PROGRAMME TRANSVERSAL 2016 PROJETS DE RECHERCHE DANS LE DOMAINE DU MICROBIOTE Lettre d'intention La lettre d'intention doit être déposée par le candidat sur (https://www.eva2.inserm.fr/EVA/jsp/) avant le 31 mars 2016 à 16h00. le site internet EVA TABLE DES MATIERES PARTIE I: ETAT CIVIL .................................................................................................................................. 3 1. CANDIDAT ......................................................................................................................................................3 2. EQUIPE(S) CANDIDATE(S) (SI APPLICABLE)............................................................................................................3 PARTIE II: PARTIE SCIENTIFIQUE................................................................................................................. 4 1. CANDIDATURE .........................................................................................................................................4 2. RESUME DU PROJET ...............................................................................................................................6 PARTIE III: CV DE(S) EQUIPE(S) PARTICIPANTE(S) ........................................................................................ 7 PARTIE IV : EXPERTS RECUSES .................................................................................................................... 8 AAP – Microbiote 2016 2/8 Partie I: Etat civil 1. Candidat Nom Prénom Laboratoire de rattachement Directeur du laboratoire Responsable d'équipe Nom de l'équipe Adresse du laboratoire Ville 2. Equipe(s) candidate(s) (si applicable) Nom du responsable d’équipe associée Prénom du responsable d’équipe associée Laboratoire de rattachement Directeur du laboratoire Responsable d'équipe Nom de l’équipe Adresse du laboratoire Ville Prévoir un tableau par équipe associée. AAP – Microbiote 2016 3/8 Partie II: Partie scientifique L'objectif du programme transversal est de financer le programme scientifique défini dans le texte de l'appel à projets qui sera réalisé par un consortium d'équipes. Vous postulez pour rejoindre le consortium. Cette lettre d’intention doit être rédigée en anglais et doit comprendre les rubriques suivantes: 1. candidature Votre thème de recherche actuelle? (10 lignes) Choix des axes de travail ☐ Axe de travail 1 ☐ Axe de travail 2 ☐ Axe de travail 3 ☐ Axe de travail 4 Le lien avec le programme transversal (10 lignes max) Votre motivation pour participer au programme transversal (10 lignes max) Outils et ressources humaines mobilisables dans votre équipe pour ce projet (une demi-page page max) Une synergie des équipes mobilisées (si applicable) (une demi-page max) Se reporter au texte de l'appel à projets pour connaitre les objectifs du programme et les différents axes de travail. Axe de Travail 1 Choix du verrou ☐ Réaliser, par OMICS de l’environnement intestinal et modélisation mathématique sans a priori, l’analyse des signatures moléculaires homéostatiques entre microbiote et hôte à partir de cohortes précisément établies pour définir le continuum de santé. ☐ Développer de nouvelles approches standardisées de préparation (purification, extraction, enrichissement mécanique ou in silico de l’information) et d'analyse (assemblage, annotation, modélisation...) des échantillons biologiques intégrant l'accès aux signatures d'éléments endogènes pouvant corréler avec certains contextes physiopathologiques et aux organismes viraux ou bactériens faiblement représentés. ☐ Etablir leur variation sous l’influence de l’environnement, notamment l’alimentation. ☐ Etablir les signatures moléculaires du microbiote extracellulaire (mucosal) et intracellulaires (tissulaire, immunitaire, métabolique) dans ce cadre. AAP – Microbiote 2016 4/8 ☐ ☐ Identifier l’adaptation moléculaire du système immunitaire voire entero-endocrine et de tissus/organes périphériques (foie, tissus adipeux) aux signatures en fonction du continuum de santé. autre Si autre, précisez Axe de travail 2 Choix du verrou ☐ Etude et modélisation multiparamétrique des régulations et des équilibres écologiques. ☐ Transition du commensalisme vers la pathogénicité ☐ Développement de technologies dédiées, en particulier la culture de bactéries actuellement non cultivables. autre ☐ Si autre, précisez Axe de travail 3 Choix du verrou ☐ Comment compartimentaliser, isoler l’effet de ces flores pour en étudier individuellement l’impact, en éliminant en particulier la reconnaissance par l’hôte de signaux issus de la flore intestinale et de manière conditionnelle les mécanismes par lesquels l’hôte adapte la composition de chacun de ses microbiotes ? ☐ Quelle biologie systémique et quelle modélisation mathématique pourrait être appliquée à la compréhension d’un hôte « mosaïque de microbiotes » ☐ autre Si autre, précisez Axe de travail 4 Choix du verrou ☐ dévoiler les causes de la variabilité inter-individuelle de ses propriétés vis-à-vis des xénobiotiques, en vue de prédire et d'optimiser l'efficacité et la tolérance des médicaments. ☐ les mécanismes et marqueurs prédictifs du phénomène de résilience du microbiote intestinal en réponse aux traitements immuno-régulateurs. ☐ compréhension des propriétés adjuvantes des commensales et des pro(pré)biotiques et l'identification des marqueurs prédictifs de leur efficacité. ☐ autre Si autre, précisez AAP – Microbiote 2016 5/8 2. Résumé du projet Compte-tenu de votre choix de verrou, fournir un résumé : pourquoi ce verrou, description du projet, intérêt pour le consortium (max 3 pages) Le résumé doit fournir une description claire de comment vous allez répondre aux questions du verrou et les moyens qui seront mis en place dans votre équipe pour les atteindre. Indiquez ce que votre expertise et vos compétences apportent au programme. AAP – Microbiote 2016 6/8 Partie III: CV de(s) équipe(s) participante(s) Cette partie doit contenir les CV (en anglais) du candidat principal et des responsables d’équipes participantes associées (si applicable). AAP – Microbiote 2016 7/8 Partie IV : Experts récusés Si le coordinateur le souhaite, indiquer les experts récusés pour l'évaluation Nom, Prénom AAP – Microbiote 2016 Pays Email Justification 8/8