IDENTIFICATION OF NEW URINE BIOMARKERS FOR THE DETECTION OF PROSTATE CANCER

IDENTIFICATION OF NEW URINE BIOMARKERS
FOR THE DETECTION OF PROSTATE CANCER
PhD thesis presented by
Marina Rigau Resina
To obtain the degree of
PhD for the UAB
PhD thesis done in the Research Unit in Biomedicine and Translational and Pediatrics
Oncology Department in the Vall Hebron Research Institute, under the supervision of
Drs.
Jaume Reventós i Puigjaner, Andreas Doll and Joan Morote Robles
Universitat Autònoma de Barcelona, Faculty of Bioscience, Department of Biochemistry,
Molecular Biology in the Faculty of Bioscience in the UAB, under the supervision of
Dr. Jaume Farrés
Universitat Autònoma de Barcelona, June 2011
Dr. Jaume Reventós Dr. Andreas Doll Dr. Joan Morote
Marina Rigau Resina

This thesis has been supported by the grant “Beca Eduardo Gallego para Jóvenes
Licenciados” (2008) from “Fundación Francisco Cobos” and the grant “Talent Empresa” from
“Generalitat de Catalunya-AGAUR” (2009-TEM 00066; TransBioMed).
Moreover this work was supported in part for the European Molecular and Biology
Organization (EMBO) with a “Short Term Fellowship (ASTF 140-2010)”, a grant for a short
stage fellowship from “Ministerio de Ciencia e Inovación (RTICC) and a grant for “AM2c
Mobility of Researchers” from “Fundation National de la Research” (FNR) in Luxembourg,
(FNR/10/AM2c/2g).
Finally the grant support for the projects presented; “Red de Genómica del Cáncer y
Genotipado de tumors “ (Grant number: C03/10), “Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de
Ciéncia e Inovación” (RTICC RD06/0020/0058), “Fundación para la Investigación en Urología -
FIU” (2007-FIU), “Recerca i Societat de la Informació de la Generalitat de Catalunya; Grant
number SGR00487” and finally, a grant from AGAUR; Generalitat de Catalunya (Valor 00220).

En realitat tot i que sé, que aquest apartat no és un requisit indispensable, a diferència de
l’infinit nombre d’obstacles de superar per poder dipositar una tesi, és poster la part més
important com a científic i com a persona. Crec que és necessari plasmar d’alguna manera
que el treball que aquí es presenta no hauria sigut possible dur-lo a terme si no hi haguessin
hagut un munt de persones al darrera.
En primer lloc vull mostrar la meva gratitut als meus directors de tesi, el Dr. Jaume Reventós,
el Dr. Andreas Doll i el Dr. Joan Morote, per brindar-me l’oportunitat de realiztar aquest treball,
per confiar en les meves possibilitats i per voler introduir-me en el món de la recerca i en un
món “paral.lel”, una mica complicat a l’inici (TransBioMed), però que per a mi representa un
repte important.
Alhora vull agraïr el support dels clinics del servei d’urologia l´Hospital de la Vall d’Hebrón, així
com també agraïr als patòlegs, als auxiliars de quiròfan i a les enfermes de les consultes
externes. Tots plegats han fet possible el contacte amb els pacients. De la mateixa manera,
vull mostrar el meu agraïment més sincer a tots els pacients que han volgut contribuir amb
una “granet de sorra” a que tot aquest treball s’hagi pogut tirar endevant.
Agraeixo d’una forma molt carinyosa la càlida acollida al Laboratori de Proteòmica, sota la
direcció del Dr. Francesc Canals, que amb l’ajut de les “floretes de proteòmica” i en especial a
la Núria Colomé, han fet que em senti una “més” del seu laboratori, així com la seva dedicació
cap a al meu projecte.
Agraeixo també al departament d’estadística de l’Institut, a l’Israel i a l’Àlex Sànchez, per el
seu ajut incondicional en tots els anàlisis estadístics, i sobretot per la seva llarga paciència.
Així com també, agraeixo a la Paqui, la MºÁngeles i al Ricardo, per el seu suport tècnic en
gran part dels experiments aquí presentats.
De la mateixa manera agraeïxo l’acollida, durant la meva estada al “Clinical Proteomics
Laboratory” de Luxembourg, per part del Dr. Bruno Domon i la Dr. Elodie Duriez, així com tots
els altres integrants del grup. Aquesta estada ha estat clau per a la elaboració de gran part
dels resultats que es presenten en aquesta tesi i alhora ha sigut una experiència plena de
nous coneixements, així com una etapa personal important.
Agraeixo al Dr. Lennart Martens i al Dr. Sven Degroeve del grup “Computational Omics and
Systems Biology” del “Department of Medical Protein Research” a la Universitat de Ghent
(Bèlgica), els quals estan col.laborant en l’anàlisi estadístic de part dels resultats que aquí es
presenten.