Liste des analyses sous-traitées
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Liste des analyses sous-traitées Analyses Adénovirus (respiratoire) Amibes (Acanthamoeba spp) Page A1/A10 Prélèvements Méthode Soustraitant Sécrétion ou aspiration naso-pharyngée, frottis de rétronasal ou prélèvements respiratoires (LBA etc…) Biopsie, grattage (eau physiol. stérile) Verre de contact, liquide de lentille PCR LS1 Examen direct Culture BE1 PCR BS1 Amibes (cf E.histolytica-dispar) Antipneumolysines Sérum Sérologie LS8 Antistaphylolysines Sérum Sérologie Non défini Arbovirus Sérum Sérologie Ascaridiose ASLO Sérum Sérum Sérologie Sérologie Paris1- IKMI GE1 BE4 ou BS1 SRNJTS Sérologie LS3 Précipitine LS8 Moléculaire Unine Labo Gern ZH1 Sérum Aspergillus spp Dosage galactomannane Sérum Aspergillus et autres (poumon du fermier) Sang, plasma,… Babesias spp Bactéries Champignons Bactéries Champignons Bartonella henselae (B.quintana) Souche Identification classique Séquençage Biopsies, Pus, coupe histologique PCR LS1 BK polyomavirus (greffés rénaux) Urine, sang EDTA PCR BS2 PCR LS1 BE1 Souche Nez , gorge Bordetella pertussis Bordetella parapertussis Frottis ou aspiration LS1 Bordetella pertussis Sérum IgG, IgA Borréliose LCR, Biopsie: ponction articulaire PCR Botulisme intoxication Sérum: Adultes ( 20 ml de Toxine sang) BE2 Brucella spp Souche Typage BE2 Campylobacter spp Souche Identification NENT ou LS1 Campylobacter spp Sérum Fixation complément SION L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 SION Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Analyses Prélèvements Page A2/A10 Méthode Soustraitant Candida spp Souche Identification LS11 Candida spp Mannane et anti mannane Chlam. pneumoniae sérum Sérologie LS3 Prélèvements respiratoires PCR LS1 Champignon Respiratoire PCR LS1 PanFungal ZH1 Champignon Champignon Identification Séquençage LS1 Chikungunya Virus Sérum Sérologie GE1 Clostridium perfringens Souche PCR (Détection de la toxine) Coccidioides immitis Sérum Sérologie ZH1 Coronavirus SRAS-SARS Coxiella burnetti (Rickettsiose: fièvre Q) Coxiella burnetti (fièvre Q) Cysticercose Prélèvement respiratoire PCR protocole OFSP !! Sérum Sérologie GE1 SION Biopsie liquide biologique PCR SION Sérum Sérologie BE4 Cytomégalovirus (CMV) Cytomégalovirus (CMV) Cytomégalovirus (CMV) Sérum Avidité IgG LS3 CMV Virémie Frottis dans milieu de PCR transport LCR (immunocompromis) PCR LBA Biopsie Urine du nouveau né <10j PCR Plasma GE1 PCR LS1 Sang EDTA complet CMV Virémie (rare) « Providence - dialyse » Sérum Dengue LS4 LS1 Sérologie IKMI Dermatophytes Souche Identification ZH1 Dermatophytes Souche Séquençage LS1 Diphtérie contrôle vaccination Echinococcus spp Sérum Sérologie ZH4 Sérum Sérologie BE4 EHEC (VTEC) EIEC EPEC E.coli pathogènes Souches Identification Confirmation L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 NENT Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Analyses Prélèvements EHEC (VTEC) EIEC EPEC E.coli pathogènes Encéphalite japonaise Entamoeba histolytica Entamoeba histolytica pathogénicité Enterovirus Méthode Soustraitant Selles PCR IMD LCR Sang EDTA PCR IKMI Sérologie IKMI Encéphalite japonaise Entamoeba histolytica Page A3/A10 Selles, biopsie, ponction URGENT ! Sérum URGENT Selles fraîches Identification BS1 Sérologie PCR BS1 BS1 Biopsies PCR LS1 0.5ml LCR natif indiquer: tél. + nom du médecin. Plasma PCR LS1 Virémie PCR GE1 (Echo-, Coxsackie, Polio-) Epstein-Barr virus (EBV) Epstein-Barr virus (EBV) chez les hémodialysés, gréffés Eubacterial PCR PCR eubactérienne Gène 16S direct (prélèvements stériles) Biopsie, ponctions stériles PCR + séquençage Fièvres hémorragiques Sérum 1-2 ml LS1 Sérologie