1
Recherche combinatoire
sur les graphes
Mathilde Bouvel
Stage effectué au Loria, équipe
Adage, sous la direction de
Gregory Kucherov
Mars-Août 2005
2
L’équipe Adage
Algorithmique Discrète Appliquée à la
GEnomique
Algorithmique du texte et géométrie discrète
Domaine d’application privilégié : bioinformatique
Développement de logiciels expérimentaux
(grappe, mreps, YASS)
3
Contexte du stage
1995-1998 : doctorat au Loria de Vladimir
Grebinski
WG 2005 à Metz : exposé alliant graphes et
bioinformatique
Mon stage au Loria :
Reprise du travail de Vladimir et Gregory
Recherche bibliographique de résultats récents
Approfondissement
4
La recherche combinatoire
Identification d’un objet inconnu ou « caché »
dans un ensemble d’objets
Jeu à deux joueurs : l’un choisit l’objet caché,
l’autre le cherche
L’objet caché peut aussi être déterminé de
façon aléatoire, par un mécanisme
biologique, ou par une réalité physique
inconnue de celui qui cherche.
5
Les problèmes de
pesage de pièces
Recherche d’une ou de
plusieurs fausses pièces parmi n
Jeu du nombre caché
Elargissements possibles
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