DIPLÔME UNIVERSITAIRE DE BIOINFORMATIQUE : DE LA

DIPLÔME UNIVERSITAIRE DE BIOINFORMATIQUE : DE LA STRUCTURE A LA
FONCTION
Le Diplôme Universitaire de Bioinformatique (nouvelle version 2010-2011) est
obtenu par la validation de 4 modules au choix (représentant un minimum de
100h totales) à sélectionner dans la liste à choix ci-après.
La diversité de l’offre de stages en bioinformatique permet de proposer divers
parcours thématiques et/ou de niveau de qualification souhaités. L’inscription à ce
DU donnera donc lieu à la mise en place d’un parcours pédagogique individuel
adapté au stagiaire.
La cohérence du parcours choisi sera évaluée par l’équipe pédagogique et discutée
avec le candidat. Cette évaluation tiendra compte des compétences de l’individu, de
ses besoins et de ses attentes de formation.
A titre d’exemple, plusieurs parcours de thèmes et de niveaux divers sont proposés. Ces
parcours indiquent les pré requis éventuels à certaines formations.
D’autres constructions de formation peuvent être envisagées.
Initiation à la programmation informatique pour les biologistes : proposé en
niveau 1 et niveau 2
- UNIX (obligatoire)
- PYTHON1 ou PYTHON 2
- PERL
- Langage C (pré requis PYTHON ou PERL)
- WEB 1 ou WEB 2
- Base de données (pré requis UNIX et au moins un langage de programmation)
Bases méthodologiques :
- Biostatistiques 1 et/ou 2
- UNIX
- Analyse in silico 1 ou 2
- Génomique fonctionnelle
- PYTHON ou PERL
Bio-informatique structurale :
- UNIX (obligatoire)
- Bioinformatique 1 – modélisation moléculaire
- Bioinformatique 2 – modèle 3D à bas taux d’identité
- Bioinformatique 3 – prédiction de complexes par docking
- Bioinformatique 4 – dynamique de protéines
- Bioinformatique 5 – approche in silico des petits composés à vocation
thérapeutique
- PYTHON ou PERL
Initiation à la bio-informatique (niveau 1) :
- UNIX (obligatoire)
- Bioinformatique 1 – modélisation moléculaire

- Biostatistiques 1
- WEB 1
- Analyse in silico 1 ou 2
- Bioinformatique 5 – approche in silico des petits composés à vocation
thérapeutique
- PYTHON ou PERL
- Génomique fonctionnelle
Bio-informatique niveau 2 (pré requis le stage initiation à la bioinformatique
niveau 1) :
- Bioinformatique 2 – modèle 3D à bas taux d’identité
- Bioinformatique 3 – prédiction de complexes par docking
- Bioinformatique 4 – dynamique de protéines (ouverture en 2011)
- Biostatistiques 2
- WEB 2
- Base de données
- Langage C
- PYTHON 2
L’évaluation individuelle est réalisée à l’issue de chaque stage sur la base de l’assiduité
ainsi que d’un rapport et/ou d’un examen écrit ou oral.
Les modules « Analyse in silico des acides nucléiques et des protéines » (niveaux 1
et 2) et le module « Biostatistiques de base 1 » sont recommandés pour les
personnes n’ayant pas de connaissances de base en bioinformatique.
LISTE A CHOIX
* Durée et Prix selon les stages choisis :
Génomique fonctionnelle : méthodes statistiques et
Bioinformatiques d’analyse de données transcriptomiques
Du 5 au 7 janvier 2011 (18h/3j) – 1155 € 1 module
Analyse in silico des séquences d’acides nucléiques et protéiques
niveau 1 – débutants
Du 21 au 24 novembre 2011 (32h/4j) – 1700 € 1 module
Analyse in silico des séquences d’acides nucléiques et protéiques
niveau 2 – avancés
Du 28 mars au 1er avril 2011 (35h/5j) – 1890 € 1 module
Initiation à la programmation informatique pour biologistes :
Module 1 : introduction aux bases du système d’exploitation
UNIX
Du 11 au 13 janvier 2011 (24h/3j) – 1260 € 1 module
Initiation à la programmation informatique pour biologistes :
Module 2 : introduction à la programmation PERL
Du 8 au 10 février 2011 (24h/3j) – 1260 € 1 module

Initiation à la programmation informatique pour biologistes :
Module 3 : introduction à la programmation C
Du 20 au 24 juin 2011 (35h/5j) – 2100 € 1 module
Programmation pour les biologistes : PYTHON 1
Du 5 au 8 avril 2011 (28h/4j) – 1680 € 1 module
Programmation pour les biologistes : PYTHON 2
Du 27 au 29 avril 2011 (18h/3j) – 1260 € 1 module
Création d’une base de données : concepts de base et
applications
Du 16 au 20 mai 2011 (30h/5j) – 1995 € 1 module
Bio statistiques de base 1 – débutants
Du 4 au 6 mai 2011 (24h/3j) – 900 € 1 module
Bio statistiques 2 – avancés
Du 26 au 27 mai 2011 (12h/2j) – 756 € 1 module
Bioinformatique structurale 1 : Modélisation moléculaire
Du 4 au 6 avril 2011 (24h/3j)– 1260 € 1 module
Bioinformatique structurale 2 : Modèles 3D à bas taux
d’identité
Du 6 au 9 juin 2011 (30h/4j) – 1890 € 1 module
Bioinformatique structurale 3 : Prédiction de complexes
par docking
Du 26 au 29 avril 2011 (30h/4j) – 1890 € 1 module
Bioinformatique structurale 4 : Dynamique de protéines
Du 2 au 6 mai 2011 (35h/5j) – 2310 € 1 module
Bioinformatique structurale 5 : Approche in silico des
petits composés à vocation thérapeutique
Du 2 au 4 février 2011 (18h/3j) – 1260 € 1 module
Programmation WEB 1
Du 27 au 29 septembre 2011 (18h/3j) – 1260 € 1 module
Programmation WEB 2
Du 11 au 14 octobre 2011 (24h/4j) – 1680 € 1 module
Inscription : 01 57 27 82 34 – [email protected]