Paris1 (Inst.Pasteur) . FSME LCR , sérum, plasma PCR SION Francisella tularensis Sérum Sérologie SION Galactomannane cf Aspergillus spp Sérum Sérologie LS11 Giardia lamblia Selles fixées SAF Antigènes BE1 Giardia lamblia Biospie, … PCR IMD PCR multiple Kit d’envoi GE1 remplis. Avec T.pallidum PCR duplex IMD Typage BE1 Sérologie ZH4 Sérologie IKMI Grippe Aviaire (H5N1) Seulement si les critères Haemophilus ducreyi Haemophilus influenzae Souche des hémocultures et LCR Sérum H. influenzae typeB contrôle vaccination Hantavirus (Puumala) Sérum L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Analyses Prélèvements Page A4/A10 Méthode Soustraitant Helicobacter pylori Selles fraîches Antigène Meditest Helminthiases tissulaires Hépatite A virémie Sérum Sérologie BS1 Plasma PCR LS1 Hépatite B Virémie 1ml plasma Virémie GE1 Hépatite B Plasma 1ml Résistances LS1 Hépatite B Plasma 1ml Génotypage LS1 PCR et hybridation GE1 Hépatite C génotypage Plasma 1ml notant virémie obtenue ! Hépatites A,B,C Sérum Sérologie SRNJTS Hépatites D,E Sérum Sérologie GE1 Hépatite D virémie Plasma PCR LS1 HépatiteE virémie Plasma PCR LS1 Herpes simplex (HSV) 0.5ml LCR natif Frottis dans milieu transport Sérum PCR LS1 Sérologie GE1 Sérologie BS 2 HHV6 HHV8 Histoplasma capsulatum HIV spécialités HIV2 virémie Sérum Sérologie ZH1 2 ml plasma Virémie ZH2 HIV pédiatrie Etude CH Plasma et sérum selon disponibilité HIV résistances 2 ml plasma PCR HIV1,2 dépistage Sérologie SRNJTS HIV1,2 AG p24 Sérum Noter si facturation HJB Sérum Sérologie ZH2 HTLV Sérum (dépistage + WB) Sérologie GE1 HTLV Sang EDTA (PCR) PCR ZH2 Influenza virus confirmation PCR LS1 L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 ZH2 GE1 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Analyses Prélèvements Sérum Influenza et parainfluenza JC polyomavirus Urine, plasma ou sang EDTA 0.5ml LCR natif indiquer: tél. + nom du médecin!! Souche JC polyomavirus (LCR) Légionelle Expectoration, LBA, Aspiration bronchique, (Urine) Sérum Légionelle Leishmania spp Page A5/A10 Méthode Soustraitant Fixation du complémentaire PCR SION BS2 PCR LS1 sérotypage TI PCR LS1 Sérologie BS1 Leptospire Moëlle, biopsies, se garde Culture à 4°C Sérum Microagglutination IKMI Leptospire Sang EDTA et Urine IKMI Leishmania spp Listeria monocytogenes Souche bactérienne LCR Liquide amniotique LCR Méningite bactérienne Listeria spp (panel de base) Microsporidies Selles fixées SAF Souche MRSA Etude CH Mycobactéries MTBC Biopsie, LCR, PCR BS1 Typage Identification PCR LS5 PCR multiplexe LS1 Identification BE1 Typage PCR LS10 (HH) LS1 LS1 MOTT rechercher et identifier Souche PCR LS1 Mycobactéries Souche Typage Antibiogramme. ZH1 Mycoplasma pneumoniae Prélèvement respiratoire, LCR PCR LS1 Neisseria meningitidis Souche bactérienne GE2 Neisseria meningitidis LCR Antibiogramme Typage PCR Multiplexe Oreillons Sérum IgM BE1 Oreillons LCR congelé . Frottis de sténon, gorge, salive, urine PCR IKMI Culture GE1 LS1 . Cf Méningites Oreillons L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Analyses Prélèvements Papilloma Virus (HPV) Coupe paraffine Confirmation Typage Parainfluenza 1,2,3 Parasites Page A6/A10 Méthode Soustraitant PCR LS1 Sécrétions nasoPCR pharyngées ou frottis milieu de transport; Selles, biopsies, ponctions. Confirmation LS1 BS1 Sang EDTA, sang cordon, PCR Moelle osseuse, Synovie, Liquide amniotique. Parvovirus B19 Pathogènes émergents Frottis sanguin fixé et Plasmodium spp IKMI Sérologie, PCR Confirmation Et PCR CNRR BS1 goutte épaisse ou sang sur EDTA Sérum Sérologie BS1 Pneumocoque Contrôle vaccination Pneumocoque invasif Sérum Sérologie ZH4 Souche isolée Typage BE3 Pneumocoque LCR PCR multiplexe