Sujet 0 U42 Microbiologie MC Versailles

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U42 MICROBIOLOGIE
Durée : 3 heures Coefficient 2 Calculatrice interdite
Le sujet comporte trois parties indépendantes. (Barème sur 40 points)
I-Première partie : Staphylococcus saprophyticus et infections urinaires (17 points)
Staphyloccocus saprophyticus est connu comme responsable d’infections urinaires chez la femme jeune,
non hospitalisée, enceinte ou non. Il s’agit généralement d’une infection urinaire par voie ascendante,
cystite simple ou récidivante, plus rarement d’une pyélonéphrite.
Une des caractéristiques des infections à Staphylococcus saprophyticus est qu’elles se compliquent de
lithiases de l’appareil urinaire. La production d’une uréase explique la formation des calculs de l’appareil
urinaire : la libération d’urée augmente le pH de l’urine (pH 6 – 8) et la formation de cristaux de
phosphates ammoniaco-magnésiens.
I-1-Donner les principaux signes cliniques d’une cystite, d’une pyélonéphrite.
I-2-Citer les facteurs favorisant les infections urinaires par voie ascendante.
I-3-A partir des données et des connaissances acquises du sujet, expliquer le mécanisme
physiopathologique d’une infection urinaire à Staphylococcus saprophyticus.
Le diagnostic bactériologique d’une infection urinaire nécessite un prélèvement urinaire avec réalisation
d’un ECBU. Les premiers résultats de l’ECBU pour une patiente X présentant des signes d’infection
urinaire sont donnés en annexe 1.
I-4-Décrire une technique de prélèvement et les conditions à respecter pour le prélèvement de l’urine.
I-5-Donner la signification de « ECBU »
I-6-Préciser si l’on peut conclure à une infection urinaire. Justifier la réponse.
I-7-L’examen du culot urinaire révèle l’absence de cylindres granuleux.
I-7-1-Expliquer l’origine de la formation de cylindres granuleux.
I-7-2-Que peut-on conclure pour la patiente X ?
I-8-L’ensemencement de l’urine est réalisé à l’oese calibrée sur un milieu chromogène, le milieu USB,
dont les principales caractéristiques sont données par l’annexe 2. Dans le cas de la patiente X, on observe
la présence de colonies blanches sur ce milieu.
Le dénombrement révèle un nombre d’UFC/mL de 105.
I-8-1-Donner l’intérêt de l’utilisation d’un milieu chromogène dans le cadre d’une infection urinaire.
I-8-2-Exploiter les données pour la patiente X .
I-9-La poursuite de l’identification d’un Staphylococcus à partir des colonies isolées peut se faire par
l’utilisation d’un test d’agglutination.
I-9-1-Donner le principe de ce test. Illustrer par un schéma soigneusement annoté.

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I-9-2-Préciser les différentes étapes de la réalisation de ce test.
I-9-3-Dans le cas de Staphylococcus saprophyticus, ce test est négatif. Schématiser l’aspect de la lame
dans ce cas.
I-9-4-Donner le nom d’une espèce qui donnerait un test positif.
I-10-L’identification biochimique de Staphylococcus saprophyticus sur galerie Api Staph révèle la
présence d’une uréase.
- Expliquer le principe de recherche de ce test.
- Donner l’aspect du test pour Staphylococcus saprophyticus.
I-11-Staphylococcus saprophyticus est naturellement résistant à plusieurs antibiotiques utilisés en routine.
Un antibiogramme par une méthode miniaturisée de type ATB Staph a été réalisé et a donné les résultats
de l’annexe 3.
I-11-1-Préciser le rôle des concentrations critiques c et C pour l’interprétation de l’antibiogramme.
I-11-2-Lire et commenter cet antibiogramme. (Annexe 3 à rendre avec la copie)
I-11-3-Un E-testR permet de confirmer la sensibilité à la pénicilline G. Le résultat dans le cas de
Staphylococcus saprophyticus isolé chez la patiente X est donné en annexe 4.
I-11-3-1-Expliquer le principe d’un E-test
I-11-3-2-Donner le résultat pour la patiente X à partir de l’annexe 4 et conclure.
II-Deuxième partie : VIH et SIDA (14 points)
II-1-Donner la signification de VIH et SIDA.
II-2-La structure du VIH-1 est schématisée par le document de l’annexe 5. Reporter les numéros de
l’annexe 5 sur la copie et donner les légendes correspondantes. Dégager les principales caractéristiques de
structure de ce virus.
II-3-Citer les voies de contaminations par le VIH.
II-4-Expliquer précisément chacune des étapes de la multiplication virale à l’aide du schéma fourni par
l’annexe 6
II-5-Lors d’un SIDA avéré, des infections opportunistes se manifestent dont les candidoses.
II-5-1-Préciser le nom d’une espèce responsable de candidoses. Donner ses caractéristiques
morphologiques.
II-5-2-Parmi les tests permettant son identification, on peut réaliser le test de blastèse. Préciser la
lecture dans le cas d’un test positif.
II-6-La trithérapie est une technique de soin utilisée sur le virus du SIDA. La structure d’une molécule
impliquée dans cette trithérapie est donnée ci-dessous. Localiser son action possible sur le cycle viral.

