diagnostic ecologique

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Estelle URIEN et Morgan TRIQUENEAUX
12/02/2016
Master 1 Gestion et Conservation de la Biodiversité
Evaluation de la
qualité de l’eau de
la rivière du Kerrus
Basé sur l’étude des populations piscicoles et des macro-invertébrés

TABLE DES MATIERES
Introduction ............................................................................................................................................. 1
Matériel et méthode ............................................................................................................................... 3
1. Site ............................................................................................................................................... 3
2. Etude du milieu aquatique à travers son peuplement et ses populations de poissons.............. 4
A. Pêche électrique ...................................................................................................................... 4
B. Scalimétrie ............................................................................................................................... 6
C. Analyse des cohortes par le modèle de Bhattacharya ............................................................ 7
D. Analyses statistiques ............................................................................................................... 7
E. Différents indices ..................................................................................................................... 8
F. Indice Poissons Rivière (IPR) .................................................................................................... 9
3. Etude du milieu aquatique à travers son peuplement de macro-invertébrés .......................... 10
A. Indice Biologique Global Normalisé (IBGN) ........................................................................... 10
B. Coefficient d’Aptitude Biogène (Cb2) .................................................................................... 11
C. Indice habitat « m » ............................................................................................................... 12
Résultats ................................................................................................................................................ 13
1. Pêche électrique ........................................................................................................................ 13
A. Nombre d’individu échantillonné sur la rivière du Kerrus .................................................... 13
B. Identification des différentes cohortes avec les individus capturés du Kerrus..................... 14
C. Répartition des espèces selon l’habitat ................................................................................ 15
D. Indice Poisson Rivière (IPR) ................................................................................................... 19
2. Les indices .................................................................................................................................. 19
A. Indice Biologique Global Normalisé (IBGN) ........................................................................... 19
B. Coefficient d’Aptitude Biogène (Cb2) et indice d’habitat « m » ........................................... 19
C. Indices de Shannon Weaver et d’équitabilité J de Pielou ..................................................... 20
D. Indice de Simpson ................................................................................................................. 20
E. Indice de Hill .......................................................................................................................... 20
3. Tests physico-chimiques ............................................................................................................ 21
Discussion .............................................................................................................................................. 22
Bibliographie.......................................................................................................................................... 27
Annexes ................................................................................................................................................. 29

Figure 1 : Carte des bassins versants de Bretagne .................................................................................. 1
Figure 2 : Bassin versant de l'Horn avec en rouge l'affluent du Kerrus................................................... 2
Figure 3 : Schéma de la zone d'échantillonage (couple substrat/vitesse) .............................................. 3
Figure 4 : Zone de prélèvement et de mesure des écailles pour la scalimétrie ...................................... 5
Figure 5 : Principe de la scalimétrie ........................................................................................................ 6
Figure 6 : Tableau des classe de qualité définies en fonction de la note de l'ipr .................................... 9
Figure 7 : Classes de qualités en fonction de la note ibgn .................................................................... 11
Figure 8 : Proportions des espèces présentes sur le site ...................................................................... 13
Figure 9 : Fréquence des truites en fonction de la taille ....................................................................... 14
Figure 10 : Analyse en Composantes Principales pour les differents peuplements ............................. 17
Figure 11 : Analyse en Composantes Principales pour Salmu trutta .................................................... 18
Figure 12 : Tableau des classes en fonction des notes IBGN ................................................................ 19
Figure 13 : Différentes classes d'habitabilité en fonction de la note .................................................... 20
Figure 14 : Cycle biologique de la Truitte .............................................................................................. 23
Figure 15 : Nitrates dans les eaux brutes au point de prélèvement en 2007 ....................................... 26
Tableau 1 : Nombre d'individu échantilloné sur le Kerrus .................................................................... 13
Tableau 2 : Résultat de l'IPR du Kerrus .................................................................................................. 19
Tableau 3 : Données physicochimiques ................................................................................................ 21
Annexe 1 : Liste des 138 taxons utilisés dans le protocole de l'IBGN ................................................... 29
Annexe 2 : Valeur de la note selon les taxons de macroinvertébré benthique .................................... 30
Annexe 3 : Grille de calcul de l'indice habitat "m" ................................................................................ 30
Annexe 4 : Fiche du Coefficient d'Aptitude Biogène ............................................................................. 32
Annexe 5 : Système d'Evaluation de la Qualité de l'Eau ....................................................................... 34

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INTRODUCTION
La Bretagne possède un réseau hydrographique important favorisé par un fort ruissellement
d’eau de surface. Ce réseau s’étend sur 30 000km et se découpe en 50 bassins versants dont 5 d’entre
eux occupent 55% du territoire breton (bretagne-environnement.org, 2007). Le bassin versant de
l’Horn correspond aux bassins hydrographiques de l’Horn, du Kerralé, du Guillec et des ruisseaux
côtiers compris entre Roscoff et l’anse de Goulven (Figure 1).
FIGURE 1 : CARTE DES BASSINS VERSANTS DE BRETAGNE
L’Horn, d’une longueur de 29,9 km prend sa source dans la commune de Plouvorn à une
altitude de 119 mètres et se jette dans la Manche à quelques kilomètres du Guillec, près de la forêt
domaniale de Santec (Gralon, 2016 ; Eau Loire Bretagne 2015). Trois sites Natura 2000 sont présents
dans ce bassin versant formant ainsi un habitat favorable à la présence de différentes espèces
piscicoles telles que Salmo trutta, Phoxinus phoxinus ou Platichthys flesus.
Les Salmonidés présents dans ce bassin, comme le Saumon d’Atlantique, sont des espèces
migratrices effectuant une partie de leur cycle biologique dans les rivières et l’autre partie dans les
milieux marins. Les adultes possèdent un mécanisme d’orientation appelé « homing » leur permettant

de retourner dans leur rivière d’origine pour se reproduire dans des habitats tels que les radiers ou les
rapides. La ponte s’y effectue entre novembre et janvier et le développement des juvéniles dès la mi-
mars (FEDE Pêche 29, 2014).
Le Saumon Atlantique est vulnérable face aux nombreuses menaces, surtout
anthropiques (pollutions, barrage, …). Ces perturbations réduisent la reproduction dans les eaux
douces et impact l’ensemble des populations, y compris celles en mer. Cette espèce, d’intérêt
halieutique et patrimonial, semble importante à conserver en préservant leurs habitats des
dégradations. Afin de restaurer les cours d’eau du bassin de l’Horn, le syndicat mixte de production et
de transport d’eau a mis en place un programme d’envergure dans le cadre d’un contrat de
restauration et d’entretien des rivières. Le syndicat a remplacé, aménagé, voir supprimé une
cinquantaine d’ouvrages, seuils de moulins et barrages pouvant être infranchissable pour la faune
piscicole.
Le Kerrus est une rivière d’ordre 2 du bassin versant de l’Horn au niveau de l’affluant du Kerrus
à proximité du lieu-dit de Kermoguéné près de Plounévez-Lochrist (Figure 2).
FIGURE 2 : BASSIN VERSANT DE L'HORN AVEC EN ROUGE L'AFFLUENT DU KERRUS
Dans l’objectif de s’interroger sur l’aptitude de cette rivière à accueillir ces différents
peuplements, un diagnostic environnement de la rivière du Kerrus est établi à partir de la structure
des populations, de l’abondance des macro-invertébrés et des paramètres physico-chimiques.