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Introduction: Histoire de l'éthologie et théorie de l'évolution, distinction entre mécanismes proximales et fonctions ultimes,
distinction entre sélection naturelle et sélection sexuelle.
Méthodologie de l'éthologie.
Ontogénie et hérédité du comportement.
Adaptation à l'environnement écologique: exploitation des ressources et défense contre la prédation
Comportement reproductif: compétition sexuelle, choix de partenaires, systèmes d'appariement, investissement parental
Reproduction coopérative: sélection de la parentèle, aides-au-nid et eusocialité.
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS
MASTER VIE ET SANTE
Spécialité Ecophysiologie et Ethologie
1ère Année
Écologie et Écophysiologie végétales
SCHMIT Anne-Catherine
NUV8 EEV1
CM : 38
TD : 10
TP : 24
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Notion d'écotoxicologie (6h) : pesticides, plantes et milieu.
Physiologie (32h) : Les sèves et leur conduction : absorption racinaire, formation, transport et devenir de la sève brute, idem
de la sève élaborée. Adaptations à la sécheresse et au froid. Photosynthèse C3, C4 et CAM.
La lumière, facteur non énergétique : tropismes , nasties, phytochrome ?
La régulation stomatique ?
La transduction du message hormonal ?
Travaux Dirigés : chorologie, phénologie, cartographie végétale, le cycle du carbone
Travaux Pratiques : manipulations de physiologie réalisables en situation de concours. Etude de la photosynthèse, de la
respiration et de la respiration en fonction de la lumière.
Écologie et Evolution du comportement
NOE Ronald
NUV8EEC1
CM : 32
TD : 20
TP : 15
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
.Module 1 : Communication et apprentissage
Ethologie de la communication: ritualisation, exploitation sensorielle, signaux 'honnêtes, mimétisme
Entre communication et langage: apprentissage du chant, sémantique des vocalisations
Apprentissage:
conditionnement et apprentissage instrumental
aspects évolutifs: écologie de l'apprentissage
aspects cognitifs: compréhension, cartes cognitives, coopération, théorie de l'esprit.
Module 2 : Endocrinologie de la reproduction
Différentiation sexuelle
Rôle des hormones dans le comportement reproducteur
Neuroendocrinologie et comportement sexuel à l'age adulte
Neuroendocrinologie et comportement parental
Module 3 : TD - TP Recherche, analyse de la littérature, synthèse et présentation orale d'un sujet d'éthologie. Conférence avec
résumé écrit pour les autres participants.
Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
CM : 30
TD : 18
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Écologie des paysages et métapopulation
Écologie Évolutive, Spéciation, Phylogénie
Sexe et sex-ratio
Écosystèmes et biocénoses, modélisation
Ecologie moléculaire
Adaptations morpho-fonctionnelles aux milieux extrêmes
Ethologie et initiation à l'écologie comportementale
CM : 24
TD : 6
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
LIGNOT Jean & MASSEMIN
Sylvie
TP : 16
NOE Ronald
NUV8 EFE1
Introduction à l'écologie fonctionnelle
LIGNOT Jean
CM : 20
TD : 6
TP : 6
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Introduction à l'écologie Fonctionnelle et Évolutive
Écosystèmes et biocénoses
Introduction à l écologie des organismes, des populations et des peuplements
Structure et productivité de quelques écosystèmes
Écologie générale des grands milieux terrestres et aquatiques
La biosphère et les grands biomes terrestres
Ecologie marine et côtière
Ecologie des eaux douces
Les changements globaux
NUV8 IEF1
Méthodologie et démarche scientifique
MASSEMIN Sylvie
NUV7 MDS1
CM : 6
TD : 6+20
TP : TER
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Analyse de la démarche scientifique : élaboration de l'hypothèse, pertinence du raisonnement et statut de l'expérience : cours
et ateliers d'analyses d'articles.
Les outils de la recherche bibliographiques.
Les outils méthodologiques en écophysiologie et en éthologie
Stage en laboratoire de 100 heures : le stage sera effectué par binôme dans un laboratoire de recherche (Ecophysiologie,
éthologie, écologie, physiologie). Les étudiants suivront des stages encadrés sur le terrain ou en laboratoire qui leur
permettront de se familiariser avec les outils méthodologiques. Il donnera lieu à une présentation sous forme de poster à
l'ensemble des étudiants avant une discussion encadrée par des enseignants/chercheurs, de chercheurs et de maîtres de stage.
Une large place sera donnée à l'analyse (intérêt, validité, limites, ..) des outils méthodologiques.
Microbiologie de l'Environnement
VUILLEUMIER Stéphane
NADALIG Thierry
TP : /
&
REM1MEN1
CM : 22
TD : 6
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
CM : Importance microbienne dans les cycles de matière ; révolution moléculaire en microbiologie de l'environnement ;
diversité microbienne ; interactions des microorganismes avec leur environnement et les autres êtres vivants ; chimiotactisme,
quorum sensing ; environnements extrêmes : microbiologie marine ; traitement microbiologique des eaux ; dépollution
microbienne.
