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ENSCM_S7_BIOCH_TP_Biotechnologie_Parcours_Etudiant_Introductio
n
Created by jvignon
Année 2016-2017 - Rotation des séances de TP
Groupe A
Date
Clonage
Purification
Electrophorèse
Cinétique enzymatique
28/10
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
14/11
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
21/11
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
05/12
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
Groupe B
Date
Clonage
Purification
Electrophorèse
Cinétique enzymatique
08/11
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
15/11
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
28/11
9, 10, 11, 12,
1, 2, 3, 4,
13, 14, 15, 16
5, 6, 7, 8
06/12
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
Groupe C
Date
Clonage
Purification
Electrophorèse
Cinétique enzymatique
25/10
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
10/11
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
29/11
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
07/12
1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 8
9, 10, 11, 12,
13, 14, 15, 16
PRELIMINAIRES
Le vocabulaire utilisé pans le polycop ne vous est pas forcément familier. En fin
d'introduction, vous trouverez un glossaire (également accessible sur la plateforme
pédagogique) vous fournissant les définitions correspondant aux termes employés. Lors de
leur première apparition dans le texte ces termes sont indiqués par la présence d'un
astérisque (*).
Les TP devront être préparés avant la séance. Pour cela consulter le tableau des
rotations au début dude l'introduction
Pour chaque atelier, vous trouverez des éléments utiles (protocoles de certaines
mesures, utilisation du matériel…) à sa préparation sur la plate-forme pédagogique
(Vignon, Deuxième année étudiants, Chimie Organique et Biologique, tronc commun-TP
Biochimie, dossier Documentation). En particulier, il est important de consulter la
notice d'utilisation des micropipettes.
Durant les séances, chaque binôme doit préparer ses propres solutions (pas de
partage des solutions par paillasse ou de solutions communes pour plusieurs binomes).
CONSIGNES DE SECURITE
Dans la salle de travaux pratiques, le port de la blouse et des lunettes de protection
est obligatoire.
Les produits toxiques (acrylamide, bromure d’étydium (BET), β-mercaptoéthanol,
solution de nickel) doivent être manipulés avec des gants (latex ou nitrile). En cas de
renversement de produits toxique, cela doit être signalé à l’enseignant responsable et la
paillasse doit être immédiatement nettoyée avec du Sopalin ou une éponge. Quand les
produits doivent être manipulés sous hotte, cela sera indiqué par l’enseignant.
Chaque binôme dispose d’une demie paillasse pour effectuer son travail, ce qui lui
laisse la place nécessaire pour s’organiser de manière optimale.
GESTION DES DECHETS
Tous les consommables (pointes de micro pipettes, tubes plastiques (Eppendorf,
Falcon, hémolyse), cuvettes de spectrophotomètre, …) ont un coût très élevé et le travail
doit être planifié pour limiter leur consommation et donc minimiser la production de
déchets.
A chaque atelier correspond la production de déchets spécifiques qui seront collectés
dans les conteneurs appropriés. Leur localisation est indiquée dans la salle de TP. Chaque
paillasse dispose d’une poubelle dans laquelle seront collectés les déchets non triés
(sopalin usagé, pointes de micropipettes, tubes plastiques, cuvettes vides de
spectrophotomètre, pipettes pasteur, …).
Les poubelles noires sont réservées au déchets en verre. Ne pas y jeter les cuvettes
de spectrophotomètre en plastique.
DEROULEMENT DE LA SEANCE DE TP.
La salle de TP sera fermée de 12 h 30 à 13 h 30. Il est essentiel d’organiser
votre travail en tenant compte de cette interruption.
La séance débute par une interrogation écrite de 10 à 15 minutes, comportant
3 à 5 questions se rapportant à la théorie, à la préparation de la manipulation et la
connaissance des prés requis. Ces questions ont pour but : (1) de déterminer
comment la partie théorique a été assimilée ; (2) vérifier que l'expérience qui doit
être menée est bien comprise et préparée.
Dans le polycopié, pour chaque atelier, vous trouverez les prés requis à
connaître et une liste non limitative de questions qui sont susceptibles d'être posées.
Le matériel commun (balances, spectrophotomètres, pH-mètres, …) doit être
maintenu parfaitement propre. En cas de manquement à cette règle, la note de
manipulation de l'ensemble du groupe de TP sera diminuée.
PRESENTATION ET CONTENU DES COMPTES RENDUS
Les comptes rendus de TP, au format pdf, devront être remis par mail au plus
tard à J+7 à 17 heures après le TP. Le compte-rendu devra refléter le travail
personnel de chaque binôme. Tout CR remis après l'heure limite ne sera pas pris en
compte et sera noté zéro.
Les CR (format pdf) doivent être remis à :
Atelier clonage : [email protected]
Atelier purification : [email protected]
Atelier électrophorèse : [email protected]
Atelier enzymologie : [email protected]
Le compte-rendu sera organisé de la manière suivante
- NOMS ET PRENOMS, GROUPE, N° DE BINOME
- INTITULE ET DATE DU TP
- SECTION RESULTATS
- ANALYSE-DISCUSSION DES RESULTATS
Le compte rendu ne devra pas exéder 5 pages, y compris figures et annexes
Dans la rédaction du compte rendu, ne pas reprendre les parties "méthodologie" et
"principe de l'expérience" ou "introduction" qui sont suffisamment développées dans le
poly ou en cours. Les notions théoriques nécessaires (vues en cours ou en TD (se rappeler
de la 1ère année et des enseignements des matières autres que la biochimie)) devront être
utilisées dans l'analyse et la discussion des résultats.
Le compte-rendu débutera directement par la partie "résultats". Dans celle-ci, doivent
impérativement figurer :
- 1- La préparation des solutions et tampons nécessaires (pesée, volume, pH, ...). Il est
inutile de recopier les tableaux du polycopié qui ont été vérifiés par les enseignants ;
- 2- L’explication claire et formelle des calculs ;
- 3- La compilation des résultats complets sous forme de tableaux les plus simples possible.
Dans ces tableaux, on doit retrouver les données expérimentales brutes initiales ;
- Quand les résultats proviennent de données graphiques (enregistrement d'activité
enzymatique, gel d'électrophorèse ...) celles-ci doivent être fournies avec le compte rendu ;
- Lors de la réalisation de graphiques, il est important de choisir une échelle qui permette
une bonne lisibilité (ce n'est pas obligatoirement le graphe qui occupe toute la page ...). Un
même graphe peut comporter plusieurs courbes qui devront être clairement différenciées
les unes des autres (symboles visibles de couleurs ou de forme différentes). Chaque graphe
doit comporter des échelles clairement définies avec les unités et une légende sur chaque
axe.
- Les courbes rendant compte des points expérimentaux ne doivent pas être définies par
une interpolation ou une équation polynomiale de degré n. Les courbes doivent refléter le
phénomène observé en fonction des équations qui le gouvernent.
- Dans tous les cas où cela est possible, un calcul d'erreur devra être effectué.
La partie résultats sera suivie par une interprétation critique des résultats et une
discussion. Cette discussion devra vous permettre de mettre en exergue les conclusions
que vous tirez du TP : avantage des techniques, simplicité, précision etc... Elle doit surtout
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