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II-7-Sérodiagnostic d’une infection par le VIH par immuno-empreinte (technique du Western Blot)
L’immuno-empreinte permet la détection des anticorps anti-VIH sériques ou plasmatiques humains en
vue de confirmer une séropositivité anti-VIH. Elle permet de caractériser les anticorps dirigés contre
chacune des protéines virales.
II-7-1-Donner les quatre principales étapes de cette technique.
II-7-2- Analyser l’ensemble des résultats obtenus à chacune des dates de l’examen présentées en
annexe 7. Conclure.
III-Troisième partie : le paludisme (9 points)
III-1-Expliquer l’origine de la contamination de l’homme par ce parasite et donner le nom de la forme
infestante.
III-2- Décrire les différentes étapes du cycle intra-érytrocytaire d’un Plasmodium en donnant le nom des
formes parasitaires impliquées.
III-3- Donner les caractères d’identification de Plasmodium falciparum à partir d’un frottis sanguin coloré
au MGG.
III-4-Des tests de détection antigénique rapides du paludisme sont actuellement réalisés au laboratoire.
Le document en annexe 8 donne des indications d’un test d’immunochromatographie.
III-4-1-Présenter sous forme de schémas annotés, les deux étapes de la réaction
d’immunochromatographie aboutissant à la formation d’une bande au niveau de T1
III-4-2-Donner le rôle des trois anticorps de capture utilisés.
III-4-3-Préciser l’intérêt de l’utilisation du conjugué anti-Ig Y de poulet
III-4-4-Dans le cas de Plasmodium falciparum seul ou associé, on obtient les résultats présentés dans
le cas A de l’annexe 9.
Compléter les schémas des fenêtres de lecture avec les résultats attendus dans les cas B,C,D.
L'emtricitabine (FTC)=
L-2',3'-didéoxy-5-fluoro-3'-thiacytidine

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ANNEXES
ANNEXE 1 : examen cytobactériologique des urines
Examens microscopiques
Hématies : absence
Leucocytes : 104 / mL (supérieur à 20 leucocytes par champ)
Cylindres : absence
Cristaux : nombreux cristaux de phosphates ammoniaco-
magnésiens
Nombreux coques Gram + en amas irréguliers
Examens complémentaires
Urine : trouble
Couleur : jaune foncée
pH : 8
Glucose : absence
Protéines : absence
Nitrites : absence
Hémoglobine : absence
Leucocytes estérases : +++
ANNEXE 2 : milieu chromogène USB (Urine Screening of Bacteria de chez AES)
Le milieu USB est utilisé pour l’isolement spécifique et la numération des bactéries responsables
d’infections urinaires grâce à une méthode d’ensemencement standardisée à l’oese calibrée.
Les espèces les plus fréquemment isolées en diagnostic médical sont pré-identifiées grâce à leur profil
enzymatique : recherche de la β-galactosidase ,de la β-glucosidase , de la TDA.
Tableau d’identification de quelques bactéries
Aspect des
colonies
β-galactosidase
β-glucosidase
TDA
Diagnostic
Rose à pourpre
+
-
-
Escherichia coli
marron
-
-
+
Proteus
Bleu turquoise
-
+
-
Enterococcus
Bleu à violet
+
+
-
Groupe KHES
Blanc
-
-
-
Staphylococcus
Beige à jaune
-
-
-
Pseudomonas

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ANNEXE 3 : fiche de résultats ATB Staph A rendre avec la copie
PEN : Pénicilline G
OXA : Oxacilline
KAN : Kanamycine
TOB : Tobramycine
GEN : Gentamicine
ERY : Erythromycine
TEL : Telithromycine
LIN : Lincomycine
FOS : Fosfomycine
PRI : Pristinamycine
QDA : Quinupristine – Dalfopristine
TET : Tetracycline
MIN : Minocycline
RFA : Rifampicine
LNZ : Linezolid
FUC : Acide fusidique
LVX : Levofloxacine
VAN : Vancomycine
TEC : Teicoplanine
TSU : Trimethoprime Sulfamethoxazole
FUR : Nitrofurantoine
Culture
Absence de
culture