L’effet du changement climatique sur l’écologie microbienne et la salubrité alimentaire Lee-Ann Jaykus, Ph.D. Professeur et ancienne directrice de l’IAFP Changement climatique: fait ou fiction? Le « changement climatique » se définit comme étant une variation de la distribution statistique des conditions météorologiques sur une période de temps se situant entre des dizaines et des millions d’années. L’expression populaire réfère aux changements dans le climat moderne, parfois qualifiés d’anthropogènes ou plus généralement de « réchauffement planétaire ». En 2007, le Groupe d’experts intergouvernemental sur l’évolution du climat (GIEC) a conclu que le réchauffement climatique est une réalité, puisque : Les changements observés au cours du dernier demi-siècle ne correspondent pas à une variabilité naturelle et Le modèle de changement est conforme à l’impact de l’activité humaine Quelles sont les activités anthropogènes majeures ? Concentrations accrues de gaz à effet de serre Changements globaux au territoire Développement Déforestation Concentrations accrues d’aérosols atmosphériques Les preuves Épaisseur moyenne des glaciers, changement (cm/an) Épaisseur moyenne cumulative, changement (m) Niveau de la mer (mm) Gaz carbonique atmosphérique mesuré à Mauna Loa, Harr all Année Manifestations et prédictions Changement de température Variations météorologiques associées Augmentation prévue de 1,8 - 4o C pour le prochain siècle De nature régionale Humidité et pluies plus abondantes Davantage de zones arides Changements associés des courants marins/temp. (ENSO) Manifestations Événements météo catastrophiques • Inondations • Sécheresses • Ouragans Changements dans la dynamique des populations Changements dans la production agricole Eutrophisation (excès de nutriments) Les liens entre le changement climatique et la salubrité alimentaire Prémisse 1 : L’eau est intimement liée à la salubrité et sécurité alimentaires et les deux sont inséparables Prémisse 2: Les principales manifestations des changements climatiques sont les variations de température et un surplus de nutriments, lesquels ont un impact sur l’approvisionnement et l’innocuité des aliments de la terre et l’approvisionnement en eau Prémisse 3: Il en résulte des changements dans l’écologie, les personnes, les animaux, les organismes nuisibles et les microbes Prémisse 4: Ces changements dans l’écologie ont des conséquences inattendues sous forme de risques pour la santé humaine Changements anticipés en matière d’innocuité alimentaire Eau Fréquence et distribution de contaminations d’origine alimentaire Disponibilité perturbée Sécheresse Inondation Événements météorologiques catastrophiques L’aspect saisonnier Distribution Émergence de pathogènes Exemples L’eau: le dénominateur commun Vive/aérosol Fourrages Sol Eau Bétail Aliments Humains L’importance de la disponibilité de l’eau Il est essentiel de disposer d’eau propre en abondance pour la production, la transformation et la préparation des aliments; Sans eau, une hygiène adéquate est impossible; Trop d’eau => risque accru de contamination fécale; La qualité/sécurité de l’eau est mal distribuée (les pays développés sont favorisés) Les changements climatiques exacerbent les inégalités Distribution mondiale des risques de sécheresses Distribution mondiale des risques d’inondations Conséquences des événements météo catastrophiques Perte des infrastructures Déplacement des populations Ouragan Katrina – rien qu’un exemple Clin. Infect. Dis. 44:1032-1039 Fréquence et distribution de la maladie: Un phénomène saisonnier Plusieurs maladies entériques augmentent selon la saison, vraisemblablement en lien avec les températures plus chaudes L’incidence de la maladie causée par Salmonella ou Campylobacter atteint un sommet 2-14 jours après une période chaude Pour Cryptosporidium, Giardia, et Shigella, ce sommet survient ~40 après la période chaude Source : Naumova et al., 2007 L’espèce pathogène du genre Vibrio Il s’agit d’organismes marins ubiquistes associés aux aliments et de maladies véhiculées par l’eau (V. cholerae, V. parahaemolyticus, V. vulnificus) Maladie plus fréquente à cause de V. parahaemolyticus, dont la souche émergeante O3:K6 Éclosions aux É.-U. vers la fin des années 1990 (les états du nord) Emergence de la souche pandémique (O3:K6) L’inquiétude gagne l’Europe Des souches encore plus virulentes? Emergence d’autres biotype 3 V. vulnificus Régions où une éclosion ou la présence de V. parahaemolyticus a été signalée sans confirmation du statut pandémique de la souche Régions ou pays où un clone pandémique de V. parahaemolyticus s’est propagé Figure 1. La distribution mondiale de la souche O3:K6 de V. parahaemolyticus et ses variants sérologiques Source : Nair et al., 2007 Fréquence et distribution de la maladie: Géographie et température Épidémie de choléra en Amérique Latine (début des années 1990) sans doute une extension de la 7e pandémie dans le monde occidental, reliée Au commerce international accru À la hausse des températures des eaux Cas de choléra par 100 000 personnes Source : Gil et al., 2004 Vibrio cholerae : Un exemple des interactions entre microbe, climat et l’environnement Le choléra est endémique dans certaines zones, augmentant en association avec la hausse de la température à la surface et le niveau de la mer