Liste des analyses sous-traitées
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Liste des analyses sous-traitées Page A1/A10 Analyses Prélèvements Méthode Sous-traitant Adénovirus Autre que selles PCR LS1 Amibes (Acanthamoeba spp) Biopsie, grattage (eau physiol. stérile) Verre de contact, liquide de lentille Examen direct Culture BE1 Amibes Selles native (cf E.histolytica-dispar) BS1 « Anthrax » B.anthracis Antibiotiques Résistances Souche isolée (ou matériel) PCR Souche Confirmation Antibiotiques rares Souche CMI Antipneumolysines Sérum Sérologie Arbovirus Sérum Sérologie NANT Ascaridiose Sérum Sérologie BE4 ASLO Sérum Sérologie SRNJTS Sérum Sérologie LS3 Sérum Précipitine GE4 Sang, plasma,… Moléculaire Souche Identification classique Souche Séquençage Bartonella henselae (B.quintana) Biopsies, Pus, coupe histologique PCR BK polyomavirus (greffés rénaux) Urine, plasma EDTA PCR Bordetella pertussis Bordetella parapertussis Nez, gorge Frottis ou aspiration PCR LS1 Borrelia miyamotoi Fièvre récurrente Sang LCR PCR SION Botulisme intoxication Selles, sérum Nouveau-né et cas chronique adultes Toxine PASTEUR Brucella spp Souche Typage BE2 Campylobacter spp Souche Identification NENT Campylobacter spp Sérum Fixation complément SION Candida spp Souche Antifongigramme Aspergillus spp Dosage galactomannane Aspergillus et autres (poumon du fermier) Babesia spp Bactéries Champignons Bactéries Champignons L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 NANT Selon type (LS4) Selon disponibilité LS4 Unine ZH1 LS1 LS1 BS2 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A2/A10 Analyses Prélèvements Méthode Sous-traitant Candida spp Mannane et anti mannane Sérum Sérologie LS3 Chlam. pneumoniae Prélèvements respiratoires PCR Chlam psitacci LS1 sérologie ZLM C.trachomatis typages+ Sérovar LGV Génital PCR LS1 Champignon Prélèvements bactériens PanFungal ZH1 Champignon Identification Séquençage LS1 Clostridium perfringens Souche PCR Sérum Sérologie ZH1 Prélèvement respiratoire protocole OFSP !! PCR GE1 LBA, Asp B, plasma Biopsie, liquide biologique PCR confirmation et contrôle SION1 (Détection de la toxine) Coccidioides immitis Coronavirus SRAS-SARS Coxiella burnetti (fièvre Q) Creutzfeld-Jakob prion protéine 14-3-3 LCR réfrigéré Cysticercose Sérum Sérologie Cytomégalovirus (CMV) Sérum Avidité IgG LS3 PCR LS1 PCR GE1 Sang EDTA complet PCR LS1 Souche Identification et séquençage ZH1 Sérum Sérologie GE3 Sérum Sérologie BE4 Souches à confirmer selon OFSP Identification Confirmation NENT Selles à analyser selon demande PCR IMD LCR Sang EDTA PCR ZLM Sérologie ZLM ZH4 LCR (immunocompromis) LBA Biopsie Urine du nouveau né <10j Plasma Cytomégalovirus (CMV) CMV Virémie CMV Virémie (rare) Dermatophytes Diphtérie contrôle vaccination Echinococcus spp EHEC (VTEC) EIEC EPEC (gènes) EHEC (VTEC) EIEC EPEC (gènes) Encéphalite japonaise Encéphalite japonaise L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 BE4 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A3/A10 Analyses Prélèvements Selles, biopsie, ponction Entamoeba histolytica Méthode Sous-traitant Identification BS1 Entamoeba histolytica Sérum URGENT Sérologie