La recherche documentaire BA3 – Chimie Question? :

La recherche documentaire
BA3 – Chimie
Module 8
ULB – Bibliothèque des Sciences et Techniques (BST)
Dominique Lerinckx
Question? : [email protected]
http://www.bib.ulb.ac.be/BST/
Plan de la séance
Scifinder :
 Différents modes de recherche




Restriction et combinaison d’ensembles
Sauvegarde du résultat
Etendre la recherche
Tri, sélection et ajout de « tags »
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D. Lerinckx
16/02/2012
SciFinder
SciFinder de chez soi:
http://www.bibhost.ulb.ac.be/BST/capsule6-web/capsule6-bis.htm
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D. Lerinckx
16/02/2012
Bases de données bibliographiques
Chemical Abstracts:
plus de 34 millions de références bibliographiques en chimie
depuis 1907Principalement des articles de pointe, des brevets et des articles de
synthèse (reviews)
entre 1907-1967 interrogations uniquement par: auteurs, nom de
société, research topics (c.a.d. mots-clés) et document identifier
Medline:
plus de 15 millions de références dans le domaine biomédical
depuis 1958-
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Répertoire de substances
Plus de 62 millions de substances chimiques et 63 millions de séquences
découvertes depuis 1957(dont 60% de composés organiques)
Nombreuses propriétés expérimentales ou calculées par ACD/Labs
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Base de réactions
CASREACT débute en 1840-, les schémas réactionnels sont indexés
depuis 1980, avec 100 journaux ciblés « synthèse » indexés ainsi que les
brevets depuis 1991Plus de 35 millions de réactions mono- et multi-étapes
Pour chaque réactions faisant partie d’un schéma multi-étapes, toutes
les combinaisons ont été indexées:
par exemple:
ABCD dans un même document
AC ou AD sont aussi indexés
Les réactions indexées sont sélectionnées: seules sont indexées des
réactions présentant des critères de nouveauté et d’originalité
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Recherche par mots-clés
Extraire les substances
dont il est question
dans les
références
Retrouver la référence
qui décrit cette
synthèse
Afficher les
schémas de synthèse
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D. Lerinckx
16/02/2012
Recherche sur base d’un nom de substance
Extraire les références
qui parlent d’une
ou plusieurs
substances
Chercher sur base
• d’un nom chimique ou commercial, IUPAC, etc…
• d’une structure exacte ou comme sous-structure
• d’une formule moléculaire
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D. Lerinckx
16/02/2012
Recherche sur base d’une réaction
Retrouver les références
qui décrivent une
synthèse
Extraire les substances
d’une sélection de
réactions
Construire un schéma de
synthèse en apposant des
conditions sur la réaction
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D. Lerinckx
16/02/2012
Prenons un exemple…
Je cherche les effets du thé vert sur le cancer




