Objectifs, contenu et organisation

UE SECC14
Intitulé : Ecosystèmes Littoraux
Responsable : Katherine Costil
Résumé : Le module « Ecosystèmes Littoraux » a pour objectif d’acquérir des
connaissances sur la caractérisation et le fonctionnement des écosystèmes littoraux
terrestres et marins.
Objectifs, contenu et organisation :
Cours Magistraux (30 h)
Les cours magistraux visent à présenter les environnements
littoraux au sens large, depuis la bande terrestre côtière jusqu’au
domaine subtidal. Ils apportent des connaissances fondamentales
sur la biodiversité, les processus d’adaptation des organismes à
leur environnement (potentiellement fluctuant), les répartitions
spatio-temporelles ainsi que la structure et le fonctionnement des
peuplements. Les organismes considérés correspondent aux
halophytes, aux algues et aux faunes pélagique et benthique.
Travaux Dirigés (20h)
Les TD ont pour objectif : 1) d’illustrer les éléments abordés lors
des cours magistraux par des exemples concrets, 2) d’apporter des
connaissances sur les caractéristiques physico-chimiques des
milieux marins (utiles pour comprendre l’organisation et le
fonctionnement des peuplements floristique et faunistique) et
3) d’aborder des notions de gestion environnementale et
d’applications de la recherche pour l’industrie et l’aquaculture.
Les TD sont organisés en 10 séances de 2 heures :
Méthodologie (instrumentation) et caractéristiques des milieux
côtiers (2 séances)
Planctonologie animale
Ecophases et cycles biologiques
Halieutique et gestion de la bande côtière
Production des milieux estuariens
Protection des dunes
Introduction d’espèces algales
Algocultures (2 séances)
UE AQUA10
Intitulé : Endocrinologie évolutive et comparée
Responsable : Pascal Favrel
Résumé :
- Mécanismes de régulations chez les modèles animaux invertébrés et vertébrés
- Aspects phylogénétiques et comparés
- Applications à l’agronomie et l’aquaculture
Objectifs, contenu et organisation (50h) :
Cours Magistraux (30 h) :
- Apports de la génomique, de la protéomique et des outils de
la génomique fonctionnelle à l’endocrinologie.
- Diversité des neuropeptides et des (neuro) hormones : aspects
évolutifs.
- Diversité des récepteurs, couples récepteurs - ligands,
coévolution.
- Endocrinologie comparée de la reproduction (modèles
vertébrés, insectes, crustacés, mollusques)
- Aspects comparatifs et phylogénétiques de la régulation
endocrine de la croissance :
Chez les vertébrés à travers l’étude de la structure et de
l’évolution des hormones de la famille des somatotropines et des
IGF, de l’étude de leur récepteurs et des modalités de
transduction du signal, l’évolution des activités biologiques et des
facteurs de régulation.
Chez les invertébrés : Identification, structure et rôles des
peptides de la superfamille des insulines : les modèles d’étude :
Mollusques (Limnée), Insectes (Bombyx et Drosophile) nématodes
(Caenorhabditis elegans).
Panorama des phéromones d’invertébrés aquatiques :
identification, structure et fonction.
Travaux Dirigés (20 h) :
- Techniques de séparation : HPLC 1D et 2D / SDS-PAGE 1 et
2D / électro-focalisation préparative.
- Séquençage de peptides (Edman et SM).
- Analyse in silico de données transcriptomiques et
peptidomiques-protéomiques, analyse de précurseurs
protéiques.
- PCR : principe et utilisation dans le cadre d’approches
peptidomiques-protéomiques .
- PCR quantitative en temps réelle
- Étude et présentation de publications
UE SECC13
Intitulé : Ecosystèmes et Environnements littoraux : étude de terrain
Responsable : Philippe Laîné
Résumé: Etude pratique des milieux littoraux: peuplements et écosystèmes, biologie et
écophysiologie des organismes.
Mots clés : distribution spatiale, diversité, végétation du littoral, phycologie, zoologie
Objectifs, contenu et organisation (55h TP - Excursions / 5h TD) :
Objectif: Acquérir les connaissances relatives aux structures et au
fonctionnement des milieux littoraux.
Descriptif: Les étudiants feront 5 sorties sur le terrain (2 sorties en
enseignement commun et 3 sorties dans l’option choisie). Elles
seront précédées d’une préparation et suivies d’une exploitation
du matériel et des données collectées.
Programme des options :
Les étudiants devront obligatoirement suivre un enseignement
commun leur permettant d’acquérir des connaissances générales
sur les peuplements et les écosystèmes littoraux puis choisir l’une
de trois options proposées :
-Ecophysiologie végétale: aspect physiologiques de l’halophilie
et de la résistance au sel des plantes du littoral; utilisation et
protection des milieux saumâtres et dunaires; étude de la
végétation des vases salées, des falaises, des dunes calcaires et
siliceuses; caractéristiques morphologiques, cytologiques,
physiologiques des végétaux rencontrés dans ces biotopes.
- Phycologie: biodiversité des algues marines, cytologie,
morphologie, écologie, sexualité et reproduction; généralités sur
l’écologie; étude de la zonation du phytobenthos sur les côtes
rocheuses; intérêts des algues marines et leurs applications;
étude qualitative du phytoplancton littoral.
- Zoologie: systématique et diversité des invertébrés benthiques;
diversité des invertébrés des estrans meubles et rocheux;
éléments de systématique et d’écologie de l’ichtyofaune;
répartition spatiale des organismes (cartographie et introduction
à l’analyse spatiale des populations).
UE SECC15
Intitulé : Facteurs du milieu et adaptations
Responsable : Jean-Marc LEBEL
Résumé : Cette unité d’enseignement est centrée sur l’analyse de l’incidence des
facteurs du milieu (facteurs abiotiques) sur la physiologie et les adaptations des organismes
végétaux et animaux)
Cours magistraux : 30 heures
E Organismes végétaux
- Effets des facteurs du milieu sur la végétation – Adaptations : Lumière et végétation,
Température et végétation, Facteur hydrique et végétation (milieu aquatique
et
milieu sec), Hypoxie et végétation
E Organismes animaux
- Effets des facteurs du milieu sur les espèces animales – Adaptations : Température et
métabolisme, ectothermie, endothermie, cas de la résistance au gel ; lumière et cycles
biologiques ; facteurs hydriques (milieu désertique et économie de l’eau) ; facteurs du
milieu et métamorphose des amphibiens.
Travaux dirigés : 20 heures
- Formation des sols (pédogenèse), les relations plante-sol, les plantes calcicoles et
calcifuges, la photosynthèse en C4 et CAM, les facteurs climatiques et la
répartition des espèces végétales
- Facteurs du milieu et : 1- développement larvaire, 2- physiologie d’un organisme de type
aquatique (adaptation des organismes marins à l’émersion ; la vie animale en
milieu extrême.
E Contrôle des connaissances : contrôle terminal écrit pour les CM, et contrôle continu
pour les TD