Spécialité BIOLOGIE VEGETALE INTEGRATIVE Gène
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Année Universitaire 2016-2017 Sciences, Technologies et Santé Mention Biologie et Technologie du Végétal MASTER 2 Spécialité BIOLOGIE VEGETALE INTEGRATIVE Gène-Plante-Agrosystème (BioVIGPA) Master 2 2 Boulevard Lavoisier - 49045 ANGERS Cedex 01 02.41.73.53.53 – : 02.41.73.53.52 www.biovigpa.fr LES INDICATIONS CONTENUES DANS LA BROCHURE SONT A TITRE INDICATIF. Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 2 Directeur de l’UFR Sciences : P. LERICHE Assesseur à la pédagogie : S. TRAVIER Assesseur à la recherche : F. SA UBION Responsable pédagogique : Professeur P. SIMONEAU : 02 41 22 56 00 : [email protected] Président de jury : P. SIMONEAU Responsable administratif : Michel VERON Responsable du service Masters : B. BICHET : 02 41 73 54.96 : [email protected] Secrétariat scolarité et examens de la formation : S. HERGUAIS : 02 41 73 54.85 : [email protected] ACCUEIL DES ETUDIANTS SCOLARITE Du lundi au vendredi De 9 H 00 à 12 H 30 ET de 13 H 30 à 17 H 00 EXAMENS Fermé le mercredi après-midi Rez de chaussée du bâtiment A Bureau A004 Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 3 CALENDRIER UNIVERSITAIRE 2016-2017 Pour l’année 2016-2017 les enseignements du 1er semestre seront dispensés sur le site de l’Université d’Angers 1er Semestre Début des cours Présentation de l’offre de stage Retour des fiches de vœux définitif pour les modules optionnels Campus Day Vacances de Toussaint Forum du végétal Vacances de Noël Fin des cours Restitution des projets individuels de recherche Révisions Examens écrits 1er semestre 1re session Jury 1er semestre 1re session 5 septembre à 10h 8 septembre 9 septembre Le jeudi 22 septembre à partir de 10h30 27 octobre 2016 – 2 novembre 2016 Jeudi 17 novembre 2016 17 décembre 2016 – 2 janvier 2017 6 décembre 5 décembre 6 décembre -11 décembre 12 - 16 décembre 06 février 2017 2e Semestre Début du stage Fin du stage Examens 1e semestre 2ème session Jury 1er semestre 2e session Soutenance de mémoire Jury 2e semestre 1re session 3 janvier 2017 16 juin 2017 15-19 mai 2017 23 juin 2017 22-23 juin 2017 23 juin 2017 Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 4 Master 2 - Semestre 1 PROGRAMME Unités d’enseignement Matières (Intitulé des enseignements) Durée totale/étudiant CM TD 20 20 60 20 5 57 15 TRONC COMMUN S3M-BioVIGPA-01 S3M-BioVIGPA-02 Partie Projet Professionnel Personnalisé Partie Acquisition de la démarche scientifique Niveaux d’organisation : du gène à l’agrosystème 3 Modélisation appliquée à la biologie végétale 20 11 9 PARCOURS DISCIPLINAIRES (4 modules au choix dont 3 dans un même parcours / le choix des modules par l’étudiant sera validé par la commission pédagogique): PARCOURS GENETIQUE ET GENOMIQUE S3M-BioVIGPA-04 Génétique évolutive et diversité 20 10 10 S3M-BioVIGPA-05 Génétique quantitative 20 11 9 S3M-BioVIGPA-06 Génomique fonctionnelle et structural 20 15 5 PARCOURS PATHOLOGIE ET INTERACTIONS S3M-BioVIGPA-07 Interactions : les réponses de la plante 20 9 11 S3M-BioVIGPA-08 Déterminisme du pouvoir pathogène 20 18 2 S3M-BioVIGPA-09 Biodiversité - épidémiologie 20 8 12 PARCOURS PHYSIOLOGIE ET METABOLISME S3M-BioVIGPA-10 Métabolisme et bioproduits 20 20 S3M-BioVIGPA-11 Développement des plantes 20 12 8 S3M-BioVIGPA-12 Réponses aux contraintes abiotiques 20 12, 7,5 5 PARCOURS ECOPHYSIOOGIE S3M-BioVIGPA-13 Fonctionnement du végétal dans son milieu 20 20 S3M-BioVIGPA-03 S3M-BioVIGPA-14 Plantes virtuelles S3M-BioVIGPA-15 Application de l’écophysiologie à la gestion du peuplement Total 1er semestre 20 12 8 20 18 2 200 Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 5 CONTROLE DES CONNAISSANCES Unités d’enseignement et matières (intitulés des enseignements) CC S3M-BioVIGPA-01 1 S3M-BioVIGPA-02 0 S3M-BioVIGPA-03 1 S3M-BioVIGPA-04 à 15 0 Nature des épreuves Assidus 1e session Nature des épreuves (dispensés d’assiduité) 1e session Mémoire + Mémoire + Mémoire + Oral Oral Oral Ecrit (4h) Ecrit (4h) Ecrit (4h) ou Oral 9 Oral Ecrits 2h par UE Oral Ecrits 2h par UE Oral Ecrits (2h par UE) ou Oral 3 Nature des épreuves ECTS 2e session TOTAL 6 3 (x4) 30 ECTS Master 2 - Semestre 2 PROGRAMME Matières (Intitulé des enseignements) Unités d’enseignement S4M-BioVIGPA-01 Conduite d’un projet de recherche (Stage en laboratoire) Durée totale/étudiant CM TD 5,5 mois CONTROLE DES CONNAISSANCES Unités d’enseignement et matières (intitulés des enseignements) S3M-BioVIGPA-01 CC Nature des épreuves Assidus 1e session Nature des épreuves (dispensés d’assiduité) 1e session Mémoire + Mémoire + Mémoire + Soutenance orale Soutenance orale Soutenance orale Nature des épreuves ECTS 2e session TOTAL Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 30 30 ECTS 6 Programme des enseignements. UE S3M-BioVIGPA-01 – Partie Projet Professionnel Personnalisé Nom des responsables : Alain Bouchereau, Philippe Simoneau Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire : Présenter au travers de conférences ciblées le contexte général, sur les plans scientifique et socioéconomique, dans lequel s’inscrit la formation (le végétal comme objet de recherche et de valorisation, productions végétales et développement durable). Présenter les dispositifs de recherche sur le végétal et la place du chercheur dans ces dispositifs dans le contexte national et international. Présenter le panorama des structures de recherche régionales sur lesquelles s’adosse la formation. Prendre connaissance et faciliter la définition du projet professionnel des étudiants. Amorcer la réflexion individuelle et collective sur l’insertion professionnelle Contenu de l’enseignement – 20h - Présentation de la formation BiOViGPA (A. Bouchereau, P. Simoneau) - Conférences d’ouverture contexte et enjeux : le végétal comme objet de recherche