Pascale MOSONI

Pascale Mosoni1, Carl Yeoman2, Pascale Lepercq1, Gérard Andant1,
Bryan White2, Evelyne Forano1
1UR454, Microbiologie, Clermont-Fd / Theix, France
2University of Illinois, Urbana-Champaign, USA
Interaction in vivo
entre trois espèces bactériennes
fibrolytiques majeures du rumen

Le Rumen
Ecosystème microbien complexe
Anaérobie strict
assure la digestion des fibres végétales
ingérées par le ruminant
Rôle essentiel des bactéries fibrolytiques
Champignons
105 zoosp./ml
Bactéries
1011 cell/ml
Protozoaires
106 cell/ml
Archaea
107 cell/ml

 109 – 1010 cell/ ml contenu ruminal
 3 espèces bactériennes majeures
 Adhèrent aux fibres végétales et dégradent cellulose,
hémicelluloses … et fermentent sucres
 Compétition entre ces 3 espèces dans l’adhésion et la
croissance sur cellulose in vitro
1 . Fibrobacter succinogenes
Gram -
2. Ruminococcus albus
3. Ruminococcus flavefaciens
Gram +
Interaction in vivo ?
Les bactéries fibrolytiques cultivables

Les enzymes de la fibrolyse
Cellulose
(b1-4 Glucose)n
Cellobiose
GH5 – GH9 …
Carbohydrate-Active Enzymes
Database Cazy
http://www.cazy.org/
Glycoside Hydrolases
GH1 …GH129
Carbohydrate esterases
CE1 …CE16
Polysaccharide lyases
PL1 …PL22
GH48 … GH3 …

GH2
2
GH3
3
GH5
12
GH8
6
GH9
9
GH10
8
GH11
4
GH13
3
GH16
4
GH18
2
GH23
3
GH26
5
GH27
1
GH30
3
GH39
1
GH43
14
GH44
1
GH45
4
GH51
2
GH53
2
GH54
1
GH57
3
GH74
1
GH77
1
GH94
1
GH95
1
GH116
1
GHnc
2
GH2
3
GH3
5
GH4
1
GH5
13
GH8
1
GH9
8
GH10
5
GH11
5
GH13
5
GH16
2
GH23
1
GH25
5
GH26
8
GH27
2
GH28
1
GH30
2
GH31
1
GH36
3
GH39
1
GH43
7
GH44
1
GH48
1
GH51
1
GH53
1
GH67
1
GH73
1
GH74
2
GH77
1
GH94
2
GH95
1
GH98
1
GH105
1
GH113
1
GH124
1
GHnc
1
F. succinogenes S85
GH = 100
R. albus 7
GH = 96
R. flavefaciens FD1
GH = 100
Analyses génomiques
http://www.cazy.org/
Berg Miller et al. Plos One 2009
GH2
2
GH3
6
GH5
14
GH9
12
GH10
6
GH11
11
GH13
4
GH16
5
GH18
1
GH24
1
GH25
9
GH26
6
GH31
1
GH36
1
GH42
1
GH43
10
GH44
2
GH48
1
GH53
1
GH74
1
GH77
1
GH94
1
GH95
1
GH97
2
GH105
1
GH = Glycoside Hydrolases