Groupe Béna Parallélisme entre la structure de l’information dans le code génétique et dans l’arithmétique Alain Bruyère Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 1 ADN-ARN-nucléotide • ADN : acide désoxyribonucléique, – molécule à double hélice composée chacune • d’une série de nucléotides (acides) formés – d’un groupe phosphate lié à – un sucre à 5 atomes de carbone, le désoxyribose (ribose pour l’ARN) et – à une base azotée A, T, C ou G (A, U, C, ou G pour l’ARN) • ARN : acide ribonucléique Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 2 la double hélice de l’ADN Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 3 ADN-double hélice • les deux hélices de l’ADN sont – reliées par des ponts hydrogène • reliant les bases qui sont appariées, – c-à-d qu’une base A d’une hélice est toujours reliée à une base T de l’autre et – une base G de l’une est toujours reliée à une base C de l’autre et vice-versa Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 4 A, G, C, T (ADN) A, G, C, U (ARN) • ADN – A adénine T thymine (2 liasons H) – G guamine C cytosine (3 liasons H) • ARN – A adénine U uracile (2 liasons H) – G guamine C cytosine (3 liasons H) • A et G : famille des purines • U, T et C : famille des pyrimidines Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 5 ADN l'ADN possède une structure en forme de double hélice (découverte en 1953 par James Dewey Watson, Francis Crick (voir la publication originale (en)[pdf]) et coll. et en partie grâce aux travaux de Rosalind Franklin). Un polymère de bases désoxyribonucléiques est constitué de répétitions de nucléotides formés d'un groupe phosphate lié à un sucre, le désoxyribose, et à une base azotée A, T, C ou G. Le squelette est formé de la répétition sucre - phosphate, ce qui change est la base. Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 6 ARN structure moléculaire de l'ARN Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 7 ADN-acide aminé-protéine • l’ADN est présent dans le noyau des cellules • a la faculté de se reproduire • a la faculté d’être transmis aux descendants lors des processus de reproduction des organismes vivants • est a la base des processus biologiques aboutissant à la production des protéines – assemblage/séquence d’acides aminés liés par des liasons peptidiques • liasons covalentes réalisées au moyen de fonctions amide Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 8 ADN-acide aminé-protéine • acide aminé : molécule organique possédant un squelette carbonné et deux groupes fonctionnels : – une amine (-NH2) et – un acide carboxylique (-COOH) – => forme : COOH | H-C-R | NH2 • où "R" représente une chaîne latérale spécifique à chaque acide aminé. Les acides aminés sont en général classés d'après les propriétés de la chaîne latérale en quatre groupes : acide, basique, hydrophile (polaire) et hydrophobe (apolaire). • les acides aminés sont les unités structurales des protéines • les protéines ont des fonctions diverses – fonction structurale – fonction enzymatique – fonction de messager Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 9 20 acides aminés Tableau présentant les 20 acides aminés représentés dans le code génétique L-Alanine (Ala / A) L-Cystéine C) Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 L-Arginine (Arg / R) L-Asparagine / N) (Asn Acide L-aspartique (Asp / D) L-Glutamine (Gln / L-Glycine (Gly / G) (Cys / Acide L-glutamique Q) (Glu / E) 10 20 acides aminés L-Histidine (His / H) L-Isoleucine (Ile / I) L-Méthionine (Met / M) L-Thréonine Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 T) [modifier] L-Phénylalanine / F) (Thr / L-Tryptophane W) L-Leucine (Leu / L) L-Lysine (Lys / K) (Phe L-Proline (Pro / P) L-Sérine (Ser / S) (Trp / L-Tyrosine Y) (Tyr / L-Valine (Val / V) 11 exemple de protéine : myoglobine Une représentation de la structure tridimentionelle de la myoglobine, montrant les hélices α colorées. Cette protéine fut la première à avoir sa structure résolu par cristallographie à rayon X par Max Perutz et John Kendrew Alain Bruyère Paris 12-13/05/2006 12