Modélisation mathématique des dynamiques de la réponse

Mod´elisation math´ematique des dynamiques de la
r´eponse immunitaire T CD8, aux ´echelles cellulaire et
mol´eculaire
Emmanuelle Terry
To cite this version:
Emmanuelle Terry. Mod´elisation math´ematique des dynamiques de la r´eponse immunitaire T
CD8, aux ´echelles cellulaire et mol´eculaire. Sciences agricoles. Universit´e Claude Bernard -
Lyon I, 2012. Fran¸cais. <NNT : 2012LYO10185>.<tel-00763897>
HAL Id: tel-00763897
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00763897
Submitted on 11 Dec 2012
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publics ou priv´es.

TH` ESE
pr´esent´ee `a
L’UNIVERSIT´ E CLAUDE BERNARD LYON 1
´
ECOLE DOCTORALE DE MATH´ EMATIQUES ET INFORMATIQUE
pour obtenir le grade de
Docteur
Sp´ecialit´e : Math´ematiques Appliqu´ees
par
Emmanuelle TERRY
Titre : Mod´elisation math´ematique des dynamiques de la r´eponse
immunitaire T CD8, aux ´echelles cellulaire et mol´eculaire
Directeurs de th`ese :
Dr Fabien Crauste
Dr Olivier Gandrillon
soutenue publiquement le 12 octobre 2012
JURY
M. Daniel LE ROUX Professeur, Universit´e de Lyon 1 Pr´esident
M. Fabien CRAUSTE Charg´e de recherches au CNRS, Universit´e de Lyon 1 Directeur de th`ese
M. Olivier GANDRILLON Directeur de recherches au CNRS, Universit´e de Lyon 1 Directeur de th`ese
Mme. V´eronique THOMAS-VASLIN Charg´ee de recherches au CNRS, Hˆopital de la Piti´e-Salpˆetri`ere Examinateur
M. Gr´egoire ALTAN-BONNET PhD, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Rapporteur
M. Michel LANGLAIS Professeur, Universit´e de Bordeaux 2 Rapporteur

Remerciements
Ecrire une page de remerciements est toujours un exercice redoutable, tant les
personnes aidant `a cheminer tout au long d’une th`ese sont nombreuses.
Mes remerciements vont en premier lieu `a mes directeurs de th`ese, Fabien Crauste
et Olivier Gandrillon. Ils m’ont accompagn´ee avec une patience et une attention
constante, et se sont toujours montr´es tr`es disponibles. Consciencieusement, et avec
rigueur, ils m’ont permis de m’initier `a la recherche en me poussant toujours `a aller
plus loin.
Merci `a Gr´egoire Altan-Bonnet et `a Michel Langlais d’avoir accept´e d’ˆetre rap-
porteurs, et d’avoir consacr´e ainsi du temps `a lire mon travail.
Merci `a V´eronique Thomas-Vaslin et Daniel Le Roux d’avoir accept´e de faire
partie du jury.
Je tiens ´egalement `a remercier Jacqueline Marvel et toute son ´equipe, avec qui
nous avons pu travailler pendant ces trois ans, dans des discussions d’immunologie
et de mod´elisation constructives, et une collaboration nous permettant de travailler
avec des donn´ees exp´erimentales.
Je tiens aussi `a remercier Alain Trautmann, pour les discussions d’immunologie
que nous avons pu ´echang´ees.
Merci `a Ga¨ el Kaneko, pour son aide technique en informatique lorsqu’il nous a
fallu parall´eliser nos simulations sur le Centre de Calcul de l’In2p3. Je n’oublie donc
pas non plus l’In2p3, et en particulier Pascal Calvat.
Mes remerciements vont aussi aux deux ´equipes dont j’ai partag´e la vie pendant
ma th`ese, l’´equipe Inria Dracula et l’´equipe BM2A. Le caract`ere interdisciplinaire
de ma th`ese m’a ainsi apport´e cet enrichissement de faire partie d’une ´equipe `a
dominante math´ematiques, et d’une ´equipe `a dominante biologie.
Enfin, toutes mes pens´ees vont `a mes parents, pour leur soutien constant et leurs
coups de pouce sur le plan technique, et `a S´ebastien, pour sa pr´esence quotidienne,
et son aide morale et technique.
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