Edition 2006 Biodiversité

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Présentation des projets financés au titre de l’édition 2006 du
programme BIODIVERSITE
ACRONYME et titre du projet
Page
AMAZ_BD - Biodiversité des paysages amazoniens. Déterminants socio-
économiques et production de biens et services écosystèmiques 2
BIOINV 4i - Etude des invasions biologiques à partir d'introductions
intentionnelles et non intentionnelles d'insectes 4
BIOTAS - The southwest Indian Ocean biodiversity hotspot: a biota-level study
of diversification on land and sea 5
BRIDGE - Bridging information on tree diversity in French Guiana and a test of
ecological theories 6
DEEP OASES - Biodiversité des écosystèmes chimiosynthétiques dans l'océan
profond 7
ECIMAR - Ecologie chimique marine: indicateurs de biodiversité et valorisation 8
ECOKELP - Dynamics of kelp forest biodiversity in northern and southern
hemispheres: ecological, social and economics aspects 9
ECOMIC-RMQS - Microbio-géographie à l'échelle de la France par l'application
d'outils moléculaires au réseau français de mesures de la qualité des sols 10
FRESHWATER FISH - Modèles prédictifs de la diversité spécifique et
fonctionnelle des communautés de poissons d'eau douce: outils de réponse aux
effets de l'anthropisation et du changement climatique annoncé
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FUNDIV - Conserving and exploiting the functionnal diversity of ectomycorhizal
fungi in forest ecosystems 12
IFORA - Les îles forestières africaines: modèles d'une nouvelle approche de la
dynamique de structuration de la biodiversité 13
INBIOPROCESS - Linking biodiversity and ecological processes in the
subsurface / surface water interfaces for sustainable ground water management 14
PICOFUNPAC - Picophytoplancton dans une région océanique hyper -
oligotrophe: diversité fonctionnelle et impact sur les bactéries 15
TRANSBIODIV - Biodiversité trans-spécifique neutre et fonctionnelle:
développements théoriques et quantification chez des organismes modèles 16

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Programme Biodiversité
Edition 2006
Titre du projet AMAZ_BD - Biodiversité des paysages
amazoniens. Déterminants socio-économiques
et production de biens et services
écosystèmiques
Résumé
Dans deux pays d’Amazonie représentant la diversité des paysages anthropisés de
l’écorégion, ce projet analysera et modélisera les liens qui unissent 1. les
paramètres socio-économiques, 2. la composition et la structure des paysages, 3.
la biodiversité des plantes, et de 6 groupes clés d’animaux (oiseaux, Drosophilidae,
Lépidoptères Saturnidae, fourmis, termites et vers de terre et 4. la production
agricole et les autres biens et services écosystémiques (BSE) utilisés par les
populations humaines.
 Un protocole original permettra une collecte de données socio-économiques,
paysagères, agronomiques et écologiques 100% compatibles permettant une
analyse statistique rigoureuse et la formulation de nouvelles hypothèses sur les
mécanismes reliant ces divers groupes de variables.
 Les groupes étudiés pour leur biodiversité sont des ingénieurs de l’écosystème
(plantes, vers de terre) ou des indicateurs des effets de la fragmentation ou les
deux à la fois. Ils représentent aussi des situations assez contrastées en termes de
proportions d’espèces endémiques.
 Dans chaque pays, 150 exploitations appartenant à trois paysages différant par
l’histoire de la colonisation et l’usage de la terre seront décrites avec des variables
socio-économiques et paysagères. On mesurera la biodiversité et une sélection de
BSE associés dans les 27 exploitations les plus représentatives de la diversité
dans chaque pays.
L’analyse statistique permettra d’identifier les co-variations significatives entre les
diverses variables et d’identifier d’éventuels effets de seuils dans leurs relations. La
simulation par la modélisation multi-agent de scénarios inspirés du Millennium
Ecosystem Assessment indiquera aux décideurs quelles mesures favoriseraient le
plus un usage durable des ressources dans des systèmes de production qui
conservent la biodiversité.
Partenaires IRD/Univ. Paris VI/XII, UMR 137 - BIOSOL (partenaire coordinateur)
UMR CNRS 5603, Société environnement territoire Univ. Pau
CIRAD-UPR 36, Ressources Forestières et politiques publiques
E.A. 6713-ECODIV, Univ. Rouen, Etude et Compréhension de la
Biodiversité
UMR 5023 CNRS Ecologie des Hydrosystèmes Fluviaux
CIRAD-GREEN, Gestion des Ressources Renouvelables et de
l’Environnement
UR 169 PATIS patrimoines naturels territoires et identités
INRA Avignon
UR 079 GEODES modélisation mathématique et informatique des
systèmes complexes
Centro Intrenacional de Agricultura Tropical – dept of environmental
research
Universidad de la Amazonia
Universidad Tecnologica de Pereira, dpt of Environment
Universidad Federal do para
UFPA – Laboratorio Socio-agrônomico do Tocantins
Museu Paraense Emilio Goeldi

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Universidad Federal Rural da Amazonia
Coordinateur Monsieur Patrick LAVELLE
[email protected]
Aide de l’ANR 543 180 Euros
Début et durée Janvier 2007 – 36 mois
Référence ANR-06-BDIV-009