TD : Préparation et restitutions de productions de groupe (oral et écrit, étude bibliographique sur un environnement/un
processus/une microflore choisis)
NUV8 EIC1
TP : /
Génétique et biologie des populations
DE MONTIGNY J
NUV7 GBP1
CM : 24
TD : 36
TP : 20
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Génétique et Biologie des Populations : polymorphisme, équilibre de Hardy - Weinberg, panmixie, évolutions de fréquences
alléliques, génétique quantitative
Dynamique des génomes eucaryotes : Analyse génétique et moléculaire des éléments transposables. Les remaniements
génomiques : caractérisation, identification par approche globale CGH et mécanismes. Recombinaison homologue et nonhomologue. Mutations et réparation
Modifications provoquées de génomes eucaryotiques : Techniques et vecteurs de transformation et de transfection (levure,
animaux , végétaux) ; Notions de thérapie génique
Génomique et Post génomique: Le séquençage systématique d'organismes modèles : cartographie physique et annotations.
Génomique fonctionnelle ; analyse génétique et moléculaire des séquences remarquables (origines de réplication,
centromères, télomères) , étude du transcriptome
Evolution et spéciation : génomique comparative et évolution ; théories de l'évolution et origine des espèces
Neurobiologie des rythmes
CM : 15
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
TD : 4
VUILLEZ Patrick
TP : 10
NUV8 NBR1
Définitions, mise en évidence et propriétés des rythmes biologiques. Mécanismes cellulaires et moléculaires des oscillations
circadiennes. Noyaux suprachiasmatiques, siège de l'horloge principale des Mammifères. Synchroniseurs externes et voies
d'entraînement. Distribution de la rythmicité et oscillateurs périphériques. Glande pinéale et mélatonine, hormone donneuse
de temps.
Rythmes chez l'Homme, organisation du sommeil, rythmes hormonaux, désynchronisations internes. Physiologie de la
reproduction, physiologie saisonnière, horloges circannuelles, sites et mécanismes d'action de la mélatonine.
Origine et évolution du vivant
BECKER Hubert
NUV7 OEV1
CM : 26
TD : /
TP : /
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Le cadre géologique des origines de la vie. La faune d'Edicacara. Les écosystèmes microbiens.
La terrestrialisation. Les radiations adaptatives. Les fondements des théories de l'Evolution.Les équilibres ponctués.
Systèmes de classification et phylogénétique moléculaire, évolution des populations, microévolution et ses causes, mutations
et recombinaisons, origine des espèces, systèmes d'auto-organisation, macro-évolution et ses mécanismes.
Description des étapes et macromolécules conventionnelles à l'origine de la synthèse de l'aminoacyl-ARNt qui est la molécule
adaptatrice permettant de traduire le code génétique. Etude de l'évolution des acteurs de la synthèse de l'adaptateur. Analyse
comparative des voies atypiques et ancestrales et des voies modernes de synthèse de l'adaptateur permettant de comprendre
comment s'est effectuée l'expansion naturelle du code génétique. Les approches expérimentales permettant l'expansion
artificielle du code génétique afin d'introduire de nouveaux acides aminés dans le code.
Physiologie comparée des organismes animaux
GAUER François
NUV7 PCA1
CM : 56
TD : 11
TP : 22
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
.Facteurs physicochimiques des milieux aériens et aquatiques: relation avec l'anatomie fonctionnelle et la physiologie des
échangeurs respiratoires ; 2) Physiologie comparée des systèmes circulatoires ; 3) Gestion de l'eau et vie animale: propriétés
physicochimiques de l'eau, modèles d'échanges transmembranaires et transépithéliaux, équilibre hydrominéral et
osmorégulation ; 4) Modalité de l'excrétion azotée et milieux de vie, anatomie comparée des organes excréteurs : des
protonéphridies aux néphrons des Mammifères ; 5) Anatomie comparée et biomécanique des systèmes locomoteurs, à l'aide
d'un groupe zoologique, les Vertébrés ; 6) Les relations interspécifiques : parasitisme et symbiose.
Les cours seront illustrés et complétés par des séances de travaux pratiques et dirigés: Anatomie et physiologie comparée des
systèmes respiratoires, excréteurs, de prise alimentaire, adaptations locomotrices et évolution des membres chez les
Vertébrés.
Statistiques appliquées 1
MAUMY-BERTRAND Myriam
NUV7 STA1
CM : 13
TD :26
TP :
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
1) Généralités de l’Analyse de la variance, Plans à un seul facteur contrôlé : Les comparaisons multiples, 2) Plans à deux
facteurs contrôlés, 3) Plans à trois facteurs contrôlés, 4) Méthode des blocs, 5) Plans complètement emboîtés. Plans
partiellement emboîtés, 6) Plans en carrés latins et gréco-latins, 7) Le non paramétrique.