LS1 Pneumocystis jirovecii Biopsie, Expectoration Asp.Bronch, LBA PCR LS1 Plasmodium spp Sérum Poliomyélite contrôle de vaccination Sérum Rage Dosage IgG vaccination antirabique Sérologie Sérologie BE5 Sérologie PCR IgM SION SION BE1 Rickettsiose Rickettsiose Rougeole Sérum Biopsie,… Sérum Rubéole Rubéole Sérum Avidité IgG Liquide amniotique 10 ml; PCR LCR garder réfrigéré DL IKMI Salmonella spp Souche NENT Identification Sérologie Salmonelles WIDAL Séquençage d’une souche Shigella spp LS1 Tétanos contrôle de vaccination L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT BE1 Souche Identification Sérum Sérologie Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 NENT ZH4 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Analyses Prélèvements Toscana Virus Sérum, Plasma Toxines de Staphylocoque (ex Panton Valentin) Toxocara canis Page A7/A10 Méthode Soustraitant Etude CHUV-Romandie Serologie, PCR Souche Pasteur Paris Marseille LS10 Sérum Sérologie BE4 Toxoplasma gondii Sérum ISAGA IgM, IgA IF IgM, IgG Aggl. IgG Avidité LS3 Toxoplasma gondii Sérum de la mère et celui du bébé en même temps Liquide amniotique ou LCR ou LBA natif Avec H.ducreyi ELIFA LS3 PCR LS1 PCR IMD Toxoplasma gondii Treponema pallidum ZH1 Trypanosomiases Sang complet EDTA (pas PCR plasma) et LCR Biopsie, ponction moëlle sur EDTA Sérum Sérologie Typage MRSA Souche 1/patient moléculaire LS10 Varicelle zoster Sérum BE1 Varicelle 0.5ml LCR natif par IgA IgM PCR Vibrio spp Souche Confirmation VIRUS spéciaux LCR généralement et Sang PCR Sérologie IKMI GE1 West Nile Virus Sérum Pas de PCR GE1 Tropheryma whipplei BS1 LS1 NENT Sérologie Cf T.whipplei Whipple (Maladie de) Yersinia spp Sérum sérologie BE1 Yersinia spp Souche Sérotype NENT L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Code Page A8/A10 Adresse Contact BE1 Institut de Microbiologie Clinique Université de Berne 3010 Berne tél. 031 632 32 65 fax 031 632 49 66 Dr Gorgievski (sérol et virologie) http://www.ifik.unibe.ch BE2 Institut de Bactériologie Vétérinaire Länggass-Strasse 122 Case Postale 3001 Berne tél. 031 631 24 85 fax 031 631 26 34 Dr Joachim Frey [email protected] BE3 CNP Centre National des Pneumocoques Institut de Microbiologie Clinique 3010 Berne tél. 031 632 3265 Dr K. Mühlemann http://www.ifik.unibe.ch BE4 Institut Vétérinaire de Parasitologie Länggass-Strasse 122 Case Postale 3001 Berne Tél 031 631 2418 Prof B.Gottstein http://www.vetmed.unibe.ch/ipa/ BE5 Intitut Vétérinaire de Virologie Länggass-Strasse 122 Case Postale 3001 Berne Tél 031 631 2378 Prof E.Peterhans http://www.cx.unibe.ch/ivv/ BS1 Institut Tropical Suisse Socinstrasse 57 Case Postale 4002 Bâle tél. 061 284 82 56 fax 061 271 86 54 Dr Marti BS2 Institut für Medizinische Mikrobiologie Labo PCR Petersplatz 10 4003 Bâle tél 061 267 32 62 fax 061 267 32 83 http://www.unibas.ch/imm/ CNRR Centre National de Référence des Rickettsioses UMR 6020 Faculté de Médecine 27, boulevard Jean Moulin 13385 MARSEILLE Cedex 5 FRANCE Centre National des Bactéries Entéropathogènes: NENT Institut Für Lebensmittelsicherheit Universität Zürich Winterthurerstrtasse 272 8057 ZÜRICH Dianalab Rue de la Colline 6 1205 Genève Téléphone : 00 33 4 91 32 43 75 Fax : 00 33 4 91 38 77 72 Laboratoire Central de Virologie Hôpital Cantonal Universitaire 24, rue Micheli-du-Crest 1211 Genève tél 022 372 49 82 séro, PCR fax 022 372 49 90 tél 022 372 40 92 culture,séro NENT DL GE1 (Virologie) 044 635 86 71 Dr H Haechler courriel: [email protected] tél 022 807 12 40 fax 022 807 12 44 Dr Stricker S.Yerly 372 49 93, http://virologie.hug-ge.ch/ L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Code Page A9/A10 Adresse Contact GE2 (Bactériologie) Laboratoire de Bactériologie Hôpital Cantonal Universitaire 24, rue Micheli-du-Crest 1211 Genève IKMI Institut für Klinische Mikrobiologie und Immunologie Frohbergstrasse 3 9001 St. Gallen IMD Institut für medizinische und molekulare Diagnostik AG Rautisstrasse 13 8047 Zürich tél 01 497 30 60 fax 01 497 30 70 Dr D.Goldenberg Dr Mosiman http://www.imdlab.ch/ LS1 (Diagn. Moléc.) Labo de Diagnostic Moléculaire CHUV, Institut de Microbiologie Bugnon 48 1011 Lausanne tél 021 314 4048 fax 021 314 4060 K.Jaton 021 314 4076 http://www.hospvd.ch/chuv/dml LS2 (Mycobactéries) Labo de Tuberculose Institut de Microbiologie Bugnon 48 1011 Lausanne tél 021 314 4040 ou 4041 Labo de Sérologie Institut de Microbiologie Bugnon 48 1011 Lausanne tél. 021 314 4069 ou 4070 LS4 (Virologie) Labo de Virologie Institut de Microbiologie Bugnon 48 1011 Lausanne tél 021 314 4068 ou 4067 fax 021 314 4060 Dr P.Meylan 021 314 4098, Dr R.Sahli 021 314 4082 LS5 (Listéria) Labo Listéria Institut de Microbiologie Bugnon 48 1011 Lausanne tél 021 314 4049 LS6 (Pneumocystis) PCR et Epidémiologie P.carinii Institut de Microbiologie Bugnon 48 1011 Lausanne tél 021 314 0268 LS7 (Toxine) Laboratoire de Bactériologie BH19, CHUV 1011 Lausanne tél 021 314 4114 coproculture LS8 (IAL) Division d' Immunologie et Allergie BH19-652, CHUV 1011Lausanne tél 021 314 0812 (hépatites HIV) ou 314 0839 immunologie. fax 021 314 0801 LS9 (LCCC) Labo Central de Chimie Clinique BH18, CHUV 1011 Lausanne tél 021 314 4166 et 314 4280 314 4288 LS3 (Sérologie) L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT tél 022 372 73 10 (bacté) 022 372 73 13 (méningo) Béatrice Ninet http://laboratoire-bacteriologie.hugge.ch/ tél. 071 494 37 00 fax 071 494 37 85 http://www.ikmi.ch K.Jaton 021 314 4076 http://www.hospvd.ch/parasite Dr Meylan 021 314 4098 Dr P.Hauser Accord Visa RL Visa MLT Date 26.07.2010 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Code Page A10/A10 Adresse Contact LS10 (HH) Hygiène hospitalière et épidémiologie Institut de Microbiologie Bugnon 44 1011 Lausanne tél 021 314 11 11 Dr Dominique Blanc http://www.hpci.ch/hh_home/hh_dam _accueil.htm LS11 (Candida) Laboratoire de Bactériologie BH19, CHUV 1011 Lausanne Labo Candida tél 021 314 41 15 C.Durussel Méditest Méditest Av. Générale Guisan 30B 1800 Vevey tél. 021 963 39 59 http://www.meditest.ch/ Paris1 (Institut Pasteur) Institut Pasteur Labo. des fièvres hémorragiques virales 25, Rue Du Dr Roux 75724 Paris cedex 15 tél 0033 1 40 61 30 88 ICHV Avenue Grand-Champsec 86 1951 Sion tél 027 603 4862 SRNJTS (CTS) Service Régional Neuchâtelois et Jurassien de Transfusion Sanguine tél int 2044 (labo) Amira Saraj int 2035 TI (CRL) Centre de Référence des Légionelles Institut de Bactériologie Via Mirasole 22 6500 Bellinzona ZH1 (IMMV) Institut für Medizinische Mikrobiologie und Virologie Gloriastrasse 30/32 8006 Zürich tél 091 814 60 41 – 11 fax 091 814 60 29 Valeria Gaia http://www.aramisresearch.ch/d/12355.html tél 044 634 27 00 fax 044 634 49 06 Dr R.Zbinden (bacté) http://www.imm.unizh.ch/ ZH2 (Rétrovirus) Centre National pour les Rétrovirus Gloriastrasse 30/32 8006 Zürich tél 044 634 38 08 / 27 00 fax 044 634 49 65 http://www.imm.unizh.ch/ ZH3 Institut de Parasitologie Winterthurstrasse266a 8057 Zürich Tél 044 635 8501 Fax 044 635 8907 [email protected] http://www.unizh.ch/paras ZH4 Universitäts Kinderklinik Kinderspital Eleonorenstiftung Steinwiesstrasse 75 8032 Zürich SION L_Sous-traitance_V1 0_web.doc Fait le 26.07.2010 Mis à jour le 27.11.2012 par MLT Dr Olivier Péter www.ichv.ch Accord Visa RL Visa MLT http://www.pasteur.fr/externe Date 26.07.2010 Mis en vigueur Visa RL Date 28.07.2010 Mis hors vigueur Visa Date
