La résistance au cuivre chez les bactéries

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Titre (Français)
La résistance au cuivre chez les bactéries
Title (English)
copper resistance in Bacteria
Informations administratives
Personne proposant le sujet
/email
David Gillan et Ruddy Wattiez
[e-mail]
[e-mail]
Service
Protéomique et Microbiologie
Faculté
Sciences
Institut
Biosciences
Informations relatives au sujet proposé
Niveau de recherche
☒Doctorat ☒Post-Doc
5 mots-clés (français)
Resistance au cuivre - bactéries - environnement - sols -
métaux
5 keywords (English)
Copper resistance - bacteria - environment - soil - metals
Bref descriptif (10-15 lignes) (français)
Le but du présent projet de recherche est d'améliorer nos connaissances concernant la résistance
au cuivre chez les bactéries. Bien que différents opérons de résistance au cuivre aient été décrits, la
fonction de nombreux gènes est toujours énigmatique. Il en est de même de l'interaction entre ces
différents opérons. Afin de mieux comprendre ces systèmes de résistance ceux-ci doivent être
comparés à ceux trouvés dans de nouvelles souches, isolées à partir de sols et de sédiments
contaminés par les métaux. Pour cela, diverses études de terrain seront menées afin d'isoler de
nouvelles bactéries résistantes au cuivre, ainsi que de nouvelles souches de Cupriavidus, et cela dans
divers sols contaminés en Europe. Un exemple est la montagne Harz en Allemagne (Rammelsberg)
qui possède une mine d'argent, cuivre, et plomb, et qui est la seule mine qui fut exploitée pendant
plus de 1,000 ans lorsqu'elle fut fermée en 1988. Les nouvelles souches seront comparées au
laboratoire à des souches modèles comme Cupriavidus metallidurans CH34, et cela en termes de
phénotype (résistance au Cu, morphologie, métabolisme en employant la protéomique) et de
génotype (séquençage du génome et annotation). La compréhension de la résistance au Cu chez les
bactéries est d'une grande importance car le Cu est utilisé dans l'agriculture comme fongicide, dans
les hôpitaux pour éviter les infections nosocomiales (surfaces traitées au Cu) et dans les peintures
anti-fouling.

Summary (10-15 lines) (English)
The goal of the present research project is to improve our knowledge on copper resistance in
Bacteria. Although various Cu resistance operons have been described, the function of many genes
is still enigmatic as well as the interactions between these operons. To better understand these
resistance systems they must be compared to those found in novel copper-resistant strains, isolated
in metal-contaminated soils and sediments. For that, several field trips will be conducted to isolate
novel Cu resistant bacteria, as well as novel Cupriavidus strains, in several Cu-contaminated soils in
Europe. An example is the Harz montain in Germany (Rammelsberg) that is the location of an
important silver, copper, and lead mine, the only mine which had been working continuously for
over 1,000 years when it finally closed in 1988. The novel strains will be compared in the laboratory
to well-known model strains such as Cupriavidus metallidurans CH34, in terms of phenotype (Cu
resistance, morphology, metabolism using proteomics) and genotype (genome sequencing and
annotation). The understanding of Cu resistance in bacteria is of paramount importance as Cu is
used in agriculture as a fungicide, in hospitals to avoid nosocomial infections (copper-treated
surfaces) and in anti-fouling paints.