et de valorisation, production végétale et développement durable (conférencier invité) - Voyage d’intégration : - Présentation des dispositifs et des structures de recherches (responsable du site d’accueil) - Les Ecoles doctorales (directeur école doctorale du site d’accueil) - Visites et exposés - Informations sur les techniques de recherche d’emploi (SUIO) - Forum des Stages - Présentations par les étudiants de leur projet professionnel et mise en route de la réflexion sur l’élaboration d’un projet individuel de recherche (Comité de pilotage) UE S3M – BioVIGPA- 01 Partie Acquisition de la demarche scientifique Responsables : Alain Bouchereau, Philippe Simoneau Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire : Acquérir la démarche scientifique par l’élaboration d’un projet de recherche 1 : A travers le sujet sélectionné, l’étudiant devra identifier clairement une question de recherche. 2 : En s’appuyant sur des recherches bibliographiques, il devra positionner le sujet dans un contexte scientifique et socio- économique plus large. 3 : L’étudiant devra définir les stratégies et les moyens à mettre en œuvre pour mener à bien le projet de recherche répondant aux questions de recherche identifiées. 4 : Le module sera évalué sur la base d’un rapport écrit et d’une soutenance Contenu de l’enseignement – 15h TD – Conférence / 5h CM 1) Apprentissage de la réflexion scientifique à travers l’analyse critique d’un article (identification de la question de recherche et des enjeux ; stratégies et méthodes mises en œuvre par les auteurs). (F.Val, F. Hamelin Agrocampus-Rennes) 2) Acquisition des règles de rédaction scientifique (construction de documents scientifiques : rapport, article, résumé, poster…). (F.Val, F Hamelin Agrocampus-Rennes) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 7 3) Présentation de la démarche expérimentale et des outils statistiques associés à travers un exemple 4) La démarche qualité et les Bonnes Pratiques de Laboratoire. (conférencier invité) 5) Propriété intellectuelle et protection du vivant (INPI) UE S3M – BioVIGPA – 02 Niveaux d’organisation du gène à l’agrosystème /Section « Transport et signalisation » Responsable : Rémi Lemoine Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire Aborder le développement intégré des plantes à travers l’acquisition de l’eau et de l’azote, les échanges inter-organes des molécules carbonées et azotées, et des molécules signal (sucres/nitrates, hormones, protéines, nucléotides…). Décrire ces phénomènes aux niveaux moléculaire et cellulaire et leur intégration au niveau de la plante entière, aborder leur rôle dans la productivité. Cet enseignement repose sur les notions d’organe source et puits, de répartition des assimilats et de leur remobilisation au cours de différentes phases du développement, de signalisation à distance à travers une grande variété de molécules. L’aspect intégratif sera traité, en lien avec les autres parties de l’UE2, sur la problématique azote à travers des exemples correspondant à cette problématique dans chacun des domaines abordés (absorption, assimilation, transport, signalisation, régulation..) Contenu de l’enseignement – 20h CM Introduction sur les voies de transport (échanges) inter organes (1h, R. Lemoine) Fonctionnement des tissus conducteurs, mécanismes de transport à longue distance. Mécanismes moléculaires du transport des assimilats carbonés et azotés (3h , R. Lemoine) Rappel sur l’assimilation carbonée et azotée; étude des mécanismes de transport inter-cellulaire (transporteurs de sucres et d’acides aminés) point de départ de leur transport à longue distance. Flux de l’eau dans la plante (3 h ; JL Durand) Le mouvement de l’eau et des sèves comme déterminant des échanges inter organes. Mécanismes d’acquisition des substances minérales (3h. A déterminer). Comment les plantes acquièrent les principales substances minérales (N, P et K) et comment elles sont transportées à l’intérieur de la plante. Transport des assimilats carbonés et azotés intégré au niveau de la plante (2h, Nathalie Noiraud-Romy). Etablir le lien entre les connaissances au niveau moléculaire et les interactions C/N au niveau de la plante. Remobilisation des assimilats au cours de la sénescence (2h, Nathalie Pourtau) Comment les molécules carbonées et azotées stockées sont réutilisées en fonction des besoins de la plante. Signalisation métabolique et hormonale à longue distance (2h, Rossitza Atanassova). L’accent sera mis sur les interactions entre les 2 types de voies de signalisation. -Régulation épigénétique à courte et longue distance (3h, Rossitza Atanassova). Inactivation trancriptionnelle (TGS) post transcriptionnelle (PTGS) et importance pour le développement intégré des organes. Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 8 UE S3M – BioVIGPA – 02 Niveaux d’organisation du gène à l’agrosystème /Section « Qualité des produits et valeur d’usage» Responsable : Fabienne Guillon Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire : Développement de connaissance sur structure et fonctionnalité des biopolymères végétaux: -Aborder les structures des biopolymères aux différentes échelles d’organisation -Illustrer les relations entre ces structures et les propriétés d’usage de la matière végétale -Illustrer à travers quelques exemples les approches de génétique quantitative et de génomique fonctionnelle mises en œuvre pour maîtriser la qualité des matières premières Contenu de l’enseignement – 20h CM Introduction du module « Qualité des produits et valeurs d'Usage » (30 min, Fabienne Guillon) Parois cellulaires (6h30) Structure-Organisation-Fonctions biologiques (Fabienne Guillon : 1h30) Valeurs d'Usage (5h00) Pectines et Fruits charnus (Estelle Bonnin) et Hemicelluloses et Céréales ( Luc Saulnier ) : 2h30 Lignines : qualité du