Ipst Cnam

CNAM
BLG 107 –MICROBIOLOGIE MOLECULAIRE-
Jeudi 19 Février -18h à 21h- Salle P12 Bât 4TP4
-Cours : La nouvelle taxonomie bactérienne
-Rappels théoriques sur les différentes techniques utilisées.
-Présentation des TP.
Jeudi 05 Mars -18h à 22h- Salle physio A
(Bioinfo)
-Identification bactérienne à l’aide de la séquence 16S
 Recherche des séquences 16S dans les différentes bases de
données notamment au NCBI et RDP
 Utilisation de la RDP et de leBiBi pour identifier une espèce
d’après la séquence.
Utilisation du package Greengenes
-Analyse de l’ADN 16S de Lactococcus lactis par profils de restriction.
-Conception de la manip
 Récupération des séquences 16S à partir de la RDP.
 Design de primers pour la PCR
 Traitement de ces séquences par Clone Manager afin
identifier les différents profils de restriction.
Samedi 21 Mars -9h à 18h- Salle P14 Bat4TP4
-Induction de phages chez une bactérie lysogène
-Recherche de bactéries produisant des bactériocines (1)
-Extraction d’ADN génomique à partir de lait contaminé
-Champs pulsés (1)
Samedi 28 Mars -9h à 18h- Salle P14 Bat4TP4
-Recherche de bactéries produisant des bactériocines (2)
–Champs pulsés (2)
-ARDRA(1)
-qPCR
-Mutiplex PCR en point final
Samedi 04 Avril -9h à 18h- Salle P14 Bat4TP4
-suite et fin des champs pulsés
-suite et fin ARDRA
-analyse qPCR et multiplex PCR en point final
-lecture des bactériocines
Jeudi 2 Avril -18h à 21h- Salle physio A
(Bioinfo)
-Construction théorique d’une puce pour la détection de microorganismes :
Design de sondes 16S et rpoB en utilisant les logiciels MEGA4,
OligoCalc, Primer3 et Primrose( ?)
Jeudi 23 Avril -18h à 22h- Salle physio A
(Bioinfo)
-Bilan et analyse des TP
Exam final : Jeudi 30 Avril de 18h à 20h salle P14
Contrôle Continu : compte-rendu de TP (oral)