Bases de Données

L3 Module Libre
Année universitaire 2005-2006
Initiation à la Bioinformatique
Jean-Michel RICHER

Deuxième Cours
Les Bases de Données
Relationnelles
Application

Plan
1. Introduction
2. Les bases de données relationnelles
3. Comment construire une base de données
4. Manipuler les données

Volume d’Information
Trop d’information tue l’information
Les volumes de données générés par la bioinformatique
sont colossaux :
Comment stocker l’information de manière non
redondante
Comment extraire l’information utile
Exemples : GenBank, PDB

GenBank
GenBank
comprehensive public database of nucleotide sequences and supporting
bibliographic and biological annotation, built and distributed by the National
Center for Biotechnology Information (NCBI), a division of the National Library of
Medicine (NLM), located on the campus of the US National Institutes of Health
(NIH) in Bethesda, Maryland.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/genbankstats.html