FUNVIRMIR Sébastien Pfeffer, IBMC-CNRS, Strasbourg (Coord.) Denis Rasschaert, INRA-Université, Tours Programme MIME 2007 Utilisation de deux virus modèles pour l'étude du rôle des microRNA d'origine virale in vitro et in vivo microARN et virus : petites molécules, grands effets Les microARN sont de petites molécules d’acide ribonucléique qui jouent un rôle essentiel dans le contrôle de l’expression génétique. Présents chez de nombreuses espèces animales et végétales, ils sont impliqués dans un grand nombre de processus biologiques. Récemment, on a mis en évidence que certains virus avaient « piraté » à leur avantage la machinerie de la cellule hôte pour synthétiser leurs propres microARN. Ces petits ARN d’origine virale peuvent être utilisés par le virus pour réguler l’expression de gènes d’origine cellulaire et virale, et participent à l’établissement d’un environnement cellulaire optimisé pour le virus. L’objectif de notre projet est d’étudier le rôle joué par les microARN au cours de l’infection par des virus appartenant à la famille des herpès. Pour ce faire, nos deux équipes travaillent sur deux virus pouvant infecter des organismes modèles : le cytomégalovirus de la souris (MCMV), et le virus de la maladie de Marek (MDV) infectant le poulet. Le but ultime est de définir l’importance réelle des microARN en contexte physiologique d’infection virale. L’infection par MCMV régule négativement l’accumulation du miR-27. Les profils d’expression des miRNA ont été analysés par séquençage (A) ou par northern blot (B). La mutation de l’un des miRNA du virus MCMV résulte en une forte atténuation du titre viral dans les glandes salivaires de souris (en haut), mais pas dans les poumons (en bas). Deux mutants différents (ponctuels ou de délétion) ont été générés. Ce phénotype est du pour partie à la régulation de la chimiokine CXCL16 par le miRNA miR-M23-2 (non montré). Publication : Buck… Pfeffer. RNA 2010 Résultats principaux et perspectives Publication : Dölken… Pfeffer. PloS pathogens 2010 Au cours de ce projet, nous avons pu montrer que les deux virus étudiés utilisaient des stratégies complexes pour réguler l’expression soit de leurs propres microARN, soit de ceux de l’hôte. Ainsi, les microARN du virus MDV sont sous le contrôle de la protéine P53 jouant un rôle bien connu dans les cancers. Le virus MCMV quant à lui, utilise une stratégie novatrice consistant à déclencher la dégradation d’un microARN cellulaire. Nous avons également identifié de nombreuses cibles cellulaires et virales des microARN des deux virus. Enfin, pour la première fois, nous avons rapporté qu’un virus mutant pour l’un de ses microARN était atténué par rapport à un virus sauvage. Ces résultats pourraient permettre à long terme envisager d’utiliser les microARN viraux comme une nouvelle cible thérapeutique pour lutter contre certaines infections virales. B Le promoteur des miRNA-6,7,8 et 10 de MDV est localisé au niveau de séquences répétées de 60 pb contenant des éléments de réponse à P53 (A). La protéine P53 pilote l’expression des miRNA (B). Publication : Stik… Rasschaert. RNA 2010 MDV1-miR4-5p et MDV1-miR4-3p ciblent respectivement les protéines virales UL28 et UL32 impliquées potentiellement dans l’assemblage de la particule virale et pourraient ainsi participer à l’entrée ou au maintien de la latence virale. Publication : Muylkens… Rasschaert. Arch Virol 2010 CONTACT : [email protected] [email protected] 175