Ecosystèmes microbiens: enjeux agronomiques

Ecosystèmes microbiens: enjeux
agronomiques

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Microorganismes et écosystèmes
• Microorganismes = bactéries, archées, levures & champignons, protistes
(protozoaires, micro-algues)
! les microorganismes vivent en communautés (mono- ou pluri-espèces)
c’est-à-dire en écosystèmes

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Les écosystèmes microbiens, l’exemple des biofilms

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Les écosystèmes microbiens, sources de biodiversité…
Quelques chiffres
- ~50% de la biomasse
- 95 % de la biosphère
en termes de diversité
- Pathogènes animaux
et humains : moins de
3% des espèces
microbiennes
Plant
Microbial
environments
Humans & animals
Aquatic environment
atmosphere
food
soil
remediation, biotech

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… et de services
" Environnement
" Cycles géochimiques (C, N, P)
" Dépollution, traitement de déchets, production d’énergie
" Biotechnologies vertes et blanches
" Nutrition plantes & arbres, animaux & humains
" Production de composés essentiels,
" Digestibilité / biodisponibilité
" Aliments fermentés ~30% (conservation, gout, culture)
" Santé plantes, animaux, humains
" Barrière vis à vis de pathogènes, interfaces muqueuses-environnement
" Education des défenses de l’hôte notamment du système immunitaire
" Relation avec système nerveux central