DIPLÔME UNIVERSITAIRE DE BIOINFORMATIQUE : DE LA
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DIPLÔME UNIVERSITAIRE DE BIOINFORMATIQUE : DE LA STRUCTURE A LA FONCTION Le Diplôme Universitaire de Bioinformatique (nouvelle version 2010-2011) est obtenu par la validation de 4 modules au choix (représentant un minimum de 100h totales) à sélectionner dans la liste à choix ci-après. La diversité de l’offre de stages en bioinformatique permet de proposer divers parcours thématiques et/ou de niveau de qualification souhaités. L’inscription à ce DU donnera donc lieu à la mise en place d’un parcours pédagogique individuel adapté au stagiaire. La cohérence du parcours choisi sera évaluée par l’équipe pédagogique et discutée avec le candidat. Cette évaluation tiendra compte des compétences de l’individu, de ses besoins et de ses attentes de formation. A titre d’exemple, plusieurs parcours de thèmes et de niveaux divers sont proposés. Ces parcours indiquent les pré requis éventuels à certaines formations. D’autres constructions de formation peuvent être envisagées. - Initiation à la programmation informatique pour les biologistes : proposé en niveau 1 et niveau 2 UNIX (obligatoire) PYTHON1 ou PYTHON 2 PERL Langage C (pré requis PYTHON ou PERL) WEB 1 ou WEB 2 Base de données (pré requis UNIX et au moins un langage de programmation) - Bases méthodologiques : Biostatistiques 1 et/ou 2 UNIX Analyse in silico 1 ou 2 Génomique fonctionnelle PYTHON ou PERL - Bio-informatique structurale : UNIX (obligatoire) Bioinformatique 1 – modélisation moléculaire Bioinformatique 2 – modèle 3D à bas taux d’identité Bioinformatique 3 – prédiction de complexes par docking Bioinformatique 4 – dynamique de protéines Bioinformatique 5 – approche in silico des petits composés à vocation thérapeutique PYTHON ou PERL - Initiation à la bio-informatique (niveau 1) : UNIX (obligatoire) Bioinformatique 1 – modélisation moléculaire - - Biostatistiques 1 WEB 1 Analyse in silico 1 ou 2 Bioinformatique 5 – approche in silico des petits composés à vocation thérapeutique PYTHON ou PERL Génomique fonctionnelle - Bio-informatique niveau 2 (pré requis le stage initiation à la bioinformatique niveau 1) : Bioinformatique 2 – modèle 3D à bas taux d’identité Bioinformatique 3 – prédiction de complexes par docking Bioinformatique 4 – dynamique de protéines (ouverture en 2011) Biostatistiques 2 WEB 2 Base de données Langage C PYTHON 2 - L’évaluation individuelle est réalisée à l’issue de chaque stage sur la base de l’assiduité ainsi que d’un rapport et/ou d’un examen écrit ou oral. Les modules « Analyse in silico des acides nucléiques et des protéines » (niveaux 1 et 2) et le module « Biostatistiques de base 1 » sont recommandés pour les personnes n’ayant pas de connaissances de base en bioinformatique. LISTE A CHOIX * Durée et Prix selon les stages choisis : Génomique fonctionnelle : méthodes statistiques et Bioinformatiques d’analyse de données transcriptomiques Du 5 au 7 janvier 2011 (18h/3j) – 1155 € 1 module Analyse in silico des séquences d’acides nucléiques et protéiques niveau 1 – débutants Du 21 au 24 novembre 2011 (32h/4j) – 1700 € 1 module Analyse in silico des séquences d’acides nucléiques et protéiques niveau 2 – avancés Du 28 mars au 1er avril 2011 (35h/5j) – 1890 € 1 module Initiation à la programmation informatique pour biologistes : Module 1 : introduction aux bases du système d’exploitation UNIX Du 11 au 13 janvier 2011 (24h/3j) – 1260 € 1 module Initiation à la programmation informatique pour biologistes : Module 2 : introduction à la programmation PERL Du 8 au 10 février 2011 (24h/3j) – 1260 € 1 module Initiation à la programmation informatique pour biologistes : Module 3 : introduction à la programmation C Du 20 au 24 juin 2011 (35h/5j) – 2100 € 1 module Programmation pour les biologistes : PYTHON 1 Du 5 au 8 avril 2011 (28h/4j) – 1680 € 1 module Programmation pour les biologistes : PYTHON 2 Du 27 au 29 avril 2011 (18h/3j) – 1260 € 1 module Création d’une base de données : concepts de base et applications Du 16 au 20 mai 2011 (30h/5j) – 1995 € 1 module Bio statistiques de base 1 – débutants Du 4 au 6 mai 2011 (24h/3j) – 900 € 1 module Bio statistiques 2 – avancés Du 26 au 27 mai 2011 (12h/2j) – 756 € 1 module Bioinformatique structurale 1 : Modélisation moléculaire Du 4 au 6 avril 2011 (24h/3j)– 1260 € 1 module Bioinformatique structurale 2 : Modèles 3D à bas taux d’identité Du 6 au 9 juin 2011 (30h/4j) – 1890 € 1 module Bioinformatique structurale 3 : Prédiction de complexes par docking Du 26 au 29 avril 2011 (30h/4j) – 1890 € 1 module Bioinformatique structurale 4 : Dynamique de protéines Du 2 au 6 mai 2011 (35h/5j) – 2310 € 1 module Bioinformatique structurale 5 : Approche in silico des petits composés à vocation thérapeutique Du 2 au 4 février 2011 (18h/3j) – 1260 € 1 module Programmation WEB 1 Du 27 au 29 septembre 2011 (18h/3j) – 1260 € 1 module Programmation WEB 2 Du 11 au 14 octobre 2011 (24h/4j) – 1680 € 1 module Inscription : 01 57 27 82 34 – [email protected]