BS1 Enterovirus Biopsies, sang, LCR PCR GE1 Biopsies, liquide péricardique, sang, Séquençage si PCR positive GE1 Recherche spéciale virus 0.5ml LCR natif indiquer: tél. + nom du médecin!! PCR Plasma Virémie PCR Eubacterial PCR PCR eubactérienne Gène 16S direct (prélèvements stériles) Biopsie, ponctions stériles PCR + séquençage Fièvres hémorragiques Sérum 1-2 ml . Sérologie FSME LCR, sérum, plasma PCR Galactomannane cf Aspergillus spp Sérum Sérologie Seulement si les critères remplis !! PCR multiplex (CRIV) GE1 Tél au labo ! Avec T.pallidum PCR duplex IMD Souche des hémocultures et LCR Typage LCR PCR multiplex LS1 Sérum Sérologie GE3 Hantavirus (Puumala) Sérum Sérologie ZLM Helicobacter pylori Biopsie PCR IMD Helminthiases tissulaires Sérum Sérologie BS1 Hépatite A virémie Plasma PCR BE CTS Hépatite B Plasma 1ml Résistances LS1 Enterovirus (Echo-, Coxsackie, Polio-) Epstein-Barr virus (EBV) Epstein-Barr virus (EBV) chez les GE1 hémodialysés, gréffés Grippe Aviaire (H5N1) Haemophilus ducreyi Haemophilus influenzae H. influenzae (type B) H. influenzae typeB (contrôle vaccination) L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA LS1 Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 LS1 (CRIV) GE1 SION1 BE1 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A4/A10 Analyses Prélèvements Méthode Sous-traitant Hépatite B Plasma 1ml Génotypage LS1 Hépatite B Plasma Virémie GE1 Hépatite C génotypage Plasma 1ml Hépatite C résistances Plasma EDTA PCR GE1B Sérum Sérologie SRNJTS Sérum Sérologie Plasma PCR LS1 Plasma PCR LS1 Herpes simplex (HSV) 0.5ml LCR natif Frottis dans milieu transport PCR Herpes simplex Sang EDTA Virémie HHV6 Sérum Sérologie HHV8 Sérum Sérologie BS 2 HHV8 Sang EDTA, LCR PCR LS1 (ou BS2) Histoplasma capsulatum Sérum Sérologie ZH1 HIV spécialités HIV2 virémie 2 ml plasma tube en sérothèque!! Virémie HIV pédiatrie Etude CH Plasma et sérum selon disponibilité HIV résistances 2 ml plasma garder un tube en sérothèque!! PCR HIV1, 2: dépistage Sérum Noter si facturation HJB Sérologie HIV1,2 AG p24 Sérum Sérologie HTLV Sérum (dépistage + WB) HTLV Sang EDTA (PCR) PCR IgE totaux Sérum sérologie GE4m Influenza virus Confirmation PCR LS1 Hépatites A, B, C Hépatites D, E Hépatite D virémie Hépatite E virémie JC polyomavirus (LCR) L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 GE1 LS1 BS2 GE1 ZH2 ZH2B GE1C SRNJTS ZH2 Sérologie Urine, (plasma ou sang EDTA) congelé express nuit 0.5ml LCR natif indiquer: tél. + nom du médecin!! JC polyomavirus GE1 PCR et hybridation GE1 ZH2 BS2 PCR LS1 PCR Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A5/A10 Analyses Prélèvements Méthode Sous-traitant Kingella kingae Gorge (dépistage) Ponction, sang EDTA PCR GE2 Legionella Souche sérotypage Legionella Expectoration, LBA, Aspiration bronchique, (Urine) PCR Sérum Sérologie BS1 Leishmania spp Moëlle, biopsies, se garde à 4°C Express de nuit ! ! Culture BS1 Leptospire Sérum EIA Leptospire Sang EDTA et Urine PCR ZLM Listeria monocytogenes Souche bactérienne Typage Identification NENT1 LCR Liquide amniotique PCR multiplex LS1 LCR PCR multiplex LS1 Leishmania spp Listeria monocytogenes Méningite bactérienne