TP9 LA DIVISION CONFORME TP guidé Nous avons pu voir que la division cellulaire était précédée d’un doublement de la quantité d’ADN afin que chaque cellule fille puisse disposer de la même quantité d’ADN, quantité équivalente à celle contenue dans la cellule mère. En plus de cet équilibre quantitatif, il est nécessaire que les deux cellules filles héritent de la même information génétique, c'est-à-dire de la même séquence en nucléotides (ATGC) : il doit y avoir équilibre qualitatif. Il est donc nécessaire de trouver un fonctionnement qui assure à la cellule de pouvoir recopier son ADN de manière précise et rigoureuse afin de pouvoir transmettre des molécules identiques à chacune des deux descendantes. Problème : Comment la cellule assure-t-elle la copie conforme de son ADN ? Activité 1 : Hypothèses sur la duplication de l’ADN Dans les faits on s’aperçoit qu’une division cellulaire ne peut avoir lieu que lorsque les chromosomes sont à deux chromatides, c’est à dire lorsque la molécule d’ADN s’est dupliquée (dédoublée) ; chaque chromatide représentant une molécule d’ADN. Nous allons tenter dans cette activité de préciser ce phénomène. Imaginez 3 hypothèses possibles pour passer de une à deux molécules d’ADN (identiques entre elles forcement). Représentez ces trois hypothèses sous forme d’un schéma en dessinant la molécule d’origine en noir et les parties nouvellement synthétisées en rouge Hypothèse 1 Hypothèse 2 Hypothèse 3 Construisez les molécules obtenues avec les Lego, pour chacune des hypothèses. Vous veillerez à utiliser les bases azotées « légères » pour les parties nouvelles des molécules et les bases azotées « lourdes » pour les parties d’origine. Construisez également une molécule constituée uniquement de bases azotées lourdes. Pesez chacune des molécules ainsi construites. En 1958, Meselson et Stahl mettent au point une expérience similaire à votre réalisation. Après avoir cultivé des bactéries dans de l’azote lourd, ils mettent celle-ci dans un milieu contenant de l’azote léger durant une seule division. Ne pouvant peser les différences de poids (trop infime), ils les séparent par centrifugation, sachant que les plus lourds vont migrer plus loin lors de la centrifugation. Ils font de même avec deux molécules témoins : un ADN fait uniquement de bases azotées « lourdes » et un ADN fait uniquement de bases azotées « légères ». Les résultats obtenus vous sont données dans le doc2p19. D’après les résultats observés et vos modèles pesés validez la bonne hypothèse en justifiant votre choix. Ra1 (Pratiquer une démarche scientifique : émettre des hypothèses, construire un protocole expérimentale en lien avec ces hypothèses, conclure quant à ces hypothèses en fonctions des résultats) Justesse : L’hypothèse est plausible, réaliste/Les interprétations de résultats justes/Les réponses aux hypothèses sont exactes Complétude : L’hypothèse permet de répondre à l’ensemble du problème/La réponse au problème est complète Précisions : Les interprétations s’appuient sur des résultats chiffrés Cohérence : Hypothèse et les réponses sont en lien avec le problème Pertinence : Seules les informations utiles sont utilisées Communicabilité : La trace écrite distingue bien les différentes phases : problème, hypothèse, expérimentation, résultats et réponse. 1 1ère S – Chap II : Expression, stabilité et variation du patrimoine génétique Moi Lui TP9 Activité 2 : L’ADN polymérase Cette réplication est assurée par un complexe enzymatique nommé ADN polymérase. D’après le document 3, schématisez la réplication de la molécule d’ADN pour une molécule de séquence : ATTCAGGTCCAATCGATCA Précisez le principe utilisé par l’ADN polymérase pour associé un nouveau nucléotide. Activité 3 : Un système presque infaillible A l’aide du logiciel Anagène, ouvrez les différentes versions du gène HLA : ouvrez anagène puis fichier, « banque de séquences », « la système HLA », « HLAA ». Choisissez les versions HLAa0210, HLAa0211, HLAa0212, HLAa1101. Comparez chacune des séquences et données sous forme de tableau la matrice de différences entre chacune de ces versions (voir fiche méthode). Considérant que ces modifications sont liées à des erreurs d’ADN polymérase, calculez le taux d’erreur de cette enzyme. Comparez ces valeurs aux taux d’erreurs mesurés dans le document 3p85. Faites deux hypothèses permettant d’expliquer les différences de fréquences obtenus. Re2 (Utiliser l’outil informatique) Justesse : Toutes les fonctions sont utilisées correctement Les résultats extraits sont justes Moi Lui Précisions : Les données obtenues sont précises Complétude : Toutes les fonctions nécessaires sont utilisées en autonomie Pertinence : Seules les fonctions utiles sont exploitées Un regard critique est gardé sur les résultats ou les recherches Communicabilité : Les documents imprimés sont suffisamment travaillés et triés pour être explicite et simple à lire Activité 4 : Vitesse de synthèse de l’ADN La réplication de l’ADN est très rapide chez les bactéries : 500 à plusieurs milliers de paires de bases (pb) par seconde. Or, le chromosome d’une bactérie (Escherichia coli) contient 4.106 pb. On a pu montrer, par ailleurs, que chez les mammifères, la réplication de l’ADN est plus lente : 50 pb par seconde. Calculez le temps nécessaire à la réplication du chromosome bactérien (on prendra une vitesse de 1000 pb par seconde). Calculez le temps théoriquement nécessaire à la réplication du plus grand chromosome humain dont vous donnerez le numéro. Sa longueur déroulée est de 8 cm. (On rappelle que la distance entre deux paires de bases est de 0.34 nm). On a pu cependant déterminer que la durée réelle de la phase S pour une cellule humaine est égale à 6 heures. Montrez que ce résultat est incompatible avec celui obtenu dans la question 2, si on admet que la réplication d’une molécule d’ADN commence à un bout et se termine à l’autre bout du chromosome. On plonge pendant quelques minutes, au cours de la phase S, des cellules humaines dans un milieu contenant de la thymine radioactive. Puis ces cellules sont détruites, leur ADN est extrait et étalé sur une lame de verre, sur laquelle on place une émulsion photographique. On obtient des images telles que celle-ci : Interprétez et utiliser ce résultat pour reprendre et résoudre le problème soulevé dans la question 3. Activité 4 : Bilan Répondez au problème de départ 2 1ère S – Chap II : Expression, stabilité et variation du patrimoine génétique TP9