bois (Gille Pilate) et Génomique fonctionnelle de la formation du bois de tension (Jean-Charles Leplé) : 2h30 Les protéines de réserve des grains-graines (2h, Didier Marion) Rôle, différents types (globulines, prolamines), polymorphisme, séquence primaire et informations structurales importantes pour la compréhension de l'assemblage Les niveaux d'organisation des assemblages de protéines de réserve à différentes échelles, notamment moléculaire (interactions entre protéines) et supramoléculaire (ultrastructure des corpuscules protéiques) La relation entre assemblage et qualité des graines : 'influence de l'état de polymérisation des prolamines du blé sur les propriétés fonctionnelles du gluten. Cutine et subérine (1h, Bénédicte Bakan) Structure, biosynthèse, fonctions biologiques et technologiques L’amidon (2h, Véronique Planchot) Structure (les différentes échelles d'assemblage: des molécules au grain d'amidon) Relation structure -propriétés fonctionnelles Les polyphénols et tannins : (2h, Sylvain Guyot) Structure-propriétés des polyphénols Rôles des polyphénols (procyanidols) dans les phénomènes physico-chimiques et biologiques conduisant à l'élaboration du cidre Les lipides (2h Didier Marion) Structure-fonctions biologiques et technologiques Maitrise de la qualité du végétal Les Stratégies pour maîtriser la qualité des fruits charnus : agronomie, génétique quantitativegénomique fonctionnelle ( 3h Marc Lahaye et coll) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 9 UE S3M-BioVIGPA-02 - Niveaux d’organisation du gène à l’agrosystème /Section «Bases scientifiques et techniques de la gestion durable des éco et agrosystèmes » Responsable : Philippe Leterme Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire L'objectif général de l'UE2 est de montrer que l'étude des processus et phénomènes biologiques constituant les sciences du végétal peuvent êtres abordés à différents niveaux d'organisation et d'échelle, depuis le gène jusqu'à l'agrosystème. Dans le cadre de la partie UE2.3, les objectifs pédagogiques spécifiques seront : -identifier les concepts communs et spécifiques des approches utilisées en écologie et agronomie -montrer l’intérêt de ces approches pour traiter les problématiques actuelles liées à l’agriculture, l’environnement et aux changements globaux (diagnostic, gestion) -faire prendre conscience qu’il est nécessaire de gérer et coordonner des échelles de temps et d’espace différentes Contenu de l’enseignement – 20h CM Concepts d’agrosystème et d'écosystème (1h) (Leterme, Lecoeur) 1. Le continuum sol-plante-atmosphère (4h) Fonctions écosystémiques des sols et interactions avec les peuplements végétaux (Ménasseri) Interactions entre peuplements (naturels et cultivés) et atmosphère (Frak) 2. Gestion des agrosystèmes (6h) Concepts, outils et méthodes de gestion des agrosystèmes (Leterme) Agroécologie et voies d'évolution de l'agriculture (Leterme) Exemple de gestion agronomique territoriale : la gestion des résistances variétales (Pinochet) 3. Gestion des écosystèmes (6h) Concepts, outils et méthodes de gestion des écosystèmes (Lecoeur) Biodiversité générale et biodiversité fonctionnelle (Lecoeur) Le rôle de l’agriculture dans la gestion du paysage et de sa biodiversité (Thenail) 4. Durabilité (2h) Définition et évaluation de la durabilité (Leterme) UE S3M-BioVIGPA-03: Modélisation appliquée à la biologie végétale Responsables : M Plantegenest, Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire Comprendre l’utilisation de la modélisation comme outil de formalisation et synthèse de connaissances Etre capable de comprendre les principes de la modélisation, de comprendre des démarches de modélisation appliquées à différents domaines de la biologie et leur intérêt. En donnant différents exemples de modèles appliqués à la biologie végétale, illustrer les principes de base de construction, test et validation, interprétation de résultats de simulations. Contenu de l’enseignement – 9h TD-conférence / 11h CM 1- Objectifs de la modélisation, typologie de modèles et grands types d’utilisation (2h) N Colbach, INRA Dijon 2- Introduction aux méthodes et outils de modélisation (9h) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 10 2 TD - Ajustements sur jeux de données expérimentales, calculs de paramètres et de valeurs statistiques (Rennes, M. Plantegenest) 4h - Prise en main d’un modèle simple et réalisations de simulations (Rennes et Angers, M. Plantegenest et N Sapoukhina) 5h 3- Différentes exemples de modélisation en biologie végétale (9 h) - Modélisation de l’échelle moléculaire à l’échelle supramoléculaire appliqué aux biopolymères et à leurs assemblages, V. Hugouvieux, Nantes 3h - Modélisation à l’échelle de la plante : modèle de développement d’une feuille (prairies, grandes cultures) A. Escobar, Lusignan 3h - Modèles d’aide aux décisions techniques à l’échelle d’un agrosystème (parcelle ou serre, système de cultures, bassin versant ou hydrologique). Exemples : développement de la tavelure du pommier Angers N. Sapoukhina, ou analyse et prévision de la pollution des eaux par les nitrates Rennes P. Leterme 3h. 3 conférences sur les 5 seront proposées aux étudiants chaque année UE S3M-BioVIGPA-04/ Parcours Disciplinaire Génétique et Génomique / Génétique évolutive et diversité Responsable : M. Manzanares-Dauleux Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire Permettre aux étudiants d'acquérir et d'intégrer les concepts de génétique évolutive, génétique des populations et génétique d’association permettant de comprendre l'origine et le maintien de la diversité dans les populations. Il s'agit de connaître et définir le concept de déséquilibre de liaison ainsi que les forces évolutives qui le maintiennent au cours des générations, et d'appréhender l’impact de l’histoire évolutive d’une espèce