bioinformatique et cancer - CBIO
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BIOINFORMATIQUE ET CANCER Jeudi 4 et Vendredi 5 octobre 2012 Espace Monceau, 44 rue de la Bienfaisance, 75008 Paris PROGRAMME* Jeudi 4 octobre 2012 9h30 - 10h15 10h15 REGISTRATION AND WELCOME / ACCUEIL Introduction I – JOURNÉE MÉTHODOLOGIQUE 10h30 - 11h30 Modeling molecular networks in cancer Modélisation des réseaux moléculaires impliquées dans le cancer Lodewyk WESSELS (NKI Amsterdam, Pays-Bas) 11h30 - 12h30 Multiscale modeling of cancer kinome networks Modélisation multi-échelle des réseaux de kinases dans le cancer Rune LINDING (TU, Danemark) 12h30 - 13h30 LUNCH / DEJEUNER 13h30 - 14h30 Systems biology approaches in colorectal cancer Approches en biologie des systèmes dans le cancer colorectal Christine SERS (Charité Berlin, Allemagne) 14h30 - 15h00 COFFEE BREAK / PAUSE CAFÉ 15h00 - 16h00 Large-scale integrative modeling of cancer Modélisation intégrée à grande échelle du cancer Sven NELANDER (Université de Götteborg, Suède) 16h00 - 17h00 Network analysis of Loss-of-Function screen of human lung cancer Analyse des réseaux lors de criblages de perte de fonction dans le cancer du poumon chez l’Homme Nadya MOROZOVA. (CNRS, CEA Saclay) BIOINFORMATIQUE ET CANCER Jeudi 4 et Vendredi 5 octobre 2012 Espace Monceau, 44 rue de la Bienfaisance, 75008 Paris PROGRAMME* Vendredi 5 octobre 2012 8h45 - 9h00 WELCOME / ACCUEIL II – JOURNÉE APPLICATIVE 9h00 - 10h00 Dissecting Cancer Heterogeneity Analyse de l’hétérogénéité dans le cancer Florian MARKOWETZ (Cancer Research UK, Royaume Uni) 10h00 - 10h30 COFFEE BREAK / PAUSE CAFÉ 10h30 - 11h30 Normalization and Differential Expression for RNA-Seq Normalisation et expression différentielle en RNA Seq Sandrine DUDOIT (UC Berkeley, USA) 11h30 - 12h30 Detection of structural variants and copy number alterations in cancer : from computational strategies to the discovery of chromothripsis in neuroblastoma Détection de variants structuraux et de l’altération du nombre de copie lors d’un cancer : des stratégies computationnelles à la découverte de la chromothripsis dans le neuroblastome Valentina BOEVA (INSERM, Institut Curie, Mines ParisTech) 12h30 - 13h30 LUNCH / DÉJEUNER 13h30 - 14h30 The challenge in integrating various omics data for better prognostication of breast cancer Challenge lors de l’intégration de différentes données en omics pour permettre un meilleur pronostique dans le cancer du sein Anne-Lise BORRENSEN-DALE (Oslo University Research Hospital, Norvège) 14h30 - 15h00 COFFEE BREAK / PAUSE CAFÉ 15h00 - 16h00 Personalize cancer genomics, a bioinformatics perspective Personnaliser la génomique en cancérologie, point de vue de la bioinformatique Alfonso VALENCIA (Spanish National Cancer Research Centre) 16h00 - 17h00 Dissecting cancer relevant cellular processes by phenotypic profiling from live cell imaging data Analyse des processus cellulaires spécifiques du cancer grâce à l’établissement d’un profil phénotypique à partir de données d’imagerie sur cellules vivantes Thomas WALTER (Mines ParisTech, Institut Curie, INSERM)
