Concilier conservation de l’environnement et risques sanitaires

Concilier conservation de
l’environnement et risques sanitaires
Deux crises sous l’effet des changements globaux :
Une crise écologique et une crise sanitaire
Démographie
humaine
Changements
d’habitats
Espèces
envahissantes
Surexploitation
Changements
du climat
Intrants et
polluants
Crise écologique : perte de biodiversité
taux d’extinction à travers l’histoire
Passé lointain
Passé récent
(données
fossiles)
(taux actuel)
Pour 1000 espèces
de mammifères,
moins d’une
s’éteint tous les
mille ans
Futur
Extinction 10
fois plus élevée
qu’actuellement
Extinction
actuelle 1000
fois plus élevée
que les données
fossiles
Extinction
moyenne sur le
long terme
Une part importante de la biodiversité globale:
100%
50%
0%
30-50 % des organismes connus
peuvent être classifiés parmi
les parasites
Optimisme sanitaire contre les
parasites
Phase d'optimisme
- traitements antibiotiques
- éradication de la variole
Parchemin certifiant l’éradication de la variole
Genève 1979
Crise sanitaire marquée par l’émergence de pathogènes dans les
populations humaines et d’animaux domestiques
Vache folle, HIV, SARS, grippe aviaire, Ebola,..
Pathogènes émergents et conservation
Oiseaux en Amérique du Nord et expansion du virus West Nile
(LaDeau et al. 2007)
Amphibiens en Australie et en Amérique du Sud en raison de l’émergence de
la chytridiomycose (Daszak et al. 1999)
75% des pathogènes émergents sont
zoonotiques, i.e. naturellement transmis entre
les humains et les autres vertébrés
Pénétration dans de nouveaux milieux, viande de brousse
Chauve-souris frugivores comme porteurs potentiels du virus Ebola
Leroy et al. 2005. Nature 438: 575-576
Ebola: manipulation de cadavres de grands sibges dans le bassin du Congo
Chauve-souris responsables et victimes du virus du SRAS
Panique en 2002 et 2003
Ecotourisme
écotourisme,
science, safaris
chasse...
Tique
Amblyomma :
Rickettsia
africae
responsable de
la fièvre à tique
africaine
Protozoaires
Giardia
Paramyxovirus
Introduction de nouveaux pathogènes
Maladie
Hemorragique
Virale
(Chine ; 1986)
Myxomatose
(Amérique du Sud ; 1952)
Monde de la santé
« pathogènes, santé »
Monde de l’écologie
« hôtes-parasites, interactions, évolution »
Paléolithique
Chasse de l’aurochs
Néolithique
Domestication
Virus de la fièvre
aphteuse (Aphtovirus)
Peste bovine
(morbillivirus).
Brucellose (Brucella)
Tuberculose bovine
(mycobacterium)
Actuel
Sélection de races
Période moderne : influence humaine inégalée
Elevage, sélection
de races
Chasse, destruction des
habitats…
?
Extinction au début du
17ième en Pologne
Extinction de parasites associés
Souches virales sauvages de la fièvre
aphteuse, peste bovine…)
Nouveaux cycles
parasitaires
« domestiques »
Nouveaux cycles
parasitaires
« domestiques »
Peste bovine
(morbillivirus)
Franchissements de la
barrière d’espèce
Prion : parasite?
Récent
(années 1990)
Dans le passé
Rougeole
(morbillivirus)
Nouveaux cycles
parasitaires humains
Encéphalopathie
spongiforme bovine
Variante de la maladie
de Creutzfeldt-Jakob
«Réservoirs » dans l’environnement
Tuberculose bovine Mycobacterium bovis
- Réservoir initial : bovins domestiques
-Epizooties expliquées jusqu’à mi-20ième siècle par les
échanges commerciaux entre régions
- Politiques d’assainissement après 1950
-Plusieurs pays déclarés indemnes (prévalence inférieure à 0,2%
du cheptel)
- Réemergence au Royaume Uni à partir des années 1970, alors
qu’éradiquée des cheptels….
«Réservoirs » dans l’environnement
Réservoir sauvage ?
