Concours blanc PAES – Tutorat PSA Samedi 12 Mars 2011 MS1 : Sources des principes actifs Méthodes d’étude et d’analyse du génome _______________________________________________ Durée : 30 minutes Documents et calculatrices interdits RECOMMANDATIONS IMPORTANTES AVANT DE COMMENCER L’EPREUVE Vous avez à votre disposition un fascicule de 20 QCM. (Réponses à reporter sur la grille de QCM) Assurez-vous que ce fascicule comporte bien 8 pages en comptant celle-ci. Dans le cas contraire, prévenez immédiatement un tuteur. AUCUNE RECLAMATION NE SERA ADMISE PAR LA SUITE OBLIGATIONS CONCERNANT LA FEUILLE DE REPONSES AUX QCM : Vous devez absolument utiliser un stylo ou un feutre noir pour cocher votre réponse définitive sur la feuille de réponses. Les feuilles de réponses remplies au crayon seront affectées de la note zéro. En cas d’erreur à l’encre, n’hésitez pas à demander une autre grille de réponses, l’usage de stylos correcteurs (blancs) étant vivement déconseillé. Il vaut mieux remplir une nouvelle feuille sur laquelle vous devrez reporter vos : NOM, PRENOM, N° de TUTORAT et N° de DOSSIER Ce sujet a été réalisé par les tuteurs de cette matière dans son intégralité. En aucun cas ni les professeurs, ni la faculté ne sauraient être tenus responsables de la validité des informations qui y sont délivrées. 1 Question 1 : Parmi les propositions suivantes concernant les principes actifs d’origine naturelle, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A/ Une drogue végétale désigne la partie du végétal qui va être utilisée à des fins médicinales. B/ L’utilisation d’un solvant apolaire est nécessaire pour extraire un principe actif. C/ L’extraction permet l’accès direct à de molécules n’existant pas à l’état naturel. D/ Les mélanges complexes produits directement par hémisynthèse sont constitués de plusieurs composés organiques purs. E/ La synthèse totale est une technique d’extraction plus efficace que l’hémisynthèse. Question 2 : Parmi les propositions suivantes concernant les exemples des sources de principes actifs d’origine naturelle, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A/ La modification de la chaine latérale de la pénicilline G la rend plus stable en milieu acide. B/ La naloxone reproduit l’effet de la morphine et de l’héroïne. C/ La majorité des hormones sexuelles sont fabriquées à partir de molécules contenant déjà un noyau tétra cyclique. D/ La vinblastine et la vincristine sont des molécules anti-tumorales. E/ L’action antalgique de la morphine est plus faible que celle de la codéine. Question 3 : Parmi les propositions suivantes concernant les principes actifs utilisés dans les médicaments de synthèse, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A/ Un agoniste est une molécule activant une protéine réceptrice qui possède la même activité qu’une molécule de l’organisme. B/ Un analogue structural peut résulter de la pharmacomodulation d’une molécule. C/ Un pharmacophore est une molécule ayant subi une optimisation pharmacologique et pharmaceutique. D/ Les groupes bioisostères classiques possèdent des encombrements stériques différents. E/ Une prodrogue est une molécule pharmacologiquement inactive. Question 4 : Parmi les propositions suivantes concernant les exemples des sources de principes actifs des médicaments de synthèse, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A/ B/ C/ D/ E/ L’hydrolyse de l’ampicilline produit de la bacampiciline. La chlorpromazine possède un noyau bi cyclique. Le dicoumarol est une molécule symétrique. L’indométacine possède une structure de stéroïde oxygéné. Le noyau aromatique de la noradrénaline porte un amino-alcool. 