marie chavent - Institut de Mathématiques de Bordeaux

MARIE CHAVENT
- MARS 2016 -
Née le 5 mai 1969, mariée, 2 enfants.
Courriel : [e-mail]
Web : http://www.math.u-bordeaux1.fr/~machaven/
Thèmes de recherche : modélisation statistique, réduction de dimension et apprentissage statistique.
Situation actuelle
Maître de Conférences Hors Classe – HDR, Université de Bordeaux.
Membre des équipes :
- OptimAl, IMB (Institut de Mathématiques de Bordeaux), UMR 5251
- CQFD, INRIA Bordeaux Sud-Ouest.
Parcours professionnelle
2014- Maître de Conférences, Université de Bordeaux, Collège Sciences et Technologie, UF
Mathématique et interactions.
2007-2014 Maître de Conférences, Université Bordeaux 2, UFR Sciences et Modélisation.
1998-2007 Maître de Conférences, IUT Michel de Montaigne, Université Bordeaux 3.
1996-1998 ATER, Université Panthéon-Assas Paris-II.
Diplômes
2008 Habilitation à diriger les recherches, Université Bordeaux 1.
Contributions en classification automatique et en réduction de dimension.
Rapporteurs : A. Bar-Hen (U. Paris Descartes), P. Besse (INSA Toulouse), G. Govaert (UTC).
1997 Doctorat de Mathématiques Appliquées, Université Paris-IX Dauphine.
Analyse des données symboliques, une méthode divisive de classification.
Rapporteurs : A. Guénoche (Institut de Mathématiques de Luminy), G. Saporta (CNAM)
Directeurs de thèse : E. Diday (U. Paris IX) et Y. Lechevallier (Inria Rocquencourt)
1993 DEA MAI, Mathématiques Appliquées à l’Ingénierie, Université Paris-IX Dauphine.
Responsabilités scientifiques et collectives
Responsabilités nationales et locales
2015- Membre nommée à la commission nationale d’évaluation d’INRIA (CE INRIA).
2015- Responsable permanent de l’équipe INRIA CQFD.
2015- Elue au conseil de laboratoire de l’Institut Mathématique de Bordeaux (IMB) .

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2011-2015 Membre élue au Conseil National des Universités (CNU) en 26ème section.
2007-2010 Membre élue au Conseil de la Société Française de Statistique (SFdS) en tant que
secrétaire adjointe (2009-2010) et webmestre (2008-2009).
2004-2006 Elue au conseil du laboratoire de Mathématiques Appliquées de Bordeaux (MAB).
Organisation de manifestations scientifiques
2016 Vice présidente du comité de programme des 5èmes Rencontres R, Toulouse.
2015 Membre du comité de programme des 22èmes rencontres de la Société Francophone de
Classification.
2014 Membre du comité de programme des 3èmes Rencontres R, Montpellier.
2013- Co-fondatrice et co-organisatrice du groupe de lecture SMILING in Bordeaux (Statistical
MachIne LearnING Reading Group).
2013 Membre du comité d’organisation de Statlearn’13, 8-9 avril à Bordeaux.
2012 Co-créatrice et présidente du comité d’organisation des Premières Rencontres R,
Bordeaux.
2006-2007 Responsable du séminaire Probabilités-Statistique de l’Institut de Mathématiques de
Bordeaux.
2009 Trésorière adjointe des 41èmes Journées de Statistique, 25-29 mai 2009 à Bordeaux.
2004 Présidente du comité d’organisation des 11èmes rencontres de la Société Francophone de
Classification.
Responsabilité pédagogique
2009-2014 Co-responsable de la spécialité de master Modélisation Statistique et Stochastique
(Master MIMSE) de l’Université de Bordeaux.
Comités de sélection et jurys
2016 Membre du jury du concours CR2 INRIA Nancy Grand-Est.
2014 Membre du jury du concours CR2 INRIA Bordeaux Sud-Ouest.
2011 Membre de trois comités de sélection MCF 26 (IUT de Vannes, Université de Poitiers,
ISPED, Université Bordeaux 2).
2009 Membre d'un comité de sélection MCF 26 à l'Université Toulouse 1.
2008 Membre expert du jury du concours externe CNRS d’ingénieur d’étude.
2007-2008 Membre de la commission de spécialistes section 26 de l’Université Bordeaux.
Relecture d’articles
2000- J’ai été rapporteur d’articles scientifiques a de nombreuses reprises (journaux : PLOS
one, Electronic Journal of Applied Statistical Analysis, Advances in Data Analysis and
Classification, Neural Processing Letters, Journal de la SFdS, Computational Statistics
and Data Analysis, Pattern Recognition Letters, IEEE Trans. on Fuzzy System).
2004 Co-éditrice invitée du numéro spécial Classification et Fouille des Données de la Revue
des Nouvelles Technologies de l'Information.
Diffusion scientifique
Programmes de recherche et contrats
2014- PEPS IMB-AMIES avec la startup Matchable : Prédiction de comportement de joueurs
de jeux vidéos.