sur l’organisation de son génome. La connaissance des outils et méthodologies d’analyse de la diversité permettront aux étudiants de comprendre comment l’évaluation de la diversité de ressources génétiques est importante pour ajuster et optimiser les méthodes de gestion et de conservation de la diversité végétale. Contenu de l’enseignement – 10h conférence / 10h CM Cours Magistraux : * Introduction du module : l'origine de la diversité génétique. Le maintien de la diversité dans les populations (3h Manzanares-Dauleux) * Méthodologies et outils d'analyse et de structuration de la diversité génétique (2h Manzanares & Laperche) * Histoire évolutive des populations : analyse des patterns de déséquilibre de liaison dans les populations (3h Manzanares-Dauleux) * Allopolyploïdie et speciation (2h Ainouche) Conférences : * The non structural variation of the genomes due to the epialleles (2h Jubauult) * Les mécanismes de recombinaison homologue et homéologue chez les plantes (2h Chèvre) * Molecular evolution (2h Clotault) * L'utilisation et le maintien de la diversité génétique : les ressources génétiques (2h Geoffriau) * Gestion des ressources génétiques et établissement de core collections (2h Leclerc & Laperche) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 11 UE S3M-BioVIGPA-05 / Parcours Disciplinaire Génétique et Génomique / Génétique quantitative Responsable : A. Laperche Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire L’UE5 a pour objectif de former les étudiants à mettre en œuvre les démarches permettant d’identifier les déterminants génétiques d’un caractère complexe. A l’issue de ce module, les étudiants auront une connaissance des différentes méthodologies existantes et des concepts génétiques sur lesquelles elles sont fondées. Ils seront capables de choisir et mettre en oeuvre ces méthodologies en fonction des informations dont ils disposent (données de génomique, information sur l’étendue du DL, données de phénotypage, type de matériel végétal ….. L’UE4 permet de repositionner les bases de génétique des populations, ainsi que le concept de déséquilibre de liaison nécessaires pour suivre l’UE5. (Selon les établissements d’origine, ces bases sont généralement vues en M1). Contenu de l’enseignement – 6h conférence / 3h TD / 11h CM Cours Magistraux : -Introduction du module et Bases de la génétique quantitative (3h, AL) -Carte génétique et application (2h, MMD) - Principes et méthodologies de détection de QTL par analyse de liaison : des dispositifs simples (pop biparentales) à des dispositifs plus complexes (pop connectées, IBD-based QTL mapping, … pop outbred) ( 3h AL ou MMD) - Principes et métholodolgies de génétique d'association et analyses conjointes par liaison et association regional association mapping, genome-wide association mapping, nested association mapping ( 3h, AL) Conférences : - Détection de QTL chez le pommier (2h, C-E DUREL) - Exemple de génétique d'association chez le ray-grass ( 2h, P BARRE) - Intégration des approches de génétique quantitative et d’écophysiologie (2h, BTM) TD : - TD de génétique d’association (3h,B. FOPA-FEMJU) UE S3M-BioVIGPA-06 / Parcours Disciplinaire Génétique et Génomique / Génomique fonctionnelle et structurale Responsable : O. Leprince Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire L’objectif est de permettre aux étudiants de mieux maîtriser les concepts et méthodologies des approches de génomique structurale et fonctionnelle. Il s’agira soit de compléter ou de mieux structurer les connaissances acquises en M1 et dans le tronc commun du M2 puis de montrer comment ces concepts et outils participent à l’innovation scientifique et sont dorénavant intégrés dans la recherche fondamentale et appliquée en lien avec les problématiques de la production végétale. Contenu de l’enseignement –5h TD / 15h CM Introduction : les enjeux et applications de la génomique : du séquençage nouvelle génération (NGS) aux statistiques et bases de données Le NGS : méthodes, bioinformatique et modélisation (prédiction de gènes, assemblage des génomes), et applications Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 12 Génomique fonctionnelle I: Concept et méthodes transcriptomiques, compréhension de la régulation du transcriptome et réseaux de gènes Génomique fonctionnelle II: Outils approfondis de clonage de gènes et d'analyse de la fonction des gènes. L' épigénomique : processus épigénétiques chez les végétaux supérieurs et leur degré d’implication dans l’expression des gènes. Métagénomique et biodiversité : Analyse de la diversité par (re)séquençage massif) Exploration informationnelle des génomes par la bioinformatique. Applications de la génomique fonctionnelle : vision intégrative des outils de la génomique en lien avec des questions de recherche (2 interventions). UE S3M-BioVIGPA-07 / Parcours disciplinaire Pathologie et Interactions / Interactions : les réponses de la plante Responsable : P. Coutos Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire En s’appuyant sur des exemples choisis parmi différents pathosystèmes, ce module présentera les interactions fines qui se mettent en place entre une plante et un bioagresseur et comment la connaissance de ces interactions peux conduire à l’élaboration de stratégies de lutte intégrée. Contenu de l’enseignement – 11h TD - conférence / 9h CM 1) Cours Introductif : 9h - Les mécanismes de perception, signalisation et réponses précoces et tardives des végétaux aux stress biotiques (généralités, relation Hôte/Non Hôte, Eliciteurs spécifiques, réponses intracellulaires, …), 3h (P.Coutos) - Exemple Signalisation, 3h (S. La Camera) - Résistances qualitative / quantitative : modèle gène pour gène/ modèle zigzag 3h (F.Val) 2) Stratégies de lutte intégrée: Conférences 11h -Adaptation des pathogènes aux gènes de