Proposition de sujet de stage Dynamique des Interactions Parasite
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Proposition de sujet de stage de Master Dynamique des Interactions Parasite-Hôte-Environnement Parasite (DIPHE) Nom et fonction de l’encadrant (maître de stage)/ Training supervisor (Name and function) Laurent GAVOTTE (MCU - ISEM) - Montpellier Coralie MARTIN (CR - MNHN) - Paris Cyril d’HAESE (CR - MNHN) - Paris Structure d’accueil / Host Institution: Institut des Sciences de l’Evolution (ISEM) - Montpellier Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN) - Paris Head Responsable de l’institution/ Host Institution Head: Agnès MIGNOT - ISEM Adresses mail (encadrant et contact structure)/ structure) mail adresses (supervisor supervisor and Institution contact) : Encadrants : [email protected] [email protected] Structure : Stage proposé en : Année 1Training proposed for : first Year/ second year Intitulé /Title of the training Emergence des bactéries Wolbachia : étude des symbiotes de collemboles Résumé du sujet proposé (contexte (context et thématique, protocoles, attendus…) / Contents of the training (problematic and context, Program proposed and training schedule...) schedule Contexte : Les bactéries intracellulaires obligatoires du genre g Wolbachia sont les symbiotes les plus répandus du monde vivant, infectant de 20 à 60% des espèces d’arthropodes. Présentes chez différents groupes taxonomiques (nématodes filaires, insectes, arachnides etc...), leur diversité et leur évolution restent encore très mal connues. Au sein de la classe des Collemboles (4 ordres ; ~7000 espèces décrites), ), le génome d’une souche de bactérie présente chez l’espèce Folsomia candida a été séquencé et la bactérie typée chez 5 autres espèces. Ces données onnées restent faiblement représentatives de la réelle diversité de ce groupe taxonomique dont la phylogénie est relativement bien connue. L’objectif du présent stage est de : i) rechercher la présence de la bactérie Wolbachia au sein d’un ensemble d’espèces de collemboles jusque là non étudiées à l’aide de marqueur moléculaire (PCR spécifique) ; ii) typer les nouvelles souches de bactéries identifiées par séquençage de plusieurs gènes ; iii) déterminer la position phylogénétique des nouvelles souches au sein de la diversité connue des Wolbachia ; iv) rechercher des marqueurs de co-évolution entre les hôtes collemboles et leurs bactéries. Protocoles : Le travail se déroulera en étroite collaboration entre le Paris et Montpellier, l’étudiant choisi sera peut-être amené à réaliser un ou plusieurs déplacements au MNHN. Les expérimentations moléculaires seront réalisées à Montpellier. Le travail consistera à réaliser un ensemble d’extraction d’acides nucléiques, de PCR spécifiques (gènes wsp, 16S, ORF7, etc...) et de les séquencer. Nous étudierons un maximum d'espèces disponibles au MNHN (collection et élevages). Attendu : Nous espérons améliorer grandement la connaissance de la diversité des Wolbachia de collemboles en étudiant un ensemble d’espèces pour lesquelles aucune donnée n’est disponible. La détermination de la position phylogénétique exacte des Wolbachia de collemboles nous permettra également d’affiner nos hypothèses sur l’histoire évolutive de cette bactérie. Enfin ce travail permettra à terme de travailler sur la co-évolution Wolbachia-collemboles et d’apprécier l’importance écologique et évolutive de cette bactérie au sein de ce groupe taxonomique. Facilités offertes à l’étudiant / facilities provided for the student ** Indemnités de stages /Training stipend provided (**) Non/No Montant/ amount : Oui /Yes Voyage financé (si besoin)/Plane ticket provided (if needed) Non/No Oui /Yes Logement gratuit/ Non/No Oui /Yes Non/No Oui /Yes Oui /Yes Accomodation provided Restauration gratuite /free meal Moyens de déplacement gratuits (si terrain)/ Field trips : refund of expenses (If needed) Non/No **obligatoire pour toute structure française au delà de 2 mois de stage-décrets ministériels du 31mars 2006 (privé) et du 21juillet 2009 (public)- mandatory for french institutions only Cette fiche doit obligatoirement être validée par le responsable pédagogique. This document must be validated by the head teacher.
