainedel’adulte:propriétésstructuralesetfonctionnellesdel’hémoglobine, enliaisonaveclefonctionnementdel’hématie.Lecaractèreallostériquedecettemoléculesera abordé. II-FDiversitémorpho-fonctionnelledesorganismes Pourl'essentiel,nefaitpaspartieduprogrammedescandidataudoubleparcoursENSLyonmédecine.Quelquespointssubsistentcependant II-F-1Organismespluricellulaires(restreintàl'Homme) Lesorganismespluricellulairessontformésdecellulesdifférenciéesounon,organiséesounonen tissus,voireenorganes. II-F-2Organismesunicellulaires Certainsorganismesassurentl’ensembledesfonctionsauniveaud’uneseulecellule(vie unicellulaire). Exemples(Saccharomycescerevisiae,Plasmodium,Trypanosoma,Escherichiacoli), Eubactérie: -unicellulairehétérotrophe(Escherichiacoli) Eucaryotesunicellulaireshétérotrophes: -ununicellulaireparasite(PlasmodiumouTrypanosoma) III–Populations,écosystèmes,biosphère NefaitpaspartieduprogrammedescandidataudoubleparcoursENSLyon-médecine 9 IV–Labiodiversitéetsadynamique IV-AGénomiquestructuraleetfonctionnelle IV-A-1Génomedeseubactéries–génomedesEucaryotes L'ensembledesmoléculesd'ADNcontenuesdansunecelluleetl’informationqu’ellesportent formentsongénome. Chezleseubactéries,legénomeàlocalisationcytoplasmiqueestforméd’unchromosomecirculaire etéventuellementdeplasmides.Legénomedeseubactériesestcompact:ilestconstituépresque exclusivementderégionscodantesassociéesàdesrégionsrégulatricescommunes(notion d’opéron). ChezlesEucaryotes,ondistinguelegénomenucléaireetlegénomedesorganites.Legénome nucléaireestconstituédechromosomes.L’ADNgénomiqueestassociéàdesprotéinesdontdes histones.LegénomenucléairedesEucaryotes,deplusgrandetaille,présenteunegrandepart deséquencesintergéniquesnontranscrites.Lamajoritédecesséquencesestrépétée.Les gèneseucaryotessontgénéralementmorcelés. IV-A-2L’expressiondugénome:latranscriptionetsoncontrôle Mécanismesdetranscriptiondel’ADN Lemécanismedetranscriptiondel’ADNestassurépardespolymérases;ellesgénèrentplusieurs typesd’ARN.Latranscriptionestinitiéeauniveaud’unpromoteurreconnupardesfacteursde transcription.Dessignauxindiquentlafindelatranscription. ChezlesEucaryotes,àpartirdetranscritsdegènesmorcelés,différentsprocessusdematuration post-transcriptionnelledesARNmessagersconduisentàlaséquencetraduite.Selonlestypes cellulaires,enréponseàdessignaux,àdesvariationsd’activité,desmodificationsdesconditionsde milieux,l’expressiondugénotypevarieetconduitàdesphénotypescellulairesvariés.Les mécanismespermettantcesmodulationsportentessentiellementsurlecontrôledelatranscription. Lecontrôledelatranscription Lecontrôledelatranscriptionfaitintervenirdesinteractionsentreséquencesrégulatrices etfacteursdetranscription.Leniveaudetranscriptiondépendaussidel'étatdeméthylationde l'ADNetdemodificationsdelachromatine.Lecontrôledel’expressiondel’informationgénétique faitaussiintervenirdespetitsARN. ChezlesEucaryotes,ladiversitédesrégulationsdetranscriptionetdesmaturations posttranscriptionnellesexpliqueengrandepartieladiversitédestranscriptomes. Auneautreéchelledetemps,lesprofilsd’expressiongénétiquesontparfoishéréditaires,en l’absencedemutation(épigénétique).gènes(§III-D-2) -détecterl’expressionsélectivedesgènesparl’étudedesrésultatsdesprincipalesméthodesd’étude destranscriptomesafind’exploiterdesrésultatsexpérimentaux.Lesméthodesd’étudedes transcriptomesnesontpasàmémoriser. IV-BRéplicationdel’informationgénétiqueetmitose Latransmissiondel’informationgénétiqueaucoursdesdivisionscellulairesestréaliséegrâceàune duplicationdumatérielgénétique,àfaibletauxd’erreur,suivied’uneunerépartitionéquitable dumatérielgénétiqueentrelesdeuxcellulesfilles. IV-B.1Duplicationdel’informationgénétique:conservationetvariation