La complexité cellulaire à la lumière de la

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La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
La complexité cellulaire à la lumière de la
physique
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
J.F. Joanny
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Physico-Chimie Curie
Institut Curie
Marathon des Sciences août 2013
Outline
La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
1
Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
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La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
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Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
2
Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
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Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
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Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
3
Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
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Structure de la
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Moteurs
moléculaires dans la
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Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
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Tisssus solides et
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Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
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Moteurs moléculaires
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Moteurs moléculaires dans la cellule
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Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
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Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
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Structure de la
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Moteurs
moléculaires dans la
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Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
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Organelles et Cytosquelette
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Moteurs
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Structure de la
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Cytosquelette
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Matière active
Propriétés
mécaniques
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liquides
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Structures cellulaires
tubulaires
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Curie Theory
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Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
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Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
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Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Fonction des moteurs moléculaires
La complexité
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physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
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Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Protéines motrices
Contraction des muscles
(myosines II)
Cils, flagelles et
axonèmes (Dynéine)
Mitose
Transport
intracellulaire(kinésine,
myosine V)
Cellules de l’oreille
interne (Myosine 1c)
Moteurs rotatifs
Structure des moteurs
moléculaires
Expériences sur molécules uniques
La complexité
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physique
Moteurs processifs, Tests de
bille
Pas des moteurs
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Moteurs
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Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Cappello
Détachement du moteur
Processivité ∼ 1µm
Pas à la période des
microtubules
Force d’arrêt 6pN Block
Pas en arrière
Vitesse 1µm/s
Processivité 200 pas
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Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Processivité et tests de motiltié
La complexité
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Test de motilité
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Moteurs
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Structure de la
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Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Processivité
Taux d’accrochage et de décrochage kon , koff
Duty ratio r =
kon
kon +koff
Fraction de moteurs liés r , 1/r moteurs par filament
Les myosines non-processives r = 0.02. Filaments de
myosines
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La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
1
Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
2
Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
3
Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Mouvement de cellules Kératocytes,
Verkhovsky
La complexité
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physique
Mouvement de lamellipode
Joanny
Fragments cellulaires
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Mouvement rapide :
10µm/min.
Lamellipode plat
Fragments de Kératocyte :
actine +myosine II
Elasticité d’une cellule, Asnacios
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cellulaire à la
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physique
Mesure de fluage
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
La complaisance de fluage augmente avec un
exposant faible J(t) ∼ t 0.24
Module complexe G(ω) ∼ ω 0.24 . Large distribution de
temps de relaxation
Effet actif
Gels actifs in vitro, G.Koenderink
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cellulaire à la
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physique
Gel
Actine-Myosine
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Croissance de la contrainte active
Gel d’actine-myosine dans un
capillaire de 400µm de diamètre
Propriétés
mécaniques des
cellules
Accéléré 180 fois
Matière active
ATP introduit à t = 0. La contrainte
de tension augmente avec le temps
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Outline
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cellulaire à la
lumière de la
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Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
2
Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
3
Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Systèmes actifs
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physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Tissus
Colonies de bactéries Kessler, Goldstein
Vibrated granular materials Menon et al.
Colloïdes actifs, Nématiques actifs Ramaswamy et al.
Bancs d’oiseaux et de poissons Vicsek, Toner, Chaté,
Carere
Outline
La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
1
Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
2
Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
3
Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Tissus épithéliaux
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physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure épitheliale
Division cellulaire
Differentiation cellulaire
Cellules apoptotiques
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Division cellulaire et apoptose
Taux de division kd (ρ, etat biochimique)
Taux d’apoptose ka (ρ, etat biochimique)
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Mécanique des tissus
Comportement solide
Comportement liquide
Aknowledgements
Liquide visco-élastique, temsp de relaxation T
Curie Theory
Group
Comportement plastique
Description microscopique et macroscopique
des tissus
La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
Joanny
Description microscopique
Analogie avec les mousses
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Bellaiche, Graner
Numerical simulations
Description hydrodynamique continue
Grandes distances, temps longs
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Equation constitutive pour déterminer le champ de
contrainte
Pression homéostatique F.Montel, M.Delarue
La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Expérience de croissance
Expériences indirectes
Sac de dialyse
Pression exercée par
le Dextrane
Expériences directes
Sphéroïde en contact
avec une solution de
Dextrane
Pas de pénétration du
Dextrane dans le
sphéroïde
Croissance de surface
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physique
Dépendance en pression
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
∂t V = (kd − ka )V + 4π(
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Effet des nutriments
Effet d’encombrement
3 2/3
) δks λV 2/3
4π
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La complexité
cellulaire à la
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physique
1
Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
2
Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
3
Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Cryptes et Villi
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physique
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Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Transition de flambage E. Hannezo
La complexité
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Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Ecoulement dans la couche de cellules
Division dépend de pression et courbure locale
Equilibre des forces dans la monocouche
Tension locale négative γ = γ0 − pw, γ0 = Ph hc
Flambage
Equilibre des forces dans la direction verticale
1
Seuil de flambage γc = (3KEs2 ) 3
1
Longueur de flambage λc = 2π (K /Es ) 3 , λ ∼ 100µm
Petit intestin et Colon
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Moteurs
moléculaires
Structure de la
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Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Petit intestin : faible couplage
à la courbure
Colon : Fort couplage à la
courbure
Structure des villi
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Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
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Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Transition entre structures
Même motif des papilles de la peau
La complexité
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Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Motif hexagonal
Polarité inversée
Outline
La complexité
cellulaire à la
lumière de la
physique
1
Moteurs moléculaires
Structure de la cellule
Moteurs moléculaires dans la cellule
2
Cytosquelette
Propriétés mécaniques des cellules
Matière active
3
Propriétés mécaniques des tissus
Tisssus solides et liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires tubulaires
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Instabilité des tubes cellulaires
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physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Structure de la
cellule
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Propriétés
mécaniques
des tissus
Onde stationnaire
artérielle
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Trachée de la drosophile
Dysplasie Fibromusculaire
Curie Theory Group
La complexité
cellulaire à la
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physique
Joanny
Moteurs
moléculaires
Thomas Risler
Structure de la
cellule
Philippe Marcq
Jacques Prost
Moteurs
moléculaires dans la
cellule
Cytosquelette
Propriétés
mécaniques des
cellules
Matière active
Christoph Erlenkämper Jonas Ranft
Pierre Recho
Propriétés
mécaniques
des tissus
Tisssus solides et
liquides
Villi de l’intestin
Structures cellulaires
tubulaires
Edouard Hannezo
Aknowledgements
Curie Theory
Group
Hervé Turlier
Alexandre Mamane
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