résistance des plantes et stratégie de - déploiement de résistances durables, 3h (B.Lecam). - Gènes de résistance aux nématodes, 3h (M.C Kerlan) - Les potentialisateurs et stimulateurs de défenses naturelles des plantes 5h (T. Guillemette, MN Brisset) UE S3M-BioVIGPA-08 / Parcours disciplinaire Pathologie et Interactions / Déterminisme du pouvoir pathogène Responsable : F. Val Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire En s’appuyant sur des exemples choisis parmi différents pathosystèmes ce module présentera les grandes stratégies parasitaires et le déterminisme du pouvoir pathogène des différents bioagresseurs des cultures : champignons, bactéries , virus, nématodes, insectes , plantes parasites. Contenu de l’enseignement – 2h TD - conférence / 18h CM - Les Grandes Stratégies Parasitaires : Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 13 - Déterminisme du pouvoir pathogène chez les champignons (P.Simoneau) - Chez les bactéries (F.Val ) - Chez les virus (M.Jacquot). - Chez les nématodes (E.Grenier) - Chez les Insectes (A.LeRalec) - Chez les Plantes parasites (P.Delavault) -conférence invitee (2h) UE S3M-BioVIGPA-09 / Parcours disciplinaire Pathologie et Interactions / Biodiversité Epidémiologie Responsables : C Le May Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire L’intégration des connaissances sur la biodiversité et l’épidémiologie des pathogènes permettra aux étudiants de comprendre comment la gestion des populations de bioagresseurs conduit également à la gestion des populations de plantes hôtes et en particulier à la gestion et à la durabilité de variétés résistantes Contenu de l’enseignement – 12h TD - conférence / 8h CM Biodiversité : (8h) - Notions d’espèce chez les champignons pathogènes : 2,5h (P.Simoneau) - Notions d’espèces chez les bactéries : 2,5h (M.LeSaux) - Répertoire d’effecteurs et notions de pathovar : 3h (T.Boureau) Outils spécifiques développés pour les approches de communauté des bioagresseurs : 2h (M.Plantegenest ou N Pariset) Epidémiologie : (10h) -Concepts d’épidémiologie 3h (F.Hamelin) Conférence d’illustration : 3h (F.Hamelin) - Conférences : par des exemples . Epidémiologie et architecture du couvert végétal : 3h (C.LeMAY) Transmission des bactéries pathogènes via les semences : 3h ( MA Jacques). UE S3M-BioVIGPA-10 / parcours disciplinaire Physiologie et métabolisme / « Métabolisme et bioproduits » Responsables : B St Pierre Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire - Comprendre les bases moléculaires, cellulaires et physiologiques de l’élaboration de produits d’intérêt des métabolismes primaire et secondaire chez les végétaux (métabolites secondaires, bois, polymères structuraux, biomasse) ainsi que les moyens d’intervention sur la régulation de ces processus métaboliques. Contenu de l’enseignement –20h CM Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 14 1. Composés Pariétaux et de réserves : 1.1 Les Composés de réserves 1.1.1 L’Amidon : Biosynthèse (systèmes enzymatiques impliqués, diversité génétique), mécanismes d'autoassemblage (V. Planchot) 1.1.2 Les fructanes : régulation du métabolisme, rôles, applications (M.P. Prudhomme) 1.2 Les parois cellulaires : 1.2.1 Les polysaccharides pariétaux : Biosynthèse et mécanismes d’assemblage des polymères pariétaux (F. Guillon) 1.2.2 Les Lignines : (G. Pilate) 2. Métabolisme secondaire : (10h) 2.1 Introduction : Les grandes voies de biosynthèses, les grandes familles structurales de produits naturels (B. St-Pierre) 2.2 Bases moléculaires de la régulation du métabolisme des alcaloïdes (N. Guivarc’h) 2.3 Organisation spatiale et compartimentation du métabolisme (V. Courdavault) 2.4 Ingénierie métabolique (B. St-Pierre) 2.5 Molécules bioactives : Composés secondaires des halophytes (C. Magné) 3. Approches globales d’analyse du métabolisme 3.1 Métabolomique, diagnostic et phénotypage métabolique (A. Bouchereau) 3.2 Réseaux métaboliques, Fluxomique (G. Tcherkez ou JC Portais). UE S3M-BioVIGPA-11 / parcours disciplinaire Physiologie et métabolisme / « Développement de la plante» Responsables : P Simier Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire − Présenter un bilan des connaissances sur les étapes du développement des végétaux (de la germination à la reproduction) et les facteurs endogènes impliqués dans sa régulation (gènes du développement, signalisations hormonales, modèles herbacés et ligneux). Appréhender les enjeux horticoles et agronomiques des recherches réalisées sur le contrôle du développement des plantes. L’UE « Fonctionnement du Végétal dans son milieu » du parcours d’Ecophysiologie peut être un complément souhaité de cet enseignement (impact des paramètres environnementaux sur le développement des plantes et approches de modélisation). Contenu de l’enseignement –12h CM / 8h TD 1. Introduction – rappels : les phytohormones impliquées dans le développement et dans la réponse des plantes aux stress abiotiques (R. Atanassova) 2. Développement germinatif et post-germinatif 2.1. Maturation de la graine (J. Bove) 2.2. Germination et dormances : du gène à la modélisation (O. Leprince) 3. Développement végétatif 3.1. Développement racinaire (Conférencier invité) 3.2. Débourrement et dormances des bourgeons (S. Travier) 3.3. Formation du bois (A. Dejardin) 4. Développement reproducteur 4.1. Floraison (F. Foucher) 4.2. Maturation des fruits (Conférencier invité) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 15 5. Cas particulier des plantes parasites obligatoires 5.1. Dormance et stimulants de germination (S. Thoiron) 5.2. Développement en post-fixation (P. Simier) UE S3M-BioVIGPA-12 / Parcours Disciplinaire Physiologie et métabolisme / Réponses aux Contraintes abiotiques Responsable : C. Magne Objectifs pédagogiques en terme de connaissance et de savoir faire Les interventions