Cependant le point d'entrée de la sonde était exceptionnel : des observations effectuées de la Terre ont suggéré
que le site de la pénétration de la sonde puisse bien avoir été l'un des plus chauds et des plus dénués de nuages
de Jupiter à ce moment.
Les données de la sonde Galileo ont aussi indiqué qu'il y a beaucoup moins d'eau que l'on pensait. On
s'attendait à ce que l'atmosphère de Jupiter contienne environ deux fois plus d'oxygène (combiné avec
l'hydrogène abondant pour former de l'eau) que le Soleil.
Aujourd'hui, la concentration en oxygène semble être la même que celle du Soleil. Le ratio hydrogène/hélium
est aussi proche de celui du Soleil, ce qui implique que la composition de la majeure partie de Jupiter n'a pas
beaucoup évolué depuis la formation du système solaire. La densité et les températures élevées relevées dans
les parties les plus hautes de l'atmosphère ont aussi été très surprenantes.
108
Jupiter et les autres planètes gazeuses présentent des vents très puissants et confinés dans de larges bandes de
latitude. Les vents soufflent dans des directions opposées dans des bandes adjacentes. De légères différences
de température entre ces bandes sont responsables de leurs différentes couleurs.
Les bandes claires sont appelées zones tandis que les sombres sont appelées ceintures. Les bandes de Jupiter
ont été observées depuis longtemps mais les tourbillons complexes sur les frontières des bandes n'étaient pas
connus avant que Voyager n'effectue un passage près de la planète.
Les données de la sonde Galileo ont indiqué que les vents étaient même plus rapides que ce que l'on pensait
(plus de 600 km/h) et se prolongaient aussi loin que la sonde fut capable d'observer. L'atmosphère de Jupiter
présente de nombreuses turbulences, ce qui semble indiquer que les vents sont principalement dus à la chaleur
interne de Jupiter plutôt qu'à l'énergie solaire comme sur la Terre. 154
Les couleurs vives des nuages de Jupiter sont probablement le résultat de réactions chimiques subtiles des
traces d'éléments dans son atmosphère, impliquant peut-être le soufre dont les composés s'étalent sur une large
variété de couleurs; cependant les détails sont inconnus.
Les couleurs correspondent à l'altitude des nuages: les bleus étant les plus bas, suivis par les bruns et les
blancs, les rouges étant les plus hauts. On peut parfois observer les couches les plus basses à travers des trous
dans les couches supérieures. 83
La Grande Tache Rouge a été observée de la Terre depuis plus de 300 ans (sa découverte est habituellement
attribuée à Cassini ou Robert Hooke au 17ème siècle). Cette tache est un ovale d'environ 12000 x 25000 km,
assez grand pour contenir deux Terres. D'autres taches similaires plus petites sont connues depuis quelques
dizaines d'années. Des observations infrarouges et le sens de sa rotation indiquent que la Grande Tache
Rouge est une région de haute pression dont la partie supérieure des nuages est sensiblement plus haute que
les régions voisines. Des structures similaires ont été observées sur Saturne et Neptune. Cependant, on ne sait
toujours pas comment ces structures peuvent persister aussi longtemps. 113
Jupiter dégage plus d'énergie dans l'espace qu'elle n'en reçoit du Soleil. En effet, l'intérieur de Jupiter est
chaud: la température du noyau est probablement de 20000 °C. Cette chaleur est générée par le mécanisme
Kelvin-Helmholtz, une lente compression gravitationnelle de la planète (Jupiter ne produit pas d'énergie par
fusion nucléaire comme le Soleil car elle est trop petite et son noyau trop froid ne peut allumer de réactions
nucléaires). Cette chaleur interne produit de profonds courants de convection jusque dans les couches liquides
de Jupiter et elle est sans doute responsable des mouvements complexes des nuages. Saturne et Neptune sont
similaires à Jupiter sur ce point mais curieusement Uranus ne l'est pas. 112
Jupiter est aussi grosse qu'une géante gazeuse peut l'être : si on lui ajoutait des éléments, elle serait tellement
comprimée par la gravité que son rayon moyen n'augmenterait presque pas. Une étoile peut être plus grosse
uniquement grâce à sa source nucléaire de chaleur interne. Jupiter devrait être 100 fois plus massive pour
devenir une étoile. 56
Jupiter possède un énorme champ magnétique beaucoup plus puissant que celui de la Terre. Sa magnétosphère 71