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Resumo
O câncer de pulmão é a neoplasia maligna mais insidiosa da oncologia, sendo
responsável pelo maior número de mortes relacionadas a câncer no mundo. Este
câncer pode ser dividido em dois tipos: câncer de pulmão de células pequenas e
câncer de pulmão de não-pequenas células (CPNPC). A maioria dos tratamentos de
primeira linha atuais baseia-se em agentes alquilantes derivados de platina, como a
cisplatina e a carboplatina, utilizados sozinhos ou em conjunto com outras drogas
antineoplásicas. A ação antitumoral dos derivados de platina ocorre basicamente em
nível de DNA, provocando a formação ligações cruzadas principalmente intra-fitas.
Independentemente do regime utilizado, entretanto, é inevitável o surgimento de
resistência e, por ser o padrão ouro da terapêutica, a resistência a derivados de platina
é um fator importante no desenrolar do tratamento. Três são os principais
mecanismos descritos de resistência a esses compostos: aumento do efluxo, da
inativação intracelular da droga e aumento da taxa de reparo do DNA. Além disso,
outro mecanismo proposto é o aumento da expressão de carreadores da membrana
nuclear, que auxiliariam na entrada de proteínas de reparo. Trabalhos anteriores de
nosso grupo identificaram a proteína cofilina-1 como um possível biomarcador
candidato para CPNPC e esses trabalhos também demonstraram uma possível
relação entre os níveis de expressão da proteína cofilina-1 e resistência a agentes
alquilantes, onde células que possuem alta expressão (e imunoconteúdo) da proteína
possuem uma maior resistência a esses agentes quimioterápicos. Por esse motivo, o
objetivo deste trabalho é avaliar a rede de interação gênica da cofilina-1 com relação
aos principais mecanismos de resistência descritos pela literatura em um modelo in
silico utilizando dados de expressão gênica de microarranjos. Para isso, dados de
microarranjo de modelos celulares e biópsias foram extraídos do repositório público
Gene Expression Omnibus (GEO) e analisados no software ViaComplex. Esse
programa utiliza-se de redes de interação geradas na ferramenta Search Tool for the
Retrieval of Interacting Genes/Proteins (STRING) e do dado obtido a partir do
microarranjo para avaliar o padrão de expressão de grupos de genes. Além do
ViaComplex, também realizamos análises de correlação para investigar a relação de
nossos genes de interesse com o processo de resistência à droga. Nossos resultados
mostram que o grupo de genes relacionados à cofilina-1 comporta-se similarmente ao
grupo de genes relacionados ao reparo por NER na maioria das análises realizadas.
Ainda, nossas análises sugerem que o padrão de expressão dos genes das redes varia