Blaireaux positifs au Royaume-Uni
Mais échanges commerciaux de
bovins sans garantie sanitaire
- Foyer chez Cerfs et sangliers en Normandie en 2001
- En Nouvelle-Zélande : cycle épidémiologique créé par deux introductions :
Mycobacterium bovis et un marsupial australien le Phalanger renard
Zones humides méditerranéennes: Camargue
Zones humides méditerranéennes et activités humaines
La difficulté de concilier la
préservation de la
biodiversité et les risques
associés pour l'homme
- Les zones humides longtemps
vécues en Europe comme des
zones de danger, de maladies, de
foyers à « miasmes » (parasites,
vecteurs, hotes..)
- Ce sentiment de maîtrise et de
sécurité en Europe peut être vite
perdu lors de réapparition d'un
risque, comme l'épizootie du
virus West Nile en Camargue en
2000 ou grippe aviaire en 2006
L’exemple du virus West Nile
DC Public Health Image Library
Virus West Nile
 depuis
1994
New York
1999
Ouganda
1937
(West Nile
district)
Hommes
Chevaux
OISEAUX
Hommes
Chevaux
(Oiseaux)
Zones humides
Épizootie ou épidémie
Virus du West Nile
Santés publique et vétérinaire
Conservation
Hommes
Oiseaux
Moustiques
Zones humides
Morts d’hommes
Destruction
Démoustication
Drainage
Virus West Nile autour du bassin méditerranéen
Cas humains en 2012: EU = 228 ; pays voisins = 547 (ECDC 2012)
Virus West Nile in France
Derniers cas équins en 2004 en Camargue
et sans les Pyrénées-Orientales en 2006.
Dernière évidence de la présence du virus
en Camargue : séroconversion d’un
moineau en 2007.
Hars et al. 2008 Epidémiol. Santé Anim.; Balança et al. 2009 Vector-Borne Zoonot. Dis.
Camargue. 2004
99
100 France-2004-B (Magpie)
France-2004-B (Sparrow)
Morocco-2003-EQ
Italy-1998-EQ
Morocco-1996-EQ
70
49
France-2000-EQ
Israel-1998-B (Goose)
100
Israel-2000-B (Goose)
48
77
Israel-2000-B (Dove)
Kenya-1998-M
Romania-1996-M
98
98
Volgograd-1999-H
0.005
57
Jourdain et al. 2007, Vector-Borne Zoonot. Dis. ; Jourdain et al. 2008, EID
Camargue. 2010
 Circulation récente du virus West Nile
 Mais pas de surveillance
Vittecoq et al. in press, Vector Borne Zoonotic Dis.
Continent américain
Galapagos: la plus forte probabilité d’introduction du West Nile par les avions
(écotourisme)
Aedes albopictus , Virus du Chikungunya et de la Dengue
Aedes albopictus
Aedes albopictus
Réponses médicale, curative, immédiate… :
utilisations massives de molécules de lutte
Apparition de résistances
dans l’environnement
Utilisation massive de molécules de lutte :
transfert de résistances bactériennes des hommes à la faune
Contexte évolutif de la résistance aux antibiotiques
Drobni et al 2009. Plos One
2006 :
Un message confus pour le virus H5N1 hautement pathogène
Oiseaux sauvages
Pandémie
Virus Influenza A : Deux formes de pathogénicité
- Une faible : Les oiseaux sauvages constituent une source permanente
de souches faiblement pathogènes
- Une forte : Depuis une cinquantaine d’année, 25 épisodes de
mortalité due à des souches hautement pathogènes ont été identifiés
chez les oiseaux domestiques.
Changements dans les
pratiques d’élevage
L’émergence résulte le plus souvent
d’un changement dans l’écologie de
l’hôte, du pathogène ou des deux
(Schrag & Wiener 1995)
Les oiseaux migrateurs : des boucs
émissaires de la dispersion du virus
H5N1 ?
Accroissement de la production de viande de canards entre 1961 et
2005. L’augmentation observée en Chine dépasse celle des autres
pays producteurs dans la région.
