sujet 2014

MASTER 2ème Année – Océanographie - Spécialité : BEM
Année 2014 – 2015
Titre du stage : «Estimation bayésienne de distributions d’abondances de proies sur la
base de contenus stomacaux : approches par modélisation»
Encadrement :
- Frédéric MENARD (DR IRD) : MIO – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille
Tel : 04 86 09 06 27 – email : [email protected]
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Jean-Christophe POGGIALE (PR) : MIO – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille
Tel : 04 86 09 06 36 – email : [email protected]
SUJET :
Les pressions anthropiques exercées sur le milieu marin ont un impact sur les
abondances de nombreuses espèces marines, dont certaines constituent des ressources
pour l’homme. Les modifications d’abondances peuvent avoir des conséquences drastiques
sur la structure des réseaux trophiques et le fonctionnement des écosystèmes marins. Parmi
les informations disponibles sur la présence et les abondances d’espèces marines, les
analyses de contenus stomacaux renseignent sur les régimes alimentaires des prédateurs et
sur le type et le nombre de proies rencontrées (céphalopodes, poissons, mollusques par
exemple). Pour obtenir des distributions de ces ressources, des méthodes d’estimation
fondées sur une approche bayésienne ont été proposées (Magnússon et Aspelund, 1997).
Des améliorations récentes de ces méthodes ont été développées (Morfin et al., 2009) et
seront utilisées dans ce travail.
L’objectif de ce stage est de tester l’efficacité de telles méthodes en utilisant une
modélisation individu centrée (IBM). Le travail consistera à compléter et utiliser un IBM
développé au MIO pour simuler des contenus stomacaux et à appliquer les méthodes
d’estimations pour comparer les distributions qu’elles fournissent à celles produites par le
modèle.
L’étudiant(e) qui réalisera ce stage devra acquérir de bonnes bases en
programmation et développera des compétences en modélisation et analyse de données
pour l’écologie marine.
K. G. Magnússon and T. Aspelund. A model for estimating meal frequency and meal size
from stomach data with an application to atlantic cod (gadus morhua) feedinf on capelin
(mallotus villosus). Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 54 : 876–889, 1997.
Morfin, M. Etienne, M.-P., Ménard, F. Modèle hiérarchique bayésien pour analyser les
contenus stomacaux de prédateurs marins: application aux thons tropicaux, 41ème journées
de statistiques, SFDS, Bordeaux 2009.