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Titre du projet BIOINV 4i - Etude des invasions biologiques à
partir d'introductions intentionnelles et non
intentionnelles d'insectes
Résumé
Bien que les bioinvasions soient une menace pour la biodiversité, la santé humaine
et l'agriculture, les paramètres démogénétiques déterminant leur succès sont mal
connus en raison de limitations méthodologiques et expérimentales.
L'objectif de ce projet est d'estimer ces paramètres dans différents contextes de
bioinvasion, y compris celui dans lequel des expériences contrôlées sont
réalisables in natura : les introductions d'auxiliaires en lutte biologique sont
intentionnelles et peuvent être utilisées pour valider de nouvelles méthodes
d'analyse statistiques et pour tester des hypothèses théoriques de biologie de
l'invasion. Nous allons donc :
1) développer de nouvelles méthodes statistiques pour estimer les paramètres
démogénétiques et historiques des bioinvasions
2) appliquer ces méthodes à 3 cas d'invasions actuelles d'insectes d'importance
socio-économique et ayant des caractéristiques écologiques variées : 2
introductions non intentionnelles (Diabrotica virgifera virgifera et Tecia solanivora) et
1 intentionnelle (Harmonia axyridis)
3) estimer au laboratoire l'effet de paramètres a priori importants pour le succès de
ces invasions : la plasticité adaptative et la variance génétique neutre et adaptative
des populations nouvellement fondées
4) évaluer les nouvelles méthodes statistiques et tester expérimentalement in
natura l'importance de la variabilité génétique, de l'hybridation et de l'introgression
en manipulant ces variables lors d'introductions expérimentales de 2 auxiliaires de
lutte biologique (Cotesia sesamiae et Psyttalia lounsburyi).
Ce projet permettra d'identifier une hiérarchie des facteurs responsables du succès
des invasions. Des stratégies de gestion des introductions favorables et
défavorables seront ensuite proposées et discutées.
Partenaires INRA -Université de Nice-Sophia Antipolis, Equipe de biologie des
populations en interaction (BPI), UMR 1112 (partenaire coordinateur)
INRA-ENSAM-CIRAD-IRD UMR 1062, Centre de Biologie et de Gestion
des Populations
INRA Unité Expérimentale 1254 de Lutte Biologique
IRD UR R072 - Biodiversité et évolution des complexes plante - insectes
ravageurs – antagonistes
CNRS/Université Toulouse III/ENFA Laboratoire d'Agroécologie de l'Ecole
nationale de Formation agronomique; UMR 5174 « Evolution et diversité
biologique »
IRD UR R072 - Biodiversité et évolution des complexes plante - insectes
ravageurs – antagonistes ICIPE
European biological control laboratory of the United States Departement of
Agriculture (USDA-ARS)
USDA-ARS, CICGRU Genetics laboratory Iowa state University
University of Nebraska-Lincoln Department of entomology
CAB International / Agricultural Pest research
LUBIES – Université Libre de Bruxelles
Cambridge, department of genetics
University of Minnesota, department of entomology
Coordinateur Monsieur Thomas GUILLEMAUD
[email protected]
Aide de l’ANR 973 523 Euros
Début et durée Janvier 2007 – 48 mois
Référence ANR-06-BDIV-008

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Titre du projet BIOTAS - The southwest Indian Ocean
biodiversity hotspot: a biota-level study of
diversification on land and sea
Résumé
Le sud-ouest de l’océan Indien est l’une des 8 régions du monde où les hotspots
des biodiversités marine et terrestre coïncident. Ce recoupement géographique
laisse supposer que des conditions similaires ont pu agir sur la diversification dans
ces deux domaines. Nous proposons d’explorer ici les similarités et les différences
entre spéciations marine et terrestre, et au sein de chaque milieu, en utilisant une
nouvelle analyse de la différenciation de lignées au niveau des biota. Plusieurs
centaines d’espèces ou de groupes taxonomiques seront examinés afin de révéler
de multiples exemples des patterns régionaux de la diversification entre les îles.
Maints nouveaux cas de radiation locale pourront ainsi être découverts, non
seulement en étudiant la différenciation locale des espèces endémiques mais aussi
en examinant la différenciation cryptique chez un grand nombre d’espèces à large
répartition. Cette différenciation cryptique est fréquente dans la région indo-
pacifique et les données préliminaires suggèrent qu’elle existe aussi dans le sud-
ouest de l’océan Indien. Améliorer la connaissance sur l’ampleur de la
différenciation cryptique conduira à une réévaluation de l’endémicité dans notre
région et fournira de nombreux modèles biologiques pour l’étude des premiers
stades de la diversification. Les similarités et les différences dans les échelles
spatiales et temporelles de différenciation entre les lignées seront utilisées afin de
définir les aspects du contexte et les mécanismes de diversification communs et
ceux qui varient entre les groupes biologiques étudiés. En comparant, par analyse
multivariée, les fréquences et ampleur de la différenciation à travers l’ensemble des
taxa, nous testerons les rôles relatifs des traits biologiques des espèces (tels le
mode et la probabilité de dispersion, le mode de reproduction, les stratégies de
reproduction et d’histoire de vie, etc.) comme moteurs de la différenciation
géographique.
Partenaires Laboratoire d'Ecologie marine, EA8, Université de la Réunion (partenaire
coordinateur)
UMR Peuplement Végétaux t Bio-agresseurs en milieu tropical, CIRAD-
Université de la Réunion, UMR_C 2004
UMR Evolution et Diversité Biologique, CNRS-Université Paul Sabatier,
ENFA
Laboratoire des Ecosystèmes Aquatiques tropicaux et Méditerranéens,FRE
2935 CNRS EPHE, Université de Perpignan
Laboratory for Evolution, Genomes and Speciation, CNRS DR4 Gif-sur-
Yvette
IRD UR 175 Caractérisation et valorisation de l’ichtyodiversité pour une
aquaculture raisonnée
Florida Museum of Natural History, University of Florida
School of biological sciences University Of East Anglia
Coordinateur Henrich BRUGGEMAN
[e-mail]
Aide de l’ANR 767 000 Euros
Début et durée Janvier 2007 – 36 mois
Référence ANR-06-BDIV-002