bioinformatique et cancer - CBIO

BIOINFORMATIQUE ET CANCER
Jeudi 4 et Vendredi 5 octobre 2012
Espace Monceau, 44 rue de la Bienfaisance, 75008 Paris
PROGRAMME*
Jeudi 4 octobre 2012
9h30 - 10h15 REGISTRATION AND WELCOME / ACCUEIL
10h15 Introduction
I – JOURNÉE MÉTHODOLOGIQUE
10h30 - 11h30 Modeling molecular networks in cancer
Modélisation des réseaux moléculaires impliquées dans le cancer
Lodewyk WESSELS (NKI Amsterdam, Pays-Bas)
11h30 - 12h30 Multiscale modeling of cancer kinome networks
Modélisation multi-échelle des réseaux de kinases dans le cancer
Rune LINDING (TU, Danemark)
12h30 - 13h30 LUNCH / DEJEUNER
13h30 - 14h30 Systems biology approaches in colorectal cancer
Approches en biologie des systèmes dans le cancer colorectal
Christine SERS (Charité Berlin, Allemagne)
14h30 - 15h00 COFFEE BREAK / PAUSE CAFÉ
15h00 - 16h00 Large-scale integrative modeling of cancer
Modélisation intégrée à grande échelle du cancer
Sven NELANDER (Université de Götteborg, Suède)
16h00 - 17h00 Network analysis of Loss-of-Function screen of human lung cancer
Analyse des réseaux lors de criblages de perte de fonction dans le cancer du
poumon chez l’Homme
Nadya MOROZOVA. (CNRS, CEA Saclay)

BIOINFORMATIQUE ET CANCER
Jeudi 4 et Vendredi 5 octobre 2012
Espace Monceau, 44 rue de la Bienfaisance, 75008 Paris
PROGRAMME*
Vendredi 5 octobre 2012
8h45 - 9h00 WELCOME / ACCUEIL
II – JOURNÉE APPLICATIVE
9h00 - 10h00 Dissecting Cancer Heterogeneity
Analyse de l’hétérogénéité dans le cancer
Florian MARKOWETZ (Cancer Research UK, Royaume Uni)
10h00 - 10h30 COFFEE BREAK / PAUSE CAFÉ
10h30 - 11h30 Normalization and Differential Expression for RNA-Seq
Normalisation et expression différentielle en RNA Seq
Sandrine DUDOIT (UC Berkeley, USA)
11h30 - 12h30 Detection of structural variants and copy number alterations in cancer : from
computational strategies to the discovery of chromothripsis in neuroblastoma
Détection de variants structuraux et de l’altération du nombre de copie lors d’un
cancer : des stratégies computationnelles à la découverte de la chromothripsis
dans le neuroblastome
Valentina BOEVA (INSERM, Institut Curie, Mines ParisTech)
12h30 - 13h30 LUNCH / DÉJEUNER
13h30 - 14h30 The challenge in integrating various omics data for better prognostication of breast
cancer
Challenge lors de l’intégration de différentes données en omics pour permettre un
meilleur pronostique dans le cancer du sein
Anne-Lise BORRENSEN-DALE (Oslo University Research Hospital, Norvège)
14h30 - 15h00 COFFEE BREAK / PAUSE CAFÉ
15h00 - 16h00 Personalize cancer genomics, a bioinformatics perspective
Personnaliser la génomique en cancérologie, point de vue de la bioinformatique
Alfonso VALENCIA (Spanish National Cancer Research Centre)
16h00 - 17h00 Dissecting cancer relevant cellular processes by phenotypic profiling from live cell
imaging data
Analyse des processus cellulaires spécifiques du cancer grâce à l’établissement d’un
profil phénotypique à partir de données d’imagerie sur cellules vivantes
Thomas WALTER (Mines ParisTech, Institut Curie, INSERM)