TI LS1 ZLM MERS-CoV GE1 Cf Virus spéciaux Microsporidies Selles fixées SAF MRSA Etude CH Souche Mycobactéries MTBC MOTT rechercher et identifier Mycobactéries Mycoplasma pneumoniae Neisseria meningitidis Typage LS6 Biopsie, LCR, par coursier Aspi Bronchique (pas LBA) PCR LS1 Souche PCR Souche Typage Antibiogramme. ZH1 Prélèvement respiratoire, LCR PCR LS1 Souche bactérienne Antibiogramme Typage GE2B PCR Multiplex LS1 . SION Neisseria meningitidis LCR Neoehrlichia mikurensis LCR Autres PCR Oreillons Sérum IgM Oreillons LCR congelé par express de nuit. PCR Oreillons Frottis de sténon, gorge, salive, urine MTV par courrier A Culture L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Accord Visa LVA BE1 Identification Visa AJA Date 09.02.2017 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 ZH1 BE1 ZLM GE1 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A6/A10 Analyses Prélèvements Méthode Papilloma Virus (HPV) Typage Cas spéciaux PCR Parainfluenza 1, 2, 3 Parasites Sous-traitant LS1 Sécrétions naso-pharyngées ou frottis milieu de transport; Selles, biopsies, ponctions. Sérum Sang EDTA, sg cordon, courrier A Moelle osseuse, Synovie, Liquide amniotique, par express de nuit LS1 PCR Confirmation Sérologie BS1 PCR ZLM Sérologie, PCR CNRR Frottis sanguin fixé et goutte épaisse ou sang sur EDTA Confirmation PCR BS1 Sérum Sérologie BS1 Pneumocoque Contrôle vaccination Sérum Sérologie GE3 Pneumocoque invasif Souche isolée Typage BE3 Parvovirus B19 Pathogènes émergents Plasmodium spp Plasmodium spp LCR Str. pneumoniae Pneumocystis jirovecii LS1 PCR multiplex LS1 Biopsie, Expectoration Asp.Bronch, LBA PCR Sérum Sérologie 2x selles délai 24-48h Culture (PCR?) BS3 Sérum Sérologie BE5 Sérum Sérologie SION1 Biopsie,… PCR SION1 Sténon, gorge PCR BE1 Rubéole Sérum Avidité IgG DL Rubéole Liquide amniotique 10 ml; LCR garder réfrigéré (le lendemain: congeler à -80°C) PCR ZLM Salmonella spp Souche Identification NENT Poliomyélite (contrôle de vaccination) Poliomyélite Suspicion clinique Rage Dosage IgG vaccination antirabique Rickettsiose Rickettsiose Rougeole Salmonelles WIDAL Séquençage Souche Shigella spp Souche LS1 TB SPOT L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA BE1 Sérologie Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Identification NENT sérologie BE1 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A7/A10 Analyses Tétanos contrôle de vaccination Toscana Virus Toxines de Staphylocoque (ex: Panton Valentin) Toxocara canis Toxoplasma gondii Toxoplasma gondii Toxoplasma gondii Prélèvements Méthode Sous-traitant Sérum Sérologie GE3 Sérum, Plasma Sérologie, PCR Pasteur Paris Marseille Etude CHUV-Romandie Souche LS6 Sérum Sérologie BE4 Sérum ISAGA IgM, IgA IF IgM, IgG Aggl. IgG Avidité Sérum de la mère et celui du bébé en même temps Liquide amniotique ou LCR ou LBA natif par courrier A – coursier Treponema pallidum LS3 LS3 ELIFA LS1 PCR Avec H.ducreyi PCR IMD PCR IMD Salive, selles (dépistage) par courrier A Sang complet EDTA (pas plasma) et LCR Biopsie, synovie, ponction moelle sur EDTA express de nuit PCR ZH1 Sérum Sérologie BS1 Typage MRSA Souche 1/patient moléculaire LS6 Varicelle