REPUBLIQUE DU SENEGAL Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche ------------------UNIVERSITE GASTON BERGER Unité de Formation et de Recherche des Sciences de la Santé Section : Biologie et Explorations UE : Bactériologie-Virologie Type (UE) : Niveau : Obligatoire Licence Année : 3 Semestre : Crédits(UE) : 5 6 Code (UE) : 21 Intitulé du cours (EC): Bactériologie Coefficient (ECUE) : Contacts : Pré-requis : Objectif : Volumes Horaires : CM , TD et TP:120 H; TPE : ….. Prénom et NOM : Seynabou LO Titre : Assistante Faculté ou UFR ou Organisme : UFR des Sciences de la santé, Section Biologie et Explorations Local : Salle KS 01 Téléphone : 77 533 96 73 Email : [email protected] [email protected] Biologie cellulaire et génétique (UE 2), biochimie (UE 9 et 12), physiologie (UE 11 et 17), anatomie (UE 1 et 13), zoologie (UE 6), Objectifs généraux: A l’issu de ce cours l’étudiant en licence 3 de médecine devra être en mesure de : - Connaitre la classification, les caractéristiques des bactéries - Connaître la physiopathologie, - Décrire les modalités de diagnostic et de prise en charge des différentes pathologies dues à ces bactéries d’intérêt médical Objectifs spécifiques (ou compétences attendues) A la fin du cours ou de l’EC/UE, l’étudiante ou l’étudiant sera capable de connaître : les caractères morphologiques, biochimiques et culturaux des bactéries d’intérêt médical ; les maladies humaines associées à ces bactéries les modalités du diagnostic au laboratoire de ces bactéries les médicaments utilisés pour traiter les pathologies et le suivi de l’efficacité thérapeutique les mesures de prévention appliquées pour éviter ces pathologies Types d’enseignement Présentiel Travail individuel no …1…. (contrôle continu) Travail individuel no …1…. (contrôle continu) Modalités Examen de fin de session (contrôle terminal) d’évaluation 20% 20% 60% Séance 1 : Anatomie Bactérienne Contenu: 1-Introduction 2- Méthodes d’étude 3- Constituants bactériens 4- Spore bactérienne Objectifs 1- Expliquer les différentes méthodes d’étude des bactéries 2- Schématiser l’anatomie fonctionnelle de la bactérie 3-Décrire les différents constituants bactériens et leurs rôles respectifs 4- Comprendre les différences de composition entre la paroi des bactéries à Gram positif et celle des bactéries à Gram négatif Séance 2 : Physiologie et Croissance Bactériennes Contenu Contenu : 1- Introduction 2- Besoins nutritifs 3- Croissance bactérienne 4- Applications Objectifs 1- Définir la croissance bactérienne 2- Distinguer les besoins élémentaires des besoins spécifiques d’une bactérie 3-Citer les facteurs influençant la croissance bactérienne 4- Interpréter les différentes phases de la courbe de croissance bactérienne en milieu liquide Séance 3 : Génétique Bactérienne Contenu 1- Introduction 2- Information génétique 3- Mutations 4- Transferts génétiques Objectifs 1-Citer les différents types de variation B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07 Internet : http://www.ugb.sn génotypique 2-Décrire les caractères et les mécanismes des mutations 3-Expliquer les mécanismes des modalités des transferts génétiques Séance 4 : Relations Hôtes - Bactéries Contenu 1- Généralités 2- Facteurs de pathogénicité 3- Défenses de l’organisme 4- Applications Objectifs 1- Expliquer les types de relation entre bactéries et organisme humain 2- Décrire les facteurs de pathogénicité des bactéries 3- Expliquer la mise en œuvre du système de défense de l’organisme face aux bactéries Séance 5 : Antibiotiques et résistances Contenu 1-Définitions : Antibiotiques, antiseptiques et désinfectants 2- Classification des antibiotiques 3- Sites et modes d’action des antibiotiques 4- Antibiogramme 5- Résistances aux antibiotiques Objectifs 1-Définir un antibiotique, un antiseptique et un désinfectant 2- Connaître les bases de classification des antibiotiques 3- Classer les antibiotiques en familles 4- Citer mécanismes de résistances des bactéries 5- Expliquer le principe de l’antibiogramme Séance 6 Travaux dirigés Contenu Les thèmes précédents sous forme de QCM Objectif Préparer le support du TD Répondre aux questions posées Séance 7 : Cocci à Gram positif 1: Staphylocoques Contenu 1- Introduction 2- Taxonomie 3-S. aureus : Caractères morphologiques, culturaux, antigéniques et biochimiques 4- Epidémiologie de S. aureus B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07 Internet : http://www.ugb.sn 5- Pouvoir pathogène 6- Diagnostic au laboratoire 7- Bases du traitement Objectifs 1- Décrire la morphologie des staphylocoques 2- connaître l’espèce de Staphylocoque la plus pathogène 3- Décrire les caractères culturaux des staphylocoques 4- Connaître les principaux caractères biochimiques impliqués dans le diagnostic Séance 8 : Cocci à Gram positif 2: Streptocoques Contenu 