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2015-2016 Projet Labex CPU TIMIC : Analyse de graphe cérébral de connectivité au repos.
2013-2016 Contrat de collaboration de recherche entre l’Inria et la PME Evollis : Systèmes de
recommandation bayésiens.
2014-2015 Projet InterLabex CPU-TRAIL : Analyses statistiques de bases de données
multidimensionnelles d’imagerie cérébrale.
2011-2015 ANR ADAPTEAU du programme CEP&S: Adaptation aux Variations des Régimes
Hydrologiques dans l’Environnement Fluvio-Estuarien de la Garonne-Gironde.
2010-2013 Projet région PSI : Psychology and Sounds Interactions. Prédiction de l’état de vigilance
à partir de signaux électroencéphalographiques (EEG).
2010 Contrat de recherche Air Breizh-ARCANE/CENBG : Identification et recherche de la
contribution de sources de particules fines sur l’agglomération de Saint Malo.
2010 Danone : contrat d’accompagnement du monitorat conseil de V. Kuentz.
2008-2009 Contrat de recherche VNF : Définition de la méthodologie statistique d’une enquête par
sondage des navigants plaisanciers sur le canal des deux mers.
2004-2006 APR Particules du programme PRIMEQUAL : Développement de modèles source-
récepteur adaptés à la quantification des sources de pollution atmosphérique.
2003 Contrat de recherche MAAPAR (Ministère de l'Agriculture, de la Pêche et des Affaires
Rurale) : Traitement statistique des informations sur les incendies de forêts.
1999-2002 CEA-CESTA : Recherche de règles de décision par discrimination et régression non
standard.
1995-1997 Projet européen SODAS : classification divisive et analyse de données symboliques.
Développement de paquets R
− Le paquet PCAmixdata
Ce paquet est dédié à l'analyse factorielle de données mixtes. Il propose principalement une
méthode d’ACP pour données mixtes (quantitatives et qualitatives) appelée PCAmix, une méthode
de rotation orthogonale des composantes de PCAmix et une méthode d’AFM de données mixtes à
l’intérieur des groupes.
http://cran.r-project.org/web/packages/PCAmixdata/index.html
− Le paquet ClustOfVar
Ce paquet propose principalement deux méthodes de clustering de variables qui fonctionnent pour
des données mixtes (quantitatives et qualitatives) et une méthode de type bootstrap pour l’aide au
choix du nombre de cluster. Chaque cluster est caractérisé par une variable synthétique quantitative
et ClustOfVar peut être utilisé comme outil de réduction de dimension et de recodage de données
en données quantitatives, au même titre que PCAmix.
http://cran.r-project.org/web/packages/ClustOfVar/index.html
− Le paquet ClustGeo
Ce paquet est dédié au clustering de données multivariées, pour lesquelles proximités
géographiques sont connues. Ces contraintes géographiques sont intégrées dans une approche
hiérarchique, un paramètre de d’importance de ces contraintes sur le résultats du clustering pouvant
être calibré.
http://cran.r-project.org/web/packages/ClustGeo/index.html
− Le paquet divclust
Ce paquet implémente DIVCLUS-T une méthode descendante de clustering hiérarchique basée sur
une approche de bi-partitionnement monothétique permettant de lire le dendrogramme comme un
arbre de décision. Cette méthode s'applique à des données quantitatives, qualitatives ou mixtes.
https://github.com/chavent/divclust