Travaux pratiques en microbiologie de l'environnement
NADALIG
Thierry
VUILLEUMIER Stéphane
TP : 20
&
NUV8TEP1
CM / CI : 24
TD : /
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
CI : méthodes de dénombrements bactériens, milieux de cultures, isolement, mesure enzymatique, détermination des CMI et
CMB, dépollution microbienne.
TP : Méthodes d'énumération et de culture de microorganismes à partir d'un échantillon de l'environnement (eau de nappe
phréatique, sol).
Détermination de la résistance au mercure de souches de l’environnement (CMI, CMB).
Effet des chélateurs du fer sur la croissance de souches bactériennes.
Etude d’interactions bactéries-bactéries (antibiose).
2ème Année
Biodiversité et contraintes environnementales
MASSEMIN Sylvie
NUV9 BCE1
CM : 18
TD : /
TP : TER
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Répartition géographique de la biodiversité
Causes de la destruction et historique des différentes extinctions.
Biologie de la conservation
Services fournis par la biodiversité
TER dans une réserve : inventaire de la biodiversité et gestion du patrimoine. Présence dans la réserve de 2 demi-journées.
Cognition animale
M Majchrzak/JJ Roeder
NUV9COA1
CM : 20
TD : 10
TP : /
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Le cours traite des capacités cognitives de différentes espèces animales. Après avoir analyser les fondements des approches
utilisées pour étudier la cognition animale (béhaviorisme, éthologie, écologie et psychologie cognitive), deux domaines de
représentation sont étudiés (espace, temps). Le cours aborde ensuite la question de la cognition sociale chez les Primates
(coopération, alliances, communication,...) et examine les hypothèses actuelles relatives à l'évolution de la cognition (théorie
de l'esprit, tromperies,...).
Cognition et stratégies sociales
PETIT Odile
NUV9CSS1
CM : 25
TD : 30
TP : 10
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
La cognition animale traitera de la transmission de l'information et de la perception qu'ont les animaux de leur environnement
physique et social. Des exemples illustrant plus spécifiquement la cognition chez les primates seront largement développés.
Dans le cadre des stratégies sociales, l'évolution de la socialité, la sélection de parentèle, la reproduction coopérative, le
comportement parental, et les problèmes de territorialité et de dominance seront abordés. Une approche plus théorique portera
sur les stratégies évolutivement stables et la théorie des jeux. Une introduction à l'éthologie humaine et à ses méthodes sera
également proposée.
Ecophysiologie animale
OUDART Hugues
NUV9 EPA1
CM : 55
TD : 15
TP : 25
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Capacités des organismes animaux à faire face aux contraintes environnementales par des adaptations anatomiques,
physiologiques et comportementales :
Distribution verticale des espèces animales (vie en altitude, vie abyssale, contraintes de pression)
Réponses et adaptations aux variations de température (vie en milieux désertiques chaud et froid, résistance au gel,
thermorégulation, contraintes thermiques)
Gestion de l'énergie dans le règne animal (acquisition, stockage, recrutement des réserves, dépense de l'énergie, contraintes
métaboliques)
Régimes alimentaires et digestion (contraintes nutritionnelles)
Modes de reproduction et régulation de la reproduction
Relations interspécifiques, contraintes et avantages de la vie en association
Incidence de ces adaptations sur les distributions spatio-temporelles des espèces animales
(migration, hibernation, passage de la mauvaise saison)
Ecologie des microorganismes
NADALIG
Thierry
VUILLEUMIER Stéphane
TP : 40
&
NUV9MEN1
CM / CI : 22
TD : /
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
CI : Etude des méthodes de biologie moléculaire appliquées à l’écologie microbienne (PCR, suivi de population (TRFLP,
DGGE, RISA), microscopie (hybridation in situ, isotopie).
TP : Etude des bactéries méthylotrophes de la phyllosphère (enrichissement, isolement, suivi de population). Conception
d’expériences, rédaction de rapports.
Origine et évolution du vivant (voir page de gauche)
BECKER Hubert
Physiologie du système nerveux
FREUND-MERCIER
José
TP : 12
NUV7 OEV1
Marie
NUV9 PSN1
CM : 40
TD : 6
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :
Neuroanatomie comparée des grands modèles de systèmes nerveux chez les invertébrés et évolution
du système nerveux central chez les vertébrés. Neurophysiologie cellulaire (transmission synaptique, intégration cellulaire).
Neurophysiologie intégrée motrice (réflexes, mouvements automatiques et intentionnels, système autonome) et sensorielle
(somesthésie et principes généraux de la neurophysiologie sensorielle, vision et audition).
Statistiques appliquées 2
MAUMY-BERTRAND Myriam
NUV9 STA1
CI : 20
TD :
TP : 20
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS : modèles multivariés et méthodes exploratoires multidimensionnelles :
1) Schémas expérimentaux 2) Modèle de régression, 3) Analyse de la covariance, Ancova. 4) Modèle linéaire généralisé : 5)
Mesures répétées., 6) Modèles multivariés 7) Analyse discriminante, 8) Modèle Log-Linéaire, 9) Méthodes de classification.
Analyse en clusters, 10) Analyse en composantes principales.