Stage proposé par Violette THERMES CR1, INRA INRA - SCRIBE, Campus de Beaulieu, Avenue du Général Leclerc, 35042 Rennes cedex Téléphone : 02.23.48.57.30 Mail : [email protected] Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : Patrick Prunet Equipe stress et adaptation Prénom et NOM du Responsable de l’équipe : Patrick Prunet Résumé du thème de recherche de l’équipe La vie en milieu aquatique est associée à des échanges permanents d'eau, d'ions et de gaz entre le milieu intérieur du poisson et le milieu extérieur, échanges qui sont largement sollicités dès que les conditions environnementales fluctuent au point parfois de générer des situations de stress. Une meilleure connaissance des réponses au stress devrait permettre d’identifier des indicateurs de l’état de santé du poisson (biomarqueurs) qui seront utiles pour le choix d'espèces à domestiquer ou pour l’amélioration des méthodes d’élevage en aquaculture. C’est dans ce contexte que le projet de l’équipe se développe autour des 3 thèmes suivants : le premier, animé par Patrick Prunet (DR1, animateur d’équipe), concerne l’étude du contrôle endocrinien de l’osmorégulation chez les poissons, le second, développé par Isabelle Leguen (CR1), concerne l’étude du fonctionnement de l’épithélium branchial, en particulier les mécanismes d'échanges ioniques impliqués dans l’osmorégulation chez la Truite. Le troisième thème est développé par Violette Thermes (CR1, recrutée en 2007) et concerne la recherche de gènes impliqués dans l’ontogenèse des branchies chez le Médaka. Caractérisation in vivo de la fonction de gènes candidats impliqués dans la prolifération/spécification des progéniteurs de ionocytes au cours du développement embryonnaire chez le poisson Médaka. Prénom, NOM, téléphone et adresse e-mail du Responsable du stage: Violette Thermes 02.23.48.57.30 [email protected] Projet de stage : Les petits poissons téléostéens euryhalins, tel que le médaka (Oryzias latipes), sont capables de s’acclimater à des variations importantes de salinité (i.e. lors d’un passage d’eau douce en eau de mer). Ce phénomène repose en parti sur un renouvellement des cellules branchiales grâce à la prolifération et la spécification de cellules progénitrices à partir d’un stock de cellules. Or, au cours du développement embryonnaire, ces processus cellulaires de prolifération, spécification et différenciation sont aussi impliqués dans l’organogenèse. Par conséquent, la dissection fine des mécanismes génétiques de contrôle de la prolifération/spécification des cellules progénitrices des branchies au cours de l’embryogenèse permettra de mieux comprendre les mécanismes génétiques de remodelage des branchies adultes lors d’un stress osmotique. Dans ce contexte, le projet proposé ici a pour objectif d’étudier in vivo la fonction de gènes candidats potentiellement impliqués dans la prolifération/spécification des progéniteurs des cellules branchiales, au cours du développement embryonnaire chez le médaka. L’étudiant réalisera des expériences de perte et de gain de fonction grâce à la microinjection dans l’embryon de Morpholinos ou d’ARNm. Les conséquences sur la prolifération/spécification des cellules et sur la fonction d’osmorégulation de l’embryon seront ensuite étudiées. Techniques mises en œuvre par le stagiaire : Microinjection dans l’embryon au stade 1-2 cellules, immuno-histochimie, hybridation in situ à l’aide d’un automate d’hybridation (utilisé en routine au laboratoire), mesure de survie des embryons/larves après transfert en eau de mer, contenus en ion… Publications du Responsable de stage au cours des 5 dernières années : 1- Candal E., Alunni A., Thermes V., Jamen F., Joly J-S., Bourrat F. “Ol-insm1b, a member of the SNAG family of transcription factors, is involved in cell cycle arrest during medaka development”, Dev Biol.309(1):1-17, 2007.(31) 2- Thermes V., Candal E., Alunni A., Serin G., Bourrat F., Joly, J.-S. “Medaka simplet (FAM53B) belongs to a family of novel vertebrate genes controlling cell proliferation”, Development 133(10):1881-1890, 2006.(32) 3- Jacquet C., Thermes V., De Luze A., Puiseux-Dao S., Bernard C., Joly J.-S. , Bourrat F. and Edery M, “Effects of microcystin-LR on development of medaka (Oryzias latipes)”, Toxicon, 43(2):141-7, 2004.(33) 4- Candal E., Thermes V., Joly J.-S., Bourrat F. “Medaka as a model system for the characterisation of cell cycle regulators: a functional analysis of Ol-Gadd45gamma during early embryogenesis”, Mech Dev.121(7-8):945-58, 2004.(34) 5- Thermes V., Grabher C., Ristoratore F., Bourrat F., Choulika A., Wittbrodt J., Joly J.S.“Linearization by the I-Sce1 meganuclease mediates highly efficient transgenesis in fish” MechDev.118:91-98, 2002.(35) Autres informations Etudiants actuellement en thèse ou en M2 dans l’équipe d’accueil. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de thèse, l’année du début de la thèse et l’Ecole Doctorale de rattachement NOM et Prénom LE BRAS Yvan BRARD François type THESE Master 2 Biologie, productions animales et qualité. Université Rennes 1 du 01-oct.-07 01-janv.09 au 30-juin-09 responsable P.PRUNET Ecole doctotale Vie-Agro-Santé Rennes P. PRUNET et I. LEGUEN Etudiants ayant préparé ou soutenu leur thèse ou leur M2 dans l’équipe d’accueil au cours des cinq dernières années. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de l’étudiant, l’année du début de la thèse et de fin de la thèse, l’Ecole Doctorale de rattachement et le devenir de l’étudiant. NOM et Prénom type du au responsable Ecole doctotale 30-sept.ODJO Nestor THESE 01-oct.-02 P. PRUNET Vie-Agro-Santé Rennes 05 DEA Biologie, productions animales et 01-janv.30-sept.MILLA Sylvain P. PRUNET qualité. Université 04 04 Rennes 1 30-sept.MILLA Sylvain THESE 01-oct.-04 P. PRUNET Vie-Agro-Santé Rennes 07 Master 2 Biologie, CHENEL productions animales et 30-sept.05-nov.-04 I. LEGUEN Thomas qualité. Université 05 Rennes 1 Master 2 professionnel Biologie et 10-marsFLORIN Anthony 29-août-08 I. LEGUEN Biotechnologie. 08 Université Lille Cette proposition de stage s’adresse-t-elle spécifiquement à un étudiant scientifique, médecin ou vétérinaire ou bien est-il ouvert à tous les profils ? Ce stage s’adresse à un étudiant scientifique. Ce sujet peut-il donner lieu à une thèse ? OUI