Grippe aviaire, une maladie émergente
dans les élevages
Epizooties des formes hautement pathogènes (H5, H7)
Centaines
(H5N1 HP)
7
6
5
4
3
2
1
1950
1960
1970
1980
1990
D’après Capua & Alexander 2004
2000
Formes hautement pathogènes : impact
économique
Cases en 2012 (OIE 2012)
Formes hautement pathogènes :
enjeu de santé publique
Les VIA hautement pathogènes :
un enjeu de santé publique
Cas humains en 2012 (WHO 2012)
The Camargue
Important bird diversity (290 species regularly present)

Bird sampling:
Funnel live-traps
Cloacal swabs
Hunters
Fresh
samples
Mist nets
dropping
Analyses moléculaires
Détection

HP, FP

Isolation
des virus Influenza A
Caractérisation
des sous-types
Unité de Génétique Moléculaire
des Virus Respiratoires
Prévalence des virus Influenza A
•
8163 prélèvements analysés parmi 121 espèces
•
298 souches de virus influenza A parmi 9 espèces d’oiseaux d’eaux
Prévalence globale de 3,8%
Lebarbenchon et al. 2007. Journal of Wildlife Disease 43
Lebarbenchon et al. 2007. Infection, Genetics and Evolution 7,
Lebarbenchon et al. 2010. Avian Diseases 54
Sous-types circulant
• Aucun virus hautement pathogène détecté
• Haut niveau de circulation de H1 (12%, H1N1), H5 (21%, majorité
H5N2 et H5N3), et H9 (8%; moitié de H9N2)
18%
16%
Fréquence
14%
12%
10%
8%
6%
4%
2%
0%
H1
100% H1N1
H4
H5
H6
H7
H9
N1
N2
Sous-types
100% H4N6
29% H5N2 33% H6N1
38% H5N3
0,5% H5N6
43% H9N2
N3
N6
N8
Carte des probabilités de haltes migratoires
Dispersion du virus en fonction du temps d’excrétion
Rôle des colverts élevés pour la chasse
• Chasse : une activité économique importante
• > 30 000 colverts lâchés par an en Camargue
• Pas de contrôle sanitaire systématique
1. Très forte prévalence dans certains élevages
2. En 2009 une épizootie par une souche H10N7 FP
H10N7
Contrôles sanitaires nécessaires avant les lâchers ou
interdiction des lâchers
Vittecoq et al. 2012, PLoS ONE
En Asie en 2004: les oiseaux migrateurs ont d'abord été accusés d’être la
cause principale de la propagation du virus
- Porte-parole de l'OMS: «Les oiseaux migrateurs sont ceux qui portent les
maladies» (New York Times, 2004)
- Conclusion de l'OIE et de la FAO en Avril 2005:
"Seules les infections localisées et limitées à des oiseaux sauvages
résidents ont été prouvés et la dispersion du virus par les oiseaux migrateurs
n'a pas été établie"
En 2006, le titre majeur du communiqué de presse de la FAO à l'issue de la
conférence de Rome était «rôle des oiseaux sauvages dans l'IAHP confirmé"
Mais la conclusion de la conférence était:
« La conférence, qui a réuni plus de 300 scientifiques de plus de 100 pays, a
reconnu que le virus a été principalement dispersé par le commerce de la
volaille, à la fois légal et illégal »
Le réseau mondial des voies migratoires des oiseaux sauvages semblaient
cacher la mondialisation - sans contrôle sanitaire strict - des échanges de
viande de volaille, le mécanisme le plus probable pour la propagation de la
maladie
Des points de vue politique et économique :
En blâmant les oiseaux sauvages, possibilité de dégager toute autre
responsabilité
Personne ne porte la responsabilité de cette catastrophe sanitaire et
économique, ni les personnes en charge des politiques nationales et
internationales d’élevage, ni les responsables du commerce, du transport, du
contrôle douanier, ou du contrôle des maladies.
Protéger les oiseaux sauvages des oiseaux domestiques
Sources permanentes de H5N1 HP : volailles en Asie du Sud-Est, Russie et
Afrique
La dispersion par le commerce de la volaille localement et sur de longues
distances
Une infection locale des oiseaux sauvages par la volaille et de la dispersion
sur de courtes distances
Pas de maintien à long terme de la grippe aviaire H5N1 dans les populations
d'oiseaux sauvages
Une réflexion est nécessaire avant tout sur ​les pratiques commerciales et de
la volaille
Monde de la santé
Monde de l’écologie
« pathogènes, santé »
« hôtes-parasites, interactions, évolution »
Santé animale
Animaux
domestiques /
Santé
vétérinaire
Ecologie de la Santé et
Biodiversité
Fonctionnement
des écosystèmes
Biodiversité /
Ecologie /
Parasites
Santé
humaine
Populations
humaines /
Santé
publique