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Invitations
• Nov. 2015 : Séminaire de l’IECL, Université de Lorraine.
• Aout 2015 : Exposé invité aux Rencontres des Jeunes Statisticiens
• Juin 2015 : Séminaire du MIA-T de l’INRA de Toulouse.
• Mai 2014 : Invité au GDR MASCOT-NUM, working meeting « Mixed-Data », IHP Paris.
• Avril 2014 : Exposé invité à la journée thématique de la SFC, Stratégies de Classification
Non-Supervisées, IHP Paris.
• Janv. 2014 : Invitée une semaine à l’Université du Queensland, Australie.
• Fév. 2012 : Séminaire du SAMM, Paris 1.
• Juin 2008 : Conférence invitée COMPOSTAT2010, Porto, Portugal.
• Juin 2008 : Invitée au GT ECAIS, Journée Méthodes Statistiques et Pollution, INSA Rouen.
• Nov. 2008 : Séminaire du Master ECD, Université Lyon2.
• Janv. 2006 : Séminaire du LMA, Université de Pau.
Collaborations pluridisciplinaires
2012 Application de la rotation orthogonale en Analyse des Correspondances Multiples en
sociologie culturelle.
Collaboration avec Z. Lakatos (Université Polytechnique et Economique de Budapest).
2 communications orales et publication des résultats dans sa thèse de doctorat.
2009 Application de la méthode DIVCLUS-T en comptabilité financière.
Collaboration avec C. Bessieux-Ollier et E. Walliser de l’Université de Montpellier.
2 articles : Rev. Française de Gestion, Int. J. Account., Auditing and Performance Evaluation.
2008 Classification sous contraintes de contiguïté pour la définition d’échelles spatiales et le calcul
d’indicateurs de risque phytosanitaire.
Collaboration avec F. Vernier (Irstea) et Y. Lechevallier (Inria Rocquencourt).
1 article dans les actes de COMPSTAT 2008.
2007 Identification et quantification de sources de pollution par des méthodes de factorisation de
matrices sous contraintes de positivité.
Collaboration avec H. Guégan (ARCANE - CENBG).
2 articles : Environmetrics et CSBIGS.
2006 Application de la méthode DIVCLUS-T en comptabilité financière.
Collaboration avec H. Stolowy (groupe HEC).
1 article à European Accounting Review.
2002 Elaboration de taxonomies de familles de végétaux à partir de la composition en acides gras de
leurs feuilles.
Collaboration avec S. Mongrand (laboratoire de Biogenèse Membranaire UMR 5200 CNRS).
2 articles à Phytochemistry.
2000 Etude de la contamination par le mercure de certaines catégories de poissons consommés en
Guyane française.
Collaboration avec A. Boudou et R. Maury Brachet (UMR CNRS 5805 EPOC).
1 chapitre de livre et un article à la Revue Modulad.
1999 Recherche d'une typologie de la peau humaine saine.
Collaboration avec C. Guinot (CERIES) et M. Tenenhaus (groupe HEC).
1 article dans la Revue de Statistique Appliquée.

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Encadrement doctoral et scientifique
Encadrement d’ingénieurs et de post-doctorants
2015-2016 Encadrement du post-doctorat de Pascal Jacq
Prédiction de comportements de joueurs de jeux vidéo.
Financement : Start up Matchable et PEPS AMIES.
2015-2016 Encadrement d’un ingénieur sur le projet de recherche TIMIC : Alexandre Laurent
Traitement multivarié en imagerie cérébrale de cohortes: Application à l’analyse de
graphe cérébral de connectivité au repos.
Financement : projet labex CPU.
Co-encadrant : M. Jolliot (Groupe d'Imagerie Neurofonctionelle – GIN).
2014-2016 Encadrement du post-doctorat de Solveig Badillo
Advanced statistical methods for analysis of multidimensional databases of human brain
imaging.
Financement : projet InterLabex CPU-TRAIL.
Co-encadrants : J. Saracco (Inst. Polytech. Bordeaux et Inria),
B. Mazoyer (Groupe d'Imagerie Neurofonctionelle – GIN).
2014-2015 Encadrement d’un ingénieur du SED Inria Bordeaux Sud-Ouest : Marc Fuentes
Développement de DIVCLUS-T, logiciel de clustering descendant monothétique.
Encadrement de thèses
2013-2016 Encadrement de la thèse d'Adrien Todeschini
Elaboration et validation d'un système de recommandation bayésien.
Financement : PME Evollis et INRIA.
Co-encadrant : F. Caron (Université d'Oxford).
2012-2015 Encadrement de la thèse d'Amaury Labenne
Méthodes de réduction de dimension pour la construction d’indicateurs de qualité de vie.
Financement : ANR ADAPT'EAU et Irstea.
Co-encadrants : V. Kuentz (Irstea),
J. Saracco (Inst. Polytech. Bordeaux et Inria).
Thèse soutenue en décembre 2015 à l'Université de Bordeaux.
Amaury Labenne est actuellement développeur statisticien chez xlstat.
2010-2013 Encadrement de la thèse de Laurent Vézard
Réduction de dimension en apprentissage supervisé. Application à l'étude de l'activité
cérébrale.
Financement : projet région Aquitaine PSI.
Co-encadrants : P. Legrand (Université de Bordeaux et Inria),
F. Faïta (Université de Bordeaux).
Thèse soutenue en décembre 2013 à l'Université Bordeaux 1.
Laurent Vézard est actuellement Data Scientist chez engineer chez Ezakus.
2006-2009 Encadrement de la thèse de Vanessa Kuentz
Contribution à la réduction de dimension.
Financement : bourse MENRT.
Co-encadrant : Jérôme Saracco (Inst. Polytech. Bordeaux et Inria).
Thèse soutenue en novembre 2009 à l’Université Bordeaux 1.
Vanessa Kuentz est ingénieur de recherche à Irstea.