VIROLOGIE

VIROLOGIE
3ème année Pharmacie
année 2008-2009
Florence MORFIN
Introduction
20 à 200 nm
Edward Jenner
1749-1823
Louis Pasteur
1822-1895
1 - Historique
• 1892 Iwanowski « mosaïque du tabac »
Dmiti Iwanowski
1864-1920
Toxine ?
• 1898 Beijerinck « agents ultrafiltrables »
mosaïque du tabac
filtration + précipitation par éthanol
pas de perte du pouvoir infectieux
=> principe infectieux fluide
Martinus Beijerinck
1851-1931
• Agents ultrafiltrables :
–
–
–
–
–
–
1898 : fièvre aphteuse des bovidés
1898 : myxome du lapin
1901 : fièvre jaune chez l’homme (La Havane)
1903 : rage
1905 : variole
1908 : poliomyélite
• 1915 : Twort – microcoque
• 1918 : d’Herelle – bacille dysenterique
– Agents ultrafiltrables : lyse des bactéries
« bactériophages »
• Développement thérapeutique :
dysenterie, fièvre typhoïde
• Regain d’intérêt face aux BMR
2 - Définition
• Les virus :
– un seul type d’acide nucléique (ADN ou ARN)
– multiplication à partir de leur génome par
réplication
– parasites intra-cellulaires obligatoires
– structure spécifique
– absence de croissance
Protistes eucaryotes
et procaryotes
Unité de
structure
La cellule
Deux types :
Acides
ADN et ARN
nucléiques
présents
Présents
Systèmes
enzymatiques
de biosynthèse
Croissance
Présence
Virus
Le virion : particule virale
Un seul type :
ADN ou ARN
Absents :
Parasitisme strict d’une
cellule évoluée
Absence
3 – Structure des virus
ADN ou ARN
capside
Oui : virus enveloppés
« peplos »
Non : virus nus
Structure Schématique
+
=
Capside
protéique
(capsa)
Génome
(ADN ou ARN)
+
Nucléocapside Enveloppe
(core)
(péplos)
(bicouche lipidique)
Nucléocapside
(core)
Virus nus
=
Virus
enveloppés
Virus du SARS
Virus herpes simplex (HSV)
Virus Ebola
Adénovirus
Virus parainfluenza
3.1. Génome viral
• Génomes à ADN
– Bicaténaire, rarement simple brin
– Linéaire, parfois circulaire
– Taille : 5 kb à 280 kb
Séquences spécifiques codant de 3 à 200
protéines virales
• Génomes à ARN
–
–
–
–
–
Monocaténaire rarement double brin
Linéaire, rarement circulaire
Un seul fragment ou plusieurs
Parfois diploïde (HIV)
Polarité positive (brin codant ou sens ou ARNm)
ou négative (brin antisens)
– Taille : 3 kb à 20 Kb
– Séquences spécifiques codant de 1 à 30 protéines
virales
3.2. Capside
• Structure protéique d’origine virale
(une ou plusieurs protéines)
• 3 organisations symétriques
– hélicoïdale
– cubique ou icosaédrique
– complexe
Symétrie hélicoïdale
Sous-unité protéique
génome
Axe
Axe creux
génome
Tubule
spiralé
Symétrie hélicoïdale
Virus de la mosaïque du tabac
Paramyxovirus
Symétrie cubique
Protéine
virale
X5
1
2
3
Pentamère / penton
Capsomère
Icosaèdre
X6
12 sommets (pentons)
20 faces (hexons)
30 arêtes
hexamère / hexon
Symétrie cubique
Adénovirus
252 capsomères
12 pentons
240 hexons
12 spicules
Symétries complexes
Symétrie cubique
Symétrie hélicoïdale
Certains bactériophages
3.3. Enveloppe virale ou peplos
• Bicouche lipidique provenant du système
membranaire cellulaire
• Protéines /glycoprotéines virales
–
–
–
–
Interactions avec récepteurs
Fusion membranaire
Hémagglutinine (HA)
Neuraminidase (NA)
• Protéines / glycoprotéines cellulaires
– HLA, ….
Autres propriétés des enveloppes virales :
• Elément de fragilité
– détergents, dessiccation, sucs digestifs
– thermosensibilité
• Tous les virus à capside hélicoïdale ont une
enveloppe
3.4. Matrice ou manteau
• Structure protéique située immédiatement
sous l’enveloppe
– Rôle de stabilisation
4 - Action des agents physiques
et chimiques
4.1. Agents physiques
– Chaleur
• position intracellulaire : bien adaptés à 37°C
• position extracellulaire : très sensibles à chaleur
envoi de prélèvements pathologiques au laboratoire
à +4°C
– dessication
• très sensibles
• exception : variole / croûtes
– ultraviolets
• altération des acides nucléiques
mutations
perte du pouvoir infectieux
4.2. Agents chimiques
– oxydants (eau de Javel)
• HIV très sensible
• entérovirus à transmission hydrique résistent à
chloration usuelle :
– poliomyélite
– HAV (hépatite A)
− β-propiolactone
• vaccins inactivés ou tués
– solvants des lipides
• inactivation des virus avec enveloppe
5 - Classification des virus
•
•
•
•
difficile
avant XIXe s ultravirus, agents ultrafiltrables
selon pathologies
1960 classification LHT
(Lwoff Horne Tournier)
Classification des virus (LHT)
•
•
•
•
Nature de l’acide nucléique
Symétrie de la capside
Présence d’une enveloppe
Dimension des virions et de la nucléocapside
Nomenclature en Virologie
• En théorie
– Ordre (-virales), famille (-viridae), sous-famille
(-virinae), genre (-virus), espèce, type
• En pratique
– Espèce ± type : Human herpesvirus 1 (HHV-1),
B19 virus (B19V)
– Noms d’usage : virus herpes simplex type 1
(HSV-1), parvovirus B19, ...
Virus nus : résistants dans le milieu extérieur
Adénovirus
Papillomavirus
Hépatite A
Poliovirus
rotavirus
Virus enveloppés : fragiles en milieu extérieur
Herpesvirus
Hépatite B
Variole
VIH
Hépatite C
Rougeole
Grippe
VRS
Découverte des Prions
• Etude du Kuru : Gajdusek (Nobel 1976)
• Théorie du Prion : S. Prusiner (Nobel 1997)
Stanley Prusiner
Carleton Gajdusek
1990
1 Infections respiratoires
2 Diarrhées
3 Complications à la naissance
4 Dépression sévère
5 Maladies cardiaques
chronique
6 Attaque (AVC)
7 Tuberculose
8 Rougeole
9 Accidents circulation
10 Affections congénitales
2020
Maladies cardiaques
Dépression sévère
Accidents circulation
Attaque (AVC)
Maladie pulmonaire
Infections respiratoires
Tuberculose
Guerre
Diarrhées
SIDA