2 Question 5 : Les vecteurs utilisés en biotechnologie A/ sont intégrés dans des cellules (ou organismes) hôtes qui produisent des protéines dites recombinantes. B/ peuvent être issus des produits de l’expression d’un gène d’intérêt. C/ sont toujours transférés dans des cellules somatiques dans la thérapie cellulaire. D/ sont toujours transférés dans des cellules embryonnaires dans la transgénèse. E/ peuvent être injecté directement dans l’organisme en ciblant le tissu à traiter. Question 6 : Les biomolécules A/ sont produites par synthèse ou hémisynthèse organique. B/ ont une cible extracellulaire. C/ ont une plus grande spécificité de liaison à leur cible que les molécules de synthèse. D/ se lient de façon rapide et réversible à leurs cibles. E/ agissent par leur activité protéasique. Question 7: Quels sont les produits pouvant être issus de l’ADN recombinant ? A/ B/ C/ D/ E/ Les anticorps polyclonaux Les médicaments dérivés du sang Les acides nucléiques Les plasmides Les antibiotiques Voici la représentation d’une molécule : Question 8 : Cette molécule fait partie de la classe des A/ alcaloïdes. B/ terpènes. C/ protides. D/ hétérosides. E/ lipides. 3 Voici la représentation d’une molécule : Question 9 : Il s’agit de la A/ morphine. B/ codéine. C/ thébaïne. D/ naloxone. E/ buprénorphine. Voici la représentation d’une molécule : Question 10 : Parmi les propositions suivantes concernant cette molécule, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A/ Il s’agit d’une prodrogue. B/ La modification de son cycle aromatique permet d’obtenir des antihypertenseur. C/ Elle peut être obtenue par hydrolyse de la liaison N=N de la sulfanilamide. D/ L’ajout d’une fonction urée à l’azote primaire porté par le soufre donne un antibactérien. E/ Elle contient une fonction pyrimidine. 4 Exercice (Cécile, Tantely) On décide d’étudier le gène de la ϐ globine, protéine exprimée uniquement dans les cellules sanguines de l’organisme. Ce gène fait 767 bp. On décide d’étudier l’exon 1 du gène qu’on amplifie par PCR. En majuscules l’exon1. En gras et en minuscules : séquences à partir desquelles seront synthétisées des amorces pour la première PCR. 1 atcctgagca tgtttttgtc cctgtcacca tctcacaatc cttaactaat actaaaatgg 61 tttgaataga actccttcct agtctgatgc ttagctacac tccatggatc attctggaag 121 aaggagaatg ggagagatgg CATGCATCGT GGAGGATGCG AGGGGAAGAA CAGAGGGTGA 181 AAATGGGGAA TGAGTGGAAA ATAATGTTGA GGATACAGGA GGACCTAACA aacgaaagat 241 gtctcaggaa ccaacaggtt atcatacact caatatacat ctccttgctg accatcagct 301 gacctgactc cacccctgag ggacacagcc taaccttgac caatgacttc aaaggacaag Question 11 : Parmi les oligonucléotides suivants, indiquer celui (ceux) qui sera (seront) choisi(s) comme amorces : A/ B/ C/ D/ E/ ACTCAATATACAT CGAATCGATGTG ATGTATATTGAG CTCAATATACAT GCTTAGCTACAC Question 12 : Le produit PCR obtenu à l’aide des amorces synthétisées à partir des séquences représentées en gras contient A/ B/ C/ D/ E/ 168 pb. 192 pb. uniquement l’exon 1. une partie de l’intron 1 et l’exon 1. une partie de l’intron 1, l’exon 1 et une partie de l’intron 2. 5 Pour étudier plus précisément les mutations on décide d’étudier l’ADNc du gène au niveau de l’exon 1, que l’on amplifie entièrement et de façon isolée également avec une PCR. Question 13 : Parmi les oligonucléotides suivants, indiquer celui (ceux) qui sera (seront) choisi(s) comme amorces : A/ B/ C/ D/ E/ CATGCATCGTGG GAGGACCTAACA ATGTATATTGAG TGTTAGGTCCTC GCTTAGCTACAC On décide de séquencer le produit PCR obtenu. On obtient deux versions du séquençage : Voici la séquence l’ADN complémentaire du gène sans mutation 1 CATGCCATCGT GGAGGATGCG AGGGGAAGAA CAGAGGGTGA 41 AAATGGGGAA TGAGTGGAAA ATAATGTTGA GGATACAGGA GGACCTAACA Voici l’autre version. 