L’ADNsubituneréplicationsemi-conservativeassuréeparunensembledeprotéinesauniveaudela fourchederéplication.Leprocessusassurefondamentalementlaconservationdel’information.Des erreursderéplicationconduisentàdesmésappariementsquipeuventêtrecorrigésaucoursouàla 10 findelaréplication.Leserreursnonréparéesmodifientlesséquencesdesgénomesetconstituent desmutationsspontanéescréantdenouveauxallèles.Unprocessusglobalement«conservateur» estainsiàl’originede«variations». IV-B.2Cyclecellulaire,mitoseetrépartitiondumatérielgénétique ChezlesEucaryotes,laduplicationdumatérielgénétiqueseproduitaucoursdelaphaseSducycle cellulaire,lorsdel’interphase.Lamitose,pendantlaquelleleschromosomessontrépartisde manièreidentiqueentrelesdeuxcellulesfillesgrâceaucytosquelette,bouclelecyclecellulaire.La cytocinèsenesuitpasobligatoirementladivisiondunoyaucequiconduitalorsàdessyncytiums. IV-CLadiversificationdesgénomes IV-C.1Diversitédesmutationsetdiversificationdesgénomes Lesséquencesdesgénomessontmodifiéesdemanièrealéatoirepardeserreursderéplicationnon réparéesoud’autrescausesdemutations.Certainesmutationsmodifientlastructure deschromosomes(délétions,inversions,duplication,translocation). Quelquesoitlemécanisme,lesmutationssontlaseulesourcedediversificationdesallèles. IV-C.2Brassagegénétiqueetdiversificationdesgénomes Lasexualitémodifielesgénomesenbrassantlesallèles.ChezlesEucaryotes,laméiosecontribueà ladiversificationdesgénomes.Enunissantdesgénomeshaploïdes,lafécondationcréedenouvelles combinaisonsalléliquesdiploïdes. D’autresprocessusliésàlareproductionsexuéeàl’échelledesorganismesetdespopulations interviennentdanscettediversification. -expliquerdesoriginespossiblesdelamodificationdeséquencesurdeuxexemplesd’altérations ponctuelles.(dimèresdethymine–cf.IV-B-désamination) -expliquerlarelationentrelesmutationsetleursconséquencessurlafonctiondupolypeptidecodé -relierlesprincipauxévènementscytogénétiquesdelaméioseavecleursconséquencessur lebrassageallélique -argumenterlesprocessusdebrassagegénétiqueens’appuyantsurleprincipedequelques croisementssimplesmaisdifférantpardeuxcouplesd’allèlesprischezlesorganismeshaploïdes et/oudiploïdes -évaluerenordredegrandeurladiversificationpotentielleàpartirdedonnées(fréquences demutation,nombredechromosomes,etc.) Transfertshorizontauxd'informationgénétique Chezleseubactéries(etdansunemoindremesurechezlesEucaryotes),desmodifications dugénomesontpossiblespartransfertshorizontauxdegènes. Quelquesoutilspourl’étudedesgénomes -réaliseretexploiteruneélectrophorèsedefragmentsderestrictiond’ADN -établirunecartederestriction -manipulerquelquesoutilsd’exploitationinformatiquedesséquencesnucléotidiquesafinderéaliser l’identificationdeséquenceshomologuesàlaséquenceétudiéeetl’alignementdeséquencesenvue delaconstructiond’arbresphylogénétiquesLienPhylogénie(§IV-E) -analyserdesrésultatsexpérimentauxdedifférentestechniquesdebiologiemoléculaire (transgénèse,Northernblot,Southernblot,utilisationdegènesrapporteurs,étudedelafonctionde gènesparknock-out,pucesàADN) Lien: Cours§IV-AChromosomes,mitoseetméiose -réaliserunepréparationmicroscopiqueafind’identifierdifférentesphasesdelamitose 11 -exploiterdeslamesetdesclichésmicroscopiquesàdifférenteséchelles(repéragedesdifférentes phases,organisationdeschromosomesetdufuseaudedivisiondecellulesvégétalesetanimales) -analyserdesrésultatsexpérimentauxsurlecontrôleducyclecellulaire(identificationd’unpointde contrôle,analysedesinteractionsentrelesprotéinesimpliquées). -analyserdescaryotypesetdétecterdesanomalies IV-DLesmécanismesdel’évolution NefaitpaspartieduprogrammedescandidataudoubleparcoursENSLyon-médecine