SpecifExportShanoir

Spécifications : bouton d’export – Shanoir
Introduction
Afin de pouvoir répertorier les données IRM stockées dans Shanoir-OFSEP (informations études,
centres, patients, examens, séquences, etc.), il est nécessaire de créer un bouton d’export. Cela
permettra de connaitre à tout moment quelles sont les données OFSEP imagerie disponibles.
Intégration dans Shanoir
Ce bouton sera accessible à l’administrateur de la plateforme Shanoir-OFSEP uniquement. Il pourra
par exemple prendre la forme d’une nouvelle ligne « Download export file » dans le menu déroulant
« Action ».
Format de sortie
Le fichier d’export sera au format suivant :
-
format : txt
séparateurs : tabulations
encodage : ANSI (de préférence)
saut de ligne CRLF (de préfèrence)
Contenu
Le fichier d’export se limitera aux études dont le nom commence par « Cohorte Principale ». Les
patients dont le common name commence par « TestDummyRun » seront exclus.
Les colonnes suivantes apparaitront dans cet ordre dans le fichier d’export :
Colonne
Nom de la colonne du fichier d’export
id patient
patient_id
common name shanoir
shanoir_name
double hash
double_hash
hash nom de naissance
birthname1
hashphon1 nom de naissance
birthname2
hashphon2 nom de naissance
birthname3
hash nom
lastname1
hashphon1 nom
lastname2
hashphon2 nom
lastname3
hash prénom
firstname1
hashphon1 prénom
firstname2
hashphon2 prénom
firstname3
hash ddn
birthdate1
sexe
sex
année de naissance
birth_year
id study
study_id
study
study_name
id centre
center_id
centre
center
constructeur
device_manufacturer
modele machine IRM
device_model
champ magnetique machine IRM
device_field_strength
n° machine IRM
device_serial_number
Antenne émettrice
emitting_coil
Antenne réceptrice
receiving_coil
id examen
examination_id
date d'examen
examination_date
protocolName
protocol_type
identifiant shanoir IRM (id sequence)
sequence_id
nom de séquence
sequence_name
nouveau nom de sequence
norm_sequence_name