Ecole Doctorale « Santé – Sciences Biologiques – Chimie du Vivant » Philippe Roingeard & Luigi Agrofoglio Directeurs CONTRAT DOCTORAUX (rentrée 2014) 1. Informations administratives : Nom du directeur de thèse : Malinge Jean-Marc Nom du co-directeur / :Midoux Patrick Unité : Centre de Biophysique Moléculaire, UPR4301 CNRS Email du directeur de thèse :[email protected] 2. Titre de la thèse : Co-ciblage de facteurs de transcription impliqués dans le cancer : preuve de concept de l’activité leurre moléculaire d’un minicercle d’ADN in cellulo et in vivo. 3. Résumé : La stratégie de thérapie moléculaire dite du leurre moléculaire à ADN a fait l’objet de plusieurs brevets portant sur des applications thérapeutiques et un ADN leurre moléculaire est en essai clinique dans le traitement de tumeurs de la tête et du cou pour cibler le facteur de transcription STAT3. Cette stratégie consiste à utiliser un oligodésoxyribonucléotide en double brin linéaire court contenant le site de reconnaissance d’un facteur de transcription cible suractivé dans le cancer. Après délivrance intracellulaire, l’acide nucléique leurre piège le facteur de transcription qui n’est alors plus capable d’interagir avec la séquence physiologique présente dans la région promotrice de plusieurs gènes dont la transcription puis l’expression sont impliquées dans le cancer. Nous avons mis au point une nouvelle méthode de production quantitative d’une forme d’ADN circulaire (minicercle ci-contre) permettant de fixer plusieurs facteurs de transcription in vitro, d’être résistant aux exonucléases et de pouvoir posséder des fonctionnalisations chimiques (fluorophores par exemple) (Malinge, J.-M. et coll., dépôt d’un brevet européen par le CNRS en 2012; T. Thibault, Thèse 2012). Cette forme offre plusieurs avantages par rapport aux leurres moléculaires ADN utilisés à l’heure actuelle qui sont linéaires et courts, avec une efficacité thérapeutique limitée par une instabilité et surtout par l’impossibilité de cibler plusieurs facteurs de transcription simultanément. Les minicercles ADN permettent le développement d’agents thérapeutiques multicibles ce qui est une nécessité dans le traitement contre le cancer car les mécanismes moléculaires de l’oncogénèse reposent sur une suractivation de plusieurs facteurs de transcription. Après avoir mis au point la préparation des minicercles d’ADN, le projet de thèse proposé a pour objectif de faire la preuve de concept de l’efficacité d’un minicercle d’ADN comme leurre moléculaire des facteurs de transcription NF-kB, STAT3 et Ets-1 impliqués respectivement dans l’inflammation, la prolifération cellulaire et l’angiogénèse tumorale. Cette preuve de concept sera faite en deux parties : 1) au niveau cellulaire, l’effet du multiciblage des facteurs de transcription par un minicercle sera déterminé en étudiant l’activité cytotoxique sur différentes lignées cellulaires tumorales; ce travail sera accompagné par une étude sur i) la délivrance, le trafic intracellulaire du minicercle et la colocalisation leurre-cible par microscopie confocale et cytométrie en flux ii) le mécanisme d’action du Ecole Doctorale « SSBCV » Site Orléans Bât. Physique-Chimie Rue de Chartres B.P. 6759 45067 ORLÉANS 02 38 49 48 25 02 38 49 48 29 minicercle en déterminant l’inhibition de la transcription des gènes sous la dépendance des facteurs de transcription ciblés (système rapporteur de la transcription, amplification quantitative de l’ARN de gènes cibles) iii) l’interaction physique des protéines ciblées avec un minicercle biotinylé par expérience de « pull down » et immunoblotting 2) in vivo, l’activité antitumorale d’un minicercle ciblant les facteurs de transcription NF-kB, STAT3 et Ets-1 sera déterminée chez la souris par injection locale de l’acide nucléique dans une tumeur ectopique luminescente (génétiquement modifiée par le gène de la luciférase) (tumeur mammaire murine et tumeur humaine de carcinome broncho-alvéolaire); la quantité de minicercles dans la tumeur sera déterminée en fonction du temps par une méthode d’amplification spécifique du minicercle (effet dose/réponse). Une étude sur l’activité toxique du minicercle sera réalisée en parallèle. Au cours de ce projet, la délivrance intracellulaire du minicercle sera optimisée grâce à l’expertise de notre équipe dans le domaine du transfert d’acides nucléiques par des méthodes non virales; les expérimentations animales seront réalisées au CIPA dans le service du Dr. A. Lepape (TAAM, CNRS, Orléans). Ecole Doctorale « SSBCV » Site Orléans Bât. Physique-Chimie Rue de Chartres B.P. 6759 45067 ORLÉANS 02 38 49 48 25 02 38 49 48 29