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TP2
II- Phylogenèse
- Place de l’Homme dans le règne animal DONNEES MOLECULAIRES
C : relations de parenté entre l’Homme et les autres Primates
M : -- utilisation de données moléculaires fournies par le logiciel « Phylogène »
Objectifs
Le logiciel « phylogène » permet de comparer les molécules homologues de plusieurs Primates.
Ces molécules jouent le même rôle et auraient pour origine une même molécule ancestrale possédée par un
ancêtre commun hypothétique. La notion de caractère dérivé (méthode cladistique) n’est pas applicable ici.
La méthode est basée sur le nombre de différences d’acides aminés indiquant le degré de ressemblance
(méthode phénétique).
Il est intéressant de comparer les résultats donnés par ces deux méthodes.
1. Accès aux tableaux de données
Démarrer \ Tous les programmes \ SVT \ cliquer sur l’icône « démarrage de phylogène » puis
Fichier>>ouvrir>>Tableau de molécules>>Parenté entre organismes>>Primates>>ouvrir>>choisir une
molécule>>ouvrir
2. Présentation des données
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Chaque acide aminé est symbolisé par une lettre (nomenclature internationale) : Q pour Gln, E pour
Glu, …
Le rang de chaque acide aminé dans la protéine est indiqué en première ligne.
Les acides aminés qui diffèrent par rapport à l’espèce « référence » (1ère ligne) sont en noir.
3. Activités proposées
1.
Comparez les cytochromes C oxydase de l’Homme, du Gorille et du
Chimpanzé. (Pour cela désactiver toutes les autres espèces en les affichant en bleu).
Cliquez sur matrice puis sur arbre.
2. a) Sélectionnez les espèces : Homme, Chimpanzé, Gorille.
b) Comparez les arbres obtenus avec chaque molécule par cette méthode
(phénétique) à celui obtenu par la méthode cladistique (cours 3.1.b) .
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