MediPy – Plate-forme de développement logiciel pour

MediPy – Plate-forme de développement logiciel
pour la neuro-imagerie
Julien Lamy <[email protected]>
Laboratoire d'imagerie et de neurosciences cognitives, équipe Imagerie in vivo
Université de Strasbourg

Introduction
●Historique
●Développement d'algorithmes de traitement d'images
médicales depuis une quinzaine d'années, collaboration
avec l'équipe TIM du LSIIT
●Naissance de la plate-forme Medimax
●Medimax
●C/C++, Gtk+ v.1, contient les travaux de nombreux
chercheurs et doctorants
●Difficilement portable (Linux seulement)
●Plat de spaghetti : dépendances croisées, code dupliqué,
pas d'utilisation de bibliothèques externes, …

Introduction
●MediPy
●Refonte totale de Medimax (Python/C++)
●Python : facilité de la syntaxe pour les nouveaux arrivants
●C++ : performances
●Utilisation de bibliothèques tierces reconnues (ITK, VTK,
NumPy, …)
●Plate-forme portable
●Modularité, indépendance traitement-visualisation
●Distribution du logiciel sous licence libre (CeCILL-B)

Plan de la présentation
●MediPy – l'application
●Visualisation
●Traitement
●MediPy – la plate-forme de développement
●Structures de données
●Création d'un plugin
●Compilation
●Application dérivées
●Redistribution

MediPy – l'application
Visualisation & traitement