Diaporama Hervé Sanguin

Apport des NGS pour l'étude de la diversité mycorhizienne en
milieu méditerranéen
Perspectives pour le décryptage des réseaux écologiques
Herve Sanguin
UMR Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes
Exploration de la Biodiversité par NGS, de nouveaux horizons ? 16 mai 2013, IMBE, Marseille,

Symbioses
Mycorhiziennes
1

Explosion Démographiques ?
1,5 M
(69-74 K connues)
Hawksworth, 1991; 2001
9,9 M
Cannon, 1997
0,5 M
May, 2000
3,5-5,1 M
O’brien, 2005
Régions tempérées
CHAMPIGNONS
Régions tropicales
Exploration
Diversité
0,6-0,7 M
(43 K connues?)
Smith and Mueller, 2007; Mora et al. 2011
5,1 M ?
Blackwell, 2011
1,5 M + ?
(100 K connues selon
The Dictionary of Fungi;
Kirk et al., 2008 )
IMA fungus
Hawksworth 2011
270 K espèces
Angiospermes
Hawksworth, 1991
350-420 K espèces
Angiospermes
Joppa et al. 2010
Exploration de la Biodiversité par NGS, de nouveaux horizons ? 16 mai 2013, IMBE, Marseille,
APPORT DES NGS ?

Exploration de la Biodiversité par NGS, de nouveaux horizons ? 16 mai 2013, IMBE, Marseille,
LES MYCORHIZES
Ectomycorhizes (EcM)
Mycorhizes à arbuscules
(CMA)
Mycorhizes
Arbutoïdes et monotropoïdes
Selosse et Le Tacon, 1995; Brundrett, 2004, 2009; Smith and Read 2008; Van Elsas et al. 2006
Endomycorhizes des Ericacées
Ectendomycorhizes
Endomycorhizes des Orchidées
Angiospermes
Angiospermes
Angiospermes
Gymnospermes
Gymnospermes
Gymnospermes
Bryophytes
Bryophytes
Ericales
Ericales
Ptéridophytes
Orchidales

“The study of plants without their mycorrhizas is the
study of artefacts. The majority of plants, strictly
speaking, do not have roots; they have mycorrhizas”
BEG-Committee, 25th May 1993
Apparition des CMA il y a plus de 460 M d’années (Ordovicien)
•Symbiose ectomycorhizienne (- 130 M, Crétacé)
•Symbiose rhizobienne (- 70 M)
> 80% des plantes terrestres forment des symbioses mycorhiziennes
•94% des angiospermes (familles), dont 82% avec des CMA et 2% avec des EcM
•>250 000 espèces sont associées à des CMA
•8000 espèces de plantes sont EcM
Redecker et al. 2000
Exploration de la Biodiversité par NGS, de nouveaux horizons ? 16 mai 2013, IMBE, Marseille,