zoster Sérum IgA BE1 Varicelle 0.5ml LCR natif par coursier ou courrier A tél. + nom du médecin!! PCR Vibrio spp Souche Confirmation NENT Virus respiratoires Asp naso-pharyngé, LBA, Asp bronchique, brossage expecto PCR semiquantitatification LS1 VIRUS spéciaux LCR généralement et Sang PCR Sérologie GE1 West Nile Virus Sérum Pas de PCR Sérologie GE1 Trichomonas vaginalis Tropheryma whipplei Trypanosomiases Whipple (Maladie de) Cf T.whipplei Yersinia spp Yersinia spp Zika virus L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA LS1 Sérum Souche Urines, plasma ou sang EDTA Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 sérologie Sérotype PCR Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 BE1 NENT GE1 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A8/A10 Code Adresse Contact BE1 Institut de Microbiologie Clinique Université de Berne Friedbühlstrasse 51 Postfach 61 3010 Berne Tél: 031 /632.32.65 Fax: 031/632 49.66 Dr Gorgievski (sérologie et virologie) www.ifik.unibe.ch [email protected] BE2 Institut de Bactériologie Vétérinaire Länggass-strasse 122 Case Postale 8466 3001 Berne Tél: 031/631.24.35 Fax: 031/631.26.34 www.vbi.unibe.ch BE3 Centre National des Pneumocoques Institut de Microbiologie Clinique 3010 Berne Tél: 031/632.32.65 http://www.ifik.unibe.ch BE4 Institut Vétérinaire de Parasitologie Länggass-Strasse 122 Case Postale 8466 3001 Berne Tél: 031/631.24.18 Prof B.Gottstein www.vetmed.unibe.ch/ipa/ BE5 Intitut Vétérinaire de Virologie Länggass-Strasse 122 Case Postale 3001 Berne Tél: 031/631.23.78 Fax: 031/631.25.34 Prof E.Peterhans www.cx.unibe.ch/ivv/ BE CTS Service de transfusion sanguine CRS Berne SA Laboratoire diagnostic Murtenstrasse 133 3008 Berne Tél: 031/384.23.00 Fax: 031./384.23.01 [email protected] BS1 Institut Tropical Suisse Case Postale 4002 Bâle Tél: 061/284.82.56 Fax: 061/284.81.18 Dr Marti BS2 (même feuille que BS1 mais adresse différente) Institut für Medizinische Mikrobiologie Labo PCR Petersplatz 10 4003 Bâle Tél: 061/ 267.32.62 Fax: 061/267.32.98 BS3 Institut für Medizinische Mikrobiologie Petersplatz 10 Tél: 061/ 267. 32.79 Fax: 061/267.32.98 [email protected] 4003 Bâle CNRR CNRT Coxiella Tél : 00 33 4 91.32.43.75 Fax : 00 33 4 91.38.77.72 Prof D.Raoult Centre National de Référence des Rickettsioses UMR 6020 Faculté de Médecine 27, boulevard Jean Moulin 13385 MARSEILLE Cedex 5 FRANCE Labo de Microbiologie CHUV Bugnon 48 1011 Lausanne L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Tél: 021/ 314.41.11 Fax 021314.40.60 K.Jaton 021/314.40.76 Prof. PD Gilbert Greub Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A9/A10 Code Adresse Contact NANT Labo Spiez Austrasse 3700 Spiez Tél: 033/228.14.01 Fax:033/228.14.02 [email protected] www.labor-spiez.ch NENT Centre National des Bactéries Entéropathogènes: NENT Institut Für Lebensmittelsicherheit Universität Zürich Winterthurerstrtasse 272 8057 ZÜRICH Dianalab Rue de la Colline 6 1205 Genève Tél : 044/635 86 71 Fax: 044/635.89.08 Dr H Haechler [email protected] GE1 GE1B GE1C DMGL/Centre d'accueil des prélèvements BAT Lab local 8D-0-850.1 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14 Tél: 022/372.49.80 