1 CATGCCATCGT GGAGGATGTG AGGGGAAGAA CAGAGGGTGA 41 AAATGGGGAA TGAGTGGAAA ATAATGTTGA GGATACAGGA GGACCTAACA Question 14 : La séquence des ADNc présentés A/ est la même que celle de l’ADN génomique au même niveau. B/ est la même que celle de l’ARNm correspondant (avec des dTTP à la place des UTP) C/ peut être obtenue à partir de toutes les cellules de l’organisme. D/ peut être obtenue uniquement à partir des cellules sanguines de l’organisme. E/ peut être obtenue par séquençage avec la méthode de Sanger. Question 15 : La mutation observée A/ B/ C/ D/ E/ est non sens. est faux sens est une transversion. n’entraine pas de modification de la séquence protéique. entraine le remplacement d’une alanine par une valine dans la protéine. 6 Application médicale On cherche à connaître le génotype d’une patiente souffrant d’une thalassémie de type B, maladie causée par un déficit de la ϐ globine. Les techniques de séquençage vues précédemment nous montrent que deux mutations au niveau de l’exon 1 de ce gène sont fréquemment retrouvées. Le séquençage du gène de la mère de la patiente montre une homozygotie pour la mutation 1 et une hétérozygotie pour la mutation 2. On appelle allèle 1 la version du gène au niveau du site de la mutation 1, et allèle 2 la version du gène au niveau du site de la mutation 2. On admet qu’il n’y a pas d’autres mutations possibles au niveau de ce gène. Question 16 : En s’aidant des données de l’énoncé et des connaissances de vos connaissances, vous pouvez affirmer que le séquençage de l’ADN génomique de la mère par la méthode de Sanger A. montre obligatoirement au moins deux bandes au même niveau sur l’électrophorèse correspondante s’il y a une substitution. B. nécessite la présence de désoxythymidine tri-phosphate dans les quatre puits du dispositif de l’électrophorèse. C. peut être réalisé avec l’ADN de toutes les cellules de l’organisme. D. peut être réalisé uniquement avec l’ADN de cellules sanguines de l’organisme. E. permet d’obtenir la séquence du gène de la ϐ globine. Chez cette patiente, le gène est amplifié par PCR et ensuite digéré par une enzyme de restriction Sfa N1. On réalise la même manipulation chez les parents de la malade et un sujet ne présentant aucune mutation pour obtenir les résultats suivants sur la série d’électrophorèses. 7 Question 17 : Uniquement à partir de cette série d’électrophorèse on peut affirmer que A/ B/ C/ D/ E/ tous les sujets ont au moins un site de restriction. la présence d’une des deux mutations révèle un site de restriction. la présence des deux mutations révèle deux sites de restriction. la mère est hétérozygote pour la mutation 1 et homozygote pour la mutation 2. le père est homozygote pour les deux allèles. Question 18 : Parmi les tailles de fragments d’ADN suivantes en bp laquelle (ou lesquelles) peut-on obtenir chez un sujet homozygote pour la mutation 1 ? (*sss*) A. 485 B. 453 C. 394 D. 314 E. 262 Question 19 : Parmi les tailles de fragments d’ADN en bp de la question 3 laquelle (ou lesquelles) peut-on obtenir chez un sujet homozygote pour la mutation 2 ? (*sss*) Question 20 : La patiente est donc A/ B/ C/ D/ E/ homozygote pour les deux allèles. hétérozygote pour les deux allèles. hétérozygote pour la mutation 1 homozygote pour la mutation 2 homozygote pour la mutation 1 et hétérozygote pour la mutation 2 Question 69 : Ce sujet était (plusieurs réponses possibles) A/ B/ C/ D/ E/ trop long pas assez long trop dur pas assez dur parfait ! Ce sujet a été réalisé par Cécile et Tantely. Merci aux PAES du forum concernés de leur contribution pour la partie « Sources des principes actifs » par leurs prises de notes, merci particulier à Piotr. Pour d’éventuelles questions sur ce sujet et cette matière, n’hésitez pas à aller sur le forum du tutorat : http://forum.tutoratpsa.org/ 8