1- Introduction 2- Taxonomie 3- Habitat 4-Caractères morphologiques, culturaux, antigéniques et biochimiques 5- Pouvoir pathogène 6- Diagnostic au laboratoire 7- Bases du traitement Objectifs 1-Citer les caractères de définition de la famille des Streptococcaceae 2-Citer les maladies liées aux streptocoques 3-Décrire les méthodes diagnostiques des streptococcies Séance 9 : Cocci à Gram négatif: Méningocoque et Gonocoque Contenu 1- Généralités 1-1-Définition 1-2- Intérêt de l’étude 2- Neisseria gonorrhoeae 3-Neisseria meningitidis Conclusion Objectifs 1- Citer les caractères généraux du genre Neisseria 2- Décrire les manifestations dues au gonocoque chez l’homme 3- Enumérer les étapes du diagnostic de la gonococcie 4- Enoncer les étapes du diagnostic de la méningite à Neisseria meningitidis Séance 10 : Travaux dirigés Contenu Les thèmes précédents sous forme de QCM Objectif Préparer le support du TD B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07 Internet : http://www.ugb.sn Répondre aux questions posées Séance 11: Bacilles à Gram négatif 1 : Entérobactéries (Escherichia, Salmonella, Shigella, Klebsiella, Enterobacter …) Contenu 1- Introduction 2- Classification 3- Epidémiologie 4- Caractères différentiels 5- Pouvoir pathogène 6- Escherichia coli 7- Genre Salmonella 8- Genre Shigella 9- Autres Entérobactéries Objectifs 1-Citer les caractères de définition des Entérobactéries 2-Expliquer le pouvoir pathogène des entérobactéries 3-Décrire la démarche diagnostique au laboratoire de chaque genre Séance 12: Bacilles à Gram négatif 2 : Vibrio cholerae Contenu 1- Introduction 2- Classification 3- Epidémiologie du choléra 4- Pouvoir pathogène 5-Diagnostic au laboratoire 6-Traitement du choléra Objectifs 1-Citer les caractères de définition de la famille des Vibrionaceae 2-Expliquer la physiopathologie du choléra 3-Décrire la démarche diagnostique au laboratoire 4- Connaitre les médicaments recommandés en première intention par l’OMS en cas de choléra Séance 13: Bacilles à Gram négatif 3 : Haemophilus influenzae b Contenu 1-Introduction 2- Taxonomie 3- Habitat – Epidémiologie 4- Caractères bactériologiques B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07 Internet : http://www.ugb.sn 5- Pouvoir pathogène de H. influenzae b 6- Diagnostic au laboratoire 7- Sensibilité aux antibiotiques Objectifs 1-Décrire les caractères bactériologiques de Haemophilus influenzae y compris les facteurs de croissance 2-Connaitre le pouvoir pathogène H. influenzae b 3-Expliquer le diagnostic au laboratoire 4-Connaître les antibiotiques à prescrire en traitement 1ère intention lors d’une méningite à H. influenzae b Séance 14: Bacilles à Gram négatif 4 : Pseudomonas Contenu 1-Introduction 2-Classification des Pseudomonas 3- Caractères de Pseudomonas aeruginosa 4-Infections dues à P. aeruginosa 5-Molécules actives sur P. aeruginosa Objectifs 1-Décrire les caractères de définition de la famille des Pseudomonadaceae 2-Citer les infections dues à P. aeruginosa 3-Décrire les étapes du diagnostic au laboratoire 4-Lister les antibiotiques actifs contre P. aeruginosa Séance 14: Bacilles à Gram positif 1: Listeria monocytogenes Contenu 1-Introduction : Définition et intérêt de la question 2-Taxonomie 3-Caractères bactériologiques de L. monocytogenes 4-Epidémiologie de la listériose 5-Pouvoir pathogène de L. monocytogenes 6-Diagnostic bactériologique 7-Eléments thérapeutiques Objectifs 1-Décrire les caractères morphologiques de L. monocytogenes 2-Citer les manifestations cliniques de la listériose chez le nouveau-né 3-Décrire les étapes du diagnostic d’une listériose 4-Connaitre les molécules à prescrire et les modalités de prévention Séance 15: Bacilles à Gram positif 2 : Bacillus anthracis Contenu Objectifs Séance 16: Bacilles à Gram positif 3 : Clostridium tetani Contenu Objectifs Séance 6 Travaux dirigés B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07 Internet : http://www.ugb.sn Contenu Les thèmes précédents sous forme de QCM Objectif Préparer le support du TD Répondre aux questions posées Séance 17: Bactéries particulières 1: Mycobacterium tuberculosis Contenu Objectifs 1. Connaître les caractères bactériologiques des Mycobactéries 3- Décrire l’épidémiologie des mycobactéries tuberculeuses 4- Décrire la physiopathologie de la tuberculose pulmonaire 5-Préciser les modalités de recueil des échantillons de produits pathologiques 6- Connaître les médicaments antituberculeux et les modalités de la prise en charge des patients Bibliographie 1-REMIC : référentiel de microbiologie, Edition 2011 2-Denis F., Ploy M. C., Martin C., Bingen E., Quentin R.: Bactériologie médicale : Techniques usuelles, Masson. 2007; 467-493 3-Bactériologie médicale : Techniques usuelles B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07 Internet : http://www.ugb.sn