Fax: 022/ 372.18.35 www.hug-ge.ch/feuille-de-demande GE2 (Bactériologie) DMGL/Centre d'accueil des prélèvements BAT C, niveau 5, local 7A-5-759 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14 Tél: 022/372.73.10 (bacté) Tél: 022/372.92.52 (méningo) GE3 Laboratoire de Vaccinologie Bâtiment des laboratoires 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14 Tél: 079/553.46.70 Barbara.lemaî[email protected] GE4 HUG, Service d'immunologie et d'allergologie Bâtiment A1, local 8D-4-876 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14 Tél: 022/372.93.73 IMD (ZH) Institut für medizinische und molekulare Diagnostik AG Falkenstrasse 14 8024 Zürich Tél: 044/250.50.50 Fax: 044/250.50.51 LS1 (Diagn. Moléc.) LS1B Labo de Diagnostic Moléculaire CHUV, Institut de Microbiologie DPML BH18-100 1011 Lausanne Tél : 021/314.40.48 Fax: 021/314.40.60 K.Jaton 021/314.40.76 www.hospvd.ch/chuv/dml LS2 (IAL) Division d'Immunologie et Allergie CHUV DPML BH18-100 1011 Lausanne Labo de Sérologie CHUV, Institut de Microbiologie DPML BH18-100 1011 Lausanne Tél : 021/314.08.05 Fax:021/314.08.01 DL GE2B (méningo) LS3 (Sérologie) L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Tél : 022/807.12.40 Fax: 022/807.12.44 Dr Stricker Tél. 021/314.40.69 ou 40.70 Dr Meylan 021/314.40.98 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 Mis hors vigueur Visa Date Liste des analyses sous-traitées Page A10/A10 Code LS4 LS6 (HH) PASTEUR Adresse Contact Service de biomédecine CHUV BH18-100 1011 Lausanne Hygiène hospitalière et épidémiologie Institut de Microbiologie Bugnon 44 1011 Lausanne Tél: 021/314.42.71 Fax: 021.314.80.98 Institut Pasteur CNR Anaérobie et botulisme 28, Rue Du Dr Roux 75724 Paris cedex 15 Tél: 0033 1 45 68 83 10 Tél 021/314.11.11 Dr Dominique Blanc .hpci.ch/hh_home/hh_dam_accueil.htm http://www.pasteur.fr/externe SION1 (sérologie) ICHV SION2 (bactério.) Avenue Grand-Champsec 86 1951 Sion Tél: 027/603.48.62 SRNJTS (CTS) Service Régional Neuchâtelois et Jurassien de Transfusion Sanguine Tél interne: 72044 (labo) Amira Saraj 72035 TI (CRL) Centre de Référence des Légionelles Institut de Bactériologie Via Mirasole 22 6500 Bellinzona Tél: 091/814.60.41 – 11 Fax: 091/814.60.29 ZH1 (IMMV) Institut für Medizinische Mikrobiologie Gloriastrasse 30/32 8006 Zürich Tél: 044/ 634.27.00 Fax: 044/ 634.49.06 www.imm.unizh.ch/ ZH2 (Rétrovirus) ZH2B (pédiatrie) Centre National pour les Rétrovirus Winterthurerstrasse 190 8057 Zürich Tél :044/634.38.08 Fax: 044/634.26.83 www.imm.unizh.ch/ ZH3 Institut für Medizinische Virologir Gloriastrasse 30/32 8006 Zürich Tél :044/635.85.01 Fax:044/635.89.07 [email protected] http://www.unizh.ch/paras ZH4 Institut für Neuropathologie Schmelzbergstrasse 12 8091 Zürich Tél 044 255 2105 Fax 044 255 4402 www.neuropathologie.usz.ch ZLM (ancien IKMI) (sérol.) ZLM1 (PCR) Zentrum für Labormedizin Frohbergstrasse 3 9001 St. Gallen Tél:071/494.37.00 Fax: 071/494.37.85 www.zlmsg.ch L_Sous-traitance_V2 0.docx Fait le 09.02.2017 Mis à jour 09.02.2017 par LVA Dr Alexis Dumoulin www.ichv.ch Accord Visa LVA Visa AJA Date 09.02.2017 Mis en vigueur Visa RLI Date 09.02.2017 Mis hors vigueur Visa Date