Quelles molécules sont impliquées?
Quel mécanisme d’action?
D’autres effets thérapeutiques sont-ils observés?
Peut-on synthétiser ces molécules?
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D. Lerinckx
16/02/2012
Recherche par mots-clés
SFS travaille en langage naturel (NLQ), il est déconseillé de rechercher sur des
phrases trop longues
NLQ reconnaît les prépositions mais n'analyse pas leur signification linguistique
Les troncatures ne sont pas reconnues car NLQ les calcule automatiquement
Les opérateurs booléens "AND", "OR" et "NOT" sont aussi considérés comme
des prépositions
 exclure des termes avec NOT ou EXCEPT :
'I am interested in ringed planets but NOT Saturn‘
 correctement employer la grammaire anglaise
Ecrire ... « I am interested in liver apoptosis or nasal apoptosis »
... plutot que « I am interested in liver or nasal apoptosis »
Les parenthèses sont utilisées pour désigner des synonymes, séparables par
une virgule :
« milk production of cows (bovines, cattles) »
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Plusieurs réponses à une requête
Topic Candidates:
As entered : les termes tels qu'ils ont été saisis ou phrase exacte
Concept : terme ou phrase, soumis successivement à différents algorithmes
destinés à :
a) la vérification dans un dictionnaire de synonymes et des formes
orthographiques alternatives, abréviations
b) élimination des majuscules, des prépositions et des stop words
d) addition du CAS Registry Number si un nom exact de substance est trouvé
e) l'autotroncation de tous les termes restants
Closely associated with one another :
les concepts appartiennent à la même phrase (titre ou résumé) ou au même index
Present anywhere in the reference :
équivalent à un simple opérateur AND entre les concepts.
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green tea effects on cancer
green tea and cancer
green tea …… cancer
closely associated
……green tea …… cancer
.
Ajout de synonymes
Green tea (camellia sinensis) effects on cancer
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D. Lerinckx
16/02/2012
Combinaison d’ensembles
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D. Lerinckx
16/02/2012
(Green tea or camellia sinensis) and cancer
camellia sinensis and cancer
Les dangers du « NOT »
Cancer and Camellia sinensis not plant
Parmi les 477 références perdues, celle-ci…
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D. Lerinckx
16/02/2012
(Green tea or camellia sinensis) and cancer
Green tea and cancer
camellia sinensis and cancer
(Green tea or camellia sinensis) and cancer
camellia sinensis and green tea and cancer
Sauvegarde d’une recherche
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D. Lerinckx
16/02/2012
La molécule qui apparaît le
plus souvent parmi l’ensemble
de références sélectionnées
Analyse
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16/02/2012
Analysis
……green tea …… cancer .
989-51-5
Analyser les références
Permet de faire ressortir :
•
Les auteurs qui ont le plus publié dans le domaine
•
Les substances les plus souvent citées dans les références
•
Les compagnies leader dans un domaine
•
« Top » revues dans le domaine
•
La terminologie utilisée
Permet d’éliminer :
•
les références hors sujet grâce à la classification « CA section
Title »
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D. Lerinckx
16/02/2012
Keep Analysis
cancer green tea 989-51-5
« Keep analysis » permet de créer un ensemble
avec le résultat d’une analyse
Refine
Permet de restreindre un ensemble sur base d’un critère déterminé
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D. Lerinckx
16/02/2012
Refine
cancer green tea 989-51-5
Review or patents
Categorize
cancer green tea 989-51-5
Génétique
Actions
thérapeutiques
Propriétés physico-chimiques
Categorize
Analyse plus fine sur base des mots-clés utilisés pour décrire les articles
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D. Lerinckx
16/02/2012
Recherche d’un substance
Nom IUPAC
Nom commercial
Registry Number : numéro qui identifie une substance
dans la base de données
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16/02/2012
Recherche par structure moléculaire
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D. Lerinckx
16/02/2012
Copier-coller au départ d’une référence
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D. Lerinckx
16/02/2012
Chercher les préparations d’une molécule
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D. Lerinckx
16/02/2012
Chercher les synthèses d’une substance
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D. Lerinckx
16/02/2012
Les options d’analyse
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D. Lerinckx
16/02/2012
Elargir la recherche
Liste des références qui citent un article
Avantages:
 Retrouver de nouveaux développements sur base d’information
ancienne
 Mesurer de l’influence d’un article dans un domaine de recherche
 Localiser des concurrents qui travaillent dans le même domaine
 Contestation quant aux résultats présentés dans un article
 Identifier des articles sur un sujet autrement que via une
recherche par mot-clé
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« get cited »: références citées dans un article
2005
Smith
1990
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D. Lerinckx
16/02/2012
« get citing »: références qui citent un article
2005
Smith
1990
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D. Lerinckx
16/02/2012
Les options de tri
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D. Lerinckx
16/02/2012
Les tags
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D. Lerinckx
16/02/2012
Personnaliser grâce aux « tags »
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D. Lerinckx
16/02/2012