L’écologie microbienne de V. cholerae est complexe et influencée par plusieurs facteurs : Abiotique Phytoplancton Zooplancton Interaction de facteurs écologiques et la prolifération de V. cholerae : Certains chercheurs croient que la prolifération du phytoplancton photosynthétique augmente le pH du milieu. Ce pH plus alcalin i) Donne un avantage compétitif à V. cholerae sur d’autres bactéries marines et ii) Permet à V. cholerae de s’attacher au zooplancton (surtout les copépodes) et de se protéger ainsi des stress de sources externes. Production des toxines ? La chute des populations de phytoplancton met plus de nutriments à la disposition du pathogène. Ces deux facteurs contribuent à augmenter énormément les nombres de V. cholerae, en association étroite avec les copépodes. Ingestion d’une dose infectieuse de V. cholerae Prolifération de V. cholerae, associée aux copépodes commensaux Transmission aux humains Zooplancton: copépodes, autres crustacées Les algues appuient la survie de V. cholerae et fournissent des nutriments pour le zooplancton Phytoplancton et plantes aquatiques Rayonnement solaire, Conditions abiotiques favorisent la croissance de V. cholerae et/ou du plancton et l’expression de la virulence Température, salinité, pH Facteurs saisonniers •Rayonnement solaire •Température •Précipitation •Moussons Facteurs socioéconomiques, démographiques, hygiéniques Variabilité climatique •Changement climatique •El Nino (oscillation méridionale) •Oscillation atlantique du nord Fe3+ Figure 1. Modèle hiérarchique pour la transmission environnementale du choléra Source : Lipp et al., 2002 La prolifération d’algues nuisibles— Autre exemple Causée par les dinoflagellés toxiques D’habitude la conséquence d’une surcharge de la colonne d’eau en nutriments, conjuguée à une hausse de température Associée aux maladies du genre : L’empoisonnement Ciguatera L’empoisonnement neurotoxique aux fruits de mer L’empoisonnement paralytique aux fruits de mer, . . . D’habitude limitée à certaines zones et saisons, mais de plus en plus répandue et fréquente Sans doute le résultat d’une combinaison du changement climatique et la pollution Distribution mondiale des floraisons d’algues nuisibles, 1970 versus 2000 Sources : Dolah (2000) et Gilbert et al. (2005) Maladie zoonotique Transmise aux humains via des réservoirs animaux Changement climatique Augmente la susceptibilité des animaux aux maladies Élargit la distribution et augmente l’abondance des vecteurs ou réservoirs Prolonge les cycles de transmission des vecteurs Affecte les pratiques élevage Augmente l’usage vétérinaire et les résidus des produits médicaux (antibiotiques) La maladie Chagas Une trypanosomiase causée par le parasite intracellulaire Trypanosoma cruzi transmis par les insectes Hausses de température Accélère de développement du pathogène chez le vecteur Raccourcit le cycle de vie du vecteur et Augmente la densité de la population du vecteur Transmission alimentaire documentée récemment en Amérique Central et du Sud (les jus) Source : Lambert et al., 2008 Les mycotoxines Composés très toxiques produits par des moisissures Aspergillus (aflatoxine) Fusarium (trichothecènes) Maïs, riz L’humidité, les températures plus chaudes favorisent la croissance des moisissures Les conditions nuisibles aux plantes (stress occasionnés par la sécheresse, les insectes ou vers, déficience en nutriments) favorisent la production des mycotoxines Température, humidité et précipitation Pourcentage des graines de coton ayant une teneur en aflatoxine > 20 ng/g Un exemple d’aflatoxine L’infection, facilitée par le dommage physique (p. ex. attaque d’insecte) s’installe avant la récolte pendant des conditions chaudes et sèches Prolifération de la moisissure et production de sa toxine, pendant la maturation et post-récolte (favorisées par la chaleur, l’humidité et d’autres dommages aux récoltes) Source : Cotty et Jaime-Garcia, 2007 Pourquoi le changement climatique affecte la salubrité alimentaire Prémisse 1: La salubrité alimentaire et l’eau sont intimement liées; on ne peut pas les séparer Prémisse 2: Le changement climatique se manifeste surtout en termes de débordements de température et de charge en nutriments des cours d’eau, ce qui affecte la sécurité de l’approvisionnement planétaire des aliments et de l’eau Prémisse 3: Le résultat principal des augmentations de température et de charge en nutriments sont des perturbations d’ordre écologique, démographique, agricole, entomologique et microbiologique Prémisse 4: Les changements écologiques ont des conséquences inattendues en termes de risques pour la santé humaine Alors, on fait quoi ? Des modèles prédictifs Plus de recherches Surveillance épidémiologique accrue Contrôles, dépistage et détection Coordination et veille Coopération international Et si l’on pouvait prévenir ? Conclusions Le changement climatique aura un impact sur la salubrité alimentaire, à cause de : Son effet sur la disponibilité de l’eau Son effet sur la fréquence et la distribution des maladies transmises par les aliments et l’eau L’émergence de pathogènes Il existe apparemment déjà des exemples des effets significatifs du changement climatique sur les maladies d’origine alimentaire Il s’agit de l’écologie Malheureusement La tendance se poursuit Les effets ne sont pas tous prévisibles