Isatis tinctoria - Consortium USTH

Doctorante: Kieu Oanh NGUYEN
Directeur de Thèse: Pr. Dr. Eric GONTIER
Co-directeur de Thèse: Dr. Rebecca DAUWE
Equipe de recherche
« Procédés pour la production de biomolécules »
Date de début de Thèse:
Mai 2010
Date de soutenance prévue:
Mai 2013
BioPI EA3900- Biologie des Plantes et Innovation
UPJV, Faculté des Sciences, 33 rue Saint Leu, 80039 Amiens, France
Indirubine
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Isatis tinctoria L.,
Brassicaceae
La métabolomique: une vision globale des
métabolites présents dans la plante…
Analyse du métabolome: révéler des
changements métaboliques globaux après
l’application d’un traitement
Solution nutritive
Agrobacterium rhizogenes
Tuyau d’arrivée d’air
GC-MS et
LC-MS
Etat d’avancement
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Etude de la bibliographie (base en place, maintien à jour et
approfondissement)
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Analyses GC-MS et LC-MS sur des extraits de graines et de fruits d’Isatis
tinctoria pour caractériser la valeur potentielle des huiles dans les
graines.
Même démarche suivie pour les feuilles et les racines de la plante:
caractériser « tous » les métabolites présents dans chaque partie de la
plante (.
 Cultures hydroponiques mises en place pour étudier l’influence de
souches bactériennes (Agrobacterium rhizogenes ) sur:
 la croissance de plantes// augmentation de la vitesse de croissance,

plus de biomasse produite par unité de temps.
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la biosynthèse des métabolites secondaires et primaires //
approche métabolomique utilisant XC-MS sous la langue R.
XC-MS profiling
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Extraction des méabolites (et dérivatisation).
Chromatographie (GC, LC) couplée à la spectrométrie de masse (MS).
Intégration des pics (caractérisés par un temps de rétention RT et un m/z).
Analyses statistiques par XC-MS sous la langue R.
Identification des pics: AMDIS (Automated Mass spectral Deconvolution
and Identification System) + NIST (libraires: Golm, BioPI – 56 métabolites)
Par GC-MS, 132 métabolites ont été étiquetés dans les feuilles et les
racines d’Isatis tinctoria L.:
 Etiquetés par groupe : 81
 Acide aminés : 23
 Sucres : 16 (not identified)
 Acides organiques : 16
 Glucosinolates : 12 (not identified)
 Autres : 14
 Autres composés étiquetés non identifiés : 51
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Pour la suite:
Continuer à compléter nos résultats de GC-MS et LC-MS.
Réaliser des cultures hydroponiques stériles pour l’étude de
l’interaction plante-microorganismes.
Tests d’activité anti-microbien de l’extrait de feuilles et de
racines d’Isatis tinctoria.
Difficultés rencontrées
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Le manque de standards spécifiques engendre une difficulté
pour l’identification des molécules.
Résultats attendus
Evaluation du potentiel d’ Isatis tinctoria pour la
production de métabolistes d’intérêt pharmaceutique à
partir de cultures hors-sol.
Des publications sur les travaux de thèse.