dans cette U.E. privilégient les thèmes actuels qui concentrent les recherches agronomiques : changements climatiques globaux (stress hydrique, thermique), changements culturaux (maîtrise de l’utilisation de l’azote), phytorémédiation (métaux, sel). Par ces interventions, il s’agira de renforcer chez les étudiants les techniques d’organisation des connaissances, d’analyse de documents et de synthèse ; renforcer leur sens critique et leur maîtrise de l’anglais scientifique sur le thème des réponses des plantes aux facteurs défavorables du milieu. Contenu de l’enseignement – 7,5h TD - / 12,5h CM - Régulations hormonales et réponses aux stress abiotiques (CM) ; Osmoadaptation et métabolismes des osmoprotecteurs (CM) ; Survie à l'état sec: mécanismes de tolérance à la dessiccation (TD) ; Effets des métaux (carence, excès) sur la plante (CM) ; Réponses des plantes à la salinité (CM) ; Réponses des plantes aux stress oxydants (TD) ; Réponse du métabolisme azoté au stress d'hypoxie/anoxie (CM) ; Réponses des plantes aux stress thermiques; Réponses des plantes au stress hydrique. UE S3M-BioVIGPA-13 / Parcours Disciplinaires Ecophysiologie / Fonctionnement du végétal dans son milieu Responsables : F Gastal Objectifs pédagogiques en terme de connaissances et de savoir faire • Apporter aux étudiants les connaissances de base relatives au fonctionnement de la plante en interaction avec son milieu : les échanges majeurs plante-milieu et leur régulation, la gestion des assimilats et la construction de l’architecture de la plante en relation avec les facteurs de milieu • Permettre aux étudiants de se familiariser avec les concepts et avec les outils relatifs à l’analyse des processus physiques, chimiques et biologiques sous-jacents au fonctionnement intégré de la plante dans son milieu • Apporter aux étudiants des éléments de réflexion sur les questions de changement d’échelle • Permettre aux étudiants de replacer les concepts et outils d’écophysiologie dans des interactions avec d’autres domaines du végétal : agronomie, physiologie, génétique Contenu de l’enseignement –20h CM • Objectifs et concepts généraux de l’écophysiologie (CM, 1 h, F. Gastal) • La régulation des échanges entre la plante et son milieu (10h) - Les variables majeures du milieu aérien (température, rayonnement) et le bilan d’énergie de la feuille (CM, 2h, G. Chassériaux) - Les variables majeures du milieu sol (ou substrat de culture) (structure, état hydrique et chimique, activité biologique) (CM 2h, S. Charpentier PR INH Angers) - Modélisation de la photosynthèse à l’échelle de la feuille et du couvert végétal (CM, 2h, F. Gastal) - La régulation des flux d’eau dans le système sol-plante-atmosphère (CM, 2h, JL. Durand) - La régulation de l’acquisition de l’azote par la plante (absorption et fixation symbiotique (CM, Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 16 2h, F. Le Dily) Le fonctionnement intégré de la plante en relation avec son milieu (9h) - La gestion des assimilats dans la plante. (CM, 2h, F. Le Dily) - Développement des végétaux en relation avec la température (CM, 2h, C. Bissuel) - Développement, morphogenèse et mise en place de l’architecture aérienne et racinaire chez les herbacées et les ligneux. (CM, 3h, N. Leduc et J. Fustec) - Rôle de la lumière sur la morphogénèse et l’architecture. (CM 2h00, E. Frak) UE S3M-BioVIGPA-14 / Parcours Disciplinaire Ecophysiologie / Plantes virtuelles Responsables : D. Combes et G. Galopin Objectifs pédagogiques en terme de connaissances et de savoir faire Acquérir la connaissance des principes de base des modèles de plante de type structure –fonction. Savoir manipuler de manière rudimentaire ce type de modèle sur une plateforme de modélisation spécifique • Apporter les concepts et les outils permettant d’intégrer le fonctionnement de la plante en interaction avec son environnement dans une approche structure-fonction • Apporter les concepts et outils d’analyse et de modélisation de l’architecture • Apporter des concepts et des outils pour coupler la modélisation de l’architecture et des flux trophiques dans la plante • Mobiliser ces concepts et ces outils pour développer un modèle simplifié (TP) • Présenter quelques exemples de modèles structure-fonction plus élaborés • Développer la réflexion sur les changements d’échelle organe-plante-peuplement et sur les différents types de modèle de plante et de culture Contenu de l’enseignement – 6h TD-conférence / 14h CM − Langue d'enseignement : Français − Forme d'enseignement : (présentiel, visio, à distance,…) Présentiel − Horaire d'enseignement : (présentiel étudiant) Cours T.P. T.D. magistraux 8 heures 4 heures 6 heures Conférence Projet stage 2 heures • Modélisation structure-fonction : définition et attendus (1 heures, CM) (A. Escobar) • Modèles structure-fonction: principes et outils. Développement d’un modèle simple de type Lsystem par les étudiants (4h. TD + 3h. TP) (A. Escobar, G. Louarn, J. Bertheloot, D. Combes, G. Buck-Sorlin) • Outils d’analyse de l’architecture de la plante (2h. TD + 1h. TP) (D. Combes) • Modélisation couplée lumière x architecture de la plante (2,5 heures, CM) (D. Combes) • Modélisation de l’allocation des assimilats C-N en relation avec l’architecture et la lumière (2,5 heures, CM) (J. Bertheloot) • Présentation d’un exemple de modèle structure-fonction élaboré (2 heures, conférence) (Invité extérieur) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 17 • Eléments pour l’introduction de la variabilité génétique dans les modèles structure-fonction (2 heures, CM) (G. Galopin) − Intervenants (Nom, Prénom, Qualité, affectation) Escobar Abraham, CR1, INRA URP3F, Lusignan Louarn Gaetan, CR2, INRA URP3F, Lusignan Bertheloot Jessica, CR2, INRA SAGAH, Angers Gerard Buck-Sorlin, Pr, IRHS Agrocampus Ouest, Angers Combes Didier, IE, INRA URP3F, Lusignan Galopin Gilles, MCF, AgroCampus Ouest, SAGAH, Angers UE S3M-BioVIGPA-15 / Parcours Disciplinaires Ecophysiologie / Application de l’écophysiologie à la gestion du peuplement végétal Responsables : P Leterme Objectifs pédagogiques en terme de connaissances et de savoir faire Présenter des connaissances, des outils et des démarches permettant d’appréhender le fonctionnement intégré du peuplement végétal, de prévoir l’évolution de ces peuplements et/ou de les piloter. Faire comprendre aux étudiants au travers d’exemples, comment les concepts d’écophysiologie sont utilisés pour quantifier les flux (C, N et eau) entre le peuplement et son milieu, comprendre le fonctionnement d’un peuplement complexe et sous contrainte abiotique, élaborer des indicateurs utilisés dans des outils de conduite des cultures. Contenu de l’enseignement –18h CM / 2h TD 1. Outils et démarche de quantification des processus écophysiologiques (4h cours) ; • Utilisation des isotopes pour l’analyse de l’acquisition et de la répartition des assimilats C-N-eau (2h Cours+TD JC AVICE Pr Université de Caen) • Analyser et prendre en compte l’interaction Génotype x Environnement (2h Cours A. LAPERCHE, MCf Agrocampus Ouest) 2. Intégration des processus écophysiologiques à l’échelle du peuplement végétal (6h cours) • Analyse et modélisation des relations source/puits et de l’interaction croissance/développement à l’échelle de la plante et du peuplement en cas de stress hydrique (2h cours C. BISSUEL, MCf Agrocampus Ouest) • Interception d’énergie lumineuse et production de biomasse en peuplements mono et plurispécifiques (2h cours A. ESCOBAR-GUTIÉRREZ, CR INRA Lusignan). • Affectation de la biomasse entre organes : partie aérienne/partie souterraine, mise en place et analyse des composantes du rendement (2h cours A. ESCOBAR-GUTIÉRREZ, CR INRA Lusignan) 3. Utilisation des modèles écophysiologiques pour l’élaboration d’indicateurs de prévision et de pilotage de l’état des systèmes (10h cours) • Présentation d’un modèle intégré de fonctionnement des cultures (STICS/COGITO) (3h cours+TD F. COSTE, MCf Groupe ESA). • Gestion de la production et de la qualité des fourrages par le mode d’exploitation : intensité et rythme de coupe (2h30 cours F. GASTAL, DR INRA Lusignan) • Gestion de la nutrition azotée d’une association légumineuses/céréales (2h30 cours G. HELLOU, MCf Groupe ESA) • Gestion de la qualité des fruits par la taille des arbres fruitiers (2h cours, P. GUILLERMIN, MCf Agrocampus Ouest) Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 18 Modalités de contrôle des connaissances et des aptitudes et de délivrance du diplôme Ces modalités, proposées par le comité de pilotage, sont harmonisées pour l’ensemble des établissements co-habilités. Elles sont formalisées annuellement et validées par les CEVU des différents établissements. Elles sont portées à la connaissance des étudiants de la formation en début de période d’enseignement. Conditions générales Inscription pédagogique Cette inscription est OBLIGATOIRE. Tout étudiant n’ayant pas rendu son contrat pédagogique au responsable du Master ou ayant effectué des changements de choix d’options sans prévenir, sera considéré non inscrit. Un(e) étudiant(e) ne peut passer l'examen d'une unité d’enseignement que s'il (si elle) est inscrit(e) à l’unité d’enseignement correspondante. Stage validé dans le cursus Le choix du stage devra être validé par le conseil pédagogique à une date fixée par le dit conseil. Traitement des absences et règles d’assiduité Toute absence est à justifier dans les 5 jours auprès du Service de Scolarité ou du secrétariat pédagogique du site d’accueil de la formation, par l’envoi d’un justificatif. Organisation des sessions d’examens L’organisation pédagogique du M2 BioVIGPA est semestrielle. Les épreuves d’examen sont organisées à l’issue du semestre d’enseignement, sur le site où ont lieu les enseignements théoriques du 1er semestre, selon les modalités proposées à l’habilitation. Deux sessions de contrôle des connaissances sont organisées : la 1ère session a lieu à la fin de chaque semestre (décembre pour le 1er semestre, juin pour le 2nd semestre). La 2nde session du 1er semestre est organisée au printemps qui suit ; la 2nde session du 2nd semestre est organisée en septembre qui suit. Tout étudiant(e) ajourné(e) à la 1ère session est inscrit(e) automatiquement à toutes les épreuves organisées en 2nde session pour lesquelles il (elle) a obtenu une note inférieure à 10/20 en 1ère session. Conditions d’admission Attribution des unités d’enseignement (UE) : Une UE est acquise lorsque la moyenne des notes des éléments qui la composent est supérieure ou égale à 10/20. Elle est alors définitivement capitalisée et confère un nombre de crédits ECTS définis selon les modalités proposées à l’habilitation. L’étudiant n’est pas autorisé à renoncer à cette UE pour la repasser. Validation du semestre ou de l’année Un semestre est validé dès lors que 30 crédits ECTS sont acquis pendant cette période. L’année de M2 est validée dès lors que chacun des deux semestres qui la composent est validé, soit par l’obtention de 60 crédits ECTS. Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 19 Règles de compensation Une UE compensée n’est pas acquise et ne peut être réutilisée comme résultat positif dans une autre mention, spécialité ou parcours. La compensation est possible au niveau : - des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement, - des unités d’enseignement constitutives d’un même semestre. Il ne peut y avoir compensation entre les épreuves théoriques et le stage (entre les deux semestres). Conditions de délivrance du diplôme La délivrance du diplôme se fait sous l’autorité du jury de diplôme. Il se réunit sur le site retenu pour les enseignements théoriques du 1er semestre. Le jury délibère et arrête les notes à l’issue de chaque session de chaque semestre. Chaque responsable d’établissement communique les notes des étudiants inscrits dans son établissement au service de scolarité correspondant. La validation du M2 entraîne de droit l’obtention du Master spécialité BioVIGPA. Les mentions de réussite au diplôme, définies selon la moyenne générale des deux semestres composant le M2, sont les suivantes : - mention passable : moyenne générale inférieure à 12 - mention assez bien : moyenne générale supérieure ou égale à 12 et inférieure à 14 - mention bien : moyenne générale supérieure ou égale à 14 et inférieure à 16 - mention très bien : moyenne générale supérieure ou égale à 16 et inférieure à 18 - mention félicitations du jury : moyenne générale supérieure ou égale à 18 Chaque université délivre indépendamment ses diplômes sans faire apparaître les co-habilitations correspondantes. Pour les étudiants n’ayant pas validé les deux semestres à l’issue des 2ndes sessions, le redoublement n’est pas de droit en M2 et il est subordonné à la proposition du jury de diplôme et la décision du chef d’établissement. Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 20 Charte antiplagiat – Université d’Angers Préambule Afin de garantir la qualité de ses diplômes et l’originalité des productions scientifiques et pédagogiques de ses étudiants et de ses personnels universitaires, enseignants, enseignants-chercheurs, chercheurs, l’Université d’Angers a mis en place une politique de lutte contre le plagiat. La présente charte en définit la philosophie et précise les règles, les outils et les mesures à mettre en œuvre pour s’assurer de la réalisation de travaux inédits, offrant une production originale et personnelle d’un sujet. Article 1er Le plagiat est défini comme le fait, de s’approprier le travail créatif d’autrui et de le présenter comme sien ; de s’accaparer des extraits de textes, des images, des données provenant de sources externes et de les intégrer à son propre travail sans en mentionner la provenance ; de résumer l’idée originale d’un auteur en l’exprimant dans ses propres mots et en omettant d’en mentionner la source. Toute édition d’écrits, de composition musicale, de dessin, de peinture ou de toute autre production, imprimée ou gravée en entier ou en partie, au mépris des lois et règlements relatifs à la propriété des auteurs est une contrefaçon (article L335-2 du code de la propriété intellectuelle). La contrefaçon est considérée comme un délit au sens des articles L335-2 et L335-3 du code de la propriété intellectuelle. Article 2 Les étudiants et les personnels de l’Université d’Angers s’engagent à respecter les valeurs présentées dans cette charte et à ne pas commettre de plagiat, ni de contrefaçon, dans leurs travaux scientifiques et/ou pédagogiques. Dans le strict respect de l’exception de courte citation, sont tolérées les reproductions de courts extraits de travaux préexistants en vue d’illustration ou à des fins didactiques, sous réserve que soit indiqué clairement le nom de l’auteur et la source (article L122-5 du code de la propriété intellectuelle), sans nécessité de demander le consentement de l’auteur. Les étudiants sont tenus d’insérer et de signer l’engagement de non plagiat en première page de toutes leurs productions. Le libellé de cet engagement de non plagiat est défini dans la charte des examens de l’Université d’Angers. Article 3 Afin d’éviter le plagiat ou la contrefaçon, les étudiants et les personnels de l’Université d’Angers s’engagent à indiquer clairement l’origine et la provenance de toute information prise dans des écrits, composition musicale, dessin, peinture ou toute autre production imprimée ou gravée. La citation des sources est, ainsi, à envisager dès qu’il est fait référence Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 21 à l’idée, à l’opinion ou à la théorie d’une autre personne ; à chaque utilisation de données, résultats, illustrations d’autrui ; à chaque citation textuelle de paroles ou d’écrits d’autrui. Dans le cadre de sa politique de lutte contre le plagiat, l’Université d’Angers propose des formations de sensibilisation à la recherche documentaire, à l’utilisation des documents trouvés et à la citation des sources. Article 4 Afin de rechercher les éventuelles tentatives de plagiat ou de contrefaçon, l’Université d’Angers s’est dotée d’un logiciel de similitudes. Ainsi, les étudiants sont informés que leurs productions sont susceptibles d’être analysées par ledit logiciel. Ce logiciel compare les travaux rendus avec une vaste base de référence. Les rapports émis détaillent les similitudes repérées sans pouvoir les qualifier de plagiat ou de contrefaçon. Sur la base de ces rapports, l’appréciation du plagiat ou de la contrefaçon est laissée à l’appréciation des enseignants. Article 5 Les manquements à la présente charte sont passibles de sanctions disciplinaires tant à l’égard des étudiants (Articles L. 811-6 et R.712-9 à R.712-46 du code de l’éducation et articles 40 et 41 du décret n°92-657 du 13 juillet 1992 – version consolidée du 21 août 2013) que des personnels (loi n°84-16 du 11 janvier 1984 et articles L952-8 et L952-9 du code de l’éducation). En cas de plagiat avéré ou de contrefaçon, la procédure disciplinaire ne préjuge pas d’éventuelles poursuites judiciaires. Charte validée à la Commission de la formation et de la vie universitaire du 24 février 2014 Et à la Commission de la recherche du 19 mai 2014 Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 22 Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 23 Formation fédérée du Grand-Ouest en Sciences du Végétal Co-habilitée dans les Universités d’Angers, Bretagne Occidentale, Nantes, Poitiers, Rennes 1, Tour, et les Ecoles INH Angers et Agrocampus Rennes 24
