identification des microorganismes pathogenes au laboratoire de
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Identification des Microorganismes pathogènes au laboratoire de Microbiologie Professeur Michel DRANCOURT URMITE, CNRS UMR 7278, IRD 198, Inserm 1095 Faculté de Médecine – Aix-Marseille Université [email protected] PCEM 2 – UFR Odontologie http://www.mediterranee-infection.com/ Maladie Infectieuse et Tropicale = Diagnostic direct des maladies infectieuses • Immunodétection: les antigènes du microorganisme. • Diagnostic moléculaire: le génome du microorganisme. • Isolement et culture: le microorganisme entier. PCEM 2 – UFR Odontologie Intérêts de l’identification des pathogènes ? PCEM 2 – UFR Odontologie Intérêts de l’identification des pathogènes • • • • Pronostic de l’infection. Isolement des patients contagieux. Recherche d’une source / porte d’entrée Traitement PCEM 2 – UFR Odontologie Sources cliniques des Microorganismes pathogènes Prélèvements endo-buccaux Expectorations Hémocultures Prélèvements cutanés Urines PCEM 2 – UFR Odontologie Examen direct: Bactéries, parasites, champignons microscopiques PCEM 2 – UFR Odontologie Exemples d’examen de Gram/Ziehl PCEM 2 – UFR Odontologie Examen direct: virus ENTEROVIRUS ROTAVIRUS Virus Respiratoire Synticial PCEM 2 – UFR Odontologie Isolement et culture: bactéries extracellulaires PCEM 2 – UFR Odontologie Isolement et culture: bactéries intracellulaires et virus PCEM 2 – UFR Odontologie Identification: spectromètre de masse (MALDI-TOF) PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie Pos Grippe A Pos Grippe B BD Flu A+B PCEM 2 – UFR Odontologie TESTS Invalides NEG Détection moléculaire: amplification PCR- temps réel PCEM 2 – UFR Odontologie Identification moléculaire: séquenceur PCEM 2 – UFR Odontologie Identification moléculaire: séquenceur PCEM 2 – UFR Odontologie Identification moléculaire : Séquenceur haut-débit PCEM 2 – UFR Odontologie Objectif : rendre le résultat des analyses microbiologiques dans le temps du soin aux urgences PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie Pour les maladies infectieuses : 1 – Hospitalisation ? 2 – Isolement ? 3 – Traitement anti-infectieux ? 4 – Examens complémentaires ? PